Alkalimarinus sediminis: NNL22_16885
Help
Entry
NNL22_16885 CDS
T08621
Name
(GenBank) translocation/assembly module TamB domain-containing protein
Organism
asem
Alkalimarinus sediminis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
DUF4352
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UZW74673
UniProt:
A0A9E8HL32
LinkDB
All DBs
Position
complement(3792379..3796044)
Genome browser
AA seq
1221 aa
AA seq
DB search
MMWRILHIVARIARWFLIIPLVGSLMLIAWLLSTKEGTQLIAMEASERLSALQLEGVDGY
ILGDLTVDYLEWREEAVIVSAYGVSLNWGPLCLLERNICLDTLKADQLIVNLIPSTEESS
SSEGLPSIVMPVGIFADWADIQTLQLMISGQTHTITGLQFSGRWVDSLLALPQVSASYQG
INLDAEGDMDFATPWVTQFKGGVTYQLPDDISKQPLQFDFTLQGTQLAFDIAGDLSGDWP
VKLTSSISFDDPQLPLTLRFESPTTWQFPIGGEQAKPNMTSIDINQFAASTSLRDLTFKV
NSRLKTAYWSEFDLLVDGQWLDNRLTLNQLQLDSKDGQVQLKGALENSSKLPFDLILSTR
ALALHQAKLPNEQSATPLIPFPVVVNSDWRINGQLGEGRPEVTFNLSQLNAQVNEYPLAG
QAAFSFDGRQGGGLWRINELLVSSGVNQFSANGALSAAADRFQNIEMHFSLPDPHQWLPE
ISGSLVGSMSVDGTIDQLDLHGQLTTEMLEYGELSIGSVESEFDIAKSGKEESYLTVSVE
NLSAAAMHINSTDWQLKGDWNGSSMQGDIVIQDMGAVSLNCDLLWDVELQESTAEYPLKG
YVESDCSVFKWASDLLPYALFTPHNTGSIAINWSFDNRALVIKPFCLADEEIEICNHQDA
LWSPNDGYSLWLTTNQLPVKQLLERWNRLADGSQKLENLDIQGALSGFAKISQKPGSTID
AELAMELPVVDLWLGKRQTTALDSDSKHHLKDDDVTPLHLAFEPITLSSVMRDENITLDA
HFSSPQLGQAKSHLMITDIVKQRLLEGELSLTNLDLSFLEDVLPAVERITGLFSSQFRVS
GTAKKPALTGSFNLSDGSLKSGYLPETLDKVAIDGVFDQHQLSYQGIFSSAGGQANLDGK
LNWQEEWQLTTSLRSEAFNITPRSGVDLTIKPNLTLLLSEGFADVSGTFEIPYARIKIDE
LPEGTKSVSSDARIIGDEDATAGTQWDYQANIKIILGNDVYFRGFGVNTYLIGQLLLRQQ
PGKALAGKGEIKTEDGFYTIFGQRLTVKEGRFIFNGPLERPDLQLDAMRAISGSSVKVGV
KVIGPANEPEVTFYSQPAMNETSVIHYLLTGRAPDSNANNADLLNNMMLSAGIFGSSELT
EKWANKVGVTDLQISTQSDEEGTSLEVSGYLSPDIYLKYGASLYDEAKTVAMRYRLRPNL
FLEAAGGLNSSLDIIYSFEHE
NT seq
3666 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgtggcgcatactgcatattgtggcgcggatagcgcggtggtttttgatcataccg
cttgttggctctttgatgttgattgcatggctactctcaaccaaagagggcactcagctt
attgcgatggaggcaagcgagcgactgtcggcactgcagcttgaaggagtcgatggttat
attctaggcgacctaaccgtcgactaccttgagtggcgcgaagaagcggtaattgtgtct
gcttatggtgtcagtttaaactggggacctctctgtttattagaaagaaatatctgcctc
gacaccctaaaggcggatcagcttatcgtcaacctgataccttccaccgaagaaagtagc
agtagtgaaggattaccttcaatcgttatgccggttggtatttttgccgactgggcagac
attcaaacgttacagttaatgatttcagggcaaacccataccattaccggcctgcagttt
tcaggtcggtgggtcgatagcttactagccttacctcaagtatcggccagctaccaaggt
ataaaccttgatgccgaaggggacatggattttgcaaccccttgggttacccagtttaaa
ggaggggtaacctatcagctaccggacgatataagcaagcagccactgcagtttgatttt
acattacaaggcactcaactggcgtttgatattgcgggtgatctgtctggtgattggcct
gttaagcttacttctagtatttcgtttgatgacccgcagttaccattgacccttaggttt
gaatcaccgactacatggcagtttccgatagggggtgagcaggcgaaaccaaacatgacg
tctatagatatcaatcaattcgccgctagtacgagcttacgagatttaacgttcaaagtt
aacagtagacttaaaacggcttattggagtgaattcgacctgttggtcgatggacagtgg
ctagataaccggttaacgcttaatcagttacaactcgactcaaaagatggacaggtacaa
ttgaaaggagcgttggaaaactcgtctaagctgccatttgaccttattttgagtactcga
gcattagcgcttcaccaagccaagttacctaacgaacaatccgcaacaccgcttataccg
ttcccggtggtagttaatagtgactggcggataaacgggcaattaggtgaggggcgacct
gaagtcacatttaatttaagccagctaaacgcgcaggttaacgaataccccttagcaggg
caggcagcctttagtttcgacggtcgtcagggcggaggtctgtggcgcataaatgagttg
ttggtgtcttcaggtgttaatcaattcagtgcaaatggtgcgctgagtgctgctgcagat
cgatttcagaatattgagatgcacttttcattgccagatcctcatcagtggttgcctgag
attagcggaagtttagtgggtagtatgagtgttgatggcaccatagaccaactagacctg
catggccagttaacgaccgaaatgctggaatatggtgagctatcgattgggtcagtggaa
agtgagtttgatatagccaagtcaggtaaagaagagagctacttaacggtaagtgttgag
aacctcagtgctgcagctatgcacattaactctaccgattggcaacttaaaggtgactgg
aatggcagttcgatgcaaggcgatattgtcatccaggatatgggggccgtctctctaaac
tgtgacttgttatgggatgttgaactacaagagtcgactgctgaatatcctcttaaaggg
tatgtcgagagtgactgtagcgtgtttaagtgggcgtctgatctgctcccttatgctttg
tttacccctcataacacaggttctattgccattaactggagttttgataaccgtgcttta
gtgattaagcctttttgtttagccgatgaagaaattgaaatttgtaatcatcaagatgcg
ctctggagccctaatgatggttattcgctttggcttacgactaaccagttaccggttaaa
cagctgctggagcgctggaataggctggcagatgggagtcaaaagttagagaacctagat
attcaaggcgctcttagtgggttcgcgaaaatcagccaaaagcccggcagtacgattgat
gcagaattggcgatggagttgccggtagttgatttatggttgggtaagcggcaaacgact
gctttagatagcgactctaagcatcatttaaaagatgatgatgttacgccgctccattta
gcgtttgaaccgattactttatcctctgtcatgcgtgatgaaaatattacgcttgatgcg
catttctcttcgcctcagttaggtcaggccaaaagccatctgatgataacggatatcgta
aagcagcggttattagagggcgagctgagtttaacgaatttggatctctcttttttagag
gatgtattgcctgcagtcgagcgtataacggggctgttttctagtcagtttcgtgtatcg
ggtacagctaagaagcctgccttgacggggagttttaatttatctgatggctcactgaag
agtggttacctgcctgaaaccctcgataaagtcgcaatcgacggtgtgtttgatcaacac
caattgagttatcagggtatttttagttcagcgggcggacaggcaaaccttgatggtaaa
ttgaactggcaagaagagtggcagttgaccacatctttgcgctcagaagcctttaatatt
acccctcgctctggcgtggacttaaccattaaacccaatttgacgctactgcttagtgaa
ggctttgccgatgtatcaggaacatttgaaattccttatgcgcgaataaaaatagatgag
ctaccggaaggcactaaatcggtttctagtgatgcacgaataattggtgacgaagatgcc
actgcaggcactcaatgggattaccaagccaatattaagatcatactgggtaatgatgtt
tactttagagggtttggtgttaatacctatctcatagggcagctattattgcgacagcaa
ccgggtaaagcattggctggcaaaggcgaaataaaaacagaagatggcttctatacgatt
tttgggcagcgactgacggtcaaggaggggcgttttatcttcaacggccctcttgagcgt
cctgacctgcagcttgatgccatgcgcgcgatttcaggcagttccgttaaagtaggggta
aaagttatagggccggccaatgagcccgaagtcaccttctactcgcaacccgccatgaac
gaaaccagtgttattcattacttgttaacagggcgagcacccgactcaaatgcaaacaat
gcagacctgttaaacaatatgatgttatccgcagggatttttggttctagtgaattgact
gaaaaatgggccaataaagtgggtgttacagacctgcaaattagtacacaatcagatgaa
gaaggcaccagcctcgaagtgagtggctatttatcccctgatatttatctcaaatatggc
gcaagcctctatgatgaagctaaaacagtggcgatgcgctatcggctaagacccaacttg
tttctggaagccgcaggaggtttaaatagctcgctggatattatctattcgtttgagcat
gaataa
DBGET
integrated database retrieval system
