Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Japan: SFBM_0186
Help
Entry
SFBM_0186 CDS
T01591
Name
(GenBank) beta-galactosidase
KO
K01190
beta-galactosidase [EC:
3.2.1.23
]
Organism
asf
Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Japan
Pathway
asf00052
Galactose metabolism
asf00511
Other glycan degradation
asf01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
asf00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00052 Galactose metabolism
SFBM_0186
09103 Lipid metabolism
00600 Sphingolipid metabolism
SFBM_0186
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00511 Other glycan degradation
SFBM_0186
Enzymes [BR:
asf01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.23 beta-galactosidase
SFBM_0186
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_2_C
Bgal_small_N
Glyco_hydro_2_N
LacZ_4
Glyco_hydro_2
Laminin_G_3
Glyco_hydro_2_N2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK55965
LinkDB
All DBs
Position
198789..202352
Genome browser
AA seq
1187 aa
AA seq
DB search
MEIFSLDYAPEDRNLDFYRRDYDVSSWEYINVPSNWQMEGYDFPIYVNFRYPWTGFENLE
FYKAPKIFNPVGNYRRDFYVDESWLDDKVYISFQGVESCFYLWINGGFVGYSEDSFSPSE
FDVTDFLVCGNNSISVQVFRWCDGSFIEDQDFIRLSGIFRDVFLYRTPKIHIADFEVITK
ADDNYMNFDLLVNINMLNHINENRNYTISAVIFDEKWNLINSVENMGNFDRNYPYRDAIK
SDFSLCLNIKEPNRWSAEEPNLYNLIISLKNDLLNETQSIHTRVGFRAFEIKGNKMYING
KPILFKGVNRHETHPLKGRALSTLDMEFDIREIKKNNINSVRTSHYPNHPYFISLCNEYG
IYVVDEGNIEAHGVEGEIPGNKEIWKNACFDRINSLVERDKNNPSVLIWSLGNESGGGSV
FRDLYNYVSLRDGTRVIHYEGERDEYYASDVVSKMYVKIDDIEKQSKYMYHKPYILCEYA
HSMGNSGGSLDKYIEKFESIDNVQGGFIWDFIDQGIYRDVPDMGIFINSHSIFHGDFEGY
IENGYKDKGYRGCIFYDNVSNLKFDEFTIDLKVKPSVYEGEGCVYLKKGNEFGLREIMNY
DKSNNRAVEFYVRDNSGIFETIVFITPKDWVNNFHSVSAIYKNKIMRLFIDDNLVGEKTF
NYNIAYFKDGIQIGGNDGYTHCESMNGIIDEVKLFSKGMDIEELRKKSFYNIDATRIIWN
DFDNERNMIMKKLSRDKYLATGGDFNDSPNDSAFCANGILLASRKIKPQVSEVKYAYQNI
DIRDYDILNGKVIIKNKNLFKNLRDYILKWDYLVDGKIVRGDTAIVNVDPMSEIIFNVHD
MDKIKDLNGKEFFLNIGFVLNESTNWGNRGFEISRNQLKINLDNLFYEVGNVSKVVQNFM
IDDLSDKLEIKSKEYYIGFNKISGTLQNYRYKNEDLINSELYVDFWNPLNDNERLCNIYN
KIVFWKNIFNRSRNNSYNILHEDGCILVKFYKPIYDLNNSVLITTYKIDEYGEISIELYM
ELLKNGIPHARSVGFKIFIPTNFKNIEYYGRGPLENYNDRNKGSNLGEYKSDVDSQFTDY
MTPQRTGNITDIRWINFYRNNGIGIRIKYINEFLQINVSSYNDDEFEKKHSYQMNKYSSI
IVNVRSKDYGSTFESFEDECINYIDKNHIYNFSFKLSPLLTDNVLIN
NT seq
3564 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagattttttcacttgattatgcaccagaagatagaaatttagatttttataggaga
gattatgatgtatctagttgggaatatataaatgtgccgagtaattggcaaatggaggga
tatgatttccccatatatgttaattttagatatccttggactggatttgaaaatttagaa
ttttataaggctcctaagatttttaatcctgttggtaattataggagagatttttatgta
gatgaatcttggcttgatgataaagtttacatatcatttcagggtgttgaatcttgtttt
tatttatggataaatggaggatttgttggatatagtgaggatagtttttcacctagcgag
tttgatgttaccgattttttagtatgtggtaataattctatatctgttcaggtttttaga
tggtgtgatggaagttttattgaagatcaggattttattcggttaagtggaatttttagg
gatgtatttttatatagaacccctaagatacatattgcagattttgaggttataactaaa
gcggatgataactatatgaattttgatttgttagttaatattaatatgctcaatcacatt
aatgagaataggaattataccatatcggccgttatatttgacgagaaatggaatttaata
aatagtgttgagaatatgggtaattttgacaggaattatccatatagagatgctatcaag
agtgattttagtttatgtttgaatataaaagagcctaatagatggtcggcagaggaacct
aatttatataatttaataatttctcttaaaaatgatttgcttaatgaaacacaatcaata
catacaagggttggatttagagcatttgagataaaaggaaataaaatgtacataaatggg
aaaccgattttgtttaagggtgtaaatagacatgaaactcatccattaaaaggaagggca
ttatctacactggatatggaattcgatataagagagattaagaaaaataatataaactct
gtaagaacttcacattatcctaatcatccttattttatttcattatgtaatgaatatgga
atttatgtagttgatgagggtaatatagaggcacatggcgttgagggtgagatacctggg
aataaagagatttggaagaatgcatgttttgatagaattaattcacttgtagagagagat
aagaataatcctagtgttttaatatggtctcttggaaatgagagtggaggaggaagtgta
tttagagatttatataattatgttagtttaagagatggaaccagagtaatacactatgaa
ggcgagagagatgaatactatgcaagtgatgttgtaagtaaaatgtatgttaaaatagat
gacattgagaaacagagtaaatatatgtatcacaagccttatattttgtgtgaatatgct
cattctatgggaaatagtggtggaagtttagataaatatattgaaaaatttgagagtatt
gataatgttcagggaggatttatatgggattttatagatcaaggaatttatagagatgtt
cctgatatgggtatttttattaattctcatagtatatttcatggagattttgaaggatat
atagaaaatggatacaaagataaagggtataggggatgtatattctatgataatgttagt
aatttaaagtttgatgaatttaccatagatttaaaggtaaaaccaagtgtatatgaggga
gaaggatgtgtttatctaaagaaaggtaatgaatttggattaagggaaattatgaattat
gataagtctaataatagggctgttgaattttatgtaagagataattctgggatatttgag
acaattgtatttataacacctaaggattgggtgaataattttcatagtgtaagtgcgata
tataaaaataagattatgagattatttatagatgataatttggttggagagaagacattt
aattataatatagcatatttcaaagatggtattcaaattggaggaaatgatggttatact
cactgtgaaagtatgaatgggataatagatgaggttaagttattttctaaaggaatggat
atagaggaattacgtaaaaagagtttttataatatagatgctacaaggataatatggaat
gattttgataatgagagaaatatgattatgaaaaaattatccagagataaatatttggct
acgggaggtgacttcaatgattctccaaatgattctgcattttgtgctaatggtatattg
ttagcatctagaaagattaaaccacaagtaagtgaggttaagtatgcatatcaaaatata
gatattagggattatgatattttaaatggtaaagtaattattaaaaataaaaacttattt
aaaaatttaagagattatatattgaaatgggactatttagttgatggcaaaatagtaaga
ggagatacagctatagttaatgttgatcccatgagtgaaattatatttaatgtacatgat
atggataaaattaaggatttaaatggaaaagaattttttttaaatattggatttgtatta
aatgaaagtacaaattggggtaacagggggtttgaaatatcaaggaatcaattaaaaata
aacttagataatttgttttatgaagtaggtaatgttagcaaggtagttcaaaattttatg
attgatgatttgtcggataaattggaaattaaatctaaagaatattatattggatttaat
aaaatatcaggtactctccaaaattataggtataagaatgaggatttaataaattctgaa
ttatatgttgatttttggaatccattaaatgataacgaaagattatgtaatatatataat
aagatagtattctggaaaaatatatttaatagaagtaggaataatagttacaatattttg
catgaagatggttgtatattggtaaaattttacaaaccaatctatgatttaaataattca
gttcttattacaacatataagatagatgagtacggggaaattagtattgagctatatatg
gagttattaaagaatggtataccgcatgctaggtcagtaggatttaagatatttatacct
actaattttaaaaatattgagtattacggaagaggaccattagaaaattataatgatcga
aataaaggtagtaatttaggagaatataaaagcgatgtagatagtcaatttacagattat
atgactcctcaaagaacagggaatataacagatattagatggataaatttttataggaac
aatggtataggtattagaatcaaatatattaatgaatttcttcaaataaatgttagttca
tataatgatgatgaatttgagaaaaaacattcttatcaaatgaataaatattcgtcaatt
atagtaaatgttagatcaaaggattatggaagcacattcgaaagttttgaagatgaatgt
attaactatattgataaaaatcatatatataatttttcattcaaattatcacctttatta
acggataatgtattaattaattga
DBGET
integrated database retrieval system