Luidia clathrata (European starfish): 117289388
Help
Entry
117289388 CDS
T10152
Name
(RefSeq) protein jagged-1b-like isoform X1
KO
K06052
jagged-1
Organism
arun Luidia clathrata (European starfish)
Pathway
arun04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
arun00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
117289388
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04090 CD molecules [BR:
arun04090
]
117289388
CD molecules [BR:
arun04090
]
Proteins
117289388
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
MNNL
EGF_DL_JAG
DSL
EGF_2
EGF_Teneurin
JAG1-like_EGF2
EGF_CA
JAG1
EGF_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
117289388
NCBI-ProteinID:
XP_033626385
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(496882..548158)
Genome browser
AA seq
1254 aa
AA seq
DB search
MVGFQHWSVFVLVVTGILLAVHQVQLVQASGYMEVVILSIDNDSGELADGDCCHGSRSDA
GCTGACHTLFVGCLRQYQSRATPEGSCTFGISDTPILGNSSFELPLDGSGRVENRNATMI
FPFEFGWVQTFTLILSAFDKQYLDASESSGLIERSFHSGIIAPASSWTTLRHNGANARLL
YRIRVLCDPNFFDTTCVKFCRSRDDTFGHYSCDANGDKVCHHGWTGVNCQTAICKRGCDF
IHGYCNEPGECLCRYGWQGELCDHCSPYPGCVHGSCNSPWQCNCQQEWGGILCDQDYNVC
GRHEPCLNGAVCTNSGPNDYTCQCQPGFNGRNCEQAEHPCENQPCNNGGTCLEIGRGFYC
RCTRGWKGDTCTENLDDCVSQPCLNGGECIDGVNSYSCRCTPQWQGPICQFDADECMGRP
CMHAFACRNRIGDYLCDCQPGWTGKNCDVNVNDCVGHCINGATCLDLVNSFSCVCLAGYT
GIECELNIDECTSSPCQHAGLCVDKVAGYQCTCAPGYAGDNCQFDVDSCDPNPCQHDSQC
FNLLGDYYCGCTDTYQGKNCSQSKQHCQGPQCQVVDSCTVALPASEDEGGLALVPSGVCG
LHGTCLSQGGDRFACQCDVGYSGRYCHENINDCESQPCQNDGVCVDGLNLFSCICSEGWE
GLLCNHNVDECARSPCRNNATCVDMHADFACHCPTGWKGKTCKSRDDQCDINTCLNGGTC
YDLGHSFTCVCPSGWEGNSCQLSTSNQCSANQCHNEATCIPSGDTFICVCREGFEGRLCQ
QNTDDCSRNPCFNGGQCVDGINWFRCQCADGFTGPDCRINLNECASNPCAYGSTCVDGID
SFKCVCPPGRSGATCSEVIGVVPICKVERRVYAQGESWKDNCNTCHCVQGTAECSKVWCG
PQRCAETVGSNSTSQLTCAENQRCQLLAESNCLTPPCQPWGLCVMGDEKATYPSNPGGSE
NQDRVCEVVTGSQSRESCAGFTLTLQTSKLPIGVSVEHVCSNLRQVAGLQRQVKTHTISL
VCSVTGTTMDTIGNCDIYVSLWVEGDKDSALAEEIADSLLEYLRLPASSNSVTVAITMVN
RHTKDSDQEPAKQGAGVMWLLGCLSGVVLVVLLGGFLLWARFHCITKPDEEQPPVPPPRF
TTTTTTTSTQPTSGTHAQDLPTNLRVVTNSERRDNRTRARAGLKREDTQLSVALTKPCMD
TDLEQRPTKWMNKENADPILMDIYKAETEESQKNRLEMHKRTKKNSSHVELTVC
NT seq
3765 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttggctttcaacattggagcgtgtttgtgctggtagtcaccgggatactgcttgca
gttcaccaggtgcagctagtccaggcctctggatatatggaagttgtgattttgtcgatt
gacaatgattctggtgaactagctgatggtgattgttgccatggatcccgatcagacgca
ggctgtaccggtgcctgccacaccctctttgttggatgtttaagacaataccagtctagg
gccacacccgaaggctcatgtacatttgggatcagcgacacccctatcttaggaaacagt
tcctttgaactgcctttggatgggagtggtagagttgagaatagaaatgcaactatgata
ttcccttttgaatttggatgggtgcaaacatttacgctgatcttatctgcctttgacaaa
caatacttggatgcctcggaatccagtggattaatcgagcgttctttccactctgggatc
attgccccagcttcttcctggacaactttgagacacaatggtgctaatgccagactctta
tacagaatacgggtcttgtgtgatccaaacttttttgacacaacgtgtgtcaagttttgc
cgttctcgagatgacacctttggacattattcttgtgatgcgaatggggacaaagtttgt
catcatggatggactggggtgaactgtcagacagctatttgtaaacgaggctgtgatttc
atccatggatactgcaatgaaccaggcgagtgtctgtgtcgctatggctggcaaggagaa
ctatgtgaccactgttcaccttatccaggatgcgtccatggcagctgcaactcaccctgg
caatgtaactgccaacaggaatggggtggtatcttatgtgatcaagattacaatgtttgc
ggcagacatgagccatgtttaaatggtgcagtgtgtacaaacagtggacctaatgattat
acatgccagtgtcaacctgggttcaatggaaggaactgtgagcaagctgaacatccttgt
gagaaccaaccatgtaataatggtgggacatgtttagagataggtcgaggcttttactgt
agatgtacaaggggctggaaaggagatacatgcactgaaaatcttgatgactgcgtaagt
caaccctgtctgaatggaggtgaatgcattgatggagtgaattcatacagctgtcgttgt
acaccacagtggcagggtcccatatgccaatttgatgctgatgagtgtatgggtaggccg
tgcatgcatgcctttgcctgtcggaatagaattggagattatctctgcgactgtcaacca
ggatggacagggaagaactgtgacgtcaatgtgaatgactgtgttggccactgcataaat
ggagctacatgcctcgacttggtgaattcgttctcttgcgtttgtctggcgggctacact
ggaatagaatgtgaactgaatattgatgaatgtactagtagtccatgccagcatgcaggg
ctgtgtgtggataaggtggctggttaccagtgtacatgtgcaccaggatacgctggagat
aactgccagtttgatgtagattcctgtgaccccaatccatgtcaacatgattctcaatgc
tttaaccttcttggggattactactgtggatgtaccgatacctaccagggcaaaaattgc
tctcagtctaagcaacattgccaaggacctcaatgtcaagtggtggatagttgtacagta
gccttaccagctagtgaagatgaaggtggtttagcattagttccatctggtgtttgtggt
cttcatggaacctgcttaagtcaaggcggtgatcgttttgcttgtcaatgtgacgtggga
tactctggaagatactgtcatgaaaatattaacgactgtgagagtcagccgtgtcagaat
gatggtgtatgtgtagatggactcaatttatttagctgtatctgttcagaaggatgggaa
ggattgttatgtaatcataatgtggatgaatgtgcacggtcaccgtgtaggaataatgct
acctgtgttgatatgcatgcagactttgcctgccattgcccaactggatggaaaggaaaa
acatgcaagtcacgtgatgatcaatgtgatatcaacacatgtctgaatggaggaacatgt
tatgatttgggacattcttttacctgtgtctgtccctcgggatgggaggggaactcatgt
caactctccacaagtaaccagtgcagtgcgaatcagtgtcataatgaagcaacgtgtatc
cctagtggcgatacattcatctgtgtctgtagagaaggatttgagggtcgactctgccaa
caaaatactgatgattgtagtcgcaatccatgcttcaatgggggacaatgtgtagatggc
attaattggtttagatgtcaatgtgctgatggattcactggacctgactgccggatcaat
ctgaatgaatgtgcatccaacccatgtgcttatgggagtacatgcgttgatggtatagat
tcctttaagtgtgtctgtcctcctggacgtagtggagcaacgtgctctgaagtgattggt
gtggttccgatatgtaaggtggagaggagggtctacgctcaaggagaatcctggaaagat
aactgtaatacctgtcactgtgtccaaggaacagcggagtgtagtaaggtttggtgtgga
ccacagagatgtgcagaaacagtaggcagtaactccacaagccaattgacttgcgctgaa
aatcaacgatgtcaactactagcagaaagtaattgtctcacccctccatgccagccgtgg
gggctttgtgtgatgggagatgaaaaagctacataccctagtaatcctggaggtagtgag
aaccaagatagagtctgtgaggtggtaacaggcagccagtctagggagagttgtgctgga
tttactctcacattacaaacatcaaagcttcccattggtgtatctgtggagcatgtatgt
agtaatctaaggcaagtagctggtcttcaaagacaagttaagactcacactatcagctta
gtatgcagtgtcactggtactacaatggatactataggcaactgtgacatctatgtatca
ttgtgggtagaaggagataaagatagtgctttggctgaagagattgcagattctctcttg
gaatacttaagattaccagcttctagtaactcagtcactgtagctattacaatggttaat
agacataccaaggattcagatcaagaaccagctaaacaaggtgctggagtgatgtggctt
cttggatgtctatctggtgtagttcttgtcgttctacttggaggtttcctcttatgggct
cgtttccattgcatcactaaacctgatgaagaacaaccaccggtacccccacctcgattt
accaccaccaccaccaccacatcaacccaacccacctcaggaactcatgcacaagacttg
ccaaccaacctgagggtggtcacaaactctgaaagaagagacaatcgaacacgagcccgg
gcgggtctcaaaagggaagacactcaactcagtgttgcactgactaagccgtgtatggat
accgacttagaacagagacccactaagtggatgaataaagagaacgctgatccaattcta
atggatatttataaagcagagacggaagagtctcagaagaacagacttgaaatgcataaa
aggactaagaagaactcatcacatgttgagttgacagtgtgctag
DBGET
integrated database retrieval system
