Acinetobacter shaoyimingii: G8E00_05750
Help
Entry
G8E00_05750 CDS
T07106
Name
(GenBank) RHS repeat protein
Organism
asha
Acinetobacter shaoyimingii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
RHS
DUF6531
Ntox47
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIO05487
UniProt:
A0A6G8RUD4
LinkDB
All DBs
Position
1284729..1289786
Genome browser
AA seq
1685 aa
AA seq
DB search
MGIAPKTTTPKKAVKTPAQKQSVRTGTGMVAVAPLNTITLADVSAGTKKIDKWLKDNTGG
IVDLETLQNVAGSLPIIGNIIALTDAVYDVIEITKKTTTEFPDWLNLGIDLLGIIPLPPG
MAASRMALRPALKKLKGQNLKKDISDTVIVLLTNHVNEKVAGELDKFADKAQPLVKKTVT
DCGNKGKELGNNFANGLSKIVSGQLFDTDKDLNVAKKSFENLAKTDILRNPGKAASHGLV
LLVSAQSIGHKTVANTVGGQATKLISADTKVKINKQITKFRTFSNSVPNKLAPLADPNKA
MSFSWLLDKLSVAARNFKKKNGKKTAPIKQNQTTQKDKKRPNGELETIQNQANAKNNPND
SCELNTTGANGNKSKSTTKTKKSITYALGTEFLTHVDAFEFEISSFVLSRRYASNLYQLD
DGVFGARWITPFTTQILPKTEYMSDENSQIGEIKKLKGLQYIGADARPISLADLKVGDSI
HDQQEGFYYSVISDTVQMISFGTDEKHYFEKYLDVYRLSVIEYKNGMTAAIRYDHIIDNK
SYISDILIKHNHQILLHIGFKINVNGKVEDIWSIEKGSLKRPLASYIYDKKGDLIEAITE
NAAKYEYEYDHHLLTRYTDLTGRGMNLEYDGIEPNSKAFHEWADDGSSEVRLEWDENIRL
TYVIDAYGNETEYYYDINGYTYRIVYPDGLEEWFFRDECCRVIRHIDTDASVTEYEFDDN
GNLVSMSQPDGSTIYYAYDDKDQMVGMVDAEQGRWLKEYDAKGNIIKEIDPLKRETKYSY
NAMGLPTQIIDAKGGTKSLKYNDQGNVISYTDCSGKETKWQYDNRGRVISVENALKSKVE
YIYSDFTTEERTPYAKNLPLNAFGQLEKIKYADGLEENFIHDEEGRLLVHIDATGKVTRY
DYDLAGFISQRIDPNGFKIKYQWDKLNRLKRLTNENGATFEFFYDVVGRLVKEIDFDGKE
TIYEYDETNGELKTSIEVAMNYGQKSSSNLNAKDRIQHFVMDSMGRLEQRITGYGYAGQD
LEDQQEEEFAYNSHGQIILAKNADSKVEWFYDAVGNLVREHIQDNMLQKTAVWKHAYDEI
DDRIKTIRPDGQQLQWLTYGTGHVYGLTLNGEDIVSFERDDLHREVVRHYANGLSQFEHY
DELGRLAEQSIIRDHENGYASQNQEKNAIQETQRLLSRVYKYDKSGQLVHIQDTRRGDLR
YKYDPLGRLLEATSKLGTEKFSFDPASNLLDPQSSGVNTIRSEQQELEASGYNRLINNVV
KEYLDQQYQYDAYGQLVLQKSSKGDLHLEWDVLGRLIRSRNAEYSADYRYDAMGRRMSKL
SKHHHTGIEQHIIYGWDGDTLAYESNDKFTKHYIYEKDSFVPLIQAIYKEKIRVHDTPVW
VDKYEFHKDPLWKKSILTQGFDEVCFYHCDHLGTPQELSNHAGQIVWKAQYKAWGELVSE
KTSKDKTNFFENSEILTNNIRFQGQYFDKETDLHYNRHRYYAPNVGRFISKDPIGLLGGH
NVYAYAPNPVEWVDPRGLNKSQGKSGNKNTGRAKKKQPCPDPCKNSKAALLAKDYQTPKP
GEKSIYNKQDDWEVVYIPKHTQLYALAPHGSNTPNFFVQKTQINKFPTAAAYNDAVQVAH
KDNFKGEDRPMRTQMHKFITTKGLCVAKSKALANSHISDGGAVQFYVTNADKGKVRSTPT
YLDLK
NT seq
5058 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggcatagcacctaaaactacgactccaaaaaaagccgttaaaactccagcacaaaaa
cagagtgtgagaacaggcactggtatggttgcagtagcgcctttaaataccattactctt
gcggatgtaagtgctggaacaaagaaaattgataagtggttaaaggataatactggtggt
atagttgatttagagacattacaaaatgtcgctgggtcattgcccattattggaaacatt
atagctttaactgatgctgtatatgacgttattgaaattacaaaaaaaacgacaacagag
tttccagattggttaaatttaggtatcgatttattgggtattatacctctaccaccgggt
atggctgcttcacggatggctcttcgcccggctttaaaaaaacttaaaggacaaaactta
aaaaaggatatttctgatacggttattgttttattgacaaatcatgtaaatgagaaagtg
gcgggtgaattagataagtttgcggacaaagcacaaccgttggtcaagaagactgtcacg
gattgtggaaacaaaggtaaagagctgggtaataattttgcgaatggcttaagtaaaatt
gtttcaggacaattatttgatacagataaagatttaaatgttgcaaaaaaaagttttgaa
aatttagcaaaaacagatattttacgtaatcctggtaaagctgcatcacacggtttagtt
ttactcgtaagtgctcaaagtataggtcacaagacagtagcaaatacggttggtggtcag
gcgacaaaattaataagtgctgatacaaaagtaaagattaataaacaaattactaaattt
agaacttttagcaattctgtcccaaataaattggctcctttggcagatccaaataaagca
atgagtttttcgtggttattggataaactcagtgttgctgcaagaaatttcaagaaaaaa
aatggtaaaaaaactgcacctattaaacagaatcaaaccacacaaaaagataaaaaaaga
ccaaatggtgagttggaaaccattcaaaatcaggcaaatgcaaaaaataatcctaatgat
agttgtgagttgaataccacaggagcaaatggaaataaatcaaaatctacaactaaaact
aaaaagagtattacttatgctttaggcacggagtttttaactcatgttgatgcgttcgaa
tttgaaatttccagttttgttctttctcgaagatatgcttcaaatctatatcaattagat
gatggcgtattcggagctcgatggattacaccatttacgactcaaattttgccaaaaaca
gagtatatgtctgatgaaaatagtcagattggtgaaattaaaaaattaaaaggattacag
tatataggagcagatgctagaccgatttcactagcagacttaaaagtaggagatagtatt
catgaccaacaagagggtttctactacagtgtaatttcagatactgtacaaatgatttcg
tttggaactgatgaaaagcattattttgaaaaatatttagatgtttatcggctttctgtt
attgaatataaaaatggaatgactgctgctattcgttatgatcatattattgataataaa
tcatatatttcagatattttaatcaaacataatcatcagattcttttacatattggtttc
aaaattaatgtgaatggaaaagtagaagatatttggtcaattgagaaaggaagcctaaaa
agaccactagcgagttatatctatgacaaaaaaggtgatttgattgaggcaatcactgaa
aatgctgctaaatatgaatatgaatatgatcatcatttattgacacgttataccgactta
acaggtcgtggaatgaatttggaatatgatgggattgaaccaaattcaaaagcatttcat
gagtgggcagatgatggtagttctgaagttcgtttggaatgggatgaaaatattcgtcta
acttatgtgattgatgcttatggtaacgaaactgaatattactatgatattaatggatat
acctaccgtatcgtttatcctgatggattagaagagtggttcttccgagatgagtgttgc
cgtgttattcgtcatattgatactgatgcatcagtgactgaatatgagttcgatgacaat
ggtaacttggtatcaatgtctcaacctgatggctcaactatttattatgcttacgatgat
aaagatcaaatggtgggtatggtagatgcagagcaagggagatggttaaaagaatatgat
gctaaaggaaatatcattaaagagattgatcctttaaaacgagaaacgaaatatagctat
aacgctatggggttaccgacacaaatcatcgatgcaaaaggtggaacgaaatcactgaaa
tataatgatcaaggtaatgtgatcagttatacggattgttcaggcaaagaaacaaaatgg
caatatgacaatcgcggtagagtgatttctgtcgagaatgcactcaaaagtaaagttgaa
tatatctatagtgactttactactgaagaaagaaccccatatgcaaaaaatcttccccta
aatgcatttggacaattagaaaaaattaaatatgcagatgggctggaagaaaatttcatt
catgatgaagaaggacgtttacttgttcatatagacgcgactggtaaagttacacgctat
gattatgatttggcaggttttatctctcaacgtattgatccaaatggttttaaaattaaa
taccaatgggataaattaaatcgtttaaaacgcctgacaaatgaaaatggtgcaactttc
gaatttttctatgatgttgttggtcgtctagttaaagagatcgactttgatggtaaagaa
actatttatgaatatgatgaaacaaatggtgagcttaaaaccagtatagaagttgccatg
aattatggtcagaagtcatcgtcaaatttaaatgctaaagatcgaattcagcattttgta
atggatagtatgggacgtttggaacaacgcattacaggttatggttatgcaggacaagat
ttagaagatcaacaagaagaagagtttgcttacaatagccatggtcagattattttagcg
aaaaatgcagatagtaaagttgaatggttctatgacgctgtgggtaatttagtacgtgaa
catattcaagataatatgcttcaaaaaacagcagtctggaagcatgcttatgatgaaatt
gatgatcgaataaaaacaatacgtccagatggtcaacagctacaatggcttacttacgga
acaggacatgtttatggtctgacattaaatggtgaagatattgttagttttgagcgagat
gatttacaccgtgaagttgttcgtcattatgcaaatggattaagccaatttgaacattat
gatgaattaggccgtcttgcagagcaatcgattattcgtgatcatgaaaatggttatgcc
tcacagaatcaagaaaaaaatgcaattcaagaaactcagcgacttttatcgagagtatat
aagtacgataaatcgggtcaattggttcacattcaagatacccgtcgaggcgatttacgt
tataaatatgaccctttgggacgcttgcttgaagcaacgagtaaattaggaactgaaaaa
tttagttttgacccagcaagtaatttgcttgatcctcaatcatctggtgtaaatactatt
cgtagtgagcagcaagagctcgaagcttctggctataaccgactgataaacaatgtcgtt
aaagaatatttggatcaacaatatcagtatgatgcttatggtcagttagtactacaaaag
tcttcaaagggcgatttacatttagagtgggatgtactaggtcgattaattcgaagccga
aatgctgaatattcagctgattatcgttacgatgccatggggcgtcgtatgagtaagttg
agtaagcaccaccatacaggtatagaacaacatattatatatggttgggatggtgatact
ttggcgtatgagtcaaatgataagttcaccaagcattatatttatgaaaaagacagtttt
gtcccactgattcaagcgatttataaagaaaagatacgtgtacatgatacccctgtttgg
gtggataagtatgagttccataaagatccattatggaaaaaatcaattctaacccaaggt
tttgatgaagtatgtttctatcattgtgatcatttgggtacaccacaagagttgagtaac
catgcggggcaaattgtatggaaagcgcaatataaagcttggggcgagcttgtatctgag
aaaacatccaaagataaaactaatttctttgaaaattcagagatactcacaaacaacatt
cgtttccaaggtcaatattttgataaagaaactgatttacattataaccgccatcgttat
tatgctccgaatgttggacgtttcataagtaaagaccctattgggcttctaggtggtcat
aatgtttatgcttatgcaccgaatcctgtggagtgggttgatccacgtggattgaataag
tcacaaggtaaatcaggtaataaaaatacgggtagagctaagaaaaaacagccttgtcct
gacccatgtaaaaatagtaaggctgcactgttagcaaaagattatcaaacaccgaaacca
ggtgaaaaaagtatatataataagcaagatgattgggaagtagtttatatccccaaacac
acccagctttatgctctagcacctcatggttcaaatacaccaaacttttttgttcagaaa
acccaaattaataaattccctacagcagcagcatataatgatgcagttcaagttgctcat
aaagataattttaaaggtgaagatcgaccaatgagaactcaaatgcataaatttattact
acaaaagggctgtgtgttgctaagtctaaggctttagctaattctcacatatcagatggt
ggtgctgttcaattctatgttacaaatgcagataaaggaaaagtgagaagtactcctact
tatttagacttaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system