Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Japan: SFBM_0665
Help
Entry
SFBM_0665 CDS
T01591
Name
(GenBank) chromosome segregation protein SMC
KO
K03529
chromosome segregation protein
Organism
asf
Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Japan
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
asf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
asf03036
]
SFBM_0665
Chromosome and associated proteins [BR:
asf03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Condensin-like complex
SFBM_0665
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_23
AAA_15
AAA_21
AAA_29
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK56442
UniProt:
F9VK30
LinkDB
All DBs
Position
715780..719346
Genome browser
AA seq
1188 aa
AA seq
DB search
MILKSIEIRGFKSFADSTELIFKQGITSVVGPNGSGKSNIADAIRWCLGEQSVKSLRGGK
MEDVIFSGTQYRKQLSLAQVSLIIDNSERELPIDYSTVIISRKLYRSGESEYLINNKPCK
LKDINGLFFDTGIGKEGYSLIGQGKIDVILNGNSNDRRAIIEEAIGITKYKFKKEEAYNK
INHANENIVRINDMLFTYEEYLEPLKIESEKARKFIDLSNELKDLEILILYNNLYDIHEE
IQSIKRDISYHNLKLSELSSEKRIMENKRYSFEKEFENLKIIEKKDKKKYYKIKDIIHKN
TNIVNLKNNDISILINSNKIYEKQIYENKSKIDNIILRENIINKTRDELENEFNSILCNL
EENKKLSTDNSMTLHNLENKINTILLEKNKIVNINNNIQNKIEFIRMSFSNIDNDKKAYL
DEKQLIEDRIKKIDKDIEHIEHILYDLHIRESEVKVLSENLLNSIEKENKKIEIVDSQLN
DLNKDVIIRQANLDALRGLDSIYDGFNKSSKTLMNEINSGSLIRFKDRCFIIGNILDTEE
KYTSAIETVIGGHISDIVIDDYVFVNDLINHLKENNLGRVTFHPLNSVSKYNIKFNNEVK
LYKGFINFAINLVKYDSKFSNIISNILGNTIICDNIDNALNIAKSINFSNRIVTLDSQII
NSGGSITGGSSYFKKFNILGRQRKISVEEDDINKKLLYISELKTKLSNCHDVKNNIQSEF
DINNNLLKDITIDIFKKNEELKRYIDLRSRDLKELDKKNIVLNNLDDIYSSNDEEINKLN
YELNLNNEKFSVLENDEKNIRIECENYKKIIEGMENEITNYKIRKAKIEENISNIYDESK
RIALEKKDLICANVKINDNINLNNVNILKIEDSIQIFNKRIDNLNQKFNEYNFDSYILDQ
NRIQQDIKKLNGDINELDLSIHKIEHDINVLNIKNTKKEVEFNINNDNLFDKYSINFDTN
DAEKYIIDSNELSKYSIKMKKITSDISDLGNINIKSIEEYEALNDKVNFITRQKEDLEKS
KMELEDFIKNITSEMRNMFNQSFKLINENFNFTFKELFKGGSAQLLLGDGDELESDIEII
VQPPGKKLQNINLLSGGEKGLSAISLLFAILKLKPVPFCVLDEIEAALDDNNVIKFSTFL
KQYSSNVQFIVITHRKPTMEASDVIYGVTMEEKGVSKVVSINLANYNT
NT seq
3567 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattcttaaatcaatagagataaggggatttaaatcttttgcagactcaactgaactt
atatttaaacaaggtataacatctgtggtaggaccgaatggaagtggtaagagtaatata
gcagatgcgataagatggtgtttaggggaacaaagtgtaaaaagtctcaggggtgggaag
atggaagatgttattttttccggaactcaatataggaaacaattatctttggcacaggtg
tcattaattatagataattcggaaagggaacttccaatagattatagtactgttataata
tctagaaaattatatagatctggagagagtgaatatttaataaataataaaccgtgtaaa
ttgaaagatataaatgggttattttttgatacaggtatcggtaaggaaggttattcttta
attggacaaggaaagatagatgttatattaaatggaaattctaatgatagaagagctata
attgaggaggcaataggtataactaaatataaatttaagaaggaagaagcatataataaa
attaatcatgccaatgaaaatattgttaggattaatgatatgctttttacatatgaagaa
tatttggaaccattaaaaattgagagtgaaaaagctagaaaatttatagatttatcaaat
gaacttaaagatttggaaattttaattttgtataataatttatatgatattcatgaagaa
atacagagtataaaaagggatataagttaccataatttgaaattaagtgaattaagtagc
gaaaaaagaattatggaaaataagaggtattcatttgaaaaagaatttgaaaatctgaaa
ataatagagaagaaagataagaagaaatattataagattaaggatattatacataaaaat
acaaatattgtaaatcttaaaaataatgacataagtatacttattaattcaaataagata
tatgagaagcagatttatgaaaataaatctaaaatagataatataatccttagagaaaat
ataattaataaaacaagagatgaattggagaatgaatttaatagtattctatgtaatcta
gaggaaaataaaaaattaagcacggataatagtatgacattacataatttagaaaataag
attaatactattctactagaaaagaataaaattgttaatatcaataacaatatacaaaat
aaaattgaatttataagaatgagtttttctaatatagataatgataagaaggcatactta
gatgaaaaacagttgatagaagatagaattaaaaaaattgataaagatatagaacatata
gaacatattttatatgatttacatattcgtgaaagtgaagttaaagttttatctgaaaat
ttattaaatagtattgaaaaagaaaacaaaaaaatagagatagttgatagtcaattgaat
gatttaaataaggatgtaataataaggcaggcaaatcttgatgcattaagagggcttgat
agtatttatgatggatttaataaatctagtaaaactttaatgaatgaaattaattctggt
tcattaattagattcaaagatagatgttttattataggaaatattttagatacggaagag
aaatatacatctgctattgagacggttattggaggacatatttctgacatagtgattgat
gattatgttttcgtaaatgatcttataaatcatcttaaagagaataatcttgggcgtgtt
acatttcatcctttaaatagtgttagtaaatataatataaaatttaataatgaagttaag
ttgtataaaggatttataaattttgccataaatttagttaagtatgattcaaaatttagt
aatattattagtaatatcttaggaaatacaattatttgcgataatattgataatgcatta
aatattgctaagagtataaatttctctaatagaatagttactttggattcccaaattata
aattctggaggatctattacaggtggatcaagttattttaagaaatttaatatacttggt
agacaacggaaaatttcagttgaggaagatgatattaataagaaattattatatatatct
gaattgaaaactaagttaagtaattgtcatgatgtaaaaaataatatacagagtgagttt
gatataaataataatttattaaaggatatcactatagatatatttaagaaaaatgaagag
ttaaagagatatattgacttaagatcaagagatcttaaagaactagataagaagaatatt
gtattgaataatctagatgatatttatagttcaaatgacgaggaaattaataagttgaat
tatgaattgaatttaaataatgagaagtttagcgttttagaaaatgatgagaaaaatata
aggatagaatgtgaaaattataagaagataattgaaggtatggaaaatgaaattacaaat
tataaaattaggaaagcaaaaattgaagaaaatatttcaaatatttatgatgaaagcaag
agaattgcattagaaaagaaagatctaatttgtgctaacgttaagattaacgataatata
aatttaaataatgttaatatattgaaaattgaagatagtatacaaatttttaataagaga
atagataatttaaaccagaaatttaatgaatataattttgattcctatatattagatcaa
aataggatacaacaagatataaaaaaattaaatggggatattaatgaactggatttaagt
atacataaaatcgaacatgatattaatgttttaaatattaaaaatactaaaaaagaagtg
gaatttaacataaataatgataacttatttgacaaatattctatcaattttgatacaaat
gatgcagaaaagtacataatagattcgaatgaacttagtaagtatagtataaaaatgaaa
aagataactagtgatataagtgatttagggaatataaatattaagtctattgaggaatat
gaagcacttaatgataaagtaaactttatcactagacagaaggaagatttagaaaagagt
aaaatggagcttgaggattttattaaaaatataacatcagaaatgcggaatatgtttaat
caaagttttaagctcataaatgaaaattttaattttacatttaaagaattatttaagggt
ggaagtgcacaacttttattaggagatggggatgaattagaaagtgatattgaaataatc
gtgcaaccaccaggtaagaaacttcaaaatattaatttattgtcgggtggtgaaaaagga
ctttctgcaatatctcttttatttgcgattttaaagttaaaacctgttccattttgtgtt
ttagacgaaattgaggctgcacttgatgataataatgttattaagttttctacattttta
aaacaatattcttctaacgtacaatttatagttataactcataggaagcctacaatggag
gcaagtgatgttatctatggtgttactatggaagaaaagggtgtatctaaggtggtatcg
attaatttagccaattataatacatag
DBGET
integrated database retrieval system
