KEGG   Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit: RATSFB_0769
Entry
RATSFB_0769       CDS       T01624                                 
Name
(GenBank) ABC transporter, ATP-binding protein
  KO
K18888  ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
asb  Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit
Pathway
asb02010  ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:asb00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   02010 ABC transporters
    RATSFB_0769
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:asb02000]
    RATSFB_0769
Transporters [BR:asb02000]
 ABC transporters, eukaryotic type
  ABCB (MDR/TAP) subfamily
   ABCB-BAC subgroup
    RATSFB_0769
SSDB
Motif
Pfam: ABC_membrane ABC_tran AAA_21 AAA_22 AAA Zeta_toxin TMEM82 MMR_HSR1 RsgA_GTPase AAA_30 AAA_23 AAA_29 SMC_N TsaE AAA_16 GTP_EFTU ABC_membrane_2 nSTAND3 AAA_24 DO-GTPase2 DUF87 SRP54 MobB
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAK81331
LinkDB
Position
complement(878164..879975)
AA seq 603 aa
MRKQDVGHFSEIKKSKPSKGTAKRLFGYFKPRLWILIVIIVFAIIGQVFNIVGPKIMGKA
INEVFDGAIRIATGMGGIDFQFIGKIILILIVLYSLGCLFTYLQNYIMAGFGQSTMYDLR
KDVDLKISRIPLNYYDTKTHGEILSRLTNDIELIATTLQENLTQFISSVITIVGVIIAMI
TISPIMTILTILILFIGTNLIKPLVGKSQKYFKSQQKTVGELNGYIEEMYSGHNVVKAFG
REPNNVKRFDEINESLYESGWKAQFISGIIMPVMMFINNINYIIIAIIGGYFSIIGKIGI
GDIQAFIQYSRQFGMPINQIASIASLFQSTLAAAERVFEFLDEEELTPESTKDARIPDVH
GRVVFENVKFGYNPDKPLMNNISFEVKPGQKVAIVGHTGAGKTTLINLLMRFYDINGGSI
KIDGVDINDMTRDYLRSNFGMVLQDTWLFNGTIKENLSYSLDGATDERIIESSKAAHTDD
FIRLFENGYDTVLNEDASNISQGQKQLLTIARAIVADPKILILDEATSNVDTRTEALIQK
AMRNLMEGRTSFVIAHRLSTIKDSDLILVMKQGNIIEHGNHDELMAQNGSYADLYNSQFE
ENA
NT seq 1812 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaggaaacaagatgtaggacatttctcggaaattaaaaaatctaaaccatctaaagga
actgctaagagattatttggatattttaaacctagattgtggattttaatagtgattatt
gtttttgctataataggtcaagtatttaatattgttggtccaaaaattatgggtaaggct
ataaatgaagtgtttgatggtgctattagaatagcaacaggcatgggtggtattgatttt
caatttatagggaagataattctaatacttattgtcctttattctttaggatgtttattt
acttatttgcagaactatataatggctggttttggacaaagtactatgtatgatttgagg
aaagatgtggatctaaagatttctagaattcctttgaattattatgataccaaaacacat
ggagaaattttaagtcgtttgactaatgacatagagttaattgcgacaacacttcaagag
aacttaactcaatttatttcttcggttataactatagttggagttataattgctatgata
acgataagtcctataatgacgatacttactattttaattttgtttattgggactaatctt
ataaaacctttagttggcaagtcacaaaaatattttaagagccagcaaaagaccgtaggt
gagcttaatggatacattgaagagatgtattctggacataatgttgtgaaagcttttgga
cgtgagccaaataatgttaaaagatttgatgaaattaatgaaagtttatatgaaagcggt
tggaaagctcaatttatatctggaattataatgcctgtaatgatgtttattaataacata
aactatattattatagctataattggaggatacttcagcataatagggaagattggaata
ggtgatattcaagcatttattcaatattcaagacagtttggaatgccaataaaccaaatt
gcaagtattgcaagtttatttcaatcaactttagcagctgcagaaagggtatttgaattt
ttagacgaagaagaacttactccagagtctactaaagatgctaggataccagatgttcat
ggtagagttgtttttgaaaatgttaaatttggatacaatccagataaacctcttatgaat
aatattagttttgaggttaagccagggcaaaaagtagctattgttggtcatactggtgca
ggtaagacaactcttataaatcttttaatgcgtttttatgatataaatggtggaagtatt
aagattgatggagtagatattaatgacatgaccagggattatttgagaagtaactttgga
atggttcttcaagatacttggctttttaatggtaccataaaagaaaatttatcttatagt
ttggatggtgcgacagatgaacgaataatagagtcatctaaggcagcacatacggatgat
tttataagattgtttgaaaatgggtatgatacagtattaaatgaggatgcgtcaaatata
tcacaaggtcaaaagcaacttttaactattgctagagcgattgttgctgatccgaagatt
cttattcttgatgaggctacaagtaacgtagatacaagaacggaagcgttaattcaaaaa
gctatgaggaatcttatggaaggtagaacaagctttgttattgctcacagactttcaaca
ataaaagattctgatttaatacttgtaatgaaacaaggtaatataattgaacatggtaat
catgatgagcttatggctcaaaatggttcttatgctgatctttataatagtcagtttgag
gagaatgcttaa

DBGET integrated database retrieval system