Arcobacter suis: ASUIS_1686
Help
Entry
ASUIS_1686 CDS
T06792
Name
(GenBank) autotransporter domain-containing protein
Organism
asui
Arcobacter suis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXX90164
UniProt:
A0AAD0WQW2
LinkDB
All DBs
Position
complement(1689601..1695972)
Genome browser
AA seq
2123 aa
AA seq
DB search
MNSFRVKDTRFRILKGGKIGLAFSIALIGGMLILSSTKANATDYFTGTSTVISPLTSGSV
TVETATNTKTNGNNTDTRSDTSSTDVIFAPTSWANSNYIPTSISSDYYGIGQDAYKLNQT
SDYLKLELTFASGANANNITKQGATLYTAPVAPTYVPVSSTSTYSLTQTPSSIDYTANLI
FQGNNTVSGYTAISDGNIKLNGDNIAFNGTVNAGSIDVTAVGTTTFNNAVDVSSGSVDDL
KFSAAGTVILNSDLTGNVVTTGNNQGILTTTGLNKTITGNIGSSTSLDLNTLNIGSDTDV
TNYSTTTINGNVFSNSTVLNNNGTTNSSELILASGKNITSTITTADANMGILTLAGGTQT
VSGQVGTNGNKLAEVNAGVNGSTSTFANDVYATNLDVEGTGTVNLDGNFTGTAIRYNADG
TVILADTKNINSAITTSVDNTGTLSLEGSSTVTGQVGASGASLKEINAGVAGSTSTFNSN
VYASNLNMTGTGTVILNSDLTGNVVATGNNQGILTTTGLNKTITGNIGSSTSLDLNTLNI
GSDTDATNYSTTTINGNVFANSTVLNNNGTTNSSELILASGKNITSTITTADANMGILTL
AGGTQTVTGTVGGVGASLEKVSSGATGATSTFVNNVYANTVENTGTGATTFQDNVVATNV
NVNAGTSTFQDNLTATTTTISTGTGNFNTVSGTTTSNLQFTNNGTANLNTGLTGNVITTA
DNKGTLNLVGSNNQTVTGTVGGVGASLAEVNAGVNGSTSTFANDVYATNLDVEGTGTVNL
DGNFTGTAIRYNADGTVILADTKNINSAITTSVDNTGTLSLEGSSTVTGQVGASGASLKE
INAGVAGSTSTFNSNVYASNLNMTGTGTVILNSDLTGNVVATGNNQGILTTTGLNKTITG
NIGSSTSLDLNTLNIGSDTDATNYSTTTINGNVFANSTVLNNNGTTNSSELILASGKNIT
STITTADANMGILTLAGGTQTVTGTVGGVGASLEKVSSGATGATSTFVNNVYANTVENTG
TGATTFQDNVVATNVNVNAGTSTFQDNLTATTTTISTGTGNFNTVSGTTTSNLQFTNNGT
ANLNTGLTGNVITTADNKGTLNLVGSNNQTVTGTVGGVGASLAEVNAGVNGSTSTFANDV
YATDITVGNGTVNFEDNVVATTTTIGAGTANFNTTSGTTTTDIVFSNIGTANLLTGLTGD
INFSGNNGIVNISDGMGILGSVQTLATNNTGIVNFKGDGIISDSIGSNIYGIKELNINTN
NEQNTPNGVLVTYDALGRELYADVVSLRNNATLTLADGVDIINTGSDNIIITVDNTNTGT
LTFQGTSNIEGEVGQSNKVLNTINAGATGKTVTFDDMVYASTLKYSDNGKVVLNGDNSSN
TSSEGMIGTVNFDNKAGTLAIGDDVNLTVGAGGTQFINGNDAILEFAGSSIITGILGGNT
AGNSTFKRINAGANGETVTFRNDVYVNETTFHVSGTGTVNFQGNLISSLIYDADGVVNVS
DGKNIVVSSVPVAVTTATTNTGSLNFLGTTLLATDIGTSTKRLKNVTFGSAGSSASTYTQ
ELTKNIYAQNTYIGNGTNQTILEMKNDIIFGGSLTVRANSALDVNTRDITVNDNLSLAAN
SLTGFKIYTSDITATGSSTGVPSGSITTDTLTIDNNAIIKVNYVGTLYGAGSYNLVSANS
ILGTYYGTEANGKVSDNSIIDSIIKVDGNNLILFADRTGGGSYGVEDLYIKKSEIGQHYS
NGASEALAGYAYDTVVREGALGDVITRIEELDGGLILSSEKKAQMVEMQKLLAPVANNSS
IQSSITASNLVLTTIKDRMADMRVSSSTDFIPYGYSGYSSGTYTLNNSLWIKAMGSKATQ
SKVEDYDGYESTTVGFVAGLDRTLRNGTTIGLAVAQATTKIDQTDFRSGDSSDTQSIQFS
TYGSRDFGDTYVDGILSYAKHSTDSTRTANSGKLTSSSDADQISAKVEVGHRVYFEDLAT
LTPFASLEYGNLNQKGYTEKGTAYQNDALKVDSVKMNKGTLGVGAKLSTNLNVGDNVVIP
EFKLAAYNAIGDSNADIKAQYTGGGNQFVTPTQELNKTVYNAGIGVKTTLSESTSLMLGV
DYDRSKDGNFEGYSGNVSFRLSF
NT seq
6372 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattcattcagagttaaggatacgagatttcgtattttaaaaggtggaaaaataggt
ttagcatttagtattgccctaataggtggaatgctaatactttctagtacaaaagctaat
gctacagattattttactggaacaagtactgtcattagtcctcttacgagtggtagtgtt
acggttgagactgcaacaaatactaaaactaatggcaataatactgatactcgaagtgat
acaagtagtactgatgtaatatttgctccaacttcttgggcaaacagcaattatatccca
acctctatttcttcagattattatggaataggacaagatgcttataaacttaatcaaaca
tcagattatttaaaattagagcttacttttgcatctggtgcaaatgcaaataatattact
aaacaaggtgctactctttataccgcacctgtagctcctacttatgttccggtttctagt
acttcaacttactctttaacacagacaccatcttcaattgattatacagctaatttgatt
tttcaaggaaataatactgtatctggttacacagcaataagtgatggaaatataaaactt
aatggtgataatatagcatttaatggaactgtaaatgctggttcaatagatgtaacggca
gtaggaacaactacttttaataatgcagttgatgtctcttctggttcagtagatgatttg
aaatttagtgctgcaggtacagtaattttaaattcagatttaacagggaatgtagtaaca
acagggaataaccaaggaatattaactacaacaggattaaataagacaatcacagggaat
ataggaagttcaacgtctttagatttaaataccttaaatattggaagtgatacagatgta
acaaattattcgacaaccacaataaatgggaatgtattttcaaatagtacagttttaaat
aataatggaacaacaaatagctcagaattaatactggcaagtgggaaaaatataacttca
acaattacaacagctgatgcaaatatgggtattttaacactagctggtggaactcaaact
gtaagtggacaagtaggaacaaatggaaataaattagcagaagtaaatgcaggagtaaat
ggttcaacgtcaacatttgcaaatgatgtttatgcaacaaatttagatgtagaaggtacc
ggaacagtaaatttagatggaaattttacaggaacagcaataagatataacgcagatgga
acagtaatattagcagatacaaaaaatataaattcagcaataacaacatctgtagataat
accggaacattaagtttagaaggaagctcaactgtaacaggacaagttggagcatcagga
gcatcattaaaagaaataaacgctggtgtcgctggttcaacttcaacatttaactcaaat
gtttatgcctcaaacctaaatatgacaggtacaggtacagtaattttaaattcagattta
acagggaatgtagtagcaacagggaataaccaaggaatattaactacaacaggattaaat
aagacaatcacagggaatataggaagttcaacgtctttagatttaaataccttaaatatt
ggaagtgatacagatgcaacaaattattcgacaaccacaataaatgggaatgtatttgca
aatagtacagttttaaataataatggaacaacaaatagctcagaattaatactggcaagt
gggaaaaatataacttcaacaattacaacagctgatgcaaatatgggtattttaacacta
gctggtggaactcaaacagtaacaggaacagttggaggagttggagcatcattagaaaaa
gtaagttcaggagcaacgggagctacttcgacatttgtaaataatgtgtacgcaaataca
gtagaaaatacaggaacaggagctacaacttttcaagataatgtagtagcaacaaatgta
aatgtaaatgcaggaacaagtactttccaagataatctaacagcaacaacaactacaata
tcaactggaacagggaattttaatacagtatcaggaacaacaacttctaatttacaattt
acaaataatggaacagcaaatttaaatactggattaacagggaatgttataacaacagcc
gataataaaggaacattaaatttagttggaagtaataatcaaaccgtaacaggaacagtt
ggaggagttggagcatcattagcagaagtaaatgcaggagtaaatggttcaacgtcaaca
tttgcaaatgatgtttatgcaacaaatttagatgtagaaggtaccggaacagtaaattta
gatggaaattttacaggaacagcaataagatataacgcagatggaacagtaatattagca
gatacaaaaaatataaattcagcaataacaacatctgtagataataccggaacattaagt
ttagaaggaagctcaactgtaacaggacaagttggagcatcaggagcatcattaaaagaa
ataaacgctggtgtcgctggttcaacttcaacatttaactcaaatgtttatgcctcaaac
ctaaatatgacaggtacaggtacagtaattttaaattcagatttaacagggaatgtagta
gcaacagggaataaccaaggaatattaactacaacaggattaaataagacaatcacaggg
aatataggaagttcaacgtctttagatttaaataccttaaatattggaagtgatacagat
gcaacaaattattcgacaaccacaataaatgggaatgtatttgcaaatagtacagtttta
aataataatggaacaacaaatagctcagaattaatactggcaagtgggaaaaatataact
tcaacaattacaacagctgatgcaaatatgggtattttaacactagctggtggaactcaa
acagtaacaggaacagttggaggagttggagcatcattagaaaaagtaagttcaggagca
acgggagctacttcgacatttgtaaataatgtgtacgcaaatacagtagaaaatacagga
acaggagctacaacttttcaagataatgtagtagcaacaaatgtaaatgtaaatgcagga
acaagtactttccaagataatctaacagcaacaacaactacaatatcaactggaacaggg
aattttaatacagtatcaggaacaacaacttctaatttacaatttacaaataatggaaca
gcaaatttaaatactggattaacagggaatgttataacaacagccgataataaaggaaca
ttaaatttagttggaagtaataatcaaaccgtaacaggaacagttggaggagttggagca
tcattagcagaagtaaatgcaggagtaaatggttcaacgtcaacatttgcaaatgatgtt
tatgctacagatataacagtaggtaatggaacagtaaattttgaagataatgtagtagca
acaacaactacaattggtgcaggaactgcaaattttaatacaacgagtggaactacaaca
actgatatagtattttcaaatattggaacagcaaatttattaactgggctaacaggagat
attaatttttcaggaaataatggaattgtaaatatatcagatggaatgggaattttaggt
tcagttcaaacattagctactaataatacaggtattgtaaatttcaaaggtgatggaatt
atttctgatagtatcggaagtaatatttatggtattaaagaacttaatataaatacaaat
aatgagcaaaatacaccaaatggagttttagtaacttatgatgcgctaggaagagaactt
tatgctgatgttgtatctcttagaaataatgcaacattaacattagcagatggtgtagat
ataataaatacaggttctgataatataataattactgtagataatacaaatacaggaaca
ttaactttccaaggaacttctaatattgaaggtgaagttggacaaagtaataaagtttta
aatactataaatgcaggagcaacaggaaaaacagttacttttgatgatatggtatatgcc
tcaactttaaaatattctgataatgggaaagttgtattaaatggtgataatagctcaaat
acttcttcagagggaatgataggaactgttaattttgataataaagctggtactttagca
ataggtgatgatgttaatttaactgttggcgctggtggaactcaatttattaatggaaat
gatgcaattttagaatttgcaggaagttcaataataacaggaattttaggtggtaatact
gctggaaattctacttttaaaagaattaatgcaggagcaaatggagaaacagttactttt
agaaatgatgtttatgtaaatgagactacttttcatgtgagtggaacaggaacagttaat
ttccaaggaaatttaataagcagtttaatatatgatgctgatggtgtggtaaatgtatct
gatggtaaaaatatagtagtgtcttctgtacctgttgcagttactacagcaactactaat
acaggttcattaaatttcttaggtacaacactacttgctacagatattggtacaagtaca
aaaagacttaaaaatgtaacttttggatcagctggttcttctgcaagtacgtatactcaa
gagttaacaaaaaatatatatgctcaaaatacttatattggaaatggaacaaatcaaacg
atacttgaaatgaagaatgatattatttttggtggaagtttgactgtaagagcgaattct
gctttagatgtaaatactcgtgacataacagttaatgataacttatcattagcagctaat
tcattaacaggatttaaaatatatacttctgatataacagctactggttcatcaacaggt
gttccttctggaagtattacaactgatactttaacaattgataataatgcaataataaaa
gttaattatgtaggtactttatatggtgcaggaagttataatttagtttctgcaaatagt
attttgggaacttattatggaacagaagcaaatggaaaagttagtgataatagtatcatt
gattcaataattaaagttgatggaaataatctgattttatttgccgatagaacaggtggt
ggaagttatggtgttgaagatttatatattaaaaaatcagaaataggacaacattattca
aatggagcttctgaagcactagcaggttatgcttatgatactgtagttagagaaggcgct
ttaggtgatgttataacaagaattgaagagttagatggtggattgattctatcttctgag
aaaaaagctcagatggtagaaatgcaaaaattattggcaccagttgctaacaattcaagt
attcaatcttctataactgcttcaaatttagtattaacaacaatcaaagatagaatggct
gatatgagagtctcttctagtacagattttattccatatggttattcaggatattcatca
ggtacatatactcttaataattcattatggataaaagcgatgggttcaaaagcaactcaa
agtaaagttgaagattatgatggctatgaatcaactactgtaggttttgtagctgggctt
gatagaactctaagaaatggtacaacaataggattagcagtagcccaagcaactacaaaa
atagatcaaactgattttagaagtggagatagttcagatactcaaagtattcaattttca
acttatgggtcaagagattttggtgatacctatgtagatggaatattatcttatgctaaa
cactctactgattcgacaagaactgctaattcaggtaagttaacatcttcatctgatgct
gatcaaatatctgctaaagttgaagttggtcatagagtatattttgaagatttagcaact
ttaacaccttttgcttcacttgaatatggaaatctaaaccaaaaaggttatactgaaaaa
ggaactgcgtatcaaaatgatgctttaaaagttgattcagtaaaaatgaataaaggtacg
ctgggagttggagctaaacttagtacgaatttaaatgttggtgataatgttgttattcct
gaatttaaattggcagcttataatgcaattggtgatagtaatgcagatataaaagcccaa
tatacaggtggtggaaatcagtttgtaacaccaactcaagaattaaacaaaacagtttat
aatgcaggaataggggttaaaaccacacttagtgaatctacaagtttaatgttaggtgtt
gattatgacagaagtaaagatggcaattttgaaggatattcaggaaatgtttcttttaga
cttagtttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
