Candidatus Arsenophonus lipoptenae: AUT07_00134
Help
Entry
AUT07_00134 CDS
T04248
Symbol
rfaF
Name
(GenBank) ADP-heptose--LPS heptosyltransferase 2
KO
K02843
lipopolysaccharide heptosyltransferase II [EC:
2.4.99.24
]
Organism
asy
Candidatus Arsenophonus lipoptenae
Pathway
asy00540
Lipopolysaccharide biosynthesis
asy01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
asy00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00540 Lipopolysaccharide biosynthesis
AUT07_00134 (rfaF)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01005 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
asy01005
]
AUT07_00134 (rfaF)
Enzymes [BR:
asy01000
]
2. Transferases
2.4 Glycosyltransferases
2.4.99 Transferring other glycosyl groups
2.4.99.24 lipopolysaccharide heptosyltransferase II
AUT07_00134 (rfaF)
Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
asy01005
]
Core region
AUT07_00134 (rfaF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_transf_9
PS_pyruv_trans
Epimerase_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMA64723
UniProt:
A0A109Q7B5
LinkDB
All DBs
Position
complement(162784..163854)
Genome browser
AA seq
356 aa
AA seq
DB search
MKILIIGPSWIGDMMMSQSLYRTLKFKYPKSEIDVVAPDWCRSLLHKMPEINQAISMPWG
HKCLSINMRRQFGIKLRSRHYDQAYVLPNSFKSALVPFFAGISKRIGWIGEMRYGLLNDI
RLLNKSAFPKMFQRYVVLAYKKNLINNADEIPKPILLPKLSVTKTELIQSKQIFHIPENL
FIIGFCPGSAFGPAKCWPFYHYAKLAKLLFSIYNRCRILIFGSKKDDVIAKNIRELLSND
YKQYCVNLTGKTTLEQVINLLASCQVIVTNDSGLMHIASALNIPLVVLYGPSSPDFTPSL
SKKVKMIRLINGYYKIRKGNMDNGYHKSLIDIKPEYVITVLIQLLTEISKNESINC
NT seq
1071 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaatattaattattggcccttcatggataggtgatatgatgatgtcgcaaagcctt
tatcgcactttaaaatttaaatacccaaaatcagagattgatgttgtagcacctgattgg
tgtcgatcattattacataaaatgcctgaaataaatcaagctatatcaatgccttgggga
cataaatgtttatctataaatatgcgtcgtcaatttggtattaaattacgatctagacat
tatgatcaagcgtatgtgctacctaattcgtttaaatctgcattagtgcctttttttgct
ggaatatcaaaaagaattggatggattggtgaaatgcgttatggattattaaatgatatt
cgtttattaaataaatccgcttttcctaaaatgtttcaacgttatgtcgtattagcttat
aaaaaaaatttaattaataatgctgatgaaatacctaaacccattttattacctaaatta
tcagtaacaaaaacagaattaatacaaagtaaacaaatttttcatattccagaaaattta
tttattattggtttttgtccaggttcggcatttggacctgctaaatgttggccgttttat
cattatgcaaaattagctaaattattattttctatttataatcgttgtcgaattttaatt
tttggttcaaaaaaagatgatgttatagctaaaaatattagagaattgttatctaatgat
tataaacaatattgtgttaatttgactggtaaaacaactctagaacaggtgattaattta
ttagcatcttgccaggttatagtaactaatgattcaggtttaatgcatattgcttcagca
ttaaacatacctcttgtagtattatatgggccaagtagtccagattttactccttccttg
tcaaaaaaagtaaaaatgattcgtttaattaatggttattacaaaattagaaaaggaaat
atggataatggttatcataaaagtttaattgatattaaacctgaatatgtgattactgta
ttaattcagttgttaacggaaatcagcaagaatgaaagtattaattgttaa
DBGET
integrated database retrieval system