Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Yit: MOUSESFB_0010
Help
Entry
MOUSESFB_0010 CDS
T01857
Symbol
addB
Name
(GenBank) ATP-dependent nuclease subunit B
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
asm
Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Yit
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
asm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
asm03400
]
MOUSESFB_0010 (addB)
Enzymes [BR:
asm01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
MOUSESFB_0010 (addB)
DNA repair and recombination proteins [BR:
asm03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
MOUSESFB_0010 (addB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ADDB_N
PDDEXK_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK79152
LinkDB
All DBs
Position
12803..16198
Genome browser
AA seq
1131 aa
AA seq
DB search
MKFKFIFGKKGYGKTQYILNEIKNEMKNVNDHRILIIVPSHNTFMMENRILEYLGENALS
KLEIMDFKKFTFKLLNIFKGKTKNRISNIGKSLLVNYLIRNNYGKFLYFKDNNNIDLSDE
ILSMLIDFKNYNIDNNCINCILNAINPNTELYSKISDLMYINNLYNDYIDNNYLDSLDDM
RIANDIIQKNKDLFNSYNIYIDGFDIFTYYQYEFLNIIIDRSNKLVVSLTIDELSNSIIY
NDIIKIKNRVLTLLFNKDCYDIEEVYLNDVHKSDELKYLDRNYLKYNVRPYPYEVKNIFL
NKCLNNFYEVEELCKKIRYLVINIGYRYKDIGVICRDIDSYENFIRVSFDEFNIPYFIDK
KNEITSNMFSIFIFSIFEIFDNNFSNNALFKYIKSGLLDLDDDEIFLIENFSLENGISKY
KWKTDFIDEYYIRYKIERGNEDNIDINKINAIRRIIIDPLMALFNKVKGKNSVNYFIKEL
YNFLKDFGFLDKIQYICESLKLRNDFINANEIVQIVDNIFNVLDEINDIFRNEMLSFSEF
GKILINSISKIEISHVPMRMDEILIGDIERLKIGNYKVLFVIGCNSINFPKIYKKEDLIN
DLEKNYIRNLGFEFSGTNIDKNLSENYLIYSLLNIPKESLYISYSISNMDSRSMNPSILI
SRIKKIFPKVIEDNKTIIKTEFSIDNIYSMNSTLSSFILDFKNCILNNKLSKIHTELYNF
YKNNDKFKDFISIFLMRIRGKNYKDLLDLDMLNYIYKDTKFSISSVETYSKCPFKYFLDY
IIKVRIRRIFSFESYDYGNIVHFLMENICKNIIKYYNFRNLSKDEIDKFTLDYFNNIIFS
YDNGSYILNNNFKFRTFGKKVRKIISDAIFFTCKHLGNTEFFHKYYEFEFGKNSSKIELI
LNDGRRASFVGKVDRIDFCKSNDEMFINVIDYKSSIHDIDYGKIYNVLNIQTIAYMDYII
RLYRDNYNIDLNPCGIFYFTISKPIIKNKKNIDLIKETEKYYRYSGFIINDIKKINLIDK
NILNNGNGSSISLKINKDGEISKVNSLESILSENEFSDILEFVHESVKDKIMEIYDGNIE
VCPVLDDINQSRCSYCNYVGICKFTKKTNKFRIINELDKDLFFNLIRKGNN
NT seq
3396 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaaatttaaatttatatttgggaaaaaaggttatggaaaaacacagtatatattgaat
gaaataaagaatgaaatgaaaaatgttaatgatcatagaattttaattatagttcctagt
cataacacttttatgatggaaaataggatacttgagtatttaggagaaaatgcactgtca
aagcttgagataatggattttaagaaattcacgtttaagttattaaatatatttaaggga
aaaacaaaaaataggatatcgaatataggtaagtcattgttagttaattatttgattagg
aataattatggtaagtttttatattttaaagataataataacattgatttgtctgatgaa
atattatcaatgttaatagattttaagaattataatatagataataattgtattaattgt
atattaaatgctattaatcctaatacggagttatatagtaagattagtgatttgatgtat
ataaataatttatataatgattatatagataataattatttagattctttagatgatatg
agaatagcaaatgatattatacaaaaaaataaggatctatttaattcttataatatttat
atagatgggttcgatatatttacatattatcaatatgagtttttaaatataattattgat
aggtcaaataaattagttgtatctcttacaatagatgagttatcaaatagtattatttat
aacgatattattaaaataaagaatagagttctaacattacttttcaacaaagattgttac
gatattgaagaagtatatttaaatgatgtacataaaagcgatgaacttaaatatttagat
agaaattatttgaaatataatgttagaccttatccttatgaggttaagaatatattttta
aataaatgtttaaataacttttatgaggttgaagaattatgtaaaaaaattagatattta
gttataaatataggatataggtataaagatataggggttatatgtagggatattgattca
tacgagaattttataagagtttcttttgatgaatttaatattccttattttatagataaa
aaaaatgagataacatcaaatatgtttagtatttttatattttctatatttgaaattttt
gataataatttttctaataatgctttatttaagtatataaagagtggacttttagattta
gatgatgatgaaatatttttaattgaaaatttttcgttggaaaatggtatatcaaaatat
aaatggaaaactgattttatagatgagtattatataagatacaaaatagaaagaggaaat
gaagataacattgatataaacaaaataaatgctatacgaagaattattatagatccatta
atggccttatttaataaggtaaaagggaaaaatagtgtaaattattttattaaagagtta
tataattttttaaaagattttggtttcttagataaaatacaatatatatgtgaatcactt
aaattaagaaatgattttattaatgctaatgaaatagttcaaattgtagataatattttt
aatgttttagatgagataaatgatatatttaggaatgagatgttaagtttttctgagttc
ggaaaaattctgataaatagtatatcaaaaattgaaatatcccatgtacctatgaggatg
gatgaaatattaataggggatattgaaagattaaagataggtaactataaggtattattt
gttatagggtgtaactctataaattttcctaaaatttataaaaaagaggatttaataaat
gacttagaaaagaattatataaggaatttaggatttgaattttcaggtacaaatattgat
aagaatttatctgaaaattatcttatatattctctattaaatatacctaaggagagttta
tatattagttattctatatcaaatatggatagtagatctatgaatccatcgattttaata
tctagaattaagaaaatatttcctaaagtaattgaagataacaaaactattataaaaact
gaattttcaatagataatatatattctatgaatagtacgttaagtagttttatattggat
tttaaaaattgtattttaaataataaattatctaagattcatacggagttatataatttt
tataaaaataatgataaatttaaggattttatatctatatttttaatgagaataagaggt
aagaattataaagatttacttgatttggatatgttaaattatatatataaagatacaaaa
ttttctatatcatcagtagaaacttattctaagtgtccattcaagtattttttagattat
ataataaaagtaaggattagaaggatattttcttttgaatcttatgattatggtaacata
gttcattttttaatggagaatatatgtaagaatataataaaatattataattttaggaat
ttatctaaagatgaaattgataaatttaccttagattattttaataatataattttttct
tatgataatgggagttatattttaaataataattttaaatttagaacttttgggaaaaaa
gtgaggaagattataagtgatgcaatattttttacttgtaagcacttaggaaatacagaa
ttttttcataaatattatgaatttgaatttggaaaaaatagttctaaaatagaattaatt
ttaaatgatggtagaagggcttcttttgttgggaaagttgatcgcattgatttttgtaag
agtaatgatgagatgtttataaatgttattgattataaatcaagtattcatgatatagat
tatggtaaaatttataatgttttaaatatacaaacaattgcgtatatggattatattata
agattatatagagataattataatattgatctaaatccttgtggtattttttattttact
ataagtaaacctataattaagaataagaagaatatagatttgataaaagaaactgagaag
tattacagatatagtggatttattattaatgatattaaaaagattaatcttatcgataaa
aatattttaaataatggaaatggaagcagtatatctttaaaaataaataaagatggagaa
atatctaaggttaattctctagagagtattttatctgaaaatgaatttagtgatatatta
gaatttgtacacgaatctgttaaggataaaattatggaaatttatgatggaaatatagag
gtatgtcctgtattagatgatattaatcaatcgagatgtagttattgcaattatgtagga
atatgtaaatttacaaagaaaacaaataaatttaggattattaatgaattagataaagat
ttattttttaatttaatacgaaagggaaataattag
DBGET
integrated database retrieval system
