Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit: RATSFB_0561
Help
Entry
RATSFB_0561 CDS
T01624
Symbol
smc
Name
(GenBank) chromosome segregation protein SMC
KO
K03529
chromosome segregation protein
Organism
asb
Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
asb00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
asb03036
]
RATSFB_0561 (smc)
Chromosome and associated proteins [BR:
asb03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Condensin-like complex
RATSFB_0561 (smc)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_21
AAA_29
AAA_15
AAA_27
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK81123
UniProt:
G2IH45
LinkDB
All DBs
Position
649815..653381
Genome browser
AA seq
1188 aa
AA seq
DB search
MILKSIEIRGFKSFADSTELIFKHGITSVVGPNGSGKSNISDAIRWCLGEQSVKNLRGGK
MEDVIFSGTQYRKQLSLAQVSLIIDNSRNELPIDYSTVIISRKLYRSGESEYLINNKPCK
LKDINRLFFDTGIGKEGYSLIGQGKIEAILNGNSNDRRSIIEEAIGITKYKFKREEAYSK
INHANENIIRINDMLFTYAEYLEPLKADSEKARKFINLSNELKDLEILIFYNNLYDIYEE
IQNIKRDIVYRNLKLDDLINEKKIAENKREVFEKEFENLKLIEKRDKKRYYKIKDITQKN
INMVNLKNNDINMLINSNKIYERQISENKSKINNITLRENIINKTRDELENEFNSLLSNL
EKNEKLILDNSVRLHNLENQINSILLEKNKIVNVNNSIQNKIEFIKMSFFNIDNDKKTYL
DEKKSIEDRIKKNDEYIDSIRYALKDLHRQENEIKILSESLLNRIESESKKIELLDDQLD
NLNKDVIVKQANLDALRSLDNVYDGFNKSSKTLMNEINSGSLIRFKDKCFIVGNVLDTEE
RYAYAIETVIGGHISDIIIEEYSFVKDLINHLKENNLGRVTFHPLNSVNKYNIKFNNEVK
SFKGFIDFAINLVKYDSKFNNIISNILGNTIICDNIDNALNIAKSINFSNRIVTLDSQII
NSGGSITGGSIYSKKFNVLGRQRKISSEALEIDKKLLYISELKTDLKNLYDVRKNIQDEF
ETNNNLIKNIDIEILKKNEELKTYNDLRLRDIEELDKKNAVLNNLEDIYSSNDEEINKLN
YELSLNNDNFVILEDNEKNARIEFENYKKIAEEIDNEITNCKIRKAKIEENILNIYDEGK
RIALEKKDLIYSNGKTNDNIKSNNINIEKIEESIKILNKRIENLNNKFNEYKIDSYIIDQ
NKIQEKINKLKLDISELDLNIHDIERNINDLNIKSTKREVEFNINNDNLFKKYSINFDIN
DAEKYIIDKNELGNYNIKMKKITSEISELGNINIKSIEEYEVLSKKVEFITKQKEDLENS
KMELEDFIESITSEMRNIFNENFKLINENFNSTFKELFKGGSAQLVLGDGDELESNIEII
VQPPGKKLQNINLLSGGEKGLSAISLLFAILRLKPVPFCVLDEIEAALDDNNVIKFSTFL
KQYSSNVQFIVITHRKPTMEASDVIYGVTMEEKGVSKVVSINLANYNT
NT seq
3567 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattcttaaatcaatagagataaggggatttaaatcttttgctgactcaaccgaactt
atatttaaacatggtataacatcagtagtaggtccaaatggaagtggtaaaagtaatata
tcagatgcaataagatggtgcttaggtgaacaaagtgttaaaaatcttagaggaggtaaa
atggaagatgtaattttttctggaactcagtatagaaaacaattgtctttagctcaagtt
tcattaattatagataattcccgaaatgaacttccaatagattatagcactgttataata
tctagaaaattatatagatctggtgaaagtgagtatttaataaataataaaccatgtaag
cttaaagatataaataggctattttttgatacaggtataggtaaagagggttattcttta
attggacaaggtaagatagaagctatattaaatggaaattctaatgataggagaagtata
atcgaggaagcgataggtataacaaaatataaatttaagagggaagaagcatatagtaaa
attaatcatgccaatgaaaatattattagaattaatgatatgctctttacatatgcggaa
tatttggagccattgaaagctgacagtgaaaaggctaggaaatttataaatctttcaaat
gaactcaaggatttagaaattttgattttttacaataatttatatgatatttatgaggaa
atacaaaatataaaaagagatatagtttatcgtaatttaaaattggatgatttgataaat
gaaaagaaaattgcggaaaataagagagaggtatttgaaaaagaatttgaaaatttaaaa
ttaattgagaaaagagataagaagcgatattataagattaaagatattacgcaaaaaaat
ataaatatggtaaatcttaaaaataacgatataaacatgcttattaattcaaacaagata
tatgaaagacagataagtgaaaacaaatctaagataaacaacataacgcttagagaaaat
ataattaataaaacaagagatgagctagaaaatgaatttaattctcttttatctaactta
gagaaaaatgagaaattaattctggataacagtgtaagattgcataacttggaaaatcaa
attaatagcattttgttggaaaaaaataagatcgttaatgtcaataatagcatacaaaat
aaaattgaatttataaagatgagttttttcaatatagataatgacaaaaagacttatttg
gatgaaaagaagtccatagaagatagaattaaaaaaaatgatgagtacatagatagtata
agatatgctttaaaagatttacacagacaagaaaatgaaattaaaattttatctgaaagc
ttattaaatcgtattgaatcagaaagtaaaaagatagagctacttgacgatcaattagat
aatttaaataaagatgtgatagtaaaacaagcgaaccttgatgcattaagaagccttgat
aatgtttatgatgggttcaataaatcaagtaaaactttaatgaatgaaattaattcggga
tcattaattaggttcaaggataaatgttttattgtggggaatgttttggatacagaagag
aggtatgcatatgcgattgaaaccgttattggaggacatatttcggatataataatcgaa
gaatattcttttgtaaaagatcttataaatcatcttaaggaaaataatcttggacgtgtt
acatttcaccctctaaacagtgttaataaatacaatataaaatttaacaatgaggtcaag
tcgtttaaaggttttatagattttgctataaatttggttaaatatgattcaaagtttaat
aatatcattagcaatattttaggtaatactatcatctgtgataatattgataatgcttta
aatattgcaaagagtataaatttttctaataggatagtgaccttagattctcaaattata
aattctggtggatctattacaggaggatcgatttattctaagaaatttaatgttcttggg
agacaacgtaaaatttcgagcgaggctcttgaaattgataaaaaattattatatatatct
gagttgaagactgatttaaaaaatctttatgatgttaggaaaaatatacaagatgaattt
gaaacaaataataatttaataaaaaatatagatatagaaatcttgaagaagaatgaggaa
ttaaagacttataatgatttgagattgagagatattgaagagttagacaaaaaaaatgct
gtattgaataatttggaagatatttatagttcaaatgatgaggaaattaacaaattaaat
tatgaattaagtttaaataatgataattttgttattttggaagataatgagaaaaatgca
aggatagaatttgaaaattacaaaaagatagctgaggagatagacaatgaaattacaaat
tgtaaaattaggaaagctaaaattgaggaaaacattttaaatatttatgatgaaggtaaa
agaattgcattggagaaaaaggacttgatttattccaatggaaagacaaatgataatata
aaatcaaataatataaatatcgaaaagattgaggaaagtataaaaattcttaataagaga
atagaaaatttaaacaataaatttaatgaatataaaattgattcatatataatagaccaa
aataaaatacaagaaaaaataaacaaattgaaattagatattagcgaattggatttaaat
atacacgatattgaacgtaatattaatgatttgaatattaagagtaccaagagagaagta
gagtttaatataaataatgataatttgtttaaaaaatattctattaattttgatataaat
gatgcggaaaaatacataatagataagaacgaacttggtaattataatataaaaatgaaa
aaaataactagtgagataagtgaattgggaaatataaatattaagtctattgaggaatat
gaagtacttagcaagaaggttgaatttataactaaacagaaggaagatttagaaaatagt
aaaatggagcttgaagattttattgaaagtataacttcagaaatgagaaatatatttaat
gaaaattttaagctcataaatgaaaattttaattcaacttttaaggaattatttaaaggt
ggaagtgcccaacttgtattgggagatggtgatgagctagagagtaatattgaaataatt
gtacagcctcctggcaaaaaacttcaaaatattaatttattatcaggtggcgaaaaggga
ctttctgcaatatcacttttatttgcaattctaagattaaagcccgtaccattttgtgtt
ttagatgaaattgaggctgcactcgacgacaataatgttattaagttttctacattttta
aagcaatattcttcaaatgtacaatttatagttataacccatagaaaaccgacgatggaa
gcgagtgatgttatttatggtgttactatggaggagaaaggagtatctaaggtagtatca
attaacttagctaattataatacatag
DBGET
integrated database retrieval system
