Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit: RATSFB_0418
Help
Entry
RATSFB_0418 CDS
T01624
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
asb
Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
fn3
DUF4214
Pur_ac_phosph_N
SARA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK80980
LinkDB
All DBs
Position
497292..503381
Genome browser
AA seq
2029 aa
AA seq
DB search
MKTCMKKFIINLMILIFLFELIPLGDMGIKLGFVEKSSAYYTQLDSVAPGYVISAEEGGI
VFDLSQRLSSSMSVESFSIKNMNPEQQKKDLKEESSDGVRWLTKDEMINGHIYEIESKIY
DSEIDKTLTFINSFKFTDKNTAYNPKVSFSNFDANRMITQDVFFDFSNCKELINNSNRLD
LEILNSDLTKAEIDSVFVDKNDLVNAGYRYKLSRAASIFKPNKDYIIRLNADGVIWDKMI
SCSLKANPTLVENIRPTEIDFKYYAKQRNLFIPTLDFGICKTFTDRHHVEVKIILSNSKK
GLVPVEVTGEIPRLAEINIPEEYCSTIIPSDIRVYFSDKYTGALLAEYLFQVTFKEGGCF
MWTGLSYYGEKDISGYQITKITPVHEENDTTTVPHSWDEFPRAHYITLYDNKLENQIGGE
YRFDVTKTKYEYVGAEQNVKGANFKVPFKDMRQGFNSYNFKFESSNRYPEWGYAYIPFGF
YADIVEIKDLDIEVKDLKVNSSGKYDFSFELKNQNVITGDKMSIIDDNGKEYIANVNTSK
RFNFKDIPLVFGGKYVVTYNKISSLFHFKSTDMSILFNPVVIGTSSNGQNVVEIDFDKKY
EKILNSDRMKNRIRILHMNGNSTGNEFTDFNVGKHKFTLSSGLTEGQNYIVEFSNSKEET
YKTTFQYTTMKLDLSDVTGTTAKLNWEYPSNYLITDGDVLNIYFKKEDANYPAIPDAKIM
HGFQGIDFNDVTTYTIRNMSPNINYVAKLELVTNEGMTYVDETEFVTSTFKILNEEIEGI
SEDGTVNSKSINFKWDINLGDIEFNAGDKVELFLKLRSHNAFPKTPVSTIDQDLNRNKRI
KFDVSNYYEDYSAKIVYTIGGVRHTSKVLNFSVEPEKLELSVNDITDYSAVVNWKYPEGI
NIENNHEIRVYLRKAGDLDYRLEKTYKQSETSLKDVTKYKFDKLRFETTYQVKLVYKVGD
KQVAGVSEDVTQDIEIEFRTESFVINNLRFEKDMNNLVNVMWNLKNDNYPYVNGDSVELF
LKERGAPSQNYKKFQYATGNISAVRAFNIMIPKFNVDYDMKLTYTLGGKQVSAYGNCRLD
MGDIGFNVDEITDTKIKVSWTYPDNYSISNNDKIEVSLKNLEDGNNVESESKTQNYDNNN
TTMIKDFKEKEFTLTKDKMYEVKIRFSSVYAEPIEKSFKFKATSGFQILGLVGKSLDSKS
FKLEWDFYNNNEEFDSNSKIEILYKEEPKGSSQDASQDNNVEDKLFENVNPVSTRTGSEL
KEFKSYVVEGLDVNKNYLFRVRYTITGDSGKVVYKDLVGKTEARKITSSVIDTQPTGVKI
SVEYPENYEILEGDILDIFIRRKEETNYSVNPNFTGKHGSGEDDVDLNEVTVLDILGLSP
NKEYFSKVVFWPDGGSGIKQEMELSFKTDVVEGIGEVIIGDVLDYVVKVGIKMEPDELIL
SDKDSCKVFIKKKDQTHYPDKSNGEIRGDIFNEEKFISAYFDELNAEYDVKVIVNIGGNE
FEKETSFVSKIDDFNIDVKEINPMTTQVEWRYPNNYTLVDGESIQIFIKYQDEDDFLSEP
DLELIQSDDLNLSDINLVELYSLIPDTRYEVKVKLNLLEADVKPVIKEFTTTVFEIENLE
IQDISSDGMSIKWDLSTEELDFIDEYDNLSVFIKNSNEEDYDFSNPVAEFTEGLNDIRSI
SFQTEDSIADVDIYLSYLIEDYEAAMEISYTAIDLNVEVQQEGVLVEWTYPPGIEFEKDD
RLDIYLKHANKSGYKTEPNFRYTNGKDGDLSELNEIFFKRLGIGNYVMKFSLITSDMRYN
PIEIEFNVQDQDVVGTELKFNGKSSNRKIELDIVGDNEFDYEKGFNINPEGLDLEIDEVR
NKFIVKNLVPGKDYKNIVITFYTEEDDEINFVVKNVKINPENLLQEFITNIYKFAFERYP
DEEGYGYWLGRLLEKGEVTGKFVLYNLMFAEREFSERNLSDDELIKVLYQIVVNREYDEG
GLNYWIGEYRNTYLPQANNDSYEAQKAIVARMLHEQEFKDLCNKMGILW
NT seq
6090 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagacatgtatgaagaaattcattattaatctcatgattcttatatttttatttgaa
ttaattccgcttggagatatgggtattaaattaggatttgttgaaaaatctagtgcttat
tatacccagcttgattcagttgctccaggttatgtgataagtgctgaggagggagggatt
gtatttgatttaagtcaaagattatcaagctcgatgagtgttgaatcatttagtataaag
aatatgaatccagaacaacagaaaaaagatttgaaagaagaatcttcagatggagttaga
tggttaacaaaagatgaaatgataaatggtcatatctatgaaattgaaagtaagatttat
gattctgaaatcgataagacattaacatttataaattcttttaaatttacagataaaaat
acagcgtacaatcctaaggtatctttttcaaattttgatgctaataggatgattactcaa
gatgttttttttgatttttcaaattgtaaagaattgataaataattcaaatagattagat
cttgagattttaaattctgatttaacaaaggcagaaatagattcagtttttgttgataaa
aatgaccttgtaaatgctggttatagatataaactttccagagcagcatctatttttaaa
ccgaacaaggattatataattagacttaatgcagatggtgttatttgggataagatgatt
tcttgttcattaaaggcaaatcctacattagttgaaaatattagacctacagagatagat
tttaaatattatgctaagcaaagaaatcttttcattccgacattagattttggaatttgt
aaaacgtttactgataggcatcatgttgaagttaagattattttaagtaattcaaaaaaa
ggtcttgttccagttgaagtaacaggtgaaataccacgtttagcagaaattaatattcca
gaagaatattgttcaacaataataccaagtgatataagagtttatttttctgataaatat
actggagctttacttgctgagtatttatttcaagttacatttaaagagggcgggtgtttt
atgtggactggactttcttattatggagaaaaagatatatcaggttatcaaataactaaa
ataacaccagttcatgaagaaaatgatactacaactgttccacattcatgggatgaattt
ccacgagcacattatataactttatatgataataaattagaaaatcaaataggtggagaa
tatagatttgatgttacaaaaactaaatatgaatatgtaggtgcggagcagaatgttaaa
ggtgctaactttaaagtgccgtttaaagatatgaggcaaggttttaatagttataatttt
aaatttgaatcgagcaatcgttatccagaatggggatatgcgtatataccatttggtttt
tatgcggatatagttgaaataaaagatttagacattgaggtaaaggatttaaaagtaaat
tcttcaggtaaatatgattttagtttcgaactgaaaaatcaaaatgttatcacaggtgat
aagatgagcattatagatgataatggtaaagaatatatagctaatgtaaatacttcaaag
agatttaattttaaagatattccattagtgtttggaggtaaatatgtagttacttataat
aaaataagttcactttttcactttaaatctacggatatgtctatattatttaatccagtt
gtaataggaacttcttcaaatggtcaaaatgttgttgaaattgattttgataagaaatat
gagaagatcctaaactcagataggatgaaaaatcgtattagaatattgcacatgaatggt
aatagcacagggaatgaatttacggattttaatgtaggaaaacataaatttacattaagt
tcaggactgactgaaggacaaaattatatagtggagttttcaaactctaaggaggaaacg
tataaaactacgtttcagtatactacaatgaagcttgacttgtcagacgtaacagggaca
acagcgaaattaaattgggaatatcctagtaattatctaataacagatggagatgtatta
aatatatatttcaaaaaagaggatgctaactatccagctattcctgatgctaaaataatg
catggatttcagggtatagattttaatgatgtgacaacatatacgattagaaacatgagt
ccaaatataaattacgttgcaaaacttgaacttgtaactaatgagggtatgacctatgta
gatgaaactgagtttgtaacaagtacttttaaaatattgaatgaagaaattgaaggtatt
tctgaggatggtactgtaaacagtaaatctataaattttaaatgggatataaatcttggt
gatatagaatttaatgcaggagataaggtagaactttttcttaaattgcgttctcataat
gcattccctaaaacgccagtatcgacgatagatcaagatttaaatagaaataaacggatt
aaatttgatgtatcaaattattatgaagattatagtgcaaaaattgtttatacaataggt
ggagttcgtcatacaagtaaagttttaaattttagtgtagagccggaaaaattagaatta
tctgtaaatgatattacagattattcggctgtcgttaattggaaatatccagaaggtata
aatatagaaaataatcatgagattagggtttatttaagaaaagctggtgatttagattat
agacttgaaaagacatataaacagtctgaaacttctcttaaagatgtaactaaatataag
tttgataaacttagatttgaaactacgtaccaagttaagcttgtttataaagttggagat
aagcaagttgcaggagtaagtgaggatgtaacacaagatatcgaaatagaatttaggacg
gaaagttttgttataaataatcttcgttttgaaaaggatatgaataatcttgtaaatgta
atgtggaatttaaaaaatgataattatccttatgttaatggtgattcagtagaattattt
ttaaaagaaagaggagcaccatcacagaattataaaaaattccaatatgcaacagggaat
atttcagcagtgagagcatttaacataatgatacctaaatttaatgtagattatgatatg
aaattgacttatactttgggtggtaaacaagttagtgcttatggaaattgtagacttgat
atgggagatataggttttaatgttgatgagataacagatactaaaattaaagtttcttgg
acatacccagataattatagtatttcaaataatgataagattgaagtatctttgaaaaat
cttgaagatggaaataatgtggaatctgaatcgaagacacaaaattatgataataataat
actactatgattaaagattttaaggaaaaagaatttactttaactaaagataaaatgtat
gaagttaagattagattttcatcggtatatgcagaacctattgagaaatcgtttaaattt
aaagctacttctggatttcaaattttaggtttagttggtaagtctttagattctaaatca
tttaaacttgaatgggatttttacaataataatgaggaatttgattcaaatagtaaaatt
gaaattttatacaaagaagaaccaaagggaagttcacaagatgcttcacaagacaataat
gttgaagataaattatttgaaaatgttaatcctgtttcaactcgtactggaagtgaattg
aaagaatttaagtcttatgtagttgagggacttgatgtaaataaaaattatttgtttaga
gttcggtatactattactggagattcgggaaaggtagtatacaaagatttggtaggtaaa
acagaagcaagaaaaataacttcgagcgtaattgatacacaacctacaggtgttaaaatt
tcagttgagtatccggagaactatgaaatattagaaggtgatatcttagatatatttata
agaagaaaagaagaaacgaattattcagttaatcctaattttactggaaagcatggcagt
ggggaagatgatgttgacttaaatgaagtaactgtacttgatatacttggattatctcca
aataaagaatatttttctaaagttgtattttggccagatggtggttcgggaattaaacaa
gagatggaacttagctttaaaacagacgtagtagaaggtataggagaagtaattataggt
gacgttttagattatgtggtaaaagtaggaattaagatggagccagatgagcttatttta
agtgataaagatagttgtaaggtttttataaagaagaaagatcaaactcattatccagat
aaatcaaatggtgaaattcgtggagatatatttaatgaagaaaaatttatatcagcatat
tttgatgaattgaacgcagagtacgatgtgaaggttatagtgaatattggtggcaatgag
tttgaaaaggaaactagttttgtaagtaagattgatgattttaatattgatgttaaagaa
attaatccgatgacgacgcaagtagaatggagatatccaaataattatacacttgtggat
ggtgaaagtattcagatatttatcaaatatcaagatgaggatgattttttaagtgaacct
gatcttgaacttattcaatcagatgatttgaatttatctgatataaatttggttgaatta
tattcattgattcctgatactagatatgaagttaaggtgaaattgaatttattagaagcg
gatgtaaaaccagttattaaggaatttactacaactgtttttgagatagagaatcttgaa
atacaggacataagtagtgatggaatgtctattaaatgggatctgagtacagaagaatta
gattttatagatgagtatgataatttatctgtttttattaagaatagcaatgaagaagat
tatgatttttcaaatcctgtggcagagttcacagaaggtttaaatgatataaggtcaata
tcttttcaaacagaagatagcatagcagatgttgatatttatttatcatatttaattgaa
gattatgaagctgctatggaaatatcatatacagcaattgatttaaatgttgaagtgcaa
caagaaggggtattagttgaatggacgtatccacctggaatagaatttgaaaaagatgat
agactcgatatttatttgaaacatgctaataagtcgggatataagacagaaccaaatttt
agatatactaatggaaaagatggcgatctaagtgaattaaatgaaatatttttcaaaaga
ttaggaattggaaactatgtgatgaagttttcattaatcacaagtgatatgagatataat
cctatagaaatcgagttcaatgtgcaggatcaagatgtggtcggaacagaacttaagttt
aatggaaaatcaagtaatagaaaaatagaattagatattgttggtgataatgaatttgat
tatgaaaaagggtttaacattaatcctgaaggtttggatcttgagatagatgaggttaga
aataaatttatagttaagaatctggttccagggaaagattataaaaatattgttattact
ttttacacagaagaagacgatgaaattaattttgtagttaaaaatgtaaagataaatcct
gaaaatcttttgcaagaatttataacaaatatttataaatttgcatttgagcgttatcca
gatgaggaaggatatggatattggcttggaagacttcttgaaaaaggagaagttacaggt
aagtttgttttatataatttgatgtttgcagaacgtgaattttctgaaagaaatctttca
gatgatgaattaataaaagttttataccaaatagtagttaacagagaatatgatgaagga
ggattgaattattggataggtgaatatagaaacacatatttaccacaagctaataatgat
agttatgaggcacaaaaagctatagttgcaagaatgttacatgagcaagagttcaaagat
ttgtgtaacaaaatgggtatcttgtggtaa
DBGET
integrated database retrieval system