Alligator sinensis (Chinese alligator): 102378173
Help
Entry
102378173 CDS
T02922
Symbol
NOTCH2
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 2
KO
K20994
Notch 2
Organism
asn
Alligator sinensis (Chinese alligator)
Pathway
asn04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
asn00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
102378173 (NOTCH2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
Ank_2
EGF_2
Ank
Notch
NOD
NODP
Ank_5
Ank_3
Ank_4
EGF_3
EGF_Teneurin
EGF_DL_JAG
DUF4064
cEGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
102378173
NCBI-ProteinID:
XP_025048418
UniProt:
A0A3Q0FRV1
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2415 aa
AA seq
DB search
LSSLHHDHLWSLQCLDTSKPCVNEGKCFSYPNGTGFCRCPEGFLGDYCQYRNPCESSTCQ
NGGTCETTSVIGKATCKCAPGFRGEDCRYPDSHICFVSHPCLNGGTCQLLSPDAYECVCK
PGYTGKNCQWIDACMSQPCANGSTCIASGERFFCTCLSGYTGQKCEVDVNECTTPGQCQH
GGTCLNVPGSYRCQCKPGFTGHRCESTYVPCSPSPCMNGGTCHQTGDFVYECNCLPGFEG
DTCEHNIDDCPNHKCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECQLQPNACQNGGT
CTNHNGGYACVCVNGWSGDDCSKNIDDCLTASCANGSTCIDRVASFACICPEGKAGLLCH
LDDACVSNPCQKEALCDTNPMNGHYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCV
NTEGSFHCECLKGYTGPRCEMDINECHSNPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGMHCELE
INECLSSPCVNNGECLDKVNHFLCKCPPGFTGAVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGY
ECQCATGFTGILCEENINNCDPDPCHYGECQDGIDSYTCVCNPGYMGAICSEQIDECYSN
PCLNQGRCIDLVNGYQCNCLPGTSGMNCENNFDDCANKPCVHGTCIDGINHYSCICNPGV
TGPRCNTDIDECISSPCHNGGTCVNEINGFRCICPEGYHHPTCHSQTDECLNNPCVHGNC
THDVNGYVCLCDPGWTGTDCEVEENECRSNPCQNGGTCDNLVNGYRCTCRRGFKGVNCRI
VQAPCSPDPCENSGICQESSGSDGYICLCAPGWEGERCTVDIDECVSKPCRNRAVCHNIQ
GSYLCECNPGFTGGDCESNIDDCLSNPCQNGASCVDGVNSFLCICLPGFQGEQCQTDTNE
CMNEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCPAGFEGTNCENNINECTESSCFNGATCVDGINSFTCQ
CPIGFTGTFCLMEINECDSHPCLNRGTCVDSLGTYHCVCPMGYTGKNCQILVDLCNKFPC
KNKGTCVQQNTHFHCNCPPGWSGAYCDVPNVSCQAAASQRGVPVDQLCQHSGNCLNVGNS
HHCQCRTGYTGSYCEEQVDECISSPCQNGATCRDYLGGYSCECVPGYQGVNCEYEVNECQ
FQPCQNGGTCIDLINHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDCMPDSGGPRCLNGGQCIDQIGGHS
CLCPSGFGGKQCEGDINECLSNPCSPRGSRDCVQLVNNYTCICRSAFTGRHCETVIDVCP
QKPCQNGGTCAVASNMPDGFICQCPPGYSGSKCEFSNTCGQMRCKKGELCIQTSSGPRCY
CPELLVGEECRATAGCTSAPCQNGGSCHPRPQAPYYYCQCPSYTEGSQCEHSVHPSREPE
GCLGQHCMERAKDGYCDEDCNTHACQWDGGDCSLMIEDPWANCSSSLRCWEHFNGLCDEA
CNTPECLFDNFECQQNPKTCKYGKYCEDHYANGLCDKGCNNEECGWDGLDCAGDKAEKLA
EGTLIIVVLMPPEQLLSDVHSFLWTLGTLLHTNLRIKRDSQGKLMVYPYYGEKSARSRRS
VLVFRKARELEQEAIGTKVFLEIDNRQCAEESDQCFKNTEAAAALLAAQAIKGMVPYPFV
SVESERVSRGKTQMLYLLAVVALIGLIILLLGVMMAKRKRKHGSLWLPEGFILHRDSSNH
KRREPVGEDAVGLKNLSVQVSDGNLADCTAGEHWSGDRGPQPKRAKSEDEALLPEADEQV
DQCQWTQQHLRAADIDGTTSLALTPPQADQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRVGSSDI
SDEDEDGEDSSANIITDLIYQGANLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADAN
ARDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELI
NCQADVNAVDDHGKSALHWAAAVNNVEATLVLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSFE
AAKILLDHFANRDITDHMDRLPRDVAQDRMHHDIVQLLNEYNVAHSPSGHPGTILNSALS
PVICGPNRSFLNLKHASLSKKSRKPNAKSVMAPNLAKEAKRRRKKSLTESKGQFSESSVT
LSPVDSLESPHAFASEQTSSPVMPSPGILHSSPSSLLTASVVQAAHPMSFSGLHEMQPLG
QGSNTVLPSVSQLLSQHRTTASSNGLGRLQPGNISTEWMNHIDVNESQYNEMFGMIPQVV
HAHPSGSQQGSLSQTDVKHVGISRETLPPIMTFQLVPKSGMNQQVLAQQAQSNCPQNVAG
PLSSMYQITPDLAQLPSASFPMAVIPQQDGQVAQTILPAYHQFQSSMGKYPTPPSQHSYT
SSSATERTPSHNRHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVATSPSHGSTQRGPV
ARMSEQQRNNMQVYA
NT seq
7248 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ctgtccagcctacaccacgaccatctttggtccttacaatgtctggatacttctaagcct
tgtgtcaatgagggaaagtgcttctcatatcccaatggcaccggattttgcagatgtcca
gaaggttttcttggagactattgtcagtacagaaacccctgtgaaagcagtacctgtcag
aatggaggaacatgtgaaaccacgtctgtgataggaaaggccacttgcaaatgcgctcca
gggttcagaggcgaggactgcagatatcctgattctcacatctgctttgtgtcacacccc
tgcttaaatggaggaacctgccaactgcttagcccagatgcatatgagtgtgtgtgcaag
ccaggttacacaggaaagaactgtcagtggattgatgcttgcatgtctcagccgtgtgcc
aatggaagtacttgcatcgcatctggggagaggtttttctgtacatgtctatctggttac
actggacaaaaatgtgaagttgatgtgaatgagtgtaccacaccaggacaatgccagcat
ggtggaacctgtctcaatgtgcctggctcctatcgatgtcagtgcaagccaggctttacc
ggccaccgctgtgaaagcacgtatgtgccatgttcaccttcaccatgtatgaatggaggg
acatgtcatcagactggtgatttcgtctatgaatgcaactgtctgccaggctttgaagga
gatacctgtgagcacaacattgatgactgcccaaatcacaagtgccagaatggtggtgtg
tgcgtggatggcgtaaacacttacaactgccgctgccctccacagtggacaggtcagttc
tgtactgaggatgtggatgaatgtcagctgcagcccaatgcctgtcaaaatggaggtacc
tgcaccaaccacaatggcggctatgcctgcgtctgtgtcaacggctggagtggggatgat
tgcagtaagaatattgatgactgtcttacggcttcctgtgccaatggatctacttgcatt
gatcgtgtggcttcatttgcatgcatttgtccagaaggaaaggcaggcctcctgtgtcat
ctggatgatgcatgtgttagcaacccctgccagaaggaagctctatgtgataccaaccct
atgaatggacactatatctgcacttgtccccaaggctacaaaggagctgactgtactgaa
gatgtagatgagtgtgctatggcaaacagtaatccgtgtgaacatgctgggaaatgtgtg
aatactgaaggctccttccactgtgagtgtctgaagggatacacaggaccacgctgtgaa
atggacattaatgagtgtcattccaatccatgtcaaaatgatgccacttgcctggataaa
atcggaggattcacatgtctgtgtatgccagggtttaaaggcatgcactgtgaactggag
atcaatgaatgccttagtagtccctgtgtgaacaatggagagtgtctggataaggtcaat
cactttttgtgcaaatgcccacctggttttactggagccgtgtgccagattgacatcgat
gactgctccagcacaccttgcctaaatggagcaaagtgcattgatcatcccaatggctac
gagtgccagtgtgccacaggttttactggcatcttgtgtgaggaaaatataaataattgt
gatcctgacccttgccactatggtgaatgccaagatggtattgattcatacacatgtgtc
tgcaatcctggatacatgggtgccatttgtagtgaacagattgatgaatgttacagcaat
ccctgccttaatcaaggacgctgcattgacttggtgaatggttaccaatgcaactgttta
ccaggcacatcaggaatgaactgtgagaataattttgatgactgtgcaaataaaccctgc
gttcatgggacctgtatagatggcattaaccactacagttgcatctgcaacccaggagtt
accggtccaagatgtaatactgatattgatgaatgtatctccagtccctgtcacaatggt
ggaacatgtgtcaatgaaattaatggatttcggtgtatatgtcctgaaggctaccatcac
cccacctgtcactcacagacagatgaatgtcttaataacccttgtgtgcatggcaactgc
acacatgacgtcaacgggtacgtgtgtctctgtgacccaggttggaccggaacggactgt
gaagtagaggaaaatgagtgtaggtcaaatccgtgccagaatggaggaacctgtgacaat
ctggtgaatggatatagatgcacctgcaggagaggattcaaaggtgtgaactgccggata
gtgcaggctccttgttcccctgatccttgtgagaattctggaatctgccaagaatcatct
ggctctgatggctatatttgtctctgtgctcctggctgggaaggagagagatgtacggtg
gatattgatgagtgtgtgtcaaagccctgcaggaatcgtgctgtctgccacaacattcaa
ggcagctacctgtgtgaatgcaacccaggcttcactgggggagactgtgaaagcaacatt
gatgactgcctttcaaatccctgccagaatggagcttcatgtgtggatggggtgaactct
ttcttatgcatctgtctgcctgggttccaaggggaacagtgtcagacagataccaacgag
tgtatgaatgaaccatgcaagaatggaggcacctgctctgactatgtcaacagctacacg
tgcaagtgcccagcaggatttgaggggaccaattgtgagaacaacatcaatgaatgcact
gagagttcgtgtttcaatggagccacttgtgtggatgggatcaactcctttacatgccaa
tgcccgattgggttcacaggaaccttttgtcttatggaaattaatgaatgtgattcacat
ccttgcttgaacagagggacttgtgtggatagcctggggacctatcattgtgtttgtccc
atgggttacactggaaagaactgtcagatacttgtggatctgtgtaacaagtttccctgt
aagaacaaaggcacatgtgtccagcagaatactcactttcattgcaactgtccccctggt
tggagtggtgcctactgtgatgtgcccaatgtctcctgccaagcggctgcttcacagagg
ggggtccctgtagaccagttgtgtcaacactctggcaattgccttaacgttggaaacagc
caccattgccaatgccggacaggctacactggtagctattgtgaagagcaggtggatgaa
tgcatctccagtccttgtcagaatggcgccacctgcagggactatcttggaggatatagc
tgtgagtgtgtgccagggtaccagggtgtcaactgcgagtatgaagtgaatgagtgtcag
ttccagccctgccaaaatggaggaacctgcattgatctcatcaatcactttaaatgctcc
tgtccaccaggaactcggggccttctttgtgaggagaacattgatgactgcatgccagat
tcaggagggcctcgctgccttaatggaggacagtgcatagaccaaattgggggccacagc
tgtctttgtccttcaggcttcggaggcaagcagtgtgagggggacattaatgaatgcctc
tccaacccttgtagccctcgtggtagccgagactgtgttcagctggtcaataattataca
tgcatctgccgcagtgcctttactggccgtcactgtgaaactgtgatagatgtgtgtcct
cagaagccttgtcagaatggaggtacttgtgctgttgccagtaatatgcctgatggattc
atctgccagtgtcctccaggttattctgggtctaaatgtgaattcagcaatacttgtggg
caaatgaggtgcaagaaaggggaactgtgcatccagacatcctcagggccccgttgttac
tgtccagagctcttggtgggtgaggagtgccgggctactgcaggctgtaccagtgcaccc
tgccagaatgggggaagttgccatcctaggcctcaggctccttattattactgccagtgt
cccagttacactgaaggcagccagtgtgagcattcagtacaccccagccgagaacctgaa
gggtgtctgggtcaacactgcatggaacgagcaaaagatggctactgtgatgaagactgc
aacacgcacgcttgccagtgggatggaggggactgttcgctgatgatagaagatccctgg
gccaactgttcttcgtcgctgcgctgctgggagcatttcaatggcttgtgcgatgaggcc
tgtaatacgcctgagtgcttgtttgacaactttgagtgtcagcagaaccctaagacatgc
aagtatggtaaatattgcgaggatcactatgcaaatggactctgtgacaaaggatgtaac
aacgaggagtgtggttgggatggtctggactgtgccggtgacaaagctgagaaactggcg
gaaggtacccttataattgtggtgctaatgccccctgaacagctgctttcagatgtccat
agcttcctatggactctaggaacccttctacacaccaacctgagaataaaacgagattcc
cagggaaagctgatggtatacccatactatggagagaagtcagcacggagccggcgatcc
gtgttggtctttcgcaaggccagagagcttgaacaagaggccattggcacaaaggtgttc
ctggaaattgacaatcgacagtgcgctgaagagtcggaccagtgcttcaaaaatacagaa
gctgcagcagctcttttagcagctcaggccattaagggcatggtgccttatccttttgtg
tctgttgaaagtgaacgtgtatcacgagggaagacccagatgctttacctgcttgctgtg
gtagctttgatcggccttataatccttcttttgggtgtgatgatggcaaagcgaaaacgg
aagcatggctccctctggctccctgagggctttattttgcacagagactccagtaaccac
aaacgcagagaaccagttggggaagacgcagttggattgaaaaatctgtcagtacaagtt
tctgacggcaatctggcagattgtactgcaggggaacattggtcaggtgataggggacct
cagccaaagagagctaagtctgaagatgaagcattgctcccagaagcagatgagcaggta
gatcaatgccagtggacacaacaacacctcagggcagctgacatagatgggaccacatcc
cttgctcttacaccacctcaggcagatcaagaagtagatgtcctggatgtcaatgttaga
ggaccagatgggtgcaccccactcatgttggcatctctgcgtgtgggcagctctgacatt
agtgacgaagatgaagatggggaggattcctcagcaaatataataacagacctgatctat
caaggggctaacttgcaagctcaaacagaccgtactggggagatggcactgcacttagca
gcccgctattcaagagcagatgcagcaaaacgcttgttggatgctggtgctgatgctaac
gcccgagacaacatggggaggactcctcttcatgcagctgtggcagctgatgcacagggt
gtcttccagatcttgatccggaacagagtgacagacctggatgctcgcatgaatgatgga
acaactccgttaattctggcagctcgtttggctgtggagggaatggtggctgagctgatc
aactgccaggcagatgtcaatgcagtggatgaccacggtaaatctgctcttcattgggct
gcagctgttaacaatgtggaggcaacgttagtgttgttgaaaaatggagccaaccgagac
atgcaggacaacaaggaggagacaccactcttcctggcagctcgggaagggagttttgaa
gcagctaaaattctgttggaccattttgccaatcgggacatcacagaccacatggaccgt
ctcccccgtgatgtggcacaggaccgcatgcaccatgacattgtgcagcttctcaatgag
tacaatgtggcccacagcccatctgggcaccctggcaccatactaaactctgccctctcc
ccagtgatttgtggccccaatagatctttcctcaatttgaaacatgcttctctaagcaag
aagtcgaggaaaccaaatgccaagagtgtgatggccccaaatcttgccaaagaagcgaag
agaagaaggaagaaatctctgactgagagcaagggtcagttttctgagagctcagtgacc
ctctcaccagtcgactccctggaatctccccacgcttttgcatctgaacaaacgtcctct
cctgtgatgccgtccccagggattctgcattcctcgcccagctcactgcttacggcctca
gttgtgcaggccgcacaccccatgtccttctctggtctccatgagatgcagccgctgggg
cagggatctaacaccgtgcttccatctgtcagccagctgctttcacagcaccgaaccaca
gcttccagcaatgggctcggtagactccagccaggtaacatttccaccgaatggatgaac
cacatagatgtgaatgaatcccaatacaatgagatgtttggcatgatcccacaggtagtc
catgctcaccccagcggctctcagcaaggaagtctgagtcaaacagatgtgaagcatgtg
ggaatctccagggagacactgccccctattatgactttccagctggttcccaaaagtggc
atgaaccagcaggtcctggcacaacaggcccagtccaactgccctcagaatgtagctggt
cctcttagttcaatgtaccagataacgccagatctagctcagctgccaagtgcctccttt
cccatggcagtaatccctcagcaggatgggcaggtcgctcagacaatcctcccagcctat
caccagttccagagctcgatgggaaagtatcccactccgccatcacagcacagctacacc
tcttcctctgccacggagaggactcctagccataacaggcacttgcaaggggagcaccca
tatctgacgccatctcctgaatctcccgatcagtggtcaagctcctccccgcactctgcc
tcagattggtctgatgtggcgaccagccccagccatggtagtacccaacgtggtccggta
gcacgaatgtcagagcagcagcggaacaacatgcaggtttatgcatga
DBGET
integrated database retrieval system
