Alkalitalea saponilacus: CDL62_11965
Help
Entry
CDL62_11965 CDS
T04906
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K01728
pectate lyase [EC:
4.2.2.2
]
Organism
asx
Alkalitalea saponilacus
Pathway
asx00040
Pentose and glucuronate interconversions
asx01100
Metabolic pathways
asx02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
asx00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00040 Pentose and glucuronate interconversions
CDL62_11965
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
CDL62_11965
Enzymes [BR:
asx01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.2 Acting on polysaccharides
4.2.2.2 pectate lyase
CDL62_11965
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pectate_lyase_4
Beta_helix
Por_Secre_tail
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASB49797
UniProt:
A0A1T5CB20
LinkDB
All DBs
Position
3086712..3088481
Genome browser
AA seq
589 aa
AA seq
DB search
MIKVLLLLLSFWIFSDLIYSNDHPWGWASVNAEGVNGTTGGAGGTVVTVSNQSDLEFYAN
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KGRVVDLLHAGWKNSGSYSYDIIRGKYQRGLYVVRMRSSTLIQHAKFVL
NT seq
1770 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system