Acinetobacter tandoii: FM020_12360
Help
Entry
FM020_12360 CDS
T06790
Name
(GenBank) Ig-like domain-containing protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
atn
Acinetobacter tandoii
Pathway
atn02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
atn00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
FM020_12360
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_13
Big_3_2
HemolysinCabind
DUF4165
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDK98639
LinkDB
All DBs
Position
complement(2619233..2627560)
Genome browser
AA seq
2775 aa
AA seq
DB search
MPNQTVTIKLHDAKTIISAFQVTKTHDQPVTIQAQKGINYELIDDATQFAPENIKIQRVG
DDLYISFEADGDSALDPDLIIQGYYGTDGNTTNLLIGLHENGNYYAYVPESGLQQNAVSM
LADQMSAGQALGGEALTSAAYEFNPYWLLALIPIVGLAAAGGGGGGGGDGTPAPSADKPD
VVALDGGQVTVRPGSNNVKQVITYTDESDNPVTLTATKGSDGSWSLDQTPTEVTINPSTG
EVTIGMDAVKDGSTVTSTGTNSSDNTATDSDTAKVDDSTPTSADAPDVSALATGAVAVKP
GEDNVKQVITYTDESDNAVTLTATKGEDGTWSLDNTPANVVIDPSTGIVAIGPDAVKDLS
TVTSVGSDAYNNTASDSDVSKVDQTDTQNANLLVTFTSITDDTGSSSTDFITNDNTLLFN
GKVAIDASTALSVLSVKVGGTTYTTADSRLTVDGSGNWTLDLTGTTLLDGTYAVVATVTD
TAGNSKSTTSQNVVIDTKIDTDGDGNTVTFDSITDDTGTADDFITNDNTLLFQGTVDLDD
GNSLSVTVGADTYTTADPRLTIDGSGNWTLDLTGTTLLDGTYAVVATVTDTAGNTQSTTS
QDVVIDTEIDTDTDGNTVTFDSITDDTGTADDFITNDNTLLFQGTVDLDDGNSLSVTVGA
DTYTTADPRLTIDGSGNWTLDLTGTTLLDGTYAVVATVTDTAGNTQSTTSQDVVIDTEID
TDTDGNTVTFDSITDDTGTADDFITNDNTLLFQGTVDLDDGNSLSVTVGADTYTTADPRL
TIDGSGNWTLDLTGTTLLDGTYAVVATVTDTAGNTQSTTSQDVVIDTEIDTDTDGNTVTF
DSITDDTGTADDFITNDNTLLFQGTVDLDDGNSLSVTVGADTYTTADPRLTIDGSGNWTL
DLTGTTLLDGTYAVVATVTDTAGNTQSTTSQDVVIDTEIDTDTDGNTVTFDSITDDTGTA
DDFITNDNTLLFQGTVDLDDGNSLSVTVGADTYTTADPRLTIDGSGNWTLDLTGTTLLDG
TYAVVATVTDTAGNTQSTTSQDVVIDTEIDTDTDGNTVTFDSITDDTGTADDFITNDNTL
LFQGTVDLDDGNSLSVTVGADTYTTADPRLTIDGSGNWTLDLTGTTLLDGTYAVVATVTD
TAGNTQSTTSQDVVIDTEIDTDTDGNTVTFDSITDDTGTADDFITNDNTLLFQGTVDLDD
GNSLSVTVGADTYTTADPRLTIDGSGNWTLDLTGTTLLDGTYAVVATVTDTAGNTQSTTS
QDVVIDTEIDTDTDGNTVTFDSITDDTGTADDFITNDNTLLFQGTVDLDDGNSLSVTVGA
DTYTTADPRLTIDGSGNWTLDLTGTTLLDGTYAVVATVTDTAGNTQSTTSQDVVIDTKID
TDGDGNIVTFDSITDDTGTADDFITNDNTLLFQGTVDLDDGNSLSVTVGADTYTTADPRL
TIDGSGNWTLDLTGTTLLDGTYAVVATVTDTAGNTQSTTSQDVVIDTEIDTDTDGNTVTF
DSITDDTGTADDFITNDNTLLFQGTVDLDDGNSLSVTVGADTYTTADPRLTIDGSGNWTL
DLTGTTLLDGTYAVVATVTDTVGNTQSTISQDVLIDTIAPIASIDINPITSDNVITLSEA
VGTINVSGSVSGEYQIGDEVTLTINNQIYTTQIQSGGVWSVAVSGSELVDDGDLTIEASA
IVHDAAGNPSTIDTTESYTLDLTTLSVTLDEALLTSQDSAEVTSQLSGTYTDLALVVPNI
SLSSQGNPITWTLSLDGKTLTGSTTQNDVLIVTLTGSSNAWSYQVELLDSIDHAGDVESL
IFTLEDSGSPVLEKISVDVIDDVPILVENVTYDFGDTPSIYFGNAVDSFGADGGHLTTAT
INGVTYTYDALADSITYTGSTTQFDPDNYSFEDGVLSLTTNFGDSIRINFQTGEYSVEST
GEGVGTEPAQVAPTAMIADQGGLLGSVGLNALDLIDLTANQKFTVADANNDITSVSLSLT
TNLGNALLNALNIQIGFITIPLGTALATLGLNTVLNALGGTIGGLLSFLGLTSYGLSASQ
DLATELGITITIGDESFISDGSGGYVYGQTITFALTNSDPVSTQAFNELLASITVDDAFL
GDIADLSLAPTYTLNVVDSLAQSDTEVSTDVANVSLLGNLLGSDTSGFLTEGTAGGESID
KSAETTSQRIYGYAGDDTLTGGSGNDLIRGGSGDDTIIAGNGNDLIYGGTGNDELTGNDG
TDIFVWEQGDGGSTADPAIDIITDFNTASAAIGGDVLDLSGLLQGEGKIGNLVGNLAAYI
HFETVNNQTEIWISTTGEFTGGYDASESSKVDQKIILSGVDYAADTRTDAEIIQELLSKG
KLIVDDLYGSVGSQESLEIDFTAIDNDLDVATKLSDGSSTTTVSLDSTTVEPETDLVDPL
VNEDPVAMLADRTLLGLVGVGALGLIDLDRQVYGAYDVDNNIAKVEIQFGSLLTVAPTKI
IIDASERLAQELGLKLSYASTEGTLTLLGYSYTLTVTALDGGAIDNVKLNELLATVQLSN
ENGTLLNSSTLSLEVLQAMQITVTDTNGAVDSDTVASLADANLINSLGDYNAYITEGTNL
SETLDESAASTGQRIYAYDGDDVITGSNFNDWIRAGSGDDTVNAGSGNDVIFGGLGNDII
DGGAGNDRILGEAGNDTITGGSGSDTVMFQVLDGEESDNAGGNGTDTWLDFHLGNTTTDD
QADKIDISDLLVNYSGDGSAASLSDYLSVNSDGTDTTIRVDRDGAGGQYQSTDLVVLKGI
DTTLTELITNQQIIL
NT seq
8328 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccaaatcaaacagtaacgataaaattgcatgatgcgaaaaccattatttcagcattt
caagtcacgaaaacccatgaccagcctgttacgattcaagctcaaaaaggcatcaattac
gagctgattgatgatgccactcaatttgcaccagaaaatattaagattcagcgagtgggt
gatgatttatatattagctttgaggcggatggtgatagtgcgcttgatcctgacttgatt
attcaaggctattacggaacggatggaaatactaccaatctgctgatcggtctgcatgaa
aatggcaattactatgcctatgtcccagaaagtggtttgcaacaaaacgcggtcagtatg
ctcgcagatcaaatgagtgcggggcaggctctcggtggagaagctttaacgtctgcggca
tatgaatttaatccttattggttgttggcattgattccgattgttggattggccgctgct
ggagggggcggcggaggtggtggagatgggacacctgctccatctgccgacaaacctgat
gttgttgctttagatggtggtcaagttacggttagaccaggttcaaataatgtaaaacaa
gtcattacttatacggatgaatcagataaccctgtgaccttaacggcaaccaagggttct
gatgggtcatggagccttgatcaaacacctactgaggtaacgattaatccttctacgggt
gaagttaccatcggtatggatgctgtgaaagatggcagcacggtgacttctacagggacc
aattcgagtgataataccgcgactgatagtgatacagctaaggtggatgacagtacacca
acatctgcagatgctcctgatgttagtgcattggcgacgggtgctgttgctgttaaacca
ggtgaagataatgttaaacaggttattacgtatacagatgaatcagataatgcagtgacc
ttaacggcaactaaaggtgaagatggtacttggagcttagataacacacctgctaacgtt
gtgattgatccatctacaggtatcgtcgccattggtcctgatgcagtgaaagacctttca
actgttacgtctgtaggtagcgatgcttataacaatactgcttcagatagtgacgtatcc
aaagtggatcagactgatactcaaaatgcaaatttattagtcacctttacttccatcact
gatgatacggggagttcatcgacagactttattaccaatgacaataccttactgtttaac
ggtaaagtggctatcgatgccagtactgcccttagtgttctcagtgtcaaagtgggtggt
acgacttacaccacagcagattcacgccttactgttgatggttcaggtaactggacactg
gacctgacaggcaccactttgctggatgggacctatgccgtggtggcaacggtgaccgat
acagcgggcaacagcaaaagcaccaccagtcagaatgtagtgattgacaccaagattgat
accgatggcgatggcaacaccgtaacctttgattcgatcacggatgatacaggcactgca
gacgacttcatcaccaatgacaatactttactgttccaaggcacagtggatttggatgat
ggcaacagcctcagtgtgaccgtcggggcagacacctacaccaccgcggatccccgtctg
acgattgatggctcaggcaactggacactggacctgacaggcaccactttgctggacggg
acctatgccgtggtggcaacggtgaccgatacagcgggcaatacccaaagcacgaccagc
caagatgtggtgattgataccgagatcgacaccgatacggacggtaacacagtaaccttt
gattcgatcacggatgatactggcactgcagacgatttcatcaccaatgacaatacttta
ctgttccaaggcacagtggatttggatgatggcaacagcctcagtgtgaccgtcggggca
gacacctacaccaccgcggatccccgtctgacgattgatggctcaggcaactggacactg
gacctgacaggcaccactttgctggacgggacctatgccgtggtggcaacggtgaccgat
acagcgggcaatacccaaagcacgaccagccaagatgtggtgattgataccgagatcgac
accgatacggacggtaacacagtaacctttgattcgatcacggatgatactggcactgca
gacgatttcatcaccaatgacaatactttactgttccaaggcacagtggatttggatgat
ggcaacagcctcagtgtgaccgtcggggcagacacctacaccaccgcggatccccgtctg
acgattgatggctcaggcaactggacactggacctgacaggcaccactttgctggacggg
acctatgccgtggtggcaacggtgaccgatacagcgggcaatacccaaagcacgaccagc
caagatgtggtgattgataccgagatcgacaccgatacggacggtaacacagtaaccttt
gattcgatcacggatgatactggcactgcagacgatttcatcaccaatgacaatacttta
ctgttccaaggcacagtggatttggatgatggcaacagcctcagtgtgaccgtcggggca
gacacctacaccaccgcggatccccgtctgacgattgatggctcaggcaactggacactg
gacctgacaggcaccactttgctggatgggacctatgccgtggtggcaacggtgaccgat
acagcgggcaatacccaaagcacgaccagccaagatgtggtgattgataccgagatcgac
accgatacggacggtaacacagtaacctttgattcgatcacggatgatactggcactgca
gacgatttcatcaccaatgacaatactttactgttccaaggcacagtggatttggatgat
ggcaacagcctcagtgtgaccgtcggggcagacacctacaccaccgcggatccccgtctg
acgattgatggctcaggcaactggacactggacctgacaggcaccactttgctggacggg
acctatgccgtggtggcaacggtgaccgatacagcgggcaatacccaaagcacgaccagc
caagatgtggtgattgataccgagatcgacaccgatacggacggtaacacagtaaccttt
gattcgatcacggatgatactggcactgcagacgatttcatcaccaatgacaatacttta
ctgttccaaggcacagtggatttggatgatggcaacagcctcagtgtgaccgtcggggca
gacacctacaccaccgcggatccccgtctgacgattgatggctcaggcaactggacactg
gacctgacaggcaccactttgctggatgggacctatgccgtggtggcaacggtgaccgat
acagcgggcaatacccaaagcacgaccagccaagatgtggtgattgataccgagatcgac
accgatacggacggtaacacagtaacctttgattcgatcacggatgatactggcactgca
gacgatttcatcaccaatgacaatactttactgttccaaggcacagtggatttggatgat
ggcaacagcctcagtgtgaccgtcggggcagacacctacaccaccgcggatccccgtctg
acgattgatggctcaggcaactggacactggacctgacaggcaccactttgctggacggg
acctatgccgtggtggcaacggtgaccgatacagcgggcaatacccaaagcacgaccagc
caagatgtggtgattgataccgagatcgacaccgatacggacggtaacacagtaaccttt
gattcgatcacggatgatactggcactgcagacgatttcatcaccaatgacaatacttta
ctgttccaaggcacggtggatctggatgatggcaacagcctcagtgtgaccgtcggggca
gacacctacaccaccgcggatccccgtctgacgattgatggctcaggcaactggacactg
gacctgacaggcaccactttgctggacgggacctatgccgtggtggcaacggtgaccgat
acagcgggcaatacccaaagcacgaccagccaagatgtggtaattgacaccaagattgat
accgatggtgatggcaatattgtcacctttgattcgatcacggatgatactggcactgca
gacgatttcatcaccaatgacaatactttactgttccaaggcacggtggatctggatgat
ggcaacagcctcagtgtgaccgtcggggcagacacctacaccaccgcggatccccgtctg
acgattgatggctcaggcaactggacactggacctgacaggcaccactttgctggacggg
acctatgccgtggtggcaacggtgaccgatactgcgggcaatacccaaagcacgaccagc
caagatgtggtgattgataccgagatcgacaccgatacggacggtaacaccgtgaccttt
gattcgatcacggatgatacaggcactgcagacgacttcatcaccaatgacaatacttta
ctgttccaaggcacggtggatctggatgatggcaacagcctcagtgtaactgtcggggca
gacacctacaccaccgcggatccccgtctgacgattgatggctcaggcaactggacactg
gacctgacaggcaccactttgctggacgggacctatgccgtggtggcaacggtgaccgat
actgtgggcaatacccaaagcacgatcagccaagatgtgttgattgataccattgcacca
atagccagcatagatatcaatccaatcaccagtgacaacgttattacactatcagaggca
gtcggtacgattaacgtcagtggttcagtgagtggtgaatatcaaattggtgatgaggtg
acactgacaattaataatcaaatctataccacacaaatccaaagtggaggagtttggagt
gtcgctgtgtcagggagtgaacttgtagatgatggtgatttaactatagaggctagtgct
atagttcacgatgctgcaggtaatccatcaacaatagatacaacagaatcctatacttta
gacttaacaacactatctgtaactttggatgaggctttattaaccagccaagactcggcc
gaggtaacaagtcagttaagtggaacatatacagatttagcattagtggtgcctaatatt
tctttatctagtcaaggtaatccaatcacttggacattatctttagatggaaaaacctta
actggttccactacacaaaatgatgtgttgatagtgactttaactggctcatcaaatgct
tggagttatcaggtcgagctactcgacagtattgatcatgcaggggatgtcgaaagctta
atctttactttggaagatagtggtagtcctgttctagagaaaattagtgtagatgtcatc
gatgatgtaccaattcttgtagaaaatgtgacttatgattttggagatacaccatccatt
tactttggtaatgcagtagattcatttggtgctgatggtggacatttaactacagcgacg
attaatggagttacttatacctacgatgctttggcagattcaattacttatacaggatca
acaacgcaatttgacccagataattatagttttgaagatggggttttaagcttaaccact
aattttggtgattcaatccgaatcaactttcaaacaggtgagtattctgtagaaagtaca
ggtgaaggtgtagggacagaaccagctcaagttgctccgacggccatgattgccgatcaa
ggtggtttgttgggctctgttggattgaatgcacttgatttaattgatttaactgcaaac
cagaagtttacggttgcagatgccaataatgatattacgtctgtttctttaagcctaacg
acaaatttgggtaatgccttactaaatgcgttaaatatacagattggttttattacaatt
ccattaggtacagcccttgctactttaggtctgaatacagtacttaatgcacttggagga
acgattggtggtttattaagctttttaggcttaacctcttatggattaagtgcatctcaa
gatttagcaacagaactgggtataacaatcactattggtgacgaatcttttatttcagac
ggttctggtggttatgtatatggtcaaacaatcacgtttgcactaacaaattctgatcct
gtttcgactcaggcttttaatgagttattagcttcaattactgtagatgatgcattctta
ggcgatattgctgatttaagtttagctccaacttatacacttaatgtggtggactctttg
gcacagtccgatacagaggtgagtactgatgttgcaaatgtttcattactggggaattta
ttaggttcagataccagtggattcctgactgaaggtactgctggaggcgaatcaatcgat
aaatcagcagaaacgaccagccagcgcatttatggctatgctggagacgatacgctcact
ggtggttcggggaatgatttaattcgtggtggtagtggcgatgatacgataattgcaggc
aatggtaacgacctgatttatggtggaactggtaatgatgaattaactggtaatgatggt
acggatatctttgtttgggagcaaggtgatgggggttcaacagcggatccagcaatagat
atcattacagattttaatacagccagtgctgcgattggcggagatgttctagatttatct
ggcttgctgcaaggcgaaggaaaaataggaaatttagttggtaatcttgctgcatatatt
cactttgaaacggtaaataatcaaacggaaatttggatcagtactacaggtgagttcaca
ggtggttatgatgcatctgaaagtagcaaagttgatcagaaaattattttgtcaggtgtc
gattatgctgctgatacacgaacggatgcagagataattcaagagttattgtctaaagga
aaattaattgttgatgatctttatggctcagttggttcgcaagagtctttggaaattgat
tttacagccattgataatgacttagatgtagcaaccaagttaagtgatggttcatctaca
acgactgtgagtttagacagcacaacggtagagccagaaacggatttagtagatccttta
gtgaatgaagacccagtagcaatgttggcagatcggacgttactcgggcttgttggtgtg
ggggcattggggctgattgatttggatcgacaagtctacggtgcctacgatgtagataat
aatattgcaaaagtcgaaattcaatttggttccttgcttacagttgcaccaactaaaatt
attattgatgcctctgaacgcctagcacaagaactcgggttgaaattgagttatgcatca
acagagggaacgctcacactacttggatattcttatacgctaacggttacagcattagat
ggtggtgctattgataatgtgaaattgaatgaattattggcgactgttcagctcagtaat
gagaatggaacattgctcaatagtagtacattgagtttagaagtactgcaagcaatgcaa
atcactgttaccgatacaaacggagcagttgattcagataccgtagccagtttggctgat
gcaaatctgattaatagcttgggtgattataatgcgtatattacggaaggtacgaatctt
agcgaaactttagatgaatctgctgcatctacggggcaaagaatttatgcctatgatggc
gatgatgtcattactggtagtaactttaatgattggattcgtgcaggatcgggtgacgat
actgtaaatgcaggctcaggtaatgatgtgattttcggcggtttggggaatgatattatt
gatggcggtgctggcaatgatcgaattcttggtgaagctggaaatgacacgattacaggt
ggttctggctcagataccgttatgttccaagttctggatggagaggaaagcgataatgct
ggtggcaatggaacagatacatggctagacttccatttaggaaatacaactacggatgac
caagctgacaaaatcgatatcagtgatttgttggtgaattattcaggtgatggtagtgct
gcttcattaagtgactatttaagtgtgaatagcgatggaaccgatacaaccattcgtgtt
gatcgtgatggtgcaggtgggcagtatcagtctaccgatctggtggttttaaaaggtatt
gataccactttgactgagttaattaccaatcaacagattattttataa
DBGET
integrated database retrieval system