Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit: RATSFB_1158
Help
Entry
RATSFB_1158 CDS
T01624
Symbol
LacI
Name
(GenBank) transcriptional regulator, LacI family
KO
K02529
LacI family transcriptional regulator, galactose operon repressor
Organism
asb
Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
asb00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
asb03000
]
RATSFB_1158 (LacI)
Transcription factors [BR:
asb03000
]
Prokaryotic type
Helix-turn-helix
LacI family
RATSFB_1158 (LacI)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peripla_BP_3
LacI
Peripla_BP_1
HTH_3
HTH_24
HTH_10
HTH_19
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK81720
UniProt:
G2IEZ6
LinkDB
All DBs
Position
complement(1330938..1331921)
Genome browser
AA seq
327 aa
AA seq
DB search
MVTIKDISDSLGISISSVSKALNGGTDISQKTREKVIEVANELGYIKKNISNKLNLKLGI
IVDQNCDEYKKILNYDIIQGFNSECIKDGNSTSIIYLKSEVKKICIDSIIRSNNLSGALL
LLNNISDSMRRSILKLSYPIVIVNSYVNIDKQNIGYVGIDMIDAMSKVVKCFVDMGHEKI
SFVSIKGNDYVYQDKLVGYIAALTSFGINYNPDNVLNVSSEDFDLQILKFVDSVHTNAIC
ADNDFTAYRILNILINKGYRVPEDISIIGFDNNFIFNYLNPSLSTVNYDKFELGVKAYFS
LKNIINGNNISKMQIKCDVLKRESTKI
NT seq
984 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaacgattaaggatatatcggatagtttgggaatatctataagttctgtttctaaa
gccttaaatggtgggacggatataagtcaaaaaactagagaaaaggttatcgaagttgca
aatgagcttggatatataaagaaaaatatttccaataaacttaatttaaaattgggtatt
atcgttgatcaaaattgtgatgaatataaaaagattttaaattacgatataatacaggga
tttaatagtgaatgtattaaagatggtaacagtacatcgataatatatttgaaaagtgaa
gttaaaaagatatgtatagattctataataagatctaataatttatcgggtgcactttta
ttattaaataatatttctgactccatgagaagatccatacttaaattatcctatccaatc
gtcatagtaaatagttatgtaaatattgataaacaaaacataggatatgttggtattgat
atgatagatgctatgagtaaagttgttaaatgttttgttgatatgggacatgaaaaaatt
agttttgttagcattaagggaaatgattacgtttatcaagataaacttgtaggttatata
gcagctttaacatcttttggaataaattataatcccgataatgttttaaatgtttctagt
gaagattttgatttacaaatattaaaatttgttgatagtgttcatactaatgcaatatgt
gcggataatgactttacagcatatagaattttgaatattttaattaataaaggttataga
gtgcctgaagatatttctataataggatttgataataattttatctttaattatttgaat
ccgtcgttatcgaccgttaattatgataagtttgagcttggggttaaggcttatttttca
cttaaaaatataataaatgggaataacataagtaaaatgcaaataaagtgcgatgtatta
aaaagagaatcaacaaaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
