Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Japan: SFBM_0011
Help
Entry
SFBM_0011 CDS
T01591
Name
(GenBank) ATP-dependent nuclease subunit A
KO
K16898
ATP-dependent helicase/nuclease subunit A [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
asf
Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Japan
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
asf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
asf03400
]
SFBM_0011
Enzymes [BR:
asf01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
SFBM_0011
DNA repair and recombination proteins [BR:
asf03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
SFBM_0011
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
Viral_helicase1
PDDEXK_1
DEAD
AAA_12
AAA_14
ResIII
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK55794
LinkDB
All DBs
Position
16198..19779
Genome browser
AA seq
1193 aa
AA seq
DB search
MDFSKNQKNVIELINGDLLVSASAGSGKTAVLVQRIINLILNYCVSINEILVITFTNAAA
VEMKERIVKALEDNINDINKHILEEQLMLVSNSNIQTFHSFCLDILKNNYYKLNLGSNFK
IIKDSHRKMLIGDALDDTFNFYYENEDEDFLTIVNIYGGKYSDVKLREIIVYIYEFIQNI
VDIDGFIEKSTDIYIIKDNDDIFSTKLGKVLRLRLINKFTLYKKKLIDFLLGISNNKKVY
SIIENDIFIINSFIKRLNNSYEDVYEYIYSFNFLRLSKLCDDYKEIRSGLKDFIDSLKKN
IFIVSENILKLQIGDLKNIVIKLFEIVCKFKEKFELGKLSENYVDFNDMEHLVIKLLNDT
RICDNYRNKFKYIFIDEYQDTNYIQEYIINKIKNNYNVFMVGDIKQSIYGFRGAKVDLFS
KKYKNFKKVDDITFVEGNENKILLYDNYRSRNEVISFVNFIFENIMIDGISNIEYTPEEY
LNCASDYKVIKNNNENCEGEVTLSIIINDEKNSDIINEMEDVECSLIIEYINKLINSEDT
IYKIYDKSINGYRKIEYKDIVILVRNVNGACISKLLHEELEKNNIPSYFDGGDQFFDCIE
VITILSLLKVINNPTDDVDILTVLKSEIFNFSNNDLAYIRIVNNDEYIYKNIKYILNLNC
CVENRVFLNDEFSITYDRFKILYDKCMFFVEKINEYREKSLFMKIDEFIWFIYKDSKYYF
LLSTMEDGLTKQSNLRIIFNKAKEFRVASFSGLFNFIEYLKYSKKFGDDILVPKNISENE
NVVRIMSIHKSKGLEFPVVILCNTSGRFNFKDLNNSIILHDEFGIGLNHIDYNLNLETDM
FIKNIIKEDHKDNIISEELRILYVALTRAKEKLFITGTYNSDKDFQRVADIYKCKSYLDF
LCNSLMKHRDGYILREYKGENGLHNDLNKCEFKINVYNKSDFLKGEKHDSENDDINLESI
MERESSSYNHINDIFNFKYDYDDVINMPINLSVSEILSYDEEEKLNINFKVPKFIDDSKN
EKLYTALDIGNLYHFFMQNIVLGPSMVYDYLESELNRMVKCEMLSNDDIKYLNLNKILKF
FESNLGKRVIECFNKDRRKVYREFEFLMNHRVDKINKNNDLRIQGIIDLFFFDGDNIVLI
DYKTDKHIFNNKVIPNKYKEQLYYYKIALNKIFNLDISESYIYSFENNKAFMV
NT seq
3582 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggattttagtaagaatcagaaaaatgttattgaattaattaacggagatttgctcgta
tcggcttcagctggatcaggaaaaacagcagttttagttcagcgtataataaatttaata
ttgaattattgtgtatctataaatgaaatattagtaattacatttacaaatgctgcagca
gttgaaatgaaagagagaattgtaaaagcattagaagataacattaatgatataaacaaa
catattttagaagagcaattaatgttagtaagtaattctaatattcaaacctttcattct
ttttgtttggatattttaaaaaataattattataaattaaatttgggatctaattttaaa
ataattaaggatagtcatagaaagatgctaattggtgatgcacttgatgatacatttaat
ttttattatgaaaatgaggatgaggattttttgactatagtaaatatttatggaggaaaa
tattcagatgtaaaattaagggagataattgtatatatttatgaatttatacaaaatata
gttgatattgatggatttatagaaaaaagtacagatatttacataataaaagataatgat
gatatattttcaaccaaattaggtaaggtattacggttacgattaataaataaatttaca
ttgtataaaaaaaagttaattgattttttattgggaattagtaataataaaaaggtttat
agtattatagagaatgatatatttataattaattcatttataaaacgattaaataattct
tatgaagatgtatatgagtatatttatagttttaattttttgagattatcaaaattatgt
gatgattataaagaaataaggagtggattaaaagattttatagactctttaaagaaaaac
atatttattgtaagtgaaaatatattaaagttgcaaattggtgatttgaaaaatattgtt
attaaattatttgagattgtatgtaaatttaaggagaaatttgaattaggaaaattatca
gaaaactatgtagattttaatgatatggaacacttagtaattaaactcttgaatgatacc
aggatatgtgataattatagaaataaattcaaatatatttttatagatgaatatcaagat
actaattacatacaagaatatataataaataaaataaagaataattataatgtatttatg
gtcggcgacattaagcagagtatttatggttttagaggtgcaaaagtagatttatttagt
aaaaaatacaagaattttaaaaaagtagatgatataacttttgtagaaggaaatgagaat
aagatattattatatgataattataggagtaggaatgaagtaattagttttgttaatttt
atatttgagaatattatgatagatggaatatctaatatagaatatacacctgaggaatat
ttaaattgtgcaagtgactataaagtgattaaaaataataatgaaaattgtgaaggagag
gttactctttcaattataataaatgatgaaaaaaattcagatattattaatgaaatggag
gatgtggagtgtagcttaattattgaatatataaataagcttattaattctgaagataca
atatataaaatttatgataaaagtattaatggatataggaaaattgaatataaggatatt
gttattttagtaaggaatgtaaatggtgcatgtatatcaaaattattacatgaagagctt
gagaaaaacaatataccatcatattttgatggaggggatcaattttttgattgtattgag
gtaatcacaatattaagtttacttaaagttattaataatcctactgatgatgttgatata
cttacagttcttaaaagtgaaatatttaatttttcaaataatgatttagcatatataaga
attgtaaataatgatgagtacatatataaaaatattaagtatattttgaatttaaattgt
tgtgtagaaaatagagtgtttttaaatgatgaattttcaataacctatgacaggtttaaa
attctttatgataagtgtatgttttttgtagagaagataaatgaatatagggaaaagtca
ttgtttatgaaaattgatgagtttatttggtttatatataaggatagtaaatattatttt
ttactgtcaactatggaagatggattaactaagcagagtaatttaagaattatatttaat
aaggcaaaggagtttagggttgctagtttttcaggattatttaattttatagagtatttg
aagtattcaaagaaatttggagatgatatattagtccctaaaaatatatctgagaatgaa
aatgtagtacgtataatgagtatacacaaaagtaaaggacttgaatttccagtagtaata
ctttgtaatacatcaggtagatttaattttaaggatttgaataattctataatattgcat
gatgagtttggtattggattaaatcacatagattacaatttgaatttagaaacagatatg
tttattaaaaatattattaaagaagatcataaagacaatattatttcagaagaacttaga
atactatatgtggctttaacaagagctaaggagaaattatttataacaggtacatacaat
tcggataaagattttcaaagagtagctgatatttataaatgtaagagttatttggatttt
ttgtgtaattcacttatgaaacatagagatggatatattcttagagaatataaaggtgaa
aatggattacacaatgatttaaataagtgtgagtttaaaattaatgtatataataaatca
gattttttaaagggtgagaaacatgatagtgaaaatgatgatataaatttagaaagtatt
atggagagagaatcctcaagttataatcatataaatgatatttttaattttaagtatgat
tatgatgatgtgattaatatgccgattaatttatctgtatctgagatattatcttatgat
gaggaagagaaattaaatataaattttaaggttcctaaatttattgatgatagcaaaaat
gaaaagttgtacacagctttagatataggtaatttatatcatttttttatgcaaaatata
gttttaggaccaagtatggtttatgattatttagaaagtgagctaaatcgtatggttaaa
tgcgagatgctttctaatgatgatattaagtatttgaatttaaataagatattaaaattt
tttgaaagtaatttaggtaagagagttatagagtgttttaataaggatagaagaaaagtt
tatagggaatttgagtttttgatgaatcatagggtagataagataaataaaaataatgat
ttgagaattcaaggaataattgatttgtttttctttgatggagataacatagttttaata
gattataaaacagacaagcatatatttaataataaagttattcctaataagtataaagaa
caactttattattataagattgctctgaataaaatatttaatttagacatttctgagagt
tatatttattcttttgagaataataaagcttttatggtttga
DBGET
integrated database retrieval system
