Actinobacillus suis ATCC 33415: ASU1_09990
Help
Entry
ASU1_09990 CDS
T03246
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
ass
Actinobacillus suis ATCC 33415
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FAD-oxidase_C
FAD_binding_4
Fer4_8
Fer4_20
Fer4_21
Fer4_9
Fer4_4
Fer4_7
Fer4_18
Fer4_17
Fer4_2
Fer4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIJ32253
LinkDB
All DBs
Position
2199880..2202969
Genome browser
AA seq
1029 aa
AA seq
DB search
MLPQLSTTPELNKTVIQFLAELKQQHFSGDIASHYADRLSLATDNSVYQQLPQAILFPKS
VSDVVILTKLAQRPHFQYLTFTPRGGGTGTNGQSLNNNIIVDLSRHLNQILELNVEERWV
RVQAGVVKDQLNQFLKPHGLFFSPELSTSNRATLGGMINTDASGQGSLQYGKTSDHVLAI
KSVLMNGEVLETQAVKSCDFFAEIGRLGLTATGKQLHREIFSRCRELRPTVLAELPQLNR
FLTGYDLKNVFNADESEFNLTRILTGSEGSLAFICEAKLNLLPLPKFRTLINIKYNSFDA
ALRSAPFMLKANALSVETVDSKVLNLAKQDIIWHSVSDLLTEDPNNPILGINIVEYAGSD
QTLIEQQVADLIKALDKKLADSTSGIIGYQICNDIASIEKIYAMRKKAVGLLGNAKGWAK
PIAFVEDTCVPPEHLADYIAEFRQLLDDHGLEYGMFGHVDAGVLHVRPALDLTDRTQVQK
FKVISDQVVELTAKYGGLIWGEHGKGMRSVYGEKFFGETLWRELRYIKQLFDPQNRLNPG
KICTPLNSNAALYPIDSSMRADFDRQIPIQVREEFKGAMNCNGNGLCFNFDVHSTMCPSM
KVSGNRLYSPKGRATLIREWLRLLAEQNVSPDDLIFKPRKQAVKLTDFVAKIRNTLNKQK
EYDFSHEVKAAMDTCLACKACASQCPIKIDVPTFRSQFNELYHSRYLRPAKDYLVSNLEF
VAPMMAKAPKFFNFFSRSKLAETVANKTIGMTYLPALSVPNLQQQLVEIGYQGVTLEALE
TQASGQKSAEFCKTVLVVQDPFTSFYDAKVVADFVRLLQKLGFRPVVLPFKPSGKAQHIK
GFLNKFAKTARNQAEFLNRVAQLGLPMVAVDPALTLVYRDEYRDILKAARGDFKVQLAHE
WLRDVIQAGELEHCKKSPNSDRLSWHLFAHCTEATELPNAPKEWQAIFAHFGEQLVNENV
GCCGMAGTFGHETKHLEMSTAIYQQSWQIKLKNKPLERCLATGYSCRSQVKRFEHYSVKH
PIQALLEVV
NT seq
3090 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttccacaattgtcgacaacgccagaactgaataaaacagttatacagtttttagca
gaactcaaacagcaacattttagtggcgatatcgcttctcattatgcggatcgcctttct
ttagccaccgataacagcgtttaccaacagttaccgcaggcgattttatttcctaaatcg
gtttcggatgtggttattctcactaagctggcacaacgccctcacttccaatatctgaca
tttacccctcggggcggtggcacgggtacgaacgggcaatcgttgaataacaatattatt
gtcgatctctctcgccatctaaatcaaatcctcgaattaaatgtagaagaacgttgggtg
cgagtgcaagccggtgtggttaaagatcagcttaaccaatttctaaaaccgcatggtttg
tttttctcaccggagctctccaccagtaaccgcgcgaccttaggcggtatgattaacacc
gatgcttccgggcaaggctcactgcaatacggcaaaacctccgatcatgttttagcgatt
aaatcggtattgatgaacggcgaagtgttggaaacacaagcggttaaatcttgcgatttt
tttgcagaaatcggccgcttgggcttaactgctaccggtaaacagctccaccgtgaaatt
tttagccgttgtcgtgagttacgtccgaccgttcttgccgagttgccgcaactcaatcgc
tttttaaccggttacgatttaaaaaatgtattcaacgcagacgagagcgaattcaatctg
actcgcattttaaccggctcggaagggtcacttgcttttatttgtgaggcgaagctcaat
ttactgccgctgccgaaattccgcaccttaataaacattaaatataattcatttgatgcg
gcattgcgttctgcgccgtttatgctgaaagccaatgcgctgtcggttgaaacagtcgat
tctaaagtgctgaacttggctaaacaggacattatttggcattcggtgtccgatttatta
accgaagatccgaataacccgattctcggtattaatattgtggaatatgctggcagcgat
cagacactaatagaacaacaagtcgcagacctcattaaagcgttagataaaaaactggca
gattcaaccagcggtattattggctatcaaatttgcaacgatattgcctccatcgaaaaa
atttatgcaatgcgtaaaaaagcggtcggtctattgggaaatgccaaaggttgggcgaag
ccgattgcgtttgtggaagacacctgtgtgccgccggagcatcttgccgattacatcgct
gagttccgccaattattagatgatcacggtttggaatacggtatgttcggtcatgtggat
gccggtgtgctacacgtgcgcccagcattagatttaaccgaccgtacacaagtgcaaaaa
tttaaagtgatttccgatcaagtggttgaacttaccgcaaaatatggcggtttgatttgg
ggagaacacggcaaaggtatgcgttcggtgtatggcgagaaattctttggcgaaacatta
tggcgagaattacgttatatcaaacagttgtttgacccgcaaaaccgcttgaatccgggc
aaaatttgtacaccgcttaacagcaatgcggcgctttacccgatcgactcatcaatgcgt
gccgattttgatcgccaaattccaattcaagtgcgtgaagaatttaaaggcgcaatgaac
tgtaacggcaacgggctatgctttaactttgatgtacatagtacgatgtgtccgtcaatg
aaagtatcgggtaaccgcctttattcgccgaaagggcgtgcgactttgattcgagaatgg
ctcagattgcttgccgaacaaaacgtatcaccggacgatttgatcttcaaaccgcgtaaa
caagcggtcaaattaaccgattttgttgcaaaaattcgcaacacgctgaataaacagaaa
gaatacgatttttcgcacgaagtgaaagcggcaatggatacttgccttgcatgtaaagcc
tgtgccagccaatgtccgatcaaaattgacgtgccgacgtttagatcgcaatttaatgag
ctgtaccatagccgttatttgcgtccggcaaaagattatctggtttccaatcttgaattt
gttgcgccgatgatggcgaaagccccgaagttttttaactttttcagtcgttcaaaatta
gcggaaactgtggcgaacaaaacgatcggcatgacttatttacctgcgctttccgtgccg
aacttgcagcaacagttggtcgagattggttatcagggggtgaccttagaggctttggaa
acacaagcaagcggtcaaaaatcagcggaattttgcaaaaccgtgctggtagtgcaagac
ccgttcacttcgttctatgatgcgaaagtagtggcggattttgttcgattgctgcaaaaa
cttggtttccgcccagtggtgctaccgtttaaaccgagcggtaaggcgcaacatattaag
ggttttttaaacaagtttgctaaaactgcacgcaatcaggcggaatttctcaatcgtgtc
gcccaactcggcttaccgatggtggcagttgatcctgctctgaccttagtttaccgtgac
gaatatcgtgatatcttaaaagccgcgcgtggcgatttcaaagtgcaactggctcacgaa
tggctacgagatgtgattcaagccggtgagttggagcattgcaaaaaatcaccgaattct
gaccgcttgagctggcatttattcgcacactgtaccgaagcgaccgaattgccaaatgca
ccgaaagagtggcaagcgatttttgcccatttcggtgaacagttggtaaatgaaaatgtc
ggttgttgcggtatggcgggcacgttcggacacgaaaccaaacaccttgaaatgtcgaca
gcgatttatcagcaatcatggcaaattaaattgaaaaataaaccgcttgagcgttgcctc
gctaccggctattcctgccgttcgcaagtaaaacgttttgagcattattcggttaaacac
ccgattcaggcgttgcttgaggtggtgtag
DBGET
integrated database retrieval system
