Arsenophonus sp. aPb: QE177_10385
Help
Entry
QE177_10385 CDS
T11176
Name
(GenBank) TcdA/TcdB pore-forming domain-containing protein
Organism
arse Arsenophonus sp. aPb
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TcdA_TcdB_pore
LRR_4
Peptidase_C80
LRR_8
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGL97609
UniProt:
A0AA95GKX8
LinkDB
All DBs
Position
complement(2305904..2311180)
Genome browser
AA seq
1758 aa
AA seq
DB search
MDITPALLELITEWRDWASQPNIGPMERRDIALKKFFNCITEESSSLNLSGLFLTSLPNL
PEWLIELNVSNNELTTLPTKLPKKLTHLYVGQNLLTSLPDHLPEDLSVLHANANKLTVLS
DNLPKNLLGLNVAKNQIISLPDKLPANLSALNVSDNKLSALSDNLPSSLTILYVDKNNLE
SLPDKLPSGIFYLKASDNPLIALPNQLPRMLEKLEVNGAFLTALPNTLPDTLWYLSVCNN
QITALPAKLPTHLQELKLNKNLLSTLPHQLPKMLKVLSVADNKLQKLPDELPSNLINLDV
GNNQLKKLPETLPQKLHTLMANDNLLTLLPSDLPSELKTLKLCGNQLKFLPDKLPAGLTV
LDVGDNQLTALPVDLPAYLLVLYANRNRLTKLPDHLPNSLTELNASYNQLVSLTIKLPDS
LQILSLAGNQLTSLSSELPAGLTKLHLEHNRLTVLPEDLPDGIAILVVSHNLLTTLPDAL
PSSLITLEACYNKLTSLPNSLSDSIQYLIVSHNQLSLLPDQFPSDLVLLIVNNNQLTQLP
AFMPPSLEHIVLYHNQLTELPHFFDNLAYLDVGYNRLTEFPPDLLVLFLQNNQLRALPAH
LPEDLVFFDVHNNQITNLPDHLPLQLEYSDFTGNPLDSIPTRFPLQFPQWHDDELRIDIV
AELLHWAHDDKYITADEYHGRDIAVKKINECINDNNSKSLDLSGLHLTRLPAHLPASITE
LRINNNQLSVLPTSLPANLKYLYAADNQLNALPGNLPNSLIYLDVSGNNLTALPNTLPIM
LQHFDGHNNLLTSLPTSFPDILITLNVSHNQLISLPNNLSNTIKKLDVSGNHLTILPDSL
PNQLGHLNVNHNQLTMLPEHFSNKLKYLDASNNKLGTLPEYLPDTLRYLNVSDNQIIILP
DYLPANLKYLDVQNNQLKKLPAQFPNKLLFLDIDNNPIIMGHVPLSVTDIEIKQGAQLPE
LSRSKDELILEWLEWVRQAPAKGMDDRRTAFNRLVDCLRSQEQFLDLSNLNLTSLPDYLP
DNLLSLNINGNQLTSLPAHLPATIEMLYAYNNQLTSLPDTLPKGLIQLDISHNRLTELAN
KLPATLASLDISYNQLIRLPDNLPAQLQLLNADNNLLTFLSDSLPANLTNLTVSNNKLKI
LTNYLPNSLIRIDVSNNQLIAMPDHIPDKLIKFNFTGNQLKAESIHLPINLSLDGSIWDY
ATLTSARNVANWQPALVSFNHEGESSRFDGQLIIQLENDSIVREAASQLLKKNPQISVLV
QLDSEGNSFTVHGNIENLRQQTKQRWQLVGHSRDGQLDGKHVSLAWREAKPLAQQLKQLA
VDLALTVSPKHINLVGCSLADDQHQTSYVRQFAEALDETIRPYSVSAYSSELMVNNEGRK
RLLEAGNKTTLFFNHDNNHWLMENVPGKTANSLTKKEMEKVALGDPSRLDSVSYKLLSFI
KLAEQFQSTISQFYHYHKLSLQKWVPLFTSFSKSSVQPGSYDLQFIHNETHQIKKLITNN
KHIIDFINKCNQYLAMVMKVYHYDGKTLVLRGNMTEADSVHGLNAAFLIKELIPWFANKK
RLGVVDQELSETLSMALNIHTYLNLTQIVHGTVEDTIRLVNLYQMAAYQGQQTTKGLLGP
LFYGSYLLGGVFNIASIVLDSIELANAQNDLQRAVFSAQLGVDITNLAVIGIGIGSGMIG
ATTVAAFTGALSVPLAGVGIGITALAEAFGNVTHNVQIVGNYFADIDWAYKQGGYQQIKK
KSLTTMRLLLLWSPSQGL
NT seq
5277 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatataacacctgctcttttggaactaataacagaatggagagattgggcatcacaa
ccaaatatcggtccaatggaacggagggacattgcactaaagaaattttttaactgtatt
actgaagaaagttcatcccttaatttatccggtttatttttgacttcactgccaaattta
ccggaatggttaatagaattaaatgttagtaataatgagttaaccacgctgccaaccaaa
ctaccaaaaaaattaacccatttgtatgtaggtcaaaatctattaactagcttgcccgat
catctacctgaggatttatcagtattgcatgctaatgctaataagttgaccgtgctatct
gataatctacccaaaaatttattagggttaaatgttgctaaaaatcaaataattagtttg
cctgataagttgcctgcaaacttaagtgcactaaatgttagtgataataaattgagtgct
ttatctgataatttaccatcatcactaaccattttgtatgtggataaaaacaatctggag
agcttgcctgataaactaccaagcggcatcttttatcttaaagccagcgataatccattg
attgctttgcctaatcaattgccacgtatgctagaaaaattagaggttaatggggcattt
ttgacggcattaccaaatactctccctgacacgctatggtatctaagtgtctgcaataat
cagataaccgcgctgcctgctaaacttccaactcacttacaagaacttaaactcaataaa
aatctgctaagcacattaccccatcaactgccaaaaatgttaaaagtgcttagtgtagca
gataataaattacagaaactgccagatgagttgccaagtaatttaattaaccttgatgtt
ggtaataatcagttaaaaaagctgccggaaactttaccgcaaaaattacataccttaatg
gctaatgacaatctattgactttgctaccatcggatttacccagtgaattaaaaactctt
aaactttgcggcaatcaattaaaatttttacctgataaattaccagcaggcttaacagta
ttggatgttggtgataatcaattaactgctttacccgtcgatttgccggcttatttattg
gtgttatatgctaatcgaaatcgactaacaaaattgcctgaccatttaccaaattcacta
accgagcttaatgccagttataatcagttagtttcactaaccattaaattacctgactcg
ttacaaattttatctctggcgggtaatcaattaacttcattatccagtgagttgccggcc
gggcttaccaaattacatcttgagcataatagattaactgtgctacctgaggatttacca
gacgggatagcaatattagttgttagccataatctattaacgacattacccgatgcttta
ccctcatcactaatcacgttggaagcttgctataataaacttaccagtttgcctaatagt
ttatcggatagcatacaatatcttattgttagccataatcaactttctttgttgcccgat
cagttccctagcgaccttgtgctattgattgttaataataatcaattaactcaattgcct
gcatttatgcctccttccttagagcatattgtgctatatcataaccaattaactgaatta
ccgcatttttttgataatttagcataccttgatgtaggttataaccgattaacagaattt
ccgcctgatttgcttgtcctttttctgcaaaataatcaattgcgtgctttacctgcccac
ttacccgaagacctggtcttttttgatgtgcataataatcagatcactaacttacctgac
catctgcctttacagttggagtacagtgactttactggtaatccattggattcaatacct
actcgttttccattgcaatttcctcaatggcatgacgatgaactgaggatagatattgta
gcggagttacttcattgggcgcatgatgataaatatattactgctgacgaatatcacggc
agagatattgcagtaaaaaaaataaacgaatgcattaatgataataatagtaagtcactt
gatttatccggtttacatttaacccgtttaccggctcatttgcctgcaagcattaccgaa
cttagaatcaacaacaatcaactatcggttttgccgactagcttgccagcgaatctaaaa
tatttatatgcggcagataatcagttaaatgctttaccgggcaatttgcctaattcctta
atttatcttgatgttagtggcaataatctgacggctttgccgaatacgttgcctattatg
ttacaacatttcgatggtcataataatttgttgacctctttgcccacttcctttcctgat
attttaattacgttgaatgttagtcataatcagctaatatctctgccaaataatttatcg
aatacaataaaaaaacttgatgttagtggtaatcacttaactattttacccgacagtttg
ccaaatcaattaggccatctcaatgtcaatcataaccaattgacaatgttgccagagcat
ttctccaacaaattaaaatacttagatgcgagtaataataaattaggtacattacctgaa
tatctacctgacacgctaagataccttaatgttagtgataatcagataattattttgcct
gattatctgccggctaacttaaaatatctcgatgtccaaaacaatcagcttaaaaaatta
ccggcacaatttcccaataaactgctttttcttgatattgacaataacccgatcattatg
ggtcatgtccctctttctgttactgatattgaaataaaacagggagctcaattacctgag
ttatcccgttctaaagatgaattaattttagaatggttagaatgggtaagacaggcacca
gcaaagggaatggatgatagaagaacagcctttaatcggctggttgattgtcttcgttcg
caagaacaattccttgatttatcaaacttaaatctaaccagcttaccggattatctcccc
gataatctgttatcactaaatattaacggcaaccaattgacgtcgttgccagctcatctg
ccagctaccatcgagatgttatatgcttataataatcagttaacttctctaccagatacc
ctgcctaaagggttaatacaattggatattagccataaccggttgacagagttagcaaat
aagttgccagccactttggccagtttagatattagttacaatcaattgattcgcttacct
gataatttacccgcacaattacaattgcttaatgccgataataacctattaaccttttta
tctgatagtctaccggcaaatttaaccaacctgactgtaagtaacaataaattaaaaata
ttaaccaattatttgcctaattcattgataaggattgatgtcagtaataaccaacttatt
gccatgcctgatcatatcccagataagttaataaaatttaactttaccggaaatcaactc
aaagctgagtcaattcatctgccaattaatcttagcctggatggttcaatttgggattac
gcaactctgacttctgctcgtaatgtagccaattggcaaccagcattagtaagttttaat
catgaaggcgaaagtagccggtttgatggccaattaattatccagctagaaaatgattcg
atagtaagagaagcggcgagccaattactaaaaaaaaatccacaaatatcagtcttagtg
cagcttgatagtgaaggaaatagttttacggtgcatggcaatatcgagaatttgcggcag
caaactaagcagcgctggcagttagtcggccatagtcgggatggccaactggatggaaag
catgtcagcctggcctggcgtgaagctaaaccgttggcacagcaattaaaacaattggca
gttgatttggcattgacggtttcgccaaaacatatcaatttagtgggttgttcattggct
gacgatcagcatcaaaccagttatgttagacaatttgctgaagctttagatgaaacgatt
cgaccctattcggtctcagcctactcttctgagctaatggtgaataatgagggcagaaaa
cgcttgttagaagcaggtaataaaaccacgctgttttttaatcatgacaataatcattgg
cttatggagaatgtgcccggcaaaacagccaacagcctgacgaaaaaagagatggaaaaa
gtagccttaggtgatccttctaggctagattctgtatcttataaattattgtctttcatt
aaattagctgagcaatttcagtccactataagccagttttatcattatcataaattgtcg
ctacaaaagtgggtaccgctttttaccagttttagcaaaagtagcgtgcagccgggcagt
tatgatttacagtttattcataatgagacccatcaaataaagaaattaatcaccaataat
aaacatattattgattttattaataaatgtaatcaatatctggcaatggttatgaaagtg
tatcattacgacggtaaaacattagttttgcggggtaatatgacggaagctgatagtgta
catggattaaatgcggcttttctcatcaaagaattaatcccctggtttgctaataaaaaa
aggcttggggtagtggatcaagagttatcagaaacgcttagtatggcgctgaatatacac
acttatctcaatttgacgcaaatcgtgcatggaacagtagaagatacaatacggttggtt
aatttatatcaaatggctgcctaccagggacagcaaacgacgaaaggattattgggcccg
ttgttttatggtagctatttactagggggggtatttaatattgccagtattgttttggat
agtattgagttagccaatgcgcaaaatgatctgcaacgggcggtctttagtgctcagtta
ggggttgatattactaatttagccgttattggcataggaatcggttctggcatgataggg
gcaactactgttgctgcatttactggcgccttatctgtaccactggcaggggtaggcata
ggcatcaccgcgttagcagaagcgtttggtaacgtcactcacaatgtacagatagtgggc
aactattttgctgatattgattgggcttataagcagggcggttatcagcaaataaaaaaa
aaatcgctgacaacgatgcggttattactattatggagcccatcccaggggctgtga
DBGET
integrated database retrieval system
