Arsenophonus sp. aPb: QE177_01900
Help
Entry
QE177_01900 CDS
T11176
Name
(GenBank) sigma 54-interacting transcriptional regulator
Organism
arse Arsenophonus sp. aPb
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Sigma54_activat
AAA_lid_14
Sigma54_activ_2
HTH_8
HTH_50
AAA_5
AAA_16
Mg_chelatase
AAA_2
AAA
AAA_14
HTH_28
AAA_19
HTH_29
nSTAND3
AAA_22
HTH_17
HTH_Tnp_ISL3
AAA_7
MCM
GAF
PAS_7
HTH_23
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGL98686
LinkDB
All DBs
Position
438890..440674
Genome browser
AA seq
594 aa
AA seq
DB search
MLGVSSQSTLMQIQPTILRFTKVLSRVLQLEVEIVDGALRRVAGSGPYGKYLGQKLERNS
RLLRYVMQTGKEKVVIQSRLDPLCDDCENKVNCKEKAFLGTPIFFQDVCVGVISLVAFTH
EQQERIKHNLHEFSDYVQHISTIFISKLLDEQSGVNHTSKALMTLIDNIDQGVLILSSRN
KLKFANAIALNILNLNYEKMIGKTFTIRPLIYQESVNGGHMQYVISCGDISEILTGQLHN
IQDYQIFLMAFHQLPLYANSAFESDEPHIEHLVGESPPMRKLKKLISRIAPSPSSVLITG
ESGTGKEVVARAIHKLSHRSNKAFIAINCAAIPEQLLESELFGYVKGAFTGASTNGKQGL
IQAANQGTLFLDEVGDMPLVIQAKLLRAIEAREIQPIGASKAIAVDIRIISATNQNLEKS
VREGKFREDLYYRLNVIPLALPPLRERQGDLLLLIHYFLNLHTKRLGLVYPGVSQEVLEC
LKVYHWPGNLRELSNLMEYLINVTSSGDVIDIALLPPNLVSHRKNDFKVETVVVANIEEK
EQAIDGAIVLEDMEKQLIREALSRYGSKKQAAKMLGIGIATLYRKIKRYELTSG
NT seq
1785 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgggtgtaagttctcaatctactttaatgcagatccaaccaactatcctgcgattt
acgaaagttctttcccgtgtattacaacttgaagttgaaattgtagacggtgctttaaga
cgtgtggctggatcagggccttatggaaagtatttagggcagaagctggaacgaaattcg
cgtttgttacgttacgtcatgcaaactggaaaagaaaaggttgtcatccaatctcgcttg
gatccattgtgtgacgattgtgaaaataaagtaaattgtaaggaaaaagcgtttttaggc
acaccaatatttttccaggatgtttgtgtcggggtaatcagtttggtggcttttactcat
gagcagcaggaaagaataaaacataatttacatgaattttctgattatgtgcagcatatt
tcgacaatttttatttcaaaattattagacgaacaaagtggtgtaaatcataccagtaaa
gcattaatgaccttaattgataatattgatcagggggttttgatattaagtagtcggaat
aaattaaaattcgccaatgctattgcacttaatatactcaatctcaattatgaaaagatg
atcggcaagacatttaccattcggccgctaatttatcaggaaagtgttaacggtggtcat
atgcaatatgtgatctcttgcggagatatatcagaaatattaacaggacaactacataat
atacaagattatcaaatatttttaatggcttttcatcaattaccgctttatgccaattct
gcatttgaatctgatgagccccacattgagcatctggttggtgaatcaccaccaatgcgt
aaattgaaaaaattaattagccgtattgcgcctagcccttctagtgttttgattactggt
gaaagtggtactggtaaagaggtggttgccagagcgattcacaaattaagtcatcgtagt
aacaaagcttttattgccatcaactgtgccgctattccagaacagctactggaaagtgag
ttatttggctatgttaaaggagcctttaccggtgcttcaactaatggtaaacaaggatta
attcaggcggctaaccaaggaacactgtttttggacgaagtcggcgatatgccactggtt
attcaggcaaagttattacgtgcaatcgaggcgcgtgaaattcagccaattggtgccagt
aaagcgattgcggtagatattcgaattatttcggccaccaatcaaaatctagaaaaatct
gttcgtgagggcaaatttcgcgaagatctctattatcgtttgaatgttattcctttagct
ttgccaccattacgagagcgtcagggagacctgctattacttattcactattttcttaat
ctccacactaagcgtcttgggctcgtgtatccaggggtttcacaagaggtgttagagtgt
ctcaaagtttatcattggccaggaaatttacgtgaactgagtaatttgatggaatattta
attaatgttacttcttcgggagatgttattgatattgcattacttcctcccaatttggtg
agtcatcgtaaaaatgattttaaggttgagacagtagttgttgccaatatagaggaaaag
gaacaagctattgatggtgcgattgtacttgaagatatggaaaaacagctgatccgtgaa
gccttaagccgttatggcagtaaaaaacaagccgcaaaaatgcttggcattggtattgct
actttataccgtaagatcaagcgctatgagttgacatctggctag
DBGET
integrated database retrieval system
