Alkalimarinus sediminis: NNL22_03060
Help
Entry
NNL22_03060 CDS
T08621
Name
(GenBank) hybrid sensor histidine kinase/response regulator
Organism
asem
Alkalimarinus sediminis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_7
HATPase_c
Response_reg
HisKA
PAS_8
PAS
PAS_9
iSTAND
HATPase_c_2
PAS_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UZW75589
UniProt:
A0A9E8KQA1
LinkDB
All DBs
Position
complement(673831..677373)
Genome browser
AA seq
1180 aa
AA seq
DB search
MVQGWILIACSFIYIGALFGIAYYGDRHSFLYNNRFIRPQIYSLSMAVYFTSWTFYGAVG
RASTEGLGYLPIYLGPLLTFFFFGSIIDRIIRISKKQSTTSIADFIAARYGKSQAIAVIV
TTIAVIGIIPYIALQLKAVSMGFSILTTGDLTQDTDNISLFKDTAWWIALLMALFTIVFG
TRHLDATEHHQGMMQAVAFESIIKMVAFVFVGLFVCYSMFNGVDDIFTRINQSSGLEKFS
LGGFSSSEFIAQTIISMCAIICLPRQFHVTVVENYHRYDFQVARVMMPLYLIIASAFVLP
IAGAGWLMFDEGTVNADTLVLNLPIIADQKWLTILAFLGGGSAATAMVIVSSVTLSTMVC
NEIVIPLIFKLFQIKLNQQQNLSRLFLNIRRVTIVILLLLAYGFYRLTAQDVSLTAFGLL
SFVAVGQFAPALVGGVMWRKGNFHGAVSGLVGGFLIWVYTLFLPTLARNGWISADIIENG
LFNNSWLTPTSLFGSEMQLITHGIVWSLGTNIFLYVVVSLLTRQRVREKIQAAAFFHEVD
ISHQASQLEQRRSNATIDDLKALAERFMGPEKADAVFMIYETRFGEKLSPGRNASPNLLK
FIEKQLASAIGSSTAKVVLDSTIKGRDMHLEDVVSIVDEASQVMQFNRDLLQSAIENISM
GVSVIDERQRIVAWNQRYLSLFDYPKGFVQVGRPIADLVRLNLMAANLPPEKVEALIEER
LKLMQDGTPHEYERERPDGSILLIQGNPTPGGGFVTTFADITDLRKTTQALKETNTYLEQ
RVEERTQELSVLNDQLLHAKSVAEQANQSKTRFLASASHDLLQPLNAARLFTSALHQQHQ
EQDKDRSLIENIDHSLTAAEEILSTLLDISKLDAGVLETHITDFCIQDILKQLNAEFTLI
AENQNIVLKTVPCYQIVSSDSQLLRRVIQNFLSNAIRYTPSGKILLGCRRLKGFLRIEVW
DTGPGISETDTKLIFEEFKRLPHHGQDKKGLGLGLAIVDRVSHILGHPIKVSSKLGKGSV
FSITVPLGKSISTPKASTQTPVSTRKVGGLEDLNVLCIDNDPTILEGMATLLRGWKCQVV
AASSLADAQQKCPHQRPEIILADYQLDNDENGLDTMDELQLFFTTSASTNRIPGVLVTAQ
TGQELVEEVHERGYQILHKPVKPAALRAMMTKLIKSSNKP
NT seq
3543 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttcagggctggatactaatcgcctgttcgtttatctatattggcgcacttttcggt
atcgcctattatggagaccgtcattcgtttctttataataaccggtttattcgacctcag
atatacagcctctctatggcggtatattttacctcttggacattttatggtgctgttgga
cgagcctctacggaagggctaggatacctgcctatttacttaggccccctgctgacgttc
ttcttttttggttccatcatcgaccgcatcatccgcattagtaaaaagcagagcaccaca
tcgattgcagactttattgcggcacgctacggcaagtctcaagctattgcagttatcgtc
accactatcgccgttattggcatcattccctacattgccttgcagctaaaagccgtttca
atggggtttagtattctaaccaccggagaccttacacaagacaccgacaatatctcacta
tttaaagataccgcttggtggattgcgttattaatggcgctatttaccattgtgtttggc
acacgacaccttgatgccactgagcaccaccagggcatgatgcaagccgtagcctttgaa
tctattattaaaatggtggcgtttgtatttgtagggttatttgtctgctatagcatgttt
aatggtgttgacgatatattcacccgcatcaaccagtcatcaggcctcgagaaattcagc
cttggcggctttagcagtagtgagtttatcgctcaaaccatcatttcgatgtgtgcaatt
atatgcttgccacgacaatttcatgtaacagttgtcgagaactatcaccgctacgacttc
caagtcgctcgcgtcatgatgccgctctatctgatcattgccagcgcttttgttcttcct
atagcaggcgcaggctggttgatgtttgacgaaggcaccgttaacgccgacacattagtc
ctcaacctaccgattattgccgatcaaaagtggttaaccattttggcctttttaggtggc
gggtcggctgctacggcgatggttatcgtatcctcagtaacccttagtaccatggtctgc
aatgagattgttattcctctcatattcaaactttttcagatcaagcttaatcaacagcag
aatttgagccgcctgtttctcaatatccgccgtgtcaccattgttatattactgttactt
gcttatgggttttatcgattaaccgcgcaagacgtcagcctcaccgcctttggattatta
tcgtttgtcgctgtcggtcagtttgcccccgcattagttggcggcgtaatgtggcgaaaa
ggtaacttccatggtgcagtgagcggcttggttggcggttttctgatatgggtttatacc
ctatttctgccgacgttagctcgtaatgggtggatatcagcagacattatcgagaatggg
ttatttaacaatagttggttaacccctacatcgttatttggtagtgagatgcagttaatt
actcacggcatcgtatggagtttggggactaatattttcctctatgttgtcgtgtcacta
ctgacccgccaacgtgtccgagaaaaaattcaagccgcggcattctttcatgaagtggac
atttcacatcaagcatcacaactagagcagcgaagaagcaatgccactatagacgaccta
aaagcgctagccgaacgctttatggggccagaaaaagccgatgcggtatttatgatttat
gaaactcgtttcggagagaagttatcgccaggtcgcaatgccagccccaatttacttaaa
ttcatcgagaagcaactcgccagcgctattggttcatccaccgccaaagtggtgctagat
tcgaccattaagggccgtgatatgcaccttgaagatgtggtgagcatcgtcgatgaagcc
tctcaagtaatgcagtttaaccgcgacctgctgcaatcagcgattgagaacatatcgatg
ggagtcagtgtaatcgatgagcgtcaacgtattgttgcctggaatcagcgatacctcagc
ctgttcgactaccccaaagggtttgtacaggtaggtcgacctattgccgacttggtaaga
ctaaacttaatggcggcaaacctcccacccgagaaagttgaggcgttaatagaagagcgc
ctgaagctaatgcaagacggaacgcctcacgagtatgaacgtgagcgaccagacggctca
atactgctgattcaaggcaacccaacaccgggtggcggttttgtaacaaccttcgcagat
attactgatctcaggaagacaacccaagcactgaaagaaaccaatacctaccttgaacaa
agggttgaagagagaactcaagaactctctgtgcttaacgatcaattactacatgcaaaa
tcagtggcggaacaagctaatcagagtaaaacccgttttctagcctcggccagtcatgac
ctgcttcagcctctaaatgcggctcgactgtttacctctgcactacaccaacagcatcaa
gagcaagataaagacagaagcctgattgagaatatagaccattcactaaccgctgccgaa
gagatacttagcaccttgctagacatctccaaactagacgcaggggtacttgaaacacat
atcactgacttttgtattcaagacatactcaaacagctcaatgctgagttcacgctaatc
gcagaaaaccaaaatatagtgctcaaaaccgtaccctgctatcaaatcgttagctctgat
tcgcaattgctccgcagagtgattcagaacttcttgtctaatgcgattcgctacaccccc
agtggaaaaatactactgggctgtcgtcgcttaaaagggtttcttcgcattgaagtatgg
gataccggccccggcatctctgaaactgataccaagctgatttttgaagagtttaagcgc
ctgccccatcatggtcaggacaaaaaaggcctgggtctagggctcgctattgtagataga
gtgagtcacatattaggtcaccccattaaagtaagctctaaactgggaaaaggtagcgtt
ttttcaattacagtgcctcttggcaagagcatatctacgcctaaagccagcactcaaaca
cctgtatcaacccgaaaagtaggtggtttggaagatctgaatgtactttgcattgataat
gaccccactattttagaaggtatggccacgttgttaaggggttggaagtgtcaagtggtc
gcagctagcagcttagcggacgctcagcaaaaatgcccacatcaacgacctgaaattatt
ttggcagattatcaattagacaatgacgagaacggtttggataccatggatgaactgcag
ttattttttactacctcagcctccactaatcgcattcctggcgtattggtaacagcacag
acaggacaagaactagttgaagaagttcatgaaagaggctaccaaatactccataagcca
gtaaaacccgctgcactaagagccatgatgaccaagctgattaaaagctcaaacaagcct
tag
DBGET
integrated database retrieval system