Arcobacter roscoffensis: NJU99_03630
Help
Entry
NJU99_03630 CDS
T09051
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
Organism
aros
Arcobacter roscoffensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
SecD_SecF_C
MMPL
DUF3377
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UTJ07190
LinkDB
All DBs
Position
complement(739626..742718)
Genome browser
AA seq
1030 aa
AA seq
DB search
MFDKLLRFFVNNSRVNYTLFILVFAIGVWSYNKTAKEIFPSFELDMISIRGSYTGASVDI
LDRMAVAEIEDNLKNIDSVDNMTTVISPGRFSIVLELKKGKDRYNEANKIKDTIALVKSN
LPSDMDEPSVNVLERSRSVVDISLTSAKYNTDELKPFADNLKSKILSIEGINDITIYGDS
DKYFEVLLNDKKIEALGLNKNEIFNTISNISYIFPVGKIEDPKKHYYISTYNGAKNAIDF
ANTLIKINDKNIYIKDIATIAKKYQDASTLYSFNGKNALSLAIEQTDSADALTIVTQIKK
LLPNLEKQNPDINITIADDNSERIADRLNIVVSNILLGIILITILVMILINFRMSIIIAV
GIPTSFVIAAIYMYFSGYTINMISLVGVLIAIGIVVDDAIVVSENIQQHIEEGHPPKQAA
IMGASEMVKPVTIASLTTLFSFLPILMISGTMGEVMKLIPIALSALVVASLIESFLFLPI
HAAHTLKNGAKVTSWEKANKVYNAIIHFFMNWKKTFLTIFIIMVPLLTFYEFTSSKFQLF
PKFDASDVKLTLKANANTTLEESFRIVQEIEQEFMKKEEEFSIKSIDSVAGFRRDVGGNS
ENFPYVMYMTVELKKLKPSNILDKYVTPNLSFYYDEEGRDRTEKSKKIASKIKKFIEKKK
FKEKYNLEEISVLERKVGPVKSDIKIGLVSNDNQKIIKTIEELHNQIKSFEGIKSVSNSL
KFGIDEIKLKVNNYGESLGLTESFVGSYLSNLYLLKKKGVSFDEKEMLDIKIKSQNKDDF
ESFKNTQIPLNDGTNVLLYEVVEINTLRAFEQLIKDQGEKNFYIYANVDPDIITASEVLE
KIQATLDKIEENGIRIILKGEAEKKKNLKNDMLLATALALVLIMLSMLYLFNSFRETFIV
MSIIPFSILGVLIGHKIMGLNLSMPSMIGALGLAGVVINDGIIMMTYLKKAKTLNEIFQR
ATKRFRPIIITTVTTLIGMSSLIFFPTGQAVIFQPIAISLGFGLLWGTILNLIYLPVLYT
ITHKLRKSKA
NT seq
3093 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttgataaattacttagattttttgttaataattcaagagtaaactacacacttttt
attttagtttttgccataggagtttggtcttataacaaaacggcaaaagagattttccct
agctttgaacttgatatgatttcaattagaggttcatatactggtgcttctgttgatatt
ctcgatagaatggcagttgctgagattgaagataatctaaaaaatattgatagtgttgat
aatatgacaacagtcatatctcctggtcgattttctattgtattagagcttaaaaaagga
aaagacagatacaatgaagccaataaaataaaagatacaatagcacttgtaaaatcaaat
ctaccatcagatatggatgaaccaagtgtaaatgtactagaaagaagtagatcggttgtt
gatatatctttaacttcagcaaaatacaatactgatgagttaaaaccctttgctgataat
ctaaaaagtaaaatcttaagtattgaaggcataaatgatattactatttatggggattcg
gataagtattttgaggtacttctaaatgataaaaagattgaagccttaggtttaaataaa
aatgaaatttttaatacaatatcaaatatctcatatatttttccagtaggaaaaatagaa
gaccctaaaaaacactattatatctccacatataatggtgcaaaaaatgcaatagatttt
gcaaataccttaatcaaaataaatgataaaaatatatacataaaagatattgctactatt
gcaaaaaaatatcaagacgcttctactctttattcatttaatggtaaaaatgccttatct
ctagcaattgagcaaactgatagcgctgatgccttgacaatagtaactcaaatcaaaaaa
ctacttcctaatttagagaagcaaaacccagatataaatatcactatagcagatgataat
agtgaaagaattgctgatagattaaatattgttgtatcaaatattcttttaggaattata
cttattactattttagtaatgattttgattaactttagaatgtcaataattatagctgtt
ggtattccaacatcctttgtaattgctgctatttatatgtattttagtggatatacaata
aatatgatttcacttgttggggttttaatagctattggtattgtagttgatgatgctatt
gttgtaagtgaaaatattcaacaacatatagaagaaggccatccacctaagcaagcagct
attatgggtgcaagtgagatggtaaaacctgtaactattgcttcacttacaactcttttc
tcatttttacctattttaatgattagtggaactatgggagaggtgatgaaactaattcct
attgccttaagtgctttagttgtagcttcactaattgagtcatttttatttttacctatt
catgcagcgcatactttaaaaaacggtgctaaagttacatcatgggaaaaagcaaataaa
gtttacaatgccattattcacttctttatgaactggaaaaagacatttttaactatattt
attattatggttcccctattaactttctatgaatttacaagttctaaatttcaactattc
cctaaatttgatgcctcagatgtaaaacttacactaaaagcaaatgcaaatactacacta
gaagaatcgtttagaatagttcaagaaattgagcaagagtttatgaaaaaagaagaagag
ttttctataaaaagtattgactctgttgcaggttttagacgagatgtaggaggaaatagc
gaaaattttccttatgttatgtatatgactgttgaacttaagaagctaaaaccatctaat
attttagataaatatgtaactccaaatttgagtttttattatgatgaagaaggtcgagat
agaactgaaaaatctaaaaaaattgcttcaaaaataaagaaatttattgagaagaaaaag
tttaaagaaaaatataatttagaagagatttcagtattagaaagaaaagtaggtcctgta
aaatcagatataaaaataggattagtttcaaatgataatcaaaaaatcataaaaacaatt
gaagagttacataatcaaataaaaagttttgaaggaataaaatctgtatctaactcttta
aaatttggtattgatgaaataaaactaaaagtaaacaactatggagaatcacttggactt
actgaatcatttgtaggttcatacctttcaaatctttatttattaaagaaaaaaggtgtg
agttttgatgaaaaagagatgttagatattaaaatcaaatcacaaaataaagatgatttt
gaaagctttaaaaatactcaaattcctttaaatgatggaacaaatgtacttttatatgaa
gttgtagaaataaacactttaagagcctttgaacaacttattaaagaccaaggggaaaag
aacttctatatttatgcaaatgtagaccctgatattattacagcatcagaagtacttgaa
aagatacaagcaacacttgataaaatagaagaaaatggtattagaataattctaaaaggt
gaagctgaaaagaaaaagaatcttaaaaatgatatgctcttagcaactgctttagcactt
gttttaataatgctttcaatgctttatttatttaactcatttagagaaacttttatagtt
atgagtattattcctttctcaattttaggagttttaataggtcataaaataatgggatta
aatctatcaatgccttcaatgattggagctttagggcttgctggagttgttattaatgat
ggtattattatgatgacatatcttaaaaaagcaaaaactctaaatgagatattccaaaga
gctacaaaaagatttagaccaattataataactactgtaacaacacttattggtatgagt
tcacttatattcttcccaacaggtcaagcagttatcttccaaccaattgccatatcactt
ggctttggtcttttatggggaacaattttaaatcttatatatttaccagttttatataca
atcactcacaaactaagaaaaagcaaggcttaa
DBGET
integrated database retrieval system