Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-NL: SFBmNL_00705
Help
Entry
SFBmNL_00705 CDS
T03243
Symbol
smc
Name
(GenBank) Chromosome partition protein Smc
KO
K03529
chromosome segregation protein
Organism
aso
Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-NL
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aso00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
aso03036
]
SFBmNL_00705 (smc)
Chromosome and associated proteins [BR:
aso03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Condensin-like complex
SFBmNL_00705 (smc)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_23
AAA_15
AAA_21
AAA_29
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AID44613
LinkDB
All DBs
Position
708514..712080
Genome browser
AA seq
1188 aa
AA seq
DB search
MILKSIEIRGFKSFADSTELIFKQGITSVVGPNGSGKSNIADAIRWCLGEQSVKSLRGGK
MEDVIFSGTQYRKQLSLAQVSLIIDNSERELPIDYSTVIISRKLYRSGESEYLINNKPCK
LKDINGLFFDTGIGKEGYSLIGQGKIDVILNGNSNDRRAIIEEAIGITKYKFKKEEAYNK
INHANENIVRINDMLFTYEEYLEPLKIESEKARKFIDLSNELKDLEILILYNNLYDIHEE
IQSIKRDISYHNLKLSELSSEKRIMENKRYSFEKEFENLKIIEKKDKKKYYKIKDIIHKN
TNIVNLKNNDISILINSNKIYEKQIYENKSKIDNIILRENIINKTRDELENEFNSILCNL
EENKKLSTDNSMTLHNLENKINTILLEKNKIVNINNNIQNKIEFIRMSFSNIDNDKKAYL
DEKQLIEDRIKKIDKDIEHIEHILYDLHIRESEVKVLSENLLNSIEKENKKIEIVDSQLN
DLNKDVIIRQANLDALRGLDSIYDGFNKSSKTLMNEINSGSLIRFKDRCFIIGNILDTEE
KYTSAIETVIGGHISDIVIDDYVFVNDLINHLKENNLGRVTFHPLNSVSKYNIKFNNEVK
LYKGFINFAINLVKYDSKFSNIISNILGNTIICDNIDNALNIAKSINFSNRIVTLDSQII
NSGGSITGGSSYFKKFNILGRQRKISVEEDDINKKLLYISELKTKLSNYHDVKNNIQSEF
DINNNLLKDITIDIFKKNEELKRYIDLRSRDLKELDKKNIVLNNLDDIYSSNDEEINKLN
YELNLNNEKFSVLENDEKNIRIECENYKKIIEGRENEITNYKIRKAKIEENISNIYDESK
RIALEKKDLICANVKINDNINLNNVNIVKIEDSIQIFNKRIDNLNQKFNEYNFDSYILDQ
NRIQQDIKKLNGDINELDLSIHKIEHDINVLNIKNTKKEVEFNINNDNLFDKYSINFDTN
DAEKYIIDSNELSKYSIKMKKITSDISDLGNINIKSIEEYEALNDKVNFITRQKEDLEKS
KMELEGFIKNITSEMRNMFNQSFKLINENFNFTFKELFKGGSAQLLLGDGDELESDIEII
VQPPGKKLQNINLLSGGEKGLSAISLLFAILKLKPVPFCVLDEIEAALDDNNVIKFSTFL
KQYSSNVQFIVITHRKPTMEASDVIYGVTMEEKGVSKVVSINLANYNT
NT seq
3567 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattcttaaatcaatagagataaggggatttaaatcttttgcagactcaactgaactt
atatttaaacaaggtataacatctgtggtaggaccgaatggaagtggtaagagtaatata
gcagatgcgataagatggtgtttaggggaacaaagtgtaaaaagtctcaggggtgggaag
atggaagatgttattttttccggaactcaatataggaaacaattatctttggcacaggtg
tcattaattatagataattcggaaagggaacttccaatagattatagtactgttataata
tctagaaaattatatagatctggagagagtgaatatttaataaataataaaccgtgtaaa
ttgaaagatataaatgggttattttttgatacaggtatcggtaaggaagggtattcttta
attggacaaggaaagatagatgttatattaaatggaaattctaatgatagaagagctata
attgaggaggcaataggtataactaaatataaatttaagaaggaagaagcatataataaa
attaatcatgccaatgaaaatattgttaggattaatgatatgctttttacatatgaagaa
tatttggaaccattaaaaattgagagtgaaaaagctagaaaatttatagatttatcaaat
gaacttaaagatttggaaattttaattttgtataataatttatatgatattcatgaagaa
atacagagtataaaaagggatataagttaccataatttgaaattaagtgaattaagtagc
gaaaaaagaattatggaaaataagaggtattcatttgaaaaagaatttgaaaatctgaaa
ataatagagaagaaagataagaagaaatattataagattaaggatattatacataaaaat
acaaatattgtaaatcttaaaaataatgacataagtatacttattaattcaaataagata
tatgagaagcagatttatgaaaataaatctaaaatagataatataatccttagagaaaat
ataattaataaaacaagagatgaattggagaatgaatttaatagtattctatgtaatcta
gaggaaaataaaaaattaagcacggataatagtatgacattacataatttagaaaataag
attaatactattctactagaaaagaataaaattgttaatatcaataacaatatacaaaat
aaaattgaatttataagaatgagtttttctaatatagataatgataagaaggcatattta
gatgaaaaacagttgatagaagatagaattaaaaaaattgataaagatatagaacatata
gaacatattttatatgatttacatattcgtgaaagtgaagttaaagttttatctgaaaat
ttattaaatagtattgaaaaagaaaacaaaaaaatagagatagttgatagtcaattgaat
gatttaaataaggatgtaataataaggcaggcaaatcttgatgcattaagagggcttgat
agtatttatgatggatttaataaatctagtaaaactttaatgaatgaaattaattctggt
tcattaattagattcaaagatagatgttttattataggaaatattttagatacggaagag
aaatatacatctgctattgagacggttattggaggacatatttctgacatagtgattgat
gattatgttttcgtaaatgatcttataaatcatcttaaagagaataatcttgggcgtgtt
acatttcatcctttaaatagtgttagtaaatataatataaaatttaataatgaagttaag
ttgtataaaggatttataaattttgccataaatttagttaagtatgattcaaaatttagt
aatattattagtaatatcttaggaaatacaattatttgcgataatattgataatgcatta
aatattgctaagagtataaatttctctaatagaatagttactttggattcccaaattata
aattctggaggatctattacaggtggatcaagttattttaagaaatttaatatacttggt
agacaacggaaaatttcagttgaggaagatgatattaataagaaattattatatatatct
gaattgaaaactaagttaagtaattatcatgatgtaaaaaataatatacagagtgagttt
gatataaataataatttattaaaggatattactatagatatatttaagaaaaatgaagag
ttaaagagatatattgacttaagatcaagagatcttaaagaactagataagaagaatatt
gtattgaataatctagatgatatttatagttcaaatgatgaggaaattaataagttgaat
tatgaattgaatttaaataatgagaagtttagcgttttagaaaatgatgagaaaaatata
aggatagaatgtgaaaattataagaagataattgaaggtagggaaaatgaaattacaaat
tataaaattaggaaagcaaaaattgaagaaaatatttcaaatatttatgatgaaagcaag
agaattgcattagaaaagaaagatctaatttgtgctaacgttaagattaacgataatata
aatttaaataatgttaatatagtgaaaattgaagatagtatacaaatttttaataagaga
atagataatttaaaccagaaatttaatgaatataattttgattcctatatattagatcaa
aataggatacaacaagatataaaaaaattaaatggggatattaatgaactggatttaagt
atacataaaatcgaacatgatattaatgttttaaatattaaaaatactaaaaaagaagtg
gaatttaacataaataatgataacttatttgacaaatattctatcaattttgatacaaat
gatgcagaaaagtacataatagattcgaatgaacttagtaagtatagtataaaaatgaaa
aagataactagtgatataagtgatttagggaatataaatattaaatctattgaggaatat
gaagcacttaatgataaagtaaactttatcactagacagaaggaagatttagaaaagagt
aaaatggagcttgagggttttattaaaaatataacatcagaaatgcggaatatgtttaat
caaagttttaagctcataaatgaaaattttaattttacatttaaagaattatttaagggt
ggaagtgcacaacttttattaggagatggggatgaattagaaagtgatattgaaataatc
gtgcaaccaccaggtaagaaacttcaaaatattaatttattgtcgggtggtgaaaaagga
ctttctgcaatatctcttttatttgcgattttaaagttaaaacctgttccattttgtgtt
ttagacgaaattgaggctgcacttgatgataataatgttattaagttttctacattttta
aaacaatattcttctaacgtacaatttatagttataactcataggaagcctacaatggag
gcaagtgatgttatctatggtgttactatggaagaaaagggtgtatctaaggtggtatcg
attaatttagccaattataatacatag
DBGET
integrated database retrieval system
