Arcobacter roscoffensis: NJU99_12855
Help
Entry
NJU99_12855 CDS
T09051
Name
(GenBank) ShlB/FhaC/HecB family hemolysin secretion/activation protein
Organism
aros
Arcobacter roscoffensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ShlB
POTRA_2
POTRA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UTJ06125
LinkDB
All DBs
Position
complement(2711730..2713424)
Genome browser
AA seq
564 aa
AA seq
DB search
MKNTSLKIASVSLLASSILLGANVPNISDIEKDTKVPNIKKEKIEIPQFETKTYKAPMAD
SGKKVLINGFSFSGNENIKSEELQDLTKDYANKNLTFTQISELTAKITRYYRSKGYFVAR
AYVPVQDLKASKNVLEIAIIEGNYGEFLLNNNSLVKDEVVQAMLDDAKNRGDIISTDTLE
RVMLIINDTPGVVVTQADVMPGKKVATSDFDMQTQASKAFDGYIVVDNTGGKNTGKNRFI
VGLNANSPFKIGDKLSFTGLTTNGFDLKNGRLAYSMPLMPNGLRGEVSYSHTTYSLVKLS
GVADDVYTGDSKTTNLNLTYPIKRTRLENLYASMDVSHKDLNDEFSGTKINPRSIKSINL
GLAYDKNYLAYGLNSVSEVGFNFTYGNLSFDEASDKSTNKAGVDTEGNYSKVNLNLSNVL
ELTPKVTLDTRLNMQYALSDKNLDGTEDLSLGGTDGVKLYPSGEFSAENGYVFNAELKYT
LPTTNGISSRVGIFYDYANAFISNDDNNSISVSRESLQDVGLGYYLNYKDYFAKLQVAWK
ANSKDVTTEKERNSRIIFQAGWSF
NT seq
1695 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaacacaagtttaaaaatagcatcagtatcacttttagcatcaagtattttactt
ggtgctaatgtaccaaatatttcagatatagaaaaagatacaaaagttccaaatataaaa
aaagagaaaattgaaattcctcagtttgaaactaagacatataaagcacctatggctgat
agtgggaagaaagtacttataaatggttttagttttagtggtaatgagaatattaaaagt
gaagagttacaagacttaacgaaagattatgctaataaaaatttgactttcacacaaatt
agtgaacttacagctaaaattacaagatattatagatcaaaaggttattttgttgcaaga
gcttatgtacctgtacaagatttaaaagcaagtaaaaatgtacttgaaattgctattatt
gaaggtaattatggagagtttttattaaataataactcattagtaaaagatgaagttgtt
caagcaatgcttgatgatgcaaaaaataggggtgatattatatcaacagatactcttgaa
agagttatgctgattataaatgacactccaggtgtagtagtaacacaagcagatgttatg
cctggtaagaaagtagcaacttctgattttgatatgcaaacacaagctagcaaggcattt
gatggttatattgtagttgataacacaggtggtaaaaataccggtaaaaacagatttatt
gtaggtttaaatgcaaactctccttttaaaataggagataaattgtcttttactggatta
actacaaatgggtttgatttaaaaaatggaagattagcttatagcatgcccttaatgcca
aatggtttaagaggtgaagtttcttattctcatacgacttattctttagttaaactatct
ggtgtagcagatgatgtatatacaggagattctaaaactactaatttaaacttaacttat
ccaattaaaagaacaagattagaaaatttatatgcatcaatggatgtttcacataaagat
ttaaatgatgaattttcaggtactaaaatcaatccaagaagtataaaatcaattaattta
ggactggcttatgataaaaactatttagcctatgggctaaatagtgtttcagaagtaggt
tttaactttacatatggaaatttaagttttgatgaggcttctgataagagcacaaacaag
gctggagttgatacagaaggtaattattcaaaagttaatttaaatttatcaaatgtttta
gaattaactcccaaagttactctagatactagattaaatatgcaatatgctttatcagat
aaaaacttagatggtacagaagatttgtctttaggtggaactgatggggttaagttatat
ccatctggagaatttagtgctgaaaatggttatgtttttaatgctgaattaaaatacaca
cttcctactacaaatggtatttcaagtagagttggtatcttctatgactatgcaaatgca
tttatatcaaatgatgataataattctatttctgtatcaagggagtcattacaagatgtt
ggtttaggatattatttaaattataaagactactttgcaaaattacaagttgcatggaaa
gcaaatagtaaagatgtaacaactgaaaaagaaagaaatagtagaattatatttcaagca
ggatggagcttttag
DBGET
integrated database retrieval system