Arabidopsis thaliana (thale cress): AT2G33410
Help
Entry
AT2G33410 CDS
T00041
Name
(RefSeq) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
ath
Arabidopsis thaliana (thale cress)
Pathway
ath03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ath00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
AT2G33410
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ath03019
]
AT2G33410
Messenger RNA biogenesis [BR:
ath03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
AT2G33410
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
OB_RNB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
817905
NCBI-ProteinID:
NP_180899
TAIR:
AT2G33410
UniProt:
O22791
A0A178VW87
LinkDB
All DBs
Position
2:14155853..14157864
Genome browser
AA seq
404 aa
AA seq
DB search
MESDQGKLFIGGISWDTDENLLREYFSNFGEVLQVTVMREKATGRPRGFGFVAFSDPAVI
DRVLQDKHHIDNRDVDVKRAMSREEQSPAGRSGTFNASRNFDSGANVRTKKIFVGGLPPA
LTSDEFRAYFETYGPVSDAVIMIDQTTQRPRGFGFVSFDSEDSVDLVLHKTFHDLNGKQV
EVKRALPKDANPGIASGGGRGSGGAGGFPGYGGSGGSGYEGRVDSNRYMQPQNTGSGYPP
YGGSGYGTGYGYGSNGVGYGGFGGYGNPAGAPYGNPSVPGAGFGSGPRSSWGAQAPSGYG
NVGYGNAAPWGGSGGPGSAVMGQAGASAGYGSQGYGYGGNDSSYGTPSAYGAVGGRSGNM
PNNHGGGGYADALDGSGGYGNHQGNNGQAGYGGGYGSGRQAQQQ
NT seq
1215 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatcagatcagggaaagctatttatcggcgggatttcatgggataccgacgagaat
cttctgagagagtacttcagcaatttcggcgaggttttgcaggtcactgttatgcgagag
aaagctactggtcgtcctagaggattcggattcgtcgcattctcggatcctgctgttatt
gatagggttcttcaggacaagcaccatattgataatagagatgttgatgtgaagagagca
atgtctagagaggagcagagtcctgctgggagatcagggacttttaatgcttctaggaat
tttgatagtggagctaacgtgaggactaagaagatattcgtgggaggtttgcctcctgca
ttaacatcagatgaatttcgggcttactttgagacttatggtcctgtgagtgatgcagtc
attatgattgatcagactacacagcgtcctcgaggatttgggtttgtttcttttgattct
gaagattcggttgaccttgttttacataagactttccacgatttgaatggtaaacaagtc
gaagttaaaagagctcttcctaaagatgctaaccctggaatagccagtggtggtggtcgt
ggcagtggtggagctggagggtttccgggctatggtggttctggtggaagtggctatgag
ggtcgtgtggattctaatagatacatgcagccgcaaaacactggaagtggttatcctcct
tatggtggttctgggtatggtactggttatggttatggaagcaatggtgtaggttatggg
ggttttggtgggtatggcaatccagctggtgcgccttatgggaatcctagtgtccctgga
gctgggtttggaagtggtccaagaagttcatggggcgctcaagcaccatcgggttatggg
aatgtgggatatggaaatgcagctccgtggggtggttctggtggtcctggttcagcagta
atgggtcaagctggtgcatctgcaggttatggcagtcaaggttatggctatggtggaaat
gattcctcttacgggactccatctgcctatggtgcagtaggggggcgatctgggaatatg
cctaacaaccatggtggcggtggctatgcggatgctttagatggctctggaggctatggg
aatcaccaagggaacaacgggcaagctggttatggtggaggttatggaagtggtaggcaa
gctcaacaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
