Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Yit: MOUSESFB_0625
Help
Entry
MOUSESFB_0625 CDS
T01857
Symbol
smc
Name
(GenBank) chromosome segregation protein SMC
KO
K03529
chromosome segregation protein
Organism
asm
Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Yit
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
asm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
asm03036
]
MOUSESFB_0625 (smc)
Chromosome and associated proteins [BR:
asm03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Condensin-like complex
MOUSESFB_0625 (smc)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK79767
LinkDB
All DBs
Position
708648..712034
Genome browser
AA seq
1128 aa
AA seq
DB search
MEDVIFSGTQYRKQLSLAQVSLIIDNSERELPIDYSTVIISRKLYRSGESEYLINNKLCK
LKDINGLFFDTGIGKEGYSLIGQGKIDVILNGNSNDRRAIIEEAIGITKYKFKKEEAYNK
INHANENIVRINDMLFTYEEYLEPLKIESEKARKFIDLSNELKDLEILILYNNLYDIHEE
IQSIKRDISYHNLKLSELSSEKRIMENKRYSFEKEFENLKIIEKKDKKKYYKIKDIIHKN
TNIVNLKNNDISILINSNKIYEKQIYENKSKIDNIILRENIINKTRDELENEFNSILCNL
EENKKLSTDNSMTLHNLENKINTILLEKNKIVNINNNIQNKIEFIRMSFSNIDNDKKAYL
DEKQLIEDRIKKIDKDIEHIEHILYDLHIRESEVKVLSENLLNSIEKENKKIEIVDSQLN
DLNKDVIIRQANLDALRGLDSIYDGFNKSSKTLMNEINSGSLIRFKDRCFIIGNILDTEE
KYTSAIETVIGGHISDIVIDDYVFVNDLINHLKENNLGRVTFHPLNSVSKYNIKFNNEVK
LYKGFINFAINLVKYDSKFSNIISNILGNTIICDNIDNALNIAKSINFSNRIVTLDSQII
NSGGSITGGSSYFKKFNILGRQRKISVEEDDINKKLLYISELKTKLSNCHDVKNNIQSEF
DINNNLLKDITIDIFKKNEELKRYIDLRSRDLKELDKKNIVLNNLDDIYSSNDEEINKLN
YELNLNNEKFSVLENDEKNIRIECENYKKIIEGMENEITNYKIRKAKIEENISNIYDESK
RIALEKKDLICANVKINDNINLNNVNILKIEDSIQIFNKRIDNLNQKFNEYNFDSYILDQ
NRIQQDIKKLNGDINELDLSIHKIEHDINVLNIKNTKKEVEFNINNDNLFDKYSINFDTN
DAEKYIIDSNELSKYSIKMKKITSDISDLGNINIKSIEEYEALNDKVNFITRQKEDLEKS
KMELEDFIKNITSEMRNMFNQSFKLINENFNFTFKELFKGGSAQLLLGDGDELESDIEII
VQPPGKKLQNINLLSGGEKGLSAISLLFAILKLKPVPFCVLDEIEAALDDNNVIKFSTFL
KQYSSNVQFIVITHRKPTMEASDVIYGVTMEEKGVSKVVSINLANYNT
NT seq
3387 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagatgttattttttccggaactcaatataggaaacaattatctttggcacaggtg
tcattaattatagataattcggaaagggaacttccaatagattatagtactgttataata
tctagaaaattatatagatctggagagagtgaatatttaataaataataaactgtgtaaa
ttgaaagatataaatgggttattttttgatacaggtatcggtaaggaagggtattcttta
attggacaaggaaagatagatgttatattaaatggaaattctaatgatagaagagctata
attgaggaggcaataggtataactaaatataaatttaagaaggaagaagcatataataaa
attaatcatgccaatgaaaatattgttaggattaatgatatgctttttacatatgaagaa
tatttggaaccattaaaaattgagagtgaaaaagctagaaaatttatagatttatcaaat
gaacttaaagatttggaaattttaattttgtataataatttatatgatattcatgaagaa
atacagagtataaaaagggatataagttaccataatttgaaattaagtgaattaagtagc
gaaaaaagaattatggaaaataagaggtattcatttgaaaaagaatttgaaaatctgaaa
ataatagagaagaaagataagaagaaatattataagattaaggatattatacataaaaat
acaaatattgtaaatcttaaaaataatgacataagtatacttattaattcaaataagata
tatgagaagcagatttatgaaaataaatctaaaatagataatataatccttagagaaaat
ataattaataaaacaagagatgaattggagaatgaatttaatagtattctatgtaatcta
gaggaaaataaaaaattaagcacggataatagtatgacattacataatttagaaaataag
attaatactattctactagaaaagaataaaattgttaatatcaataacaatatacaaaat
aaaattgaatttataagaatgagtttttctaatatagataatgataagaaggcatactta
gatgaaaaacagttgatagaagatagaattaaaaaaattgataaagatatagaacatata
gaacatattttatatgatttacatattcgtgaaagtgaagttaaagttttatctgaaaat
ttattaaatagtattgaaaaagaaaacaaaaaaatagagatagttgatagtcaattgaat
gatttaaataaggatgtaataataaggcaggcaaatcttgatgcattaagagggcttgat
agtatttatgatggatttaataaatctagtaaaactttaatgaatgaaattaattctggt
tcattaattagattcaaagatagatgttttattataggaaatattttagatacggaagag
aaatatacatctgctattgagacggttattggaggacatatttctgacatagtgattgat
gattatgttttcgtaaatgatcttataaatcatcttaaagagaataatcttgggcgtgtt
acatttcatcctttaaatagtgttagtaaatataatataaaatttaataatgaagttaag
ttgtataaaggatttataaattttgccataaatttagttaagtatgattcaaaatttagt
aatattattagtaatatcttaggaaatacaattatttgcgataatattgataatgcatta
aatattgctaagagtataaatttctctaatagaatagttactttggattcccaaattata
aattctggaggatctattacaggtggatcaagttattttaagaaatttaatatacttggt
agacaacggaaaatttcagttgaggaagatgatattaataagaaattattatatatatct
gaattgaaaactaagttaagtaattgtcatgatgtaaaaaataatatacagagtgagttt
gatataaataataatttattaaaggatatcactatagatatatttaagaaaaatgaagag
ttaaagagatatattgacttaagatcaagagatcttaaagaactagataagaagaatatt
gtattgaataatctagatgatatttatagttcaaatgacgaggaaattaataagttgaat
tatgaattgaatttaaataatgagaagtttagcgttttagaaaatgatgagaaaaatata
aggatagaatgtgaaaattataagaagataattgaaggtatggaaaatgaaattacaaat
tataaaattaggaaagcaaaaattgaagaaaatatttcaaatatttatgatgaaagcaag
agaattgcattagaaaagaaagatctaatttgtgctaacgttaagattaacgataatata
aatttaaataatgttaatatattgaaaattgaagatagtatacaaatttttaataagaga
atagataatttaaaccagaaatttaatgaatataattttgattcctatatattagatcaa
aataggatacaacaagatataaaaaaattaaatggggatattaatgaactggatttaagt
atacataaaatcgaacatgatattaatgttttaaatattaaaaatactaaaaaagaagtg
gaatttaacataaataatgataacttatttgacaaatattctatcaattttgatacaaat
gatgcagaaaagtacataatagattcgaatgaacttagtaagtatagtataaaaatgaaa
aagataactagtgatataagtgatttagggaatataaatattaagtctattgaggaatat
gaagcacttaatgataaagtaaactttatcactagacagaaggaagatttagaaaagagt
aaaatggagcttgaggattttattaaaaatataacatcagaaatgcggaatatgtttaat
caaagttttaagctcataaatgaaaattttaattttacatttaaagaattatttaagggt
ggaagtgcacaacttttattaggagatggggatgaattagaaagtgatattgaaataatc
gtgcaaccaccaggtaagaaacttcaaaatattaatttattgtcgggtggtgaaaaagga
ctttctgcaatatctcttttatttgcgattttaaagttaaaacctgttccattttgtgtt
ttagacgaaattgaggctgcacttgatgataataatgttattaagttttctacattttta
aaacaatattcttctaacgtacaatttatagttataactcataggaagcctacaatggag
gcaagtgatgttatctatggtgttactatggaagaaaagggtgtatctaaggtggtatcg
attaatttagccaattataatacatag
DBGET
integrated database retrieval system
