Entry |
|
Symbol |
deaD
|
Name |
(GenBank) ATP-dependent RNA helicase DeaD
|
KO |
|
Organism |
asy Candidatus Arsenophonus lipoptenae
|
Pathway |
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:asy00001]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
AUT07_00632 (deaD)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:asy03019]
AUT07_00632 (deaD)
03009 Ribosome biogenesis [BR:asy03009]
AUT07_00632 (deaD)
Enzymes [BR:asy01000]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
AUT07_00632 (deaD)
Messenger RNA biogenesis [BR:asy03019]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Helicases
AUT07_00632 (deaD)
Ribosome biogenesis [BR:asy03009]
Prokaryotic type
rRNA helicases
AUT07_00632 (deaD)
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
780161..781990
|
AA seq |
609 aa
MTNETEISFADLGLSTPIISALNDLGYEKPSPIQKQCIPYLLDGGDLLGIAQTGSGKTAA
FSLPLLHNIDMLLKFPQLLILAPTRELAVQVSEAIIEFSKYMSNIKVVALYGGQRYDLQL
RALKNGPQIVVGTPGRLLDHLRRGTLNLFYLRGLVIDEADEMLRMGFIEDVENIMNKIPN
KHQTALFSATMRTAIRRITYKFMKSPKEVSIKSNIKTRPDITQRYWFVYGMRKHEALVRF
LEVEDFDAAIIFVRTKNATLEVSAALESSGYNSSALNGDMNQTLREQTLERLKDGRLDIL
IATDIAARGLDVERISLVINYDIPMNAESYVHRIGRTGRAGRAGRALLFVDHRERRFLRN
IERTIKQSIPEIYLPNSSVLSERRQAKFTENILKQLKIGNLEKYRLLLNKFSNVNGLDIE
TLASILLKMAQGNRPLILPPDPVNKNKYQISKKNEISPNKVFSKCKKRKRERHTTHGDMQ
LYRIEVGLNDGVEVRHIVGAIANEADINSRYIGNIELFAYHSTIELLKGIPNEIFNHLTH
TRILNKPIRMQLLSKKNLFEHNNSTCYRNYSEFRKRGRRFSNEHEREHFRNRNSEHHNSI
LRRKINCNI |
NT seq |
1830 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgaccaatgagactgaaatctcttttgctgatttaggtttatcaacaccaattatttct
gcattaaatgatttaggttatgaaaaaccatctcctatacaaaaacaatgcattccttat
ttattagatggtggtgatttattaggtatagcacaaactggtagcgggaaaacagcagca
tttagtttaccattgttacataacatagatatgttattaaaattcccccaactattaata
ttagctccaactcgtgaattagcagtacaagtttcagaagcaataattgaattttctaaa
tatatgagcaatataaaagtagttgcactttatggtggtcaacgttatgacttgcagtta
cgtgcacttaaaaacggtccacaaattgtagtaggaacacctggtcgtttattagatcat
ttaagacgaggcactttaaatcttttttatttacgtgggttagttatcgatgaagctgat
gaaatgttacgtatgggatttattgaagacgttgaaaatattatgaataaaattccaaat
aaacatcaaacagcattattttctgctacaatgagaacagctattcgtcgtattacttat
aaattcatgaaatcacctaaagaagttagcataaaatctaatattaaaactagaccagat
attacccaaagatattggtttgtttatggtatgcgtaaacatgaagcattagttcgtttt
ttagaggtggaagattttgatgcagcaattatttttgtacgtactaaaaatgctacatta
gaagtttctgcagcacttgaaagtagtggttataatagttcagcattaaatggtgatatg
aaccaaactttacgtgaacaaacattagaacgtctaaaagatggacgtcttgacatatta
atagctactgatattgcagcaagaggtctggacgttgaacgtattagtttggttattaac
tatgatatacctatgaatgctgaatcttatgttcatagaattggtcgtactggaagagct
ggaagagctggtcgtgctctcttgttcgtagatcatcgtgaacgtaggttcttacgtaat
attgaacgtactataaagcaatctattcctgaaatttatttgcctaattcttctgtttta
agtgaacgacgacaagctaaatttactgaaaatattttaaagcaattaaaaataggtaat
ttagaaaaatatcgtttattattgaataaattcagtaatgttaatgggttagatatagaa
actttagcttcaattttattaaaaatggcacaaggtaatcgaccattaatattaccacca
gatccagttaataaaaataaatatcaaattagtaagaaaaatgaaatttctcctaataaa
gttttttctaaatgtaaaaaaagaaaacgtgaaaggcatactacccatggtgatatgcaa
ttatatcgtattgaagttggtcttaatgatggcgttgaagttaggcatattgttggtgca
attgctaatgaagcagatattaatagtcgttatattggtaatattgagttatttgcttat
cattcaacgatagaattattaaaaggtataccaaatgaaatatttaatcatttaacacat
acacgtattttaaataaaccaattagaatgcaattattaagtaaaaaaaatttatttgaa
cataataatagtacatgctaccgtaattatagtgaatttcgcaaacgaggacgtagattt
agtaatgaacatgaacgtgaacacttcagaaatcgtaattctgaacatcataattctatt
ttacgtcgtaagataaattgtaatatttaa |