Limnospira platensis: NIES39_O03160
Help
Entry
NIES39_O03160 CDS
T02608
Name
(GenBank) two-component hybrid histidine kinase
Organism
arp
Limnospira platensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GAF
PAS_3
HATPase_c
Response_reg
HisKA
PAS_9
GAF_2
PAS_4
PAS_8
PAS
GAF_3
PDE8A_N
HATPase_c_3
FleQ
Diguanyl_cycl_sensor
PAS_12
DUF7328
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAI93565
LinkDB
All DBs
Position
complement(5861394..5865566)
Genome browser
AA seq
1390 aa
AA seq
DB search
MYKQFYPKKPWLHHQPYIVIYTGTMVTISNSGVSLGCQIFPVNYDSREGENVMNYRPFNI
LLVTNDDAYEVQLRQLLQFMRSLSVKLERYSPTLEPFEQTFPEYHLYLIDYTTYLLRDWI
DRVLPTPVIALVDNSEAGLAALNMGATDYLPINRLILEEIERSLRLSLALGQAHNHQTIS
SDPNHRTPNLYEDKLFIETIINSFPKLIYIYEPKNLQNVYVNNQIINILGFSPEDLQKLG
DRFFWEQIHPDDLPILETILEQVSALSEGEVLDIEYRMRHKNGSYRWLRAQEVPFTKDAN
GLAVQVLGTAQDITSHKLIESQLQESEARLQVIFNSISDSILMVDCQGIVHAVNPAGLNL
FGRTSEELINHELGLPITVGDVAQLGILNPERGLVMVEMTVAETEWLQRPFYVVCFRDIT
ERCKTQEALQESEERFSQVVNHIQDVFWLTSPRGDKLFYISPAYEKIWGRSCQAVYDDPG
SWLEAVHPDDLQSVIVNFSYQEYAQSRFIEYRIFKPDGDMLWICDRAFPIKNERGDVVRV
ARIAEDITNRKKTEEHLRQQAEREHLLYQLTLHISQSLNLDDILQNTVNELRHLLDLDRV
LILRCHDQNLATVTHESIVPGIDTILGCKYQDYLYNHGQQNDQKEPLIIYDNDANLRAFS
PQHYSFNLQAKSRISVPIYQGDNLWGLLIVHHVAHLRNWENWEIQLLKQLATQLAIAIYQ
AELYHQLQVELNDRTQAEEALRESLVREMAITQLIQQISQTLELDQIFDNTTKDVQQILD
CDSVVIHKFKNPDNYYHHLLLPDLRIISAKHNQESPHIKLVVKHLKSGQVVMADSHQDSS
ISESQIKLLKSLNIQAYLGVPVYVGETLWGILATYQKESRKWLHHEVKLLTQIARQLGVA
IYQAELFTQLQQAKEAADTANRAKSEFLANMSHELRTPLNAILGFTQLLGQNYGLTSQQQ
EYLQIIQQSGKYLLSLINEVLDLSKIEAGAVTLNPTNFNLITLLKRINTMLQIKASSKNL
VMNIQLQQDIPDYVQTDESKLRQVLVNLLDNAIKFTDAGSVTLRVSFVSSVSQLYFEVED
TGPGITPDEQERLFKPFVQTDVGRRHQQGTGLGLAISQQYVSLMGGKITIVSVVDGGAKF
MFNIPVEVIKSENIDIEYLPEEELTLDDISCINMAPNQPNYRILLVEDNFNHRQLLVNIL
TPLGFQVQEAENGQQACDLWQLWHPHLILMDMRMPVMDGYQATQKIRQTPEGRSTIIIAI
TAHAFESERASILATGCNDLIHKPFNIKTLLDCISANLGVNYIYGKSISNSSSSSSLGPP
RLTTKDIDILDYEWIKQFYRAAMAARESQLRGLIAQIPPEHTVIIEGLNWYVNHLLFDQI
IDLMEPYNHG
NT seq
4173 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtataaacagttttacccaaaaaaaccctggttgcatcatcagccatatattgtcatt
tatactggtacaatggtaactatcagtaactccggggttagtttgggttgccagatcttt
cctgttaactatgactcaagagaaggtgagaatgttatgaactacagaccctttaatatt
ctcctggtaacaaatgatgatgcttatgaagttcaactacgacagttgctacaatttatg
cgatcgctttctgttaaattagagcgatactcccctaccttagagcctttcgagcagact
ttccctgaatatcatctttaccttattgattatactacatatttgcttcgagattggatt
gatcgggtactacctaccccagttattgccttagtggacaactcagaagcgggtctagct
gctttgaatatgggtgccacagattatctgcccataaatagacttattcttgaggaaata
gagcgatcgctcagattaagtttagctttgggtcaagcccataatcatcagacaatttcc
tcagatcctaatcaccgtacccccaatttatatgaagacaaattatttatagagaccatc
attaatagttttccaaaactcatatatatttatgaacccaaaaacttacaaaatgtttat
gtaaataaccaaattattaacatcctaggtttttctccagaagatttacaaaagctgggc
gatcgctttttctgggagcagattcaccccgatgatttacctatattagaaaccatatta
gagcaagtctctgccttatcagagggagaagttttagatattgaataccggatgcgccat
aaaaatggctcctatcgctggttgcgagcccaggaagtgccatttaccaaagatgccaat
ggtctggctgtacaagtcttaggaaccgcccaagatattacttcccacaaactcatagaa
tcccaacttcaagaaagcgaagctcgtttacaagtaatttttaatagtatttctgatagt
attttaatggtagattgccaaggaatagttcatgcagtcaatcccgctggattaaattta
tttggacgcacttccgaagagttaattaaccatgagttaggactaccaataactgtggga
gatgtagcacaattgggaattcttaacccagaacggggactggtcatggtagaaatgact
gtcgctgaaactgagtggttacaaagaccattttatgtagtttgttttcgcgatattaca
gagcgctgtaaaacccaagaagctctacaggaaagtgaagagagatttagccaagtagtt
aatcatattcaagatgttttctggcttaccagtcctaggggagacaaattgttttatatc
agtccagcctatgaaaaaatttggggtcgtagttgtcaggctgtttatgatgatcccggc
tcctggttagaagccgtacatcctgatgatttacagtcagtaatcgtcaatttttcctat
caagaatatgctcaatctaggtttatagaatatcgcatatttaagcctgatggtgatatg
ctgtggatttgcgatcgcgctttccctattaaaaatgagcgaggcgatgtagtcagagtt
gctcgcattgctgaagatattactaaccgcaaaaaaaccgaagaacacctacgccaacag
gcagaaagagagcatcttctgtatcaactaactctccatattagtcaatctctcaatctt
gatgatattctgcaaaatacagttaatgaattgcgtcacttacttgacttagatagggtg
ttaattctccgctgtcatgaccaaaatttagccactgttacccatgagtcaattgtgcca
ggaatcgacacaattctgggctgtaaatatcaggattatttgtataatcatggccaacaa
aatgaccaaaaagaaccattaattatctatgataatgatgctaatctcagagcattttct
cctcagcattattcctttaatctgcaagcaaaatctcggatttctgtgccaatttatcag
ggagataatttatgggggctattaattgtccatcatgtagcacatctgcgaaactgggaa
aattgggaaattcagcttcttaaacaattagcaactcaactggcgatcgctatttaccaa
gccgaactatatcatcagttacaagtagaattaaatgaccgaactcaagcagaggaagcc
ttgcgagaaagcctagtcagagaaatggcaattacccaactgattcaacagattagtcaa
accttagaactagatcagatttttgacaatactaccaaagacgtacaacaaattttagac
tgtgatagtgtggtcattcataaatttaaaaaccctgacaattactaccaccatttatta
ttaccagatttgcgaatcatatccgcaaaacacaaccaagaatctccccatattaaactc
gtagtcaagcatcttaaatcaggtcaggttgtcatggctgatagtcaccaagatagtagt
atttcggaaagtcagattaaactattaaaaagtctcaatattcaagcatatctaggagtt
cctgtttatgtaggtgaaaccctgtggggtatattagccacctaccaaaaagaatcccgt
aaatggctccaccatgaagtaaaattactaacccaaattgctcgacagttgggagtagct
atctaccaagccgaactatttacccaacttcaacaagccaaagaagccgccgacaccgcc
aaccgagctaaaagcgaatttttagccaatatgagtcatgaactccgtacccctttaaat
gctattctgggttttacccaacttttagggcaaaattacggtcttacttcccaacaacaa
gagtatctacaaatcatccaacaatcaggaaaatatctattatccctaattaatgaagtc
ctagatttatctaaaatagaagccggagcagtaaccttaaatcctaccaattttaacctg
ataactttactaaagcggattaataccatgctccaaattaaggcgagttctaagaattta
gtgatgaatatacagttacagcaagatattcctgattatgtccaaactgatgagtcaaaa
cttaggcaagttttagtcaatttactagataatgccatcaagtttactgatgctggttct
gtcaccctgcgggtatcatttgttagctctgttagccaactttattttgaggtagaagat
accggacctggtattactcccgacgaacaagaacgcttatttaaaccatttgtacaaacc
gacgtgggtcgcagacatcaacaaggtactggtttgggtttagcaatttctcagcaatat
gttagtttaatgggtggaaaaattaccattgttagtgtggtagatgggggggcaaaattt
atgtttaatatccccgttgaagtcatcaaatctgaaaatattgacatcgaatatctcccg
gaagaagaattaactcttgatgacattagctgcattaatatggctcccaatcaacctaat
tatcggattcttttagtggaagataattttaatcatcgccaactattagttaatatttta
actcccttgggttttcaagtccaagaagccgaaaatggtcaacaggcttgcgatttatgg
caactatggcatccacatctaattttaatggatatgagaatgccggttatggatggttat
caagctacccagaagattcgacaaactccagagggtcggtctaccatcattattgcgatt
accgctcatgcttttgagtctgagcgagcctcaattctggctacaggctgtaacgactta
atccacaaaccttttaatattaaaactcttcttgattgcattagtgccaatcttggggta
aactacatttatggcaaatctatttctaactcttcttcctcatcctccttggggccacct
cgtttaactacaaaggatattgatattttagactatgaatggattaaacaattctatcga
gcagctatggcagccagggaatctcaacttaggggcttaattgctcaaatccctcccgaa
catacggtaattattgaaggtttaaattggtatgttaatcatcttttatttgaccaaatt
attgatttaatggagccatacaaccatggataa
DBGET
integrated database retrieval system