Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Japan: SFBM_0210
Help
Entry
SFBM_0210 CDS
T01591
Name
(GenBank) BglG family transcriptional antiterminator
KO
K03483
mannitol operon transcriptional activator
Organism
asf
Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Japan
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
asf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
asf03000
]
SFBM_0210
Transcription factors [BR:
asf03000
]
Prokaryotic type
Other transcription factors
BglG family
SFBM_0210
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PRD
HTH_11
Mga
HTH_Mga
PuR_N
HTH_38
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK55989
LinkDB
All DBs
Position
231353..233452
Genome browser
AA seq
699 aa
AA seq
DB search
MSKLKLTFRQKQIILILIDNFKNPKRIKDISNELNVSSRTIMRELHLIEEFFDEREILFV
KKSGVGIFLDGEYEKINKLREEMSLEYPLTKYSKNDRVICILENILHSETKSTLFLNKFK
ISYSTFSKDLDYIKSKILTKFDLKLLTKKGLGIYIEGSEDKLRELSSYLFYEKFSGRNLY
LIFQNYSLNLYDDFGGLLEEHLKIINQVVEETFLLFNIKLSHKAYSSLMVHLIVTLHRMK
DSYNCEFPLSKINEFKKDIEFNISKMILNKLDEKFEIEVKDGDICYISMHLKANNICGDN
YEYSDDFNFDRLDRIKISGDIICEVQKILGISLIDSRDLIKNLSLHLGPAINRLFMNMNI
RNSFLGMMKTEYKEIFDATKKACLVLENVISREVPDSEVGYITMHIVAAYERKLQLKFKY
RVLIYSEGERGVTSFLYNKITKEFPNVVIVNTIDSFDELRNSYDENIDFIISTSDIKDNM
NYIKVGVDLSISDILIINDKIKEIFKLKSKAIKNVENKNKSLDIDVINYLGNMIKFIEEN
FKVNKIDTYGSIQNVIRDFVYKTLSYNRDEIFHEILRKEMISSSYVKELGIIILHTISKF
SKDIYIGSYILSKDIPIYNGNLNIIFYFIIPEELNTKVLRKVIGELTSNLVKDDTFIDIL
KKQDILIIREYIRNILSIYYVEELKGIIEKFENGIIKER
NT seq
2100 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaaattaaagttaacttttagacaaaaacaaataattttaatacttattgataat
tttaaaaatcccaaaagaataaaagatatatcaaatgagttaaatgtgagttctcgaact
attatgagggaactccatcttattgaagaattttttgatgagagggagatattatttgtt
aaaaaaagtggggttgggatatttttagatggtgagtatgaaaagataaataaattgaga
gaagagatgagcttagaatatcctttaactaaatattcaaaaaatgatagagttatatgt
atacttgagaatattttacattcagaaactaagagtactttatttttaaataagtttaag
atatcttattctactttttcaaaggatttggattacataaaaagtaaaattttaactaag
tttgatttaaaacttttaactaaaaaaggtttagggatatatatagagggaagtgaagat
aaattaagagagctttcttcttatttgttttatgaaaagttttcaggaaggaatttgtat
ttaattttccaaaattattctttgaatttatatgatgattttggtggattgcttgaggaa
catcttaaaattataaatcaagtggtagaagagacttttttattatttaatataaagtta
tcgcataaagcgtattcatctcttatggttcatcttattgtaacgcttcataggatgaaa
gattcttataattgtgaatttccattatctaagataaatgagtttaaaaaggatatagag
tttaatatttcaaagatgatattgaataaattggatgaaaaatttgaaattgaagttaaa
gatggggatatatgttacatatcaatgcatcttaaggcaaataatatatgcggtgataat
tatgagtatagtgatgattttaattttgatcgtttagataggattaagatttcaggagat
attatatgtgaggttcaaaagatacttggaatatctcttatagattcaagagatcttata
aaaaatttaagccttcatcttggacctgctataaatagattatttatgaatatgaacatt
agaaattcatttttagggatgatgaaaacagagtataaggaaatatttgatgcgacaaag
aaagcatgtttggttttagaaaatgtaatatcgagagaggttccagatagtgaagttgga
tatataacgatgcacatagttgcagcttacgaaagaaagctccaattaaaatttaaatat
agagttttaatatattcagagggagagaggggggttacctcctttttatataataaaata
acaaaggaatttccaaatgttgttattgtaaatacgattgattcttttgatgaacttagg
aattcatatgatgaaaatatagattttattatttcaacaagtgatataaaagataatatg
aactatataaaagttggtgttgatttaagtataagtgatatattaattataaatgataag
ataaaagaaatatttaaattaaagtccaaagctattaagaatgtagaaaataagaataag
tcattagatatagatgtgataaattatttaggaaatatgattaagtttatagaagaaaac
tttaaggtaaataaaattgatacatatggatcaatacaaaatgtaatcagagattttgtg
tataaaactctttcttataatagggatgaaatatttcatgaaatattaagaaaagagatg
atatcgagttcttatgtaaaggaattagggataataattcttcatacaataagcaaattt
tcaaaggatatatatatagggagttatatattaagtaaagatataccaatttataatgga
aatttaaatattattttttattttattataccagaagagttaaatacgaaagttttaagg
aaagttataggggagttaacttcaaatttagtaaaagatgacacttttatagatatttta
aaaaaacaggatatattgattattagagagtatataagaaatatattatcaatttattat
gtggaagaattaaagggaattatagagaaatttgaaaatggtatcataaaggagaggtaa
DBGET
integrated database retrieval system