Actinobacillus suis ATCC 33415: ASU1_11200
Help
Entry
ASU1_11200 CDS
T03246
Name
(GenBank) iron-hydroxamate transporter permease subunit
KO
K23228
ferric hydroxamate transport system permease protein
Organism
ass
Actinobacillus suis ATCC 33415
Pathway
ass02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ass00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
ASU1_11200
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ass02000
]
ASU1_11200
Transporters [BR:
ass02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Metallic cation, iron-siderophore and vitamin B12 transporters
Ferric hydroxamate transporter
ASU1_11200
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FecCD
ABC-3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIJ32494
LinkDB
All DBs
Position
2460663..2462615
Genome browser
AA seq
650 aa
AA seq
DB search
MVKASKLLFSGLAVLFVGLLLTTLTLQLPNGSGLVSLFLPSENLELLLIQSYSLPRIVMA
LLSGGLLGLASLLLQQVMANPLASDNTLGISSGAQFALFLTAIFLPDWLEYGSSAVALIG
AAFSLILVLSLAMRKTMSPLLLILAGLVVNLYFGSFSALMMLFYPEESRGLAQWGAGSLV
QESWRDSLLLIAQAIPAILIISLLVRPLTILALNDANAQSLGVPVAKLRVLGVLIAAFLI
AVVVAKVGMLGFIGLASATIVRQLHIRRFSHQLCAAFVLGALLLANTDLLLQLFAFFSGI
HLPTGAVVALLGTPLLLWLMFSALPHTGRLQEAGSQKIRQFRPLVLALIVGGLALAICLA
LFVGKGINGWQWTQQSELIALRLPRLMAAIAVGILLSVAGVILQRLTLNPMASPELLGVS
SGTSMGILAALFLFGVQQTEWFWLAGILGACVALLVLTAINQRSGMLPEKVLLTGISLSA
LFDTLQRLAIASGDPRANQLIAWTSGSTQNVTNEMAIGLLAVSFALLFASLIFSRWLALL
ALQAPMAQSLGLNLKQVRWSLILFSALLTALATLVIGPLSFIGLLVPQMVRFLGVKKVSQ
QILISACLGGLIMSLADWLGRQLLFPYEIPAGLVATLVGGTYFLLMLRRV
NT seq
1953 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaaaagcgagcaaattattgttcagcggattagccgtgctatttgtcgggctattg
ctaacgacattaacgttacaattaccaaacggaagcgggttggtttcgctctttttgccg
agcgaaaatctggaactattgctgattcaaagttatagcttaccgcgtattgtgatggca
ttactttccggcggtttgctaggtttagcgagcttattattacagcaagtgatggcgaat
ccgttggcatcggataatacgcttggcattagtagcggtgcgcaattcgccttattttta
acggcgatttttttaccggattggctggaatacggctcaagtgcggtcgcattaatcggt
gcggcattcagcctgattttagtgctgagtttggcgatgcgaaaaacaatgtcgccctta
ttgttgatccttgctggtttagtggtaaatctctattttggttcattttccgcattaatg
atgctgttttatccggaagaatctcgaggtttggcacaatggggggctggctctttagta
caagaaagctggcgggattcgttattgctgattgctcaagcgatacctgcgatcttgatt
attagtttattggttcgtccgctaaccattttggcattaaatgatgcgaatgcgcagagc
ttaggtgtgccggtagctaaattgcgagtgctcggtgtattgatcgcggcatttttaatt
gcagttgtggtggcgaaagtcggtatgttgggttttatcggcttggcttcggcaactatc
gttcgccaactgcatattcgccgttttagtcatcagctatgtgccgcttttgtgctgggg
gcgttattgttggcgaatacggatttgctgttacagttatttgccttttttagcgggatt
catttaccgaccggtgcggtggtcgcattattaggtacgccgttgttgctttggctaatg
tttagtgccttaccgcataccggacgtttacaagaggcgggttcgcaaaaaattcgtcaa
tttagaccgcttgttcttgctttgatagtgggcggcttagcgttggcaatttgcttagcg
ttatttgtcggcaaaggtatcaatggctggcaatggacgcaacaaagcgagttgattgca
ttgcgcctccctcgtttaatggcggcgatagcagtcggaattttattatcggttgccggt
gtaattttacagcgtttaacgctcaatccaatggcaagccccgagttattgggcgtttct
tccggcacatcaatgggcatcttagccgctttatttctgtttggcgtacaacaaacagaa
tggttttggttagcagggattctcggtgcttgtgtggcattattggtattaacggcgatt
aatcagcgtagcggtatgttgccggaaaaagtgttgctgaccggtattagcttatcggca
ttattcgatacgttgcaacgtttagcgattgccagcggtgatccccgagcgaatcagttg
attgcctggacatccggatcaacgcaaaatgttactaatgaaatggctatcggcttgcta
gcggtcagttttgcactactttttgcaagtttgattttcagccgttggcttgctttactg
gcgttacaagcaccgatggcacaatcgctaggattaaatctcaaacaggttcgctggagt
ttaattttatttagtgcgttattaactgcgctagcgaccttggttatcgggccgctaagc
tttatcggtttactggtgccgcaaatggttcgctttttaggggtaaaaaaagtctcgcaa
cagattttgatctcagcttgtttgggcggattgataatgtcgcttgccgactggctcggc
agacagttattgtttccgtatgaaattccggcaggcttagtcgccacattagttggtgga
acttatttcttattaatgctaagaagagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system