Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit: RATSFB_0150
Help
Entry
RATSFB_0150 CDS
T01624
Name
(GenBank) putative transcription antiterminator
Organism
asb
Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PRD
HTH_11
Phage_terminase
PuR_N
IF2_N
Barttin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK80712
LinkDB
All DBs
Position
192235..194334
Genome browser
AA seq
699 aa
AA seq
DB search
MGKIKITFRQKQIILILIENFKKPKRIKDISEELNVSSRTIIRELYVIDKFFDERNILFV
KKSGVGIFLEGDYERINKLREELNLENSLSKYSRNDRVMFILENILYSQTKSNLFLNKFK
ISYSTFSKDLEYIKSKILIKFNLKLITKKGLGMYIEGSEEKLRELSSHLFREKFSGRNLY
LMLISSSYNLQHDFLKVPDNHLKIINNIVEETFQLFNIKLLQKAYTSIMVHLIITFCRIK
ESYNCEFSRYKIEEFKDSIEFNISKVMLNKIGEEFGLFVDDFDICYISMHLKANNICGYY
GEYGYDFNFDRLDKIKISGDIVGKVQKILGISLMDSSDLIKNLSIHLGPAISRLFMNMNI
RNSFLEMIKSEYREIFDATKKACSVLENIIFKEVPESEVGYITMYIAAAYEKKLQSKFKY
RILIYSEGERGVSYFLNNRIKKEFPNIVIVNTIDSFDLLKISYDRNIDFIISTSDIKDDM
NYVKVGVNLSISDILAINDKIKNIFKLKCKDLKSFGNKNKSLDIEGISYLGNIVRFIEDN
FKIGEIETFGSIQNIIKDFTNKTLSYNREEIFDEILKKEMTLSSYVKDLGIIILHTISKF
SREIFIGSYILNEEISFCNGKLNLIFYFIIPEAINTKVLRGVIGELTSNLVKDYTFIDIL
KKRDIIPIKEYIKNILSIYYVEELKRIIDKFENGVIKEM
NT seq
2100 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggcaagataaagataacttttagacaaaaacaaataatattaatacttattgaaaat
tttaaaaaacctaaaagaataaaagatatatcagaagagttaaatgtgagttcccgaact
attattagggaactctatgttatagataaatttttcgatgaaagaaatatattgtttgtt
aaaaaaagtggggttggtatatttttagagggagattatgaaagaataaataaattaagg
gaagagttgaatttagagaattctttaagtaaatattcaagaaatgatagagtaatgttc
atacttgaaaatattttatattcacaaactaagagtaatttatttttaaataaatttaag
atatcttattctacattttcaaaagatttagagtacataaaaagcaagattttaatcaag
tttaatttaaaacttataactaaaaaagggttaggcatgtatatagaaggaagcgaagag
aagttaagagagctctcttctcatttgttccgtgaaaagttttcaggtagaaatttatat
ttaatgcttataagttcttcttataatttacagcatgactttctaaaagttcccgataat
catttgaaaattataaataatatagtggaagaaacatttcaactatttaatataaagtta
ttacaaaaagcctatacatccattatggtgcatcttattattaccttttgcagaattaaa
gagtcttataactgtgaattttcacgatataaaatagaggagtttaaagatagtatagaa
tttaatatatcaaaagtgatgttaaataaaattggagaagaatttggactttttgtagat
gattttgatatttgttatatatcaatgcatctcaaggcgaataatatatgtggatattat
ggagaatatggttatgattttaattttgatcgtttagacaagattaaaatttcgggagat
attgtaggtaaggttcaaaagattcttggaatatctcttatggattcaagcgaccttata
aaaaatttaagtattcatcttggtcctgctataagcaggttatttatgaatatgaacatt
agaaactcttttttagaaatgataaaaagtgagtatagggaaatatttgatgcaacaaag
aaggcgtgttcagttttagaaaatataatatttaaggaagtccctgagagtgaagttgga
tatataacgatgtatatagctgcagcatatgaaaagaagcttcaatcaaaatttaaatat
aggattttaatatattcagagggggaaagaggagtttcttattttttaaataatagaata
aaaaaagagtttccaaacatagttattgtaaatactattgattcttttgatttgcttaaa
atttcatacgatagaaatatagattttattatttcgacaagtgatataaaagatgatatg
aattatgtaaaagttggagtgaatctaagtataagcgatatacttgctataaatgataag
ataaaaaatatatttaagttaaagtgtaaggatcttaaatcatttgggaataaaaataaa
tcattagatatagagggtatttcttatttgggaaatatagttagatttatagaagataat
tttaagataggagaaattgaaacatttggatcaattcaaaatataattaaggattttaca
aataaaactctttcgtataatagagaggaaatatttgatgaaatattaaaaaaagagatg
actttaagctcttacgtaaaagatcttggtataataattcttcatacaataagcaaattt
tcaagagaaatattcatagggagttatatattaaatgaggaaatatcattttgtaatgga
aaattaaatctcattttttattttattataccagaagctataaatacaaaagttttaaga
ggggttataggagagttaacttcaaatttagttaaggattatactttcatagatattttg
aaaaaacgagatataatacctattaaagagtatataaaaaatatattatctatttattat
gttgaagaattaaaaagaattatagataaatttgaaaatggcgttataaaggagatgtag
DBGET
integrated database retrieval system
