Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit: RATSFB_0873
Help
Entry
RATSFB_0873 CDS
T01624
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
asb
Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4214
YbaB_DNA_bd
LMSTEN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK81435
LinkDB
All DBs
Position
complement(983227..986445)
Genome browser
AA seq
1072 aa
AA seq
DB search
MNKRKVSFMLVVMFITSNIFSGHLMPYNMKKNMEVTMALDRAAVETGEDNKLIYAYLNSS
LRDGDVVVDAPTTDDSSVDQDESSSEGDSVQDPSTTPVTPPSNGTEPPNVENSPEQPSQP
DKTNQSQVQIIKSLGSSELLGSGESYTPYGTIELSLKLSGEILNKKVIETTPPENSEGEE
VDKPSEGEGDSDKPNGDQGSEEDGDEVEGGETEDGVQDGSGSDNAGSNPGQGEAGDENEE
NGETSQPQPPSETTPSPEEPSEPSKPGEDGTTGDDDSVEDDNTDTEEDTTEKDDAEQEDT
EQEVKISTYVIRNYDEGTLGDLIIKAYEEAKKNSNETVERKKLRDALSKILDDMNAQLSF
DGNGGVKKVKMSSDFAPDKEKYIKNIIDLSSMSSEGEIRASDVALRIVIRNENENTIGDK
LRTNTVYTLNALEEQEVNRDITVGDDVKLTLTGLSNCKTGKAPALFVSKNAGKSNLYETT
SQNLQGTAKNDMYVTQFKDGVYLDMKSYGTSEQDIFITTNSIRFRNITFKDTDRSISRVE
IQDDQGYRYNCSLTLENTDTFSIEVNGLKSSTPYVFTKLFITSDMNGRTTTQELNLGYYD
NGTVKQNYEPVVTLKEPEPKIQLAGTNSSMIKLPNGLDTNIVKNSDSALRYVFKVDNKQG
NVLDLNVTSLTDSETYRVEKMIDKTQKENYYIVTLNNLTKNKDYGFVILELNYLDSNGNV
QIARKSLSTLNPSKGENIKYDNTTEGEPLPVEEAVQISLNDNFSSSYARVARVPILIDDL
ENRIDSIEVKNPDDNPDAKVSYDNFVLQFSDLKPETSGMFTVIFNCNNTTAREANQIKRY
VRLTTTETPDYDIKSADINVVDPTKVNIKLNTYSEPKSKVKSVSVYDDLNNVFKSTWDND
TNTIKLEGLKPEYTYTNVIIRINLENGKSVEYPLGTFKTVVDENKPKGEVAEFVRRVYNI
ALGREPEGGGWNFWIEKLQSKELSATEFIAENLMTQPEFVDRELTKSKFVSTMYTLIVDR
EAEEEGQRYWEGKYVEYRNEVSTIAQLRIKIAREMMDQPEFKELVSRIGLIY
NT seq
3219 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataagaggaaagttagctttatgttagttgtgatgtttattacatcaaatattttt
tcaggacatcttatgccttataatatgaaaaaaaatatggaagttacaatggctttggat
cgtgcggctgttgaaacgggtgaagataataaattgatttatgcatatttaaattcaagt
ttgagagatggagatgttgtagttgatgccccaacaacagacgacagttctgtagatcaa
gatgaaagtagtagtgagggggatagtgttcaagatccgtcgactacaccagtaactcca
ccatcaaatggtacagaaccacctaatgttgagaatagtcctgaacaaccatcacaacca
gataaaacaaatcaaagccaagttcaaattattaagagcttaggtagttctgaattgctt
ggttctggagaatcatacacaccttatggaacaatagagttgagtttaaaattatcaggt
gaaatattaaataaaaaagtgattgaaacaacacctccagaaaattcagaaggtgaagaa
gtggataaaccttcagaaggtgaaggtgatagcgataagccaaatggtgaccaaggttca
gaagaagatggagatgaggtagaagggggcgaaactgaagatggtgtacaagatggaagt
ggaagcgacaatgctggatcaaaccctggtcaaggtgaagcaggagatgaaaatgaagaa
aatggagaaacctctcaaccacaaccaccatcagaaactactccatcacctgaagaacct
tcagaaccttcaaaacctggagaagatggaactacaggtgatgatgattctgtagaggat
gataatactgatacagaagaagacactacggaaaaagatgatgcagagcaagaagataca
gaacaagaagttaaaatttcaacttatgtaataagaaattatgatgaaggcactcttgga
gatttaattattaaagcatatgaggaagcgaagaaaaattcaaatgaaactgtagagagg
aaaaaacttcgtgatgctctttctaaaattttagatgatatgaatgcacaattatcattt
gatggtaatggtggtgtgaaaaaagttaagatgagttcggactttgcaccagataaagaa
aagtatattaaaaatattattgatttatcaagcatgagttcagaaggtgaaataagagct
agtgatgttgctttaagaattgtaattagaaatgagaatgaaaacacaattggagataag
cttcgtactaatacggtttatactttgaatgctttagaggaacaggaagtgaatcgagat
ataactgttggtgatgatgttaagttgactttaacgggattgagtaactgtaaaactgga
aaagctccagcgttatttgtatctaaaaatgcaggaaaatctaatttatatgaaacgact
tcacaaaatttacaaggtactgctaaaaatgatatgtatgtcactcaatttaaagatggc
gtttatttggatatgaaatcatatgggacaagtgagcaagatatttttattacaacaaat
tctataagatttagaaatataactttcaaagatactgatagaagtatatcaagagttgag
attcaggatgatcaaggttatagatataattgtagtttgactttggagaatacggatact
ttttcaattgaggtaaatgggcttaagagtagtacgccatatgtgtttacaaaattattt
ataacatcagatatgaatggaagaacgacaactcaagaattgaatttaggttattatgat
aatggaactgttaaacaaaattatgaacctgtagttacattaaaagagccagaaccaaaa
attcaattagctggcacgaattcttcgatgattaagcttccaaatggtcttgatactaac
attgttaagaattctgattctgcattaagatatgtatttaaagttgataataaacaaggg
aatgttttagatcttaatgttacaagtcttacggactctgaaacataccgagtagaaaag
atgatagataaaacgcagaaggaaaattattatatagtgacgcttaataatttgacgaag
aataaagattatggatttgtaattttggaattaaattatttagatagcaatggaaatgtt
cagattgctagaaaaagtttatcaacattaaatccatcaaaaggtgaaaacattaaatat
gataacacaactgagggtgaaccattaccagttgaagaagctgtacaaatttcattaaat
gataattttagttcatcgtacgcaagagttgcaagagttccaattttaattgatgatttg
gaaaataggatagattcaatcgaggttaaaaatcctgacgataatccagatgcaaaagta
agttatgacaactttgtattacaatttagtgatttgaaaccagaaacaagtggaatgttt
actgtaatatttaattgtaataatacgactgctagagaagcgaatcaaataaaaagatat
gttagattaacaacaacagaaacaccagattatgatattaaatctgcagatataaatgta
gttgatccaactaaggtaaatattaaattaaacacatattcagagccaaaatcaaaagta
aaatctgtatcagtttatgatgatttaaataatgtttttaaatcaacatgggataacgat
acaaacacaataaaattagaaggacttaaaccagaatacacatacacgaacgtaattata
aggataaatttagaaaatggaaagagtgttgaatatccactgggaacttttaaaacggtt
gtcgatgagaataaaccaaaaggagaggtagctgaatttgtaagaagagtatataatatt
gctcttggacgtgagcctgaaggtggaggatggaatttctggatagaaaaacttcagagt
aaagagctttcagctacggaatttatagctgagaatttaatgactcaaccagaatttgtt
gacagggaacttactaaatcgaaatttgtttcaacaatgtacactttaatagtagacaga
gaggcagaagaggaagggcaaagatattgggaaggaaaatatgttgaatataggaatgaa
gtttcgactatcgcacagctaagaattaagatagcgagagaaatgatggatcagccggaa
tttaaagagttagtgagtaggataggacttatatattaa
DBGET
integrated database retrieval system