Caldicellulosiruptor bescii: Athe_1855
Help
Entry
Athe_1855 CDS
T00857
Name
(GenBank) Pectate disaccharide-lyase
Organism
ate
Caldicellulosiruptor bescii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Beta_helix
3keto-disac_hyd
Laminin_G_3
Glyco_hydro_59_C
Laminin_G_1
Laminin_G_2
Trypan_PARP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACM60943
UniProt:
B9MKT5
LinkDB
All DBs
Position
complement(1933527..1935488)
Genome browser
AA seq
653 aa
AA seq
DB search
MSNRKILAIVVSLIMVVSLFTGIGLRNEVAKAATLLTDDFEDGNRDGWSTSNGSWSVVVD
GSKVLKQASTGSEARAYTGSSDWSDYTVEAKVKVLNVKDSSSGAGVIVRYKNSGNFYALV
LRGSKIEIGKKLNSNWSTLAFKSFTLDQDTWYNVKLEVNGSKLVGYVNGSQVLSASDLSI
TTGKAGLIADRCVAEFDDVVVNSSVSGTAPTPTPTPTSSVTPTPTSTPTPTKTPTPTSTP
VPTQTPAVTPTPTPTPTTVPTPAPTPVPGVNAIYVAPSGSSDNPGTIDRPTTLEKAITIV
QPGQIIYMRGGTYKYSAQITIERNNSGTSNARKCIYAFPNERPILDFSSQTYGSVDSNPR
GLQINGNYWHIKGLEVMGAADNGIFVGGSYNIIEQCEIHHNRDSGLQISRYISSATRDEW
PSYNLILNCTSHDNMDPDNGEDADGFACKLTAGPGNVFRGCVAYYNVDDGWDLYTKSETG
AIGEVLIEDCVAYGHGQTSTGSATSSSDGNGFKLGGSNIKVNHTVRRCIAFNNNKHGFTY
NSNPGSITVENCTGYNNGLKVSGRNFYFEEGTHVLKNCLSYKESASSDLVSGTIINCVLW
SNRQAIKLNGQLVTDNDFYSLTPTITRNSDGGLNLGDFLKPKPGSGLEGIGAR
NT seq
1962 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaacaggaagattttagccattgtagtcagtttgataatggttgtttcattgttt
acagggattgggttgcgtaatgaagttgcaaaggcagcgacacttttaacagatgatttt
gaagatggcaacagagatggatggtcgacatcgaacggtagttggagtgtagtagtggat
gggagcaaggttttaaagcaggctagcacaggttctgaggcgagagcatatactggttca
tctgattggagtgattatacagttgaagcgaaagttaaagtattaaatgtgaaggattcg
agttcaggtgcgggagtgatagtgagatataaaaactcaggtaacttttatgcgttggtg
ctaaggggttcaaagatagaaatagggaagaaattaaacagtaactggagtacattggcg
ttcaagtcatttacgttggatcaggatacctggtataatgtgaaattagaagtaaatggg
agcaagttagttggatatgttaatgggagtcaagtattaagtgcaagtgatttatcgatt
acgacaggaaaagcaggtttaatagctgacaggtgtgttgctgaatttgatgatgttgtt
gtaaattcaagtgtgagcggtacagcacctactccgacaccaacaccgacttcatcagtg
acaccaacaccgacatcgactccaacgccaaccaaaacacctactccaacttccacacca
gtaccaacacagaccccagcagtaacaccgacgccgaccccaacgccgacgacagttcca
acacctgccccgacacctgtacctggggtgaatgctatttatgtggcaccaagtgggagc
tcagataatcctggtaccattgatcgacctactacattagaaaaagcaatcacgatagta
caacctgggcagataatctacatgagaggtgggacgtataagtattctgcgcagatcaca
attgaaagaaataatagtggtacaagcaatgcaagaaaatgtatttatgcatttccaaat
gaaaggccaatattggacttttcatctcaaacatatgggagtgtggactcaaatccaaga
ggattacagattaatgggaactattggcacataaaaggattagaagtcatgggagctgcg
gacaacggaatcttcgtaggaggcagctacaatataattgaacaatgtgaaattcatcat
aacagagattcaggtttgcagataagcaggtatataagttctgcaaccagagatgagtgg
ccaagttataacttgatattgaattgtacatcacatgacaatatggatccagataacggt
gaagatgcagatggttttgcatgcaaactaacagcaggaccaggaaatgtattccgaggt
tgtgtagcgtactacaatgttgatgatggttgggatttatacacaaaaagtgagacagga
gctattggtgaagtattaattgaggattgtgtggcatatggtcacgggcaaacatcaacc
gggagtgccacatctagcagtgatggaaatggctttaagctaggaggcagtaatataaag
gtcaatcatacagtgagaagatgtatagcatttaataacaacaaacatggatttacttat
aatagtaatccgggtagcataacagtggaaaattgtacgggctataataacggtttaaag
gtaagtggaaggaacttttattttgaagaaggtacacacgtgttgaagaattgtttatcc
tacaaagagagtgcatcgagtgatttggtaagtggaacgataattaattgtgttttgtgg
agtaataggcaagcaataaagctaaatggtcaactggtaaccgataatgacttttacagc
ttaacaccaaccataacaaggaatagtgatgggggtttaaacttaggagactttttaaag
ccaaagcctggtagtggtttagaaggaataggagcaaggtaa
DBGET
integrated database retrieval system