Alteromonas stellipolaris LMG 21861: AVL57_15165
Help
Entry
AVL57_15165 CDS
T04545
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
asq
Alteromonas stellipolaris LMG 21861
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PKD_4
Sde0182_C
LPAM_1
DUF5707
EF-hand_1
EF-hand_5
Cmr7A
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMJ75183
LinkDB
All DBs
Position
complement(3252713..3256015)
Genome browser
AA seq
1100 aa
AA seq
DB search
MFIRANYKKSIIAASLVLALSGCNDDDKENVIVNEEESVNEEVVNVAPVAQAGEDATVDE
NTQVTLSGSGVDDDGTIASYNWVQTEGVAVTLTNADQASAEFTAPDVKPSETLTFELTVT
DDAGATATDSVSVTVTHINASPTISISAQEVEEKEAHSIDAVAEDDGEIASYLWMQTGGI
EVELSGATTATLSFIAPSVDSDETLSFVLTVEDDEGETTTETVNVNVLHKTVDLTLTGLV
TDSPIIDANLVIHVGDEQQVVTAGSDGSYSATLSVDDDATDKMVSIVASGVGSQTQAKLM
SMLGSVEALNEASNGDGEVTKDDFFGVNVTNVTTANAGLMQRENLGAPIVDDATLTALNL
RVSQQEKFALATAIKVAIDKAGDDASLALPEGIADTLALAQNPEASTAYIETIEDTEAYE
SAYEEIIADPELVDSDLDSSITTYFLLDYYNPLISYPGKKLTLTSDTTATYSNYLGTFEA
ERFSDDNEITLEFEYGEYHFYQVETVNVDGDLLRVDVEYAYHEITFLPLSEQDGVVTFEV
TSLYSKYYPNGELEDIHNIIDGPAQVTGIALNNAKEIVIDSADNKALSLPITDSLFDTDN
SNLFTFSWASDTFEFNQDGTGSTRVVDNDFTWVKQPYALNPDINELVITFDNGTTQSYVQ
LTDSSDNNLYAVSGISSDGQSDSFKVDAGGTITDEDKFDVASVPGIYSYAFDGDSLNEFW
WELWPNGKAYTIEVGDDNGDGKITTEEILVMYGSWSVEANGELKINRYRFTDYSWPGCFD
ESADCYLYNSRTWSIFAQVGDAYHITNLHEFDFSQQDGRGGFDGIVDYFTQDNRRVSKQA
NRPVTATLPEHPHLPALPPQAFVNLVAPSDYMGTTIYGVEQNGLYTVDDASITLSLEADE
TYTRTFEGLPQGSESGSYLVAADNTILLQAGDVTAPNALQAFLLSSDDVLIGAHLGAPVP
FFETQQQADDYETVLREGTSVASFDSLKDKSLVLVDASQNGEWSATYLQFDGTNVVIYTD
STYSEVDDSFGYSLNDDGSIDVGGRVYLSLSTTGFSVFVSDEGEGDYIDFNYLFEDTTIA
AQFVENANNLRATAEQLGDN
NT seq
3303 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttcatcagagcaaattataagaaaagcattatcgctgcgtcactggtactagccttg
tcaggttgtaacgacgatgacaaagaaaatgttattgttaacgaagaagagtcggttaat
gaagaggtggttaatgttgcccccgtcgctcaagccggcgaggatgcaaccgttgacgaa
aatacgcaggttacactttccggtagtggtgtagatgatgacggtactattgcatcttat
aattgggtgcaaaccgaaggcgtagcggtgacgttaacaaatgccgaccaagcttctgct
gaatttaccgccccagatgtgaaaccttccgaaacacttacgttcgaactgactgtaact
gatgatgctggggcgactgccacagatagtgtgtctgtcacagttactcacatcaacgca
tcgccgacaatctcaatatcagcacaagaagtagaagagaaagaggctcactctattgat
gcggtagctgaagacgacggtgaaattgccagctatttgtggatgcaaacgggcggtata
gaggttgagctaagcggggcgactaccgcaacgctttcctttattgcaccttcagtagac
agtgatgaaaccttatcctttgtgcttaccgtagaagatgatgaaggtgagacgacgact
gaaacggttaacgttaatgtgcttcataaaacagttgatttaacactaacaggcctagtg
accgattccccgattattgatgcaaacttagtcattcatgtaggcgatgagcaacaagta
gtgacggctggtagcgatggaagttattctgctacattgagtgtggatgatgatgcgact
gataaaatggtgtctattgtagctagtggtgtaggatcgcaaacgcaagctaaacttatg
tcgatgctggggtcggttgaagcactcaatgaagcctctaacggtgacggcgaggtaacg
aaagatgattttttcggcgtgaatgtgaccaacgttaccactgcaaacgccggtttaatg
cagcgagaaaacctgggcgcgcccatcgtcgatgacgcaacgctaacggcactgaatctt
cgggtttcacaacaagagaaatttgcgttggccaccgcgattaaagtggcaatagataaa
gcgggcgatgatgccagcttggcccttcctgaaggtattgctgatacgctagcactagcc
caaaatccagaagcttccacagcctatattgaaactattgaagataccgaggcttatgag
tcagcctacgaagaaattattgcagacccagagctagtagatagtgatttagattcgtcg
attaccacctactttctgcttgattactacaatccgctaattagctacccaggcaaaaaa
cttacgttaaccagtgatacgacggctacttatagcaactatttaggcacgtttgaagct
gagcgctttagtgatgacaatgaaataacattggaatttgaatacggagagtatcatttc
tatcaagttgaaactgtaaacgttgatggggatttactaagagttgacgttgaatatgct
taccatgaaatcacatttttaccgctaagtgagcaagatggtgtagtgacgtttgaagtg
acgtcactttactcaaagtattaccccaatggtgaattggaagatattcacaatattata
gatggaccagcgcaagttactggaattgcgttaaataacgccaaagaaattgttattgat
agtgccgataacaaggcgttatcgctccccatcactgattcgttattcgatactgataac
agcaatttatttactttttcttgggcttcagacacattcgaatttaatcaggatggaaca
ggtagtacccgtgttgtagataatgattttacatgggtgaagcaaccctacgcgttgaac
ccagacattaacgagctagttattacgtttgacaatgggacaacacagtcctacgtgcaa
cttacagactccagcgacaataatctttatgcggttagtggaatctcgtcagatgggcaa
agtgactcattcaaagtagatgctggaggtaccataaccgatgaagataagttcgacgtg
gcatcagtaccaggtatctatagttacgcttttgatggagatagccttaatgaattttgg
tgggagctttggccgaatggaaaggcctataccattgaggtgggtgatgataacggtgac
ggcaaaattacaacggaagaaattttggtgatgtatggaagttggtcagtggaagcgaat
ggggaactaaaaataaaccgctaccgctttactgactatagttggccaggttgttttgac
gaatcagcggattgttatttatataacagtcgcacatggtcgatatttgcccaagttggc
gatgcctatcatattacaaatctgcacgaatttgattttagccaacaagatggccgcggt
ggattcgatggtatagttgattactttactcaagataaccgccgagtgtcaaaacaggcg
aatcgtcctgtaaccgcaacactgcctgaacacccgcatttaccagcgctaccgcctcaa
gcgtttgtaaatttagtggcaccctcagattatatgggtacaaccatatatggggttgag
caaaacgggttgtacacagtcgacgacgcatctataacattgagcctagaggccgacgaa
acttatactcgaaccttcgaaggattgccccagggcagtgaaagtggaagttacttggtt
gcagcagacaacactattcttctacaggcaggtgatgttacggcgccgaatgcgcttcaa
gcatttctactgtcttctgatgacgtgttaataggtgctcatctaggcgcgccagtcccg
ttttttgaaacacagcaacaggctgatgattatgaaacggtgttaagagaaggaacttca
gttgcttcgtttgattcgttaaaagataagagtctagttttggtagacgcatcacaaaac
ggtgaatggtctgccacttatttacagtttgatggtaccaatgtggttatctacaccgac
agcacttactcagaagtagatgacagttttggctactcattaaacgatgatggaagcata
gatgtgggtggtagagtgtatctttctttgagtacgactgggttttcggttttcgtttct
gatgaaggtgagggggattatattgacttcaactacctttttgaagatacgacaatagcc
gcacagttcgttgaaaacgcaaataacttgcgcgcgacggcagaacagttaggtgacaat
tga
DBGET
integrated database retrieval system
