Limnospira platensis: NIES39_L00340
Help
Entry
NIES39_L00340 CDS
T02608
Name
(GenBank) SNF2 helicase homolog
Organism
arp
Limnospira platensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
DUF3670
Helicase_C
ResIII
HDA2-3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAI92195
LinkDB
All DBs
Position
4465821..4469027
Genome browser
AA seq
1068 aa
AA seq
DB search
MAILHGTWRIHQDDSYVFIWGETWRGGGAQQDNRWEIAPLSWAMTEAELSQWSLLQDMAL
SKLSPDTITEAIALPTHIDLHCGHLTPIHSAATVPTEAAEAQDIYLYPWLITGYRLNPSD
AFHLFESLPLGTIDLDWLGDDIRFWSHVNRWSLDLLARRKFLPIISTSRLGEGLSSPVGA
SKWQPIVDSATDRARLLKFAGFMPTVCRISGLAPLQPQKVSSMVCAIFLPGRAEDLILGA
LGAMIDCQVRHIAQEVERKALTNVAILTPVVRMWLHGLADDAGGHIEADRAEIDTLQTSL
ENWMFPLQQSLVEQTQFRASFRLQPPQGKTQEWLLEYGLQAIDDPDFVVDAATIWKHPVE
AFIYRERTIRYPQETLLAGLGLACKLYPVIENSLAEASPQGCWIDSGQVYEFITRLAWRF
SDSGLGVILPPGLSQREGWASRLGLRIKANTPRGKNQVKIGLKSLLNFKWELSLGGQSLS
KAEFERLVAKKSPLVEVNGEWVELRERDIKAAQAFFASRKEEMTLSLEDALRLSTGDSQT
IERLPVVDFEAGGKLADLLTALTDNRTIDAIATPPTFKGELRPYQARGAGWLNFLQEWGL
GACLADDMGLGKTIELMAFLLHLQLEKTLINPVLLVCPTSVLGNWEREVKRFGPSLKTLV
HHGDKRAKGKAFPPAIKGKNLVITSYALTYRDQSELQSVKWQGVVLDEAQNIKNPEAKQS
KTVKTLEADFKIALTGTPVENRLSELWSILEFLNPGYLGQRPFFQRRFAIPIEKYGDTES
LQILRSLVQPFILRRLKTDKDIIQDLPEKQENTVFCPLSKEQASLYQKLVDESLSEIESS
TGIQRRGMILGLLVKLKQVCNHPLLLGAKTKAKKEMPTLNSAYSGKLQRLNEMLEELISE
GDRALIFTQFAEWGKLLKPYLEAKLNREVLFLYGGSRKLQREQMVDRFQQDPQGPPVMIL
SLKAGGVGLNLTRANHVFHFDRWWNPAVENQATDRVFRIGQTRNVQVHKFVCTGTLEEKI
HDLIESKQALAEQVVSSGEDWLTEMDTDQLRNLLILDRSSIIEESEET
NT seq
3207 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctattttacacggaacttggcggattcaccaggacgatagttatgtattcatttgg
ggggaaacttggcgggggggcggcgcacaacaggataaccgctgggaaatagcaccacta
agttgggctatgaccgaggcggaactctcccagtggtcgcttttacaagatatggcttta
tctaaactctctcccgatactatcacagaagcgatcgcccttcccactcatattgacctc
cattgtggtcatctcacccccattcattccgccgccacagtccccacagaagcagcagaa
gctcaagatatctacctgtatccttggttaatcaccgggtatcggctcaaccccagtgat
gctttccacctgttcgagtccttacctttagggaccatagatttagactggttgggagac
gatataaggttttggtctcatgtgaaccgctggagtttagaccttctagcgaggcgtaaa
tttttacccatcattagcaccagtcgcctgggagaggggttatcttccccagttggcgcg
tccaaatggcaacccattgttgatagtgccacagatcgcgcccgcctgttaaaatttgct
ggcttcatgccgaccgtttgtagaatctctggtttagcgcccctacagccacagaaggtc
tcatctatggtttgtgccatatttttacccggaagggctgaggatttgatattaggggct
ttaggagcaatgattgattgccaggtgcgtcatattgcccaagaagttgaacgcaaagcc
ttaactaatgtagccattctcacccctgtggttagaatgtggttgcatggtttagccgat
gatgctggtggccacatagaagccgatagggcggaaatagataccctccagaccagctta
gagaattggatgtttcccctccaacagtctttggtggagcaaacccagtttagggctagt
tttcgtctccagccaccccagggaaaaactcaagagtggcttttggaatatggtttacag
gctattgatgatcctgattttgtcgttgatgcggcgactatttggaaacacccagttgag
gcttttatttatcgggaaaggactattcgttatccccaagaaactctcctggctggttta
ggattggcttgtaaattatatccggtaattgagaacagtttagccgaagctagtccccag
gggtgctggattgactctggtcaggtttatgagtttattacccgtctagcttggcgattt
agtgatagtggtttgggggtaattttaccacctggattaagtcaacgagaaggctgggcg
agtcgtttgggtttgcggattaaggcaaatactcccagggggaaaaatcaggtaaaaatt
ggtttaaaaagtttgttaaattttaagtgggaattatccctaggtggtcaaagtttatct
aaggctgaatttgagcgtttagtagctaaaaaaagtccgttagtcgaggttaacggtgaa
tgggtagagttgcgagaacgagatattaaagcggctcaggctttttttgctagtcggaaa
gaagagatgactctttctctagaagatgctttgcgtttgtctactggagatagtcaaact
attgaacgactcccggtggtggattttgaagctggggggaagttggcggacttgttaacg
gctttaactgataatcgtaccattgatgcgatcgctactcctcccacttttaaaggagag
ttaagaccctatcaagccaggggtgcgggttggttaaattttctgcaagaatggggtctg
ggtgcttgtttggctgatgatatggggttgggaaaaaccatagaattgatggcctttttg
ttacatttacagctagaaaaaaccctgataaatccggttttattggtgtgtccgacttca
gttttgggaaactgggaacgggaagttaagaggtttggacccagtttaaagaccttggtt
catcatggagataaacgcgccaaaggaaaggctttccccccggctattaaaggcaaaaac
ttggtaattactagctatgctttgacctatcgagaccagtcggaattacaatcagtaaaa
tggcagggtgtggttttagatgaagcgcaaaatattaaaaatcccgaagccaaacaatcg
aaaaccgtcaagactttagaggcggattttaaaattgctttaactggaactcccgtagaa
aatcggttatctgagttatggtcgattttggagtttttgaatcctgggtatctaggacaa
cgaccattttttcagcgtcgctttgctattccgattgaaaagtatggggatactgaatca
ttgcaaattttgcgatcgcttgtacaaccttttattctgcgtcgcctcaaaaccgataaa
gatattattcaagatttacccgaaaaacaagaaaacaccgtattttgtcctctgtcaaaa
gaacaggctagtttatatcaaaagctggtagatgaatcactctcagaaattgaatcttct
accgggatacaaagacgggggatgattttaggattattggtgaagttgaagcaggtttgc
aatcatcccttattattgggtgctaaaaccaaagccaagaaagaaatgccaaccctcaac
tccgcttattctgggaagttgcagcgtttaaatgaaatgttagaagagttaatatcagaa
ggcgatagggctttaatttttacccaattcgccgaatgggggaaactcttaaaaccctat
ttagaagccaagttaaatcgagaagtcctgtttttatatgggggaagtcgtaaacttcag
cgagaacaaatggtcgatcgctttcaacaagacccccagggacctccggtgatgatttta
tctctcaaagctgggggagtcggtttaaacctaacccgtgctaaccatgtattccacttt
gaccgttggtggaacccagcagtagaaaatcaagccaccgatagagtatttcggattggt
caaactcgcaatgtacaagtgcataaatttgtctgtaccggaaccttagaagaaaaaatc
catgacctcatagaaagtaaacaagccttagccgaacaagtagttagttctggggaagac
tggctaaccgaaatggataccgaccaactcagaaacctattgattttagacagaagttcc
attatcgaagagtccgaagaaacctaa
DBGET
integrated database retrieval system
