Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-NL: SFBmNL_00197
Help
Entry
SFBmNL_00197 CDS
T03243
Symbol
lacZ
Name
(GenBank) Beta-galactosidase
KO
K01190
beta-galactosidase [EC:
3.2.1.23
]
Organism
aso
Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-NL
Pathway
aso00052
Galactose metabolism
aso00511
Other glycan degradation
aso01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aso00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00052 Galactose metabolism
SFBmNL_00197 (lacZ)
09103 Lipid metabolism
00600 Sphingolipid metabolism
SFBmNL_00197 (lacZ)
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00511 Other glycan degradation
SFBmNL_00197 (lacZ)
Enzymes [BR:
aso01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.23 beta-galactosidase
SFBmNL_00197 (lacZ)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_2_C
Glyco_hydro_2_N
Bgal_small_N
LacZ_4
Glyco_hydro_2
Laminin_G_3
Glyco_hydro_2_N2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AID44125
LinkDB
All DBs
Position
197445..201335
Genome browser
AA seq
1296 aa
AA seq
DB search
MLSVRRILGKVLKLSILSIMLIIIGILIFINKNIKGAVISNGFFNEFPKIHVDFNEWDDR
VDVFQINREFARSFFLPYPNRETLLMDVKNEPLNSVRIKDSDNIRVLNGKWRFSLDYAPE
DRNLDFYRRDYDVSSWEYINVPSNWQMEGYDFPIYVNFRYPWTGFENLEFYKAPKIFNPV
GNYRRDFYVDESWLDDKVYISFQGVESCFYLWINGGFVGYSEDSFSPSEFDVTDFLVCGN
NSISVQVFRWCDGSFIEDQDFIRLSGIFRDVFLYRTPKIHIADFEVITKADDNYMNFDLL
VNINMLNHINENRNYTISAVIFDEKWNLINSVENMGNFDRNYPYRDAIKSDFSLCLNIKE
PNRWSAEEPNLYNLIISLKNDLLNETQSIHTRVGFRAFEIKGNKMYINGKPILFKGVNRH
ETHPLKGRALSTLDMEFDIREIKKNNINSVRTSHYPNHPYFISLCNEYGIYVVDEGNIEA
HGVEGEIPGNKEIWKNACFDRINSLVERDKNNPSVLIWSLGNESGGGSVFRDLYNYVSLR
DGTRVIHYEGERDEYYASDVVSKMYVKIDDIEKQSKYMYHKPYILCEYAHSMGNSGGSLD
KYIEKFESIDNVQGGFIWDFIDQGIYRDVPDMGIFINSHSIFHGDFEGYIENGYKDKGYR
GCIFYDNVSNLKFDEFTIDLKVKPSVYEGEGCVYLKKGNEFGLREIMNYDKSNNRAVEFY
VRDNSGIFETIVFITPKDWVNNFHSVSAIYKNKIMRLFIDDNLVGEKTFNYNIAYFKDGI
QIGGNDGYTHCESMNGIIDEVKLFSKGMDIEELRKKSFYNIDATRIIWNDFDNERNMIMK
KLSRDKYLATGGDFNDSPNDSAFCANGILLASRKIKPQVSEVKYAYQNIDIRDYDILNGK
VIIKNKNLFKNLRDYILKWDYLVDGKIVRGDTAIVNVDPMSEIIFNVHDMDKIKDLNGKE
FFLNIGFVLNESTNWGNRGFEISRNQLKINLDNLFYEVGNVSKVVQNFMIDDLSDKLEIK
SKEYYIGFNKISGTLQNYRYKNEDLINSELYVDFWNPLNDNERLCNIYNKIVFWKNIFNR
SRNNSYNILHEDGCILVKFYKPIYDLNNSVLITTYKIDEYGEISIELYMELLKNGIPHAR
SVGFKIFIPTNFKNIEYYGRGPLENYNDRNKGSNLGEYKSDVDSQFTDYMTPQRTGNITD
IRWINFYRNNGIGIRIKYINEFLQINVSSYNDDEFEKKHSYQMNKYSSIIVNVRSKDYGS
TFESFEDECINYIDKNHIYNFSFKLSPLLTDNVLIN
NT seq
3891 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgttaagtgtaaggagaatattaggaaaggtacttaagttatctattttatcaattatg
ttgataataattggaatcttaatatttataaataaaaatattaaaggagcggtaatttca
aatggtttttttaatgagtttcctaaaattcatgttgattttaatgaatgggatgataga
gttgatgtatttcagataaatagggagtttgctaggagcttttttctaccgtatcctaat
cgtgaaactttattgatggatgttaagaatgaaccattaaatagtgtaaggataaaagat
tctgataatattagagttttaaatggtaaatggagattttcacttgattatgcgccagaa
gatagaaatttagatttttataggagagattatgatgtatctagttgggaatatataaat
gtgccgagtaattggcaaatggagggatatgatttccccatatatgttaattttagatat
ccttggactggatttgaaaatttagaattttataaggctcctaagatttttaatcctgtt
ggtaattataggagagatttttatgtagatgaatcttggcttgatgataaagtttacata
tcatttcagggtgttgaatcttgtttttatttatggataaatggaggatttgttggatat
agtgaggatagtttttcacctagcgagtttgatgttaccgattttttagtatgtggtaat
aattctatatctgttcaggtttttagatggtgtgatggaagttttattgaagatcaggat
tttattcggttaagtggaatttttagggatgtatttttatatagaacccctaagatacat
attgcagattttgaggttataactaaagcggatgataactatatgaattttgatttgtta
gttaatattaatatgctcaatcacattaatgagaataggaattataccatatcggctgtt
atatttgacgagaaatggaatttaataaatagtgttgagaatatgggtaattttgacagg
aattatccatatagagatgctatcaagagtgattttagtttatgtttgaatataaaagag
cctaatagatggtcggcagaggaacctaatttatataatttaataatttctcttaaaaat
gatttgcttaatgaaacacaatcaatacatacaagggttggatttagagcatttgagata
aaaggaaataaaatgtacataaatgggaaaccgattttgtttaagggtgtaaatagacat
gaaactcatccattaaaaggaagggcattatctacactggatatggaattcgatataaga
gagattaagaaaaataatataaactctgtaagaacttcacattatcctaatcatccttat
tttatttcattatgtaatgaatatggaatttatgtagttgatgagggtaatatagaggca
catggcgttgagggtgagatacctgggaataaagagatttggaagaatgcatgttttgat
agaattaattcacttgtagagagagataagaataatcctagtgttttaatatggtctctt
ggaaatgagagcggaggaggaagtgtatttagagatttatataattatgttagtttaaga
gatggaaccagagtaatacactatgaaggcgagagagatgaatactatgcaagtgatgtt
gtaagtaaaatgtatgttaaaatagacgacattgagaaacagagtaaatatatgtatcac
aagccttatattttgtgtgaatatgctcattctatgggaaatagtggtggaagtttagat
aaatatattgaaaaatttgagagtattgataatgttcagggaggatttatatgggatttt
atagatcaaggaatttatagagatgttcctgatatgggtatttttattaattcccatagt
atatttcatggagattttgaaggatatatagaaaatggatacaaagataaagggtataga
ggatgtatattctatgataatgttagtaatttaaagtttgatgaatttaccatagattta
aaggtaaaaccaagtgtatatgagggagaaggatgtgtttatctaaagaaaggtaatgaa
tttggattaagggaaattatgaattatgataagtctaataatagggctgttgaattttat
gtaagagataattctgggatatttgagacaattgtatttataacacctaaggattgggtg
aataattttcatagtgtaagtgcgatatataaaaataagattatgagattatttatagat
gataatttggttggagagaagacatttaattataatatagcatatttcaaagatggtatt
caaattggaggaaatgatggttatactcactgtgaaagtatgaatgggataatagatgag
gttaagttattttctaaaggaatggatatagaggaattacgtaaaaagagtttttataat
atagatgctacaaggataatatggaatgattttgataatgagagaaatatgattatgaaa
aaattatccagagataaatatttggctacgggaggtgacttcaatgattctccaaatgat
tctgcattttgtgctaatggtatattgttagcatctagaaagattaaaccacaagtaagt
gaggttaagtatgcatatcaaaatatagatattagggattatgatattttaaatggtaaa
gtaattattaaaaataaaaacttatttaaaaatttaagagattatatattgaaatgggac
tatttagttgatggcaaaatagtaagaggagatacagctatagttaatgttgatcccatg
agtgaaattatatttaatgtacatgatatggataaaattaaggatttaaatggaaaagaa
ttttttttaaatattggatttgtattaaatgaaagtacaaattggggtaacagggggttt
gaaatatcaaggaatcaattaaaaataaacttagataatttgttttatgaagtaggtaat
gttagcaaggtagttcaaaattttatgattgatgatttgtcggataaattggaaattaaa
tctaaagaatattatattggatttaataaaatatcaggtactctccaaaattataggtat
aagaatgaggatttaataaattctgaattatatgttgatttttggaatccattaaatgat
aacgaaagattatgtaatatatataataagatagtattctggaaaaatatatttaataga
agtaggaataatagttacaatattttgcatgaagatggttgtatattggtaaaattttac
aaaccaatctatgatttaaataattcagttcttattacaacatataagatagatgagtac
ggggaaattagtattgagctatatatggagttattaaagaatggtataccgcatgctagg
tcagtaggatttaagatatttatacctactaattttaaaaatattgagtattacggaaga
ggaccattagaaaattataatgatcgaaataaaggtagtaatttaggagaatataaaagc
gatgtagatagtcaatttacagattatatgactcctcaaagaacagggaatataacagat
attagatggataaatttttataggaacaatggtataggtattagaatcaaatatattaat
gaatttcttcaaataaatgttagttcatataatgatgatgaatttgagaaaaaacattct
tatcaaatgaataaatattcgtcaattatagtaaatgttagatcaaaggattatggaagc
acattcgaaagttttgaagatgaatgtattaactatattgataaaaatcatatatataat
ttttcattcaaattatcacctttattaacggataatgtattaattaattga
DBGET
integrated database retrieval system
