Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit: RATSFB_1124
Help
Entry
RATSFB_1124 CDS
T01624
Name
(GenBank) LysM domain protein
Organism
asb
Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SipL
LysM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK81686
LinkDB
All DBs
Position
complement(1293918..1295465)
Genome browser
AA seq
515 aa
AA seq
DB search
MEEINLIKQKISYECKNIEGHNDFVVKGEYLIPDTHPDVDKILLIEVKPRITNTEAFLDK
IFVEGELVYSIVYVAVDDEKNNTYNVSYSDKFNLYIESVGMRKENLYNIKVNVSDKKFLL
LNERKISIEANLKFSSNSNEILDVDIVSDIEDQDDIQFLMKELEVCELKGTFTEELINET
SINVPLDKGDIGKILICDSYIYKTECKLLDNKITYNAYCKVKVLYKEVNSDNLNYLEQDI
YLTKDCDVDGIDSSMIPVYNWDVIGFEYMIDEDESGESRIINSYINIRCNLKVLSKNILS
IIDDAYSKNYSVNLVKNNYKINNVESHGNIDTIIKDNINVEDVPVSIIYTTGVCNILNKK
VLEGKLVIEGVINTEVIYKNSEGQFLNVVQAIPFTTNFDDENIKIDMDAVINENLENIEA
FIEAKTIGIKAVINIRVYINSEIKRDILVDMYKTQEETPLKECSVIIYITGEDDTLWSIA
KKYCVSIEDICRINNLDQEDEIVGCKLLLPSKAVF
NT seq
1548 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggaagagataaatttgataaaacaaaaaattagttatgaatgtaaaaatatagaaggg
cacaatgattttgtagttaaaggtgaatatttaattccagatactcatccagatgtagat
aaaatattattaatagaagtaaaacctagaattaccaatactgaagcatttttagataaa
atatttgtagagggagaattagtatatagtattgtttatgttgcagtagatgatgaaaaa
aataatacatataatgtttcttattctgataagtttaatttgtatattgaaagtgttggt
atgagaaaagaaaatttgtataatattaaagtaaatgtttcagataaaaaattcttatta
ttaaatgaaagaaaaattagcatagaagctaatttgaaatttagttcaaattcgaatgaa
atattagatgtagatattgtaagtgatattgaagatcaagatgatatacagtttttgatg
aaagaattagaagtatgtgaactaaaaggtacatttacagaggaactaattaatgaaaca
tctataaatgttcctttagataagggggatattggaaagatattaatatgtgattcgtat
atatacaaaacagaatgcaaacttttagataataaaataacatataatgcttattgtaaa
gtcaaagtattatataaagaagttaattctgataatttaaattatttagagcaagatata
tatttaactaaagattgtgatgtagatggtatagattcaagcatgattccagtatataat
tgggatgtgattggatttgagtatatgatagatgaggatgagtcaggagaaagtaggatt
ataaatagttacattaatataagatgtaatcttaaagttttaagtaagaatatactttct
ataatagatgatgcttatagtaaaaattattcagtaaatttagttaaaaataattataaa
attaataatgtagaatcacatggtaatatagatacgataattaaagataatataaatgta
gaagatgttccagtttctataatttatactactggtgtgtgcaatatacttaataagaaa
gttttggaaggtaaacttgtaatagaaggtgttataaatactgaggttatatataaaaat
agcgaaggacaatttttaaatgtggtacaagctattccatttactactaattttgatgat
gaaaatattaaaatagatatggatgcagtgattaatgagaacttggaaaatattgaagct
tttattgaggctaagactataggaataaaggcggttataaatataagggtttacattaat
tctgaaattaaaagggatatattagttgatatgtataaaactcaagaagaaactcctctt
aaagaatgtagtgttataatatatattacaggagaagatgatacattgtggagtatagct
aagaaatattgtgtttcaatagaagatatatgtaggattaataatttagatcaggaagat
gaaatagttggatgtaaattgttgcttccatctaaagctgtattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
