Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit: RATSFB_0758
Help
Entry
RATSFB_0758 CDS
T01624
Name
(GenBank) UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2
KO
K01929
UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D-alanine ligase [EC:
6.3.2.10
]
Organism
asb
Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit
Pathway
asb00300
Lysine biosynthesis
asb00550
Peptidoglycan biosynthesis
asb01100
Metabolic pathways
asb01502
Vancomycin resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
asb00001
]
09100 Metabolism
09105 Amino acid metabolism
00300 Lysine biosynthesis
RATSFB_0758
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00550 Peptidoglycan biosynthesis
RATSFB_0758
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01502 Vancomycin resistance
RATSFB_0758
Enzymes [BR:
asb01000
]
6. Ligases
6.3 Forming carbon-nitrogen bonds
6.3.2 Acid-D-amino-acid ligases (peptide synthases)
6.3.2.10 UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide---D-alanyl-D-alanine ligase
RATSFB_0758
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Mur_ligase_M
Mur_ligase_C
Mur_ligase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK81320
UniProt:
G2IDU6
LinkDB
All DBs
Position
complement(865480..866847)
Genome browser
AA seq
455 aa
AA seq
DB search
MILNIEEIVKCVSGNLLIKGTYCEFNKISIDTRTINGEDIFLAISGENFDGNKYIFDAIK
EGVKLCIIDKDYFSYKEFELYDVSVVLVDSTLDALKKLAIYVRSKLDIDLIAVTGSVGKT
TTKDLIYDFLSSNYKVYKNFGNFNNHLGMPISLINIDDDAEIGVFEVGMNNLGEIDYLVN
ILRPHIGVITNIGVSHIEFLKTKENILKAKMEIVNYFNHNDILIVNYEDDLLKSINSSDF
LINRVGFSKDCCDMYAVNEDVSLNGIKFDVLYNGEEEGVSLPLKGKHNILNSLIAFKLCE
IFNIPMDVLRNKFNSLTPASMRQEIINYKNITIINDCYNASLNSMKSAIDILSLYKNEKV
GIFGDMGEAGEFAEEYHREVSRYANEKIDKLIAVGKFRNEYCSNFKNKEKCFQFENLDEL
RNNIEQILNGNETILIKASRSAKFERVLDIIRDIF
NT seq
1368 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattcttaacattgaggaaattgttaaatgtgtttcaggtaatttattaataaagggt
acatattgtgaatttaataaaatttctattgatacgagaaccataaatggcgaagatata
tttttggcaataagtggagagaactttgatggaaacaaatatatttttgatgctataaaa
gaaggcgttaaactttgtattattgataaggattatttttcttacaaagaatttgaacta
tatgatgtttcagttgtgttggttgatagtactctcgatgcacttaaaaaacttgctatt
tatgtaagatcaaaattagatatagatttaatagctgtaacgggatcggtaggtaagaca
actacaaaggatttaatttatgattttttatcttcaaattataaagtttataaaaatttt
ggaaattttaacaatcatttaggtatgccaatatctcttattaatattgatgatgatgct
gaaattggcgtgtttgaagttggtatgaataatttaggtgaaattgattatctagttaat
attttaagaccacatattggggttataacaaatattggagtgagtcatatagagttttta
aaaactaaagaaaatatactcaaagctaaaatggagatagtaaattattttaatcataat
gatattttaattgtaaattatgaagatgatctcttgaagtcaattaactcatcggatttt
ttaattaacagagttggtttttcaaaagattgttgtgatatgtatgctgttaatgaagat
gtatctttaaatggaattaagtttgatgtcctatataacggagaagaagaaggtgtttca
ttacctcttaaaggtaaacataacatattaaattctctaatcgcttttaagctttgtgaa
atttttaatattcctatggatgtgcttagaaataaatttaattcgctaactccagctagt
atgagacaggagattattaattataaaaatattacaataataaatgattgctataacgca
agtttaaattccatgaaaagtgctatagatatactttcgttatacaaaaatgaaaaagta
ggtatttttggtgatatgggagaagcaggagagtttgcagaggaatatcatagagaagtt
tctagatatgccaacgaaaagatagataaattgatagctgttggaaaatttagaaatgaa
tattgtagtaattttaaaaataaggaaaagtgttttcagtttgaaaacttagatgaactt
agaaataatatagagcaaatattaaatggaaatgaaacgatacttataaaagcttcacgt
tcagcgaagtttgaaagagtgttggatattataagagatatattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
