KEGG   Amyelois transitella (navel orangeworm): 106131358
Entry
106131358         CDS       T09957                                 
Name
(RefSeq) laminin subunit beta-1
  KO
K05636  laminin, beta 1
Organism
atra  Amyelois transitella (navel orangeworm)
Pathway
atra04512  ECM-receptor interaction
atra04518  Integrin signaling
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:atra00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    106131358
   04518 Integrin signaling
    106131358
SSDB
Motif
Pfam: EGF_laminin Laminin_N LAMININ_IV_B EGF_LMN_ATRN ATG17_like HmpF F5_F8_type_C CCDC39
Other DBs
NCBI-GeneID: 106131358
NCBI-ProteinID: XP_013185898
LinkDB
Position
6:4927195..4932552
AA seq 1785 aa
MALRALFILPALIAAGTAVFDREHLRADPRLLDRACQLSPCYPATGNLLIGRESRLSASS
TCGLYGRERYCIVSHLQDRKKCFWCDSTNNTIHDAQLNHRIQNIIYKFTPGTRNKSWWQS
ENGIENVTIQLDMEAEFHLTHLIIQFKTFRPAAMLVERSFDFGKTWRVYRYFAHRCEESF
PGIPTHSQRSLTEIVCESRYSGVAPSTEGEVIFRVLPPNLTFVKNPYSEEVQNLLRMTNL
RINFTKLHTLGDDLLDNRAEIQEKYYYSIYEMTVRGSCSCYGHASRCLPMPGVESKNNMV
HGRCECTHNTRGLNCEYCEDFFNDLPWQPAVGRTSNACKQCTCNNHATKCHFDAAVYNKT
GKKSGGVCDNCQHNTMGINCERCQPQFYKDPNLDIQSPDICKPCDCDPQGTTDEEILCDD
ETDEMNNKTAGRCLCKANVDGPRCDKCKDGFWNFDPQNTEGCTACTCNGLGTINERGCDP
TTGNCFCKRHVTGRNCDQCLPEFYGLSEIDDGCTPCDCDIGGSIDRDCDVITGQCKCRPY
VTGRRCDQPIQNFFVGALDSMVFEAESSQCDSQFDDNAIQSQVCHVVIRENFPDGRRETW
TGPGFMKIPEGSTLVFIIDNIQTTMNYNVLIRYEPQSNLNWEEATILVKRPGPIDLDSPC
ANIRPEDDRITTYLPANQRSVLVIPPVCLEKQKETEIRIYLGHQDKRTPNPRASVLIDSI
VLIPSFDDLPFFKGNDSVANNMKREFDRNNCGDPYYYDLNRDTVPEICKNYHASIGFYIR
NGSESCQCDPSGSKSHQCHPYTGYCQCVENIVGARCDRCAPGTYDFSKFGCKRCDCNSIG
SLDNFCDATSGQCKCRTNTYGRACDLCQPGYFNFPNCEQCDCNGHAVECDDRTGACRDCR
DFTEGHRCERCIAGYYGDPRLGVDIACRPCPCPGIKGDPNKNNHADSCELDSDTKDVVCE
CKAGYAGALCDVCADNYYGDPITGTCEKCECNENIDITKPGNCDPYTGQCLQCLHNTAGD
HCEVCEEGYYGNALEKACYKCNCSVLGTNFTRGNCDGVTGQCPCFNNVMGINCDQCTENH
WRIALGTGCDPCDCDPIGSRSSQCNPFIGKCDCKPGHGGRQCDQCQENHWGDPNIECHEC
ECNLYGSMSPQCMRDTGSCVCKPGIGGYNCDKCARGYLGEAPQCYACGECFDNWDRVIDE
LRVQTEYAIGNASKIKVVGATGAYTRDFDEMTKKLSEIEGMLNSANMGQTTVNELLSNIS
SLQNELAKTEEKVKDSNSNLNDITSQINLGNVTLDNLRKNIETLKQKTVELGNNATKLQE
ANLEGALNLTREAKQRAIKASDEAENVQTLIANTDRQIKNTDRLIEMQYAHFNNNQNDNE
KKLDDIQSELTELESRIPKLNEKMCGQESDTCDICGGAGCGKCGGISCDQGAVTKAEQAL
DFANKTDHRIKEHELTAEDLFRSISLVKQDTVAVRSQAKELFNKAHEFKSSTERVTNESK
DLTSELKDFLSNTSSTPADIRSLAQEILNLSISIEPKEITELSQRINSTVSQLTNIENII
IETKPDLERAKALKQNATAVNQSANVTLMTAKKVLEALDDAQAAQDAAENAIQKANSDIE
AAKNDLIPIAKETEQAQKKANETKDEVEGLRLRLSDLQKNILKIESDADQVKQEANDVVN
RAEGAEQKARQLRLDFKQTNMSLAQRADQTSNSRERAQLLLNRATKLASDTQMQLKLLAN
MEELYNDHNEQLNILEKEISELNALMNYYLTEITKRSDYYRACTT
NT seq 5358 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggctctacgcgcattgtttatattgcccgcgctaatcgccgccggcactgctgtattc
gaccgtgagcaccttcgagcggacccgcgcctcctggacagagcctgtcagctcagcccc
tgctaccccgccaccggcaatttactaattggccgggagtcgcgactatccgcatcttcg
acatgcggactctacggtcgcgaacgctactgcatcgtatcacatttacaagaccgcaag
aaatgcttttggtgcgactctacgaacaatacgatacatgacgcgcagctaaatcatcga
atacaaaatattatttacaaattcacacctggaacacgtaataagtcttggtggcagtcg
gaaaatgggatagaaaatgttactattcaattggatatggaagcggaatttcatctcact
cacttgatcatacagttcaaaacgtttcggccggctgctatgttagtggaacgttctttt
gattttggaaaaacttggcgtgtctatcgttattttgcccatcgctgcgaagaatctttt
cctggaattccgacgcattcccaacgatctctaactgaaattgtgtgtgaatcgcggtat
tcaggagtagccccgtctacagaaggtgaagtgatattcagagttttacctcccaatttg
acatttgtcaaaaacccttattcagaggaagtgcaaaatttgttacggatgaccaattta
aggatcaattttactaagcttcacactttaggagatgatttgttagataatagagcggag
attcaagaaaaatattactactctatttatgaaatgactgtacgtggctcttgctcttgt
tatgggcacgcttctcgctgcttacccatgccaggggtggaatctaaaaacaatatggtg
cacgggcgatgtgaatgtactcataatactcgtggattaaattgcgaatattgtgaagat
tttttcaatgatttgccatggcaaccagctgtaggaagaacatctaatgcttgtaaacaa
tgtacatgtaacaatcacgcaacaaaatgccattttgatgccgcagtttataataaaaca
ggaaaaaagagcggtggagtgtgtgataattgccaacacaacaccatgggaattaattgc
gaacgttgccagccacaattttataaagacccaaatttagatatacaaagtccagatatc
tgcaaaccatgtgattgtgatccccaagggacaacagatgaagagattctctgtgatgat
gaaactgatgaaatgaacaataaaaccgcgggtcggtgtttatgcaaggccaacgttgat
ggacctaggtgtgacaaatgtaaagatggtttttggaattttgatccacaaaatactgag
ggttgcacggcttgcacatgcaatggtcttggaacaataaacgaacgtggatgcgatcct
acaacaggcaattgtttctgtaagcgacatgtcacgggtagaaattgcgaccagtgttta
ccagaattttacggcttgtctgaaattgacgatggttgtacaccttgtgactgtgatatc
ggtggttcaatcgatcgcgattgtgatgtaattacagggcagtgcaaatgtcggccatat
gttactggtcgacgctgtgatcaaccgatacaaaactttttcgttggtgctttagattct
atggttttcgaagcggagtctagtcaatgtgattcacaatttgatgataatgctattcaa
agtcaagtatgccatgttgtcattcgtgagaactttccagatggaaggagggaaacttgg
acgggacctggttttatgaaaataccagaaggaagcacattggtatttataatcgacaac
atacagacaacgatgaactataacgttttgataagatacgagccacaatcaaatctaaat
tgggaagaagcaacaatattagttaaaagaccagggcctatagatttagattcgccatgt
gccaatattcgtccagaagatgatagaataactacatatttacctgctaatcaacgaagt
gtgcttgttatacctccagtttgtttagagaagcaaaaagaaactgagattcgtatatat
ttaggacatcaagacaaaagaacaccaaatcctagagcttccgtactcattgattctatt
gtgcttatcccatcgtttgatgatttgccatttttcaagggtaatgattctgttgcaaat
aatatgaaacgagaatttgatcgtaacaactgtggagatccatattattatgacttaaat
agagatactgttcctgaaatatgcaagaattaccacgctagtattggattttatattaga
aatggatctgaatcttgtcagtgtgatccctctggatcaaaaagccatcagtgtcatcca
tatactggatactgtcaatgtgttgaaaatattgtaggagcgcggtgcgatcgttgtgct
ccaggaacatatgactttagcaaattcggatgtaagcgttgtgattgtaatagtatagga
tctttagacaatttctgtgatgcaaccagtggacaatgtaaatgtagaacaaatacatat
ggtcgtgcttgtgatttgtgtcaacctggttatttcaatttccctaattgtgaacagtgt
gattgtaacggtcatgcagtggaatgtgatgatagaacgggggcgtgtagagattgcaga
gactttactgaaggccatcgatgcgaaagatgcatagcaggttattacggtgatccacgt
ctcggtgtagacattgcttgtcgtccttgtccctgtcccggtataaaaggtgatcctaat
aaaaataaccacgctgattcttgtgaactcgattcagatacaaaagatgtcgtatgtgaa
tgtaaagcaggttatgctggagctctatgcgatgtgtgtgctgataattattatggtgat
ccgatcacaggaacttgtgaaaaatgtgaatgtaacgaaaacatcgatattacaaaacct
ggtaactgtgacccctatacaggtcagtgtttgcagtgcttacataacacagctggagat
cactgtgaagtatgtgaggaaggatattacggaaacgctttggaaaaagcgtgctacaaa
tgtaattgttctgtcctgggaactaactttactcgaggaaattgcgatggtgtaaccgga
caatgtccttgcttcaataatgtgatgggtataaattgtgaccagtgtactgaaaatcat
tggagaatagcgctcggtactggatgtgatccatgtgactgcgatccaataggatctcga
tcttcgcaatgtaacccatttatcggtaaatgtgattgtaagccagggcatggtggaagg
caatgcgatcagtgccaggaaaatcactggggcgatcccaacatcgaatgtcatgaatgt
gaatgtaatttgtatggttccatgtcaccgcagtgtatgcgtgacaccggatcgtgtgtc
tgtaaacctggcataggtggttacaattgtgataaatgcgccagaggatatttaggagaa
gctcctcaatgctatgcttgcggtgaatgctttgacaactgggatcgagttattgatgag
ttacgtgttcaaacagaatatgccattggaaatgctagtaaaataaaagtggttggtgct
acaggagcatatacaagagactttgatgaaatgactaaaaagttatctgaaatagaaggc
atgttaaatagtgctaatatgggacaaactacagtcaatgaattattatctaatattagt
agtttacaaaatgaacttgcaaaaaccgaggagaaagtgaaagatagtaattctaatttg
aatgatataacttcccaaatcaatttaggaaatgttactttagataatttaaggaaaaat
attgagacactaaagcaaaaaactgttgaactaggtaataatgcaacaaaactgcaggaa
gccaacttagaaggtgcccttaatttgacacgagaagctaaacaaagagcaatcaaagca
tctgacgaagctgaaaatgttcaaactcttattgcaaatactgacagacaaataaaaaat
acagaccgtctaattgaaatgcaatatgctcattttaacaataatcagaatgataatgaa
aaaaaattagacgatattcaaagtgagttaactgaattggagtcccggatacccaaactt
aatgaaaagatgtgcgggcaagaaagtgatacttgtgacatttgtggcggtgcaggttgt
ggaaaatgtgggggaatatcctgcgatcaaggcgcagtcactaaagcagagcaagcctta
gattttgctaataaaactgaccatagaataaaggaacatgaacttacagctgaagattta
ttccgatcaatttctttagtcaaacaagacactgttgccgtacgttcgcaagctaaagaa
ctattcaataaagcacacgagtttaaatcgtcaactgaacgcgttacaaatgagagcaaa
gatttgacttccgaactgaaagactttttatcaaatacttccagtactccagctgatata
aggtctttggctcaagaaatcttaaatctttccatcagtatagaacccaaagaaataaca
gagttatcacagcgtataaattcaactgtttctcagctaactaatattgaaaatattata
attgaaacgaagcctgatttggagagagccaaagcgttgaagcaaaatgcaacagctgtt
aatcaatcggcaaatgtaactttgatgacagccaaaaaagtgctagaagcattggatgat
gcgcaagcagcacaagatgcagcagagaatgctattcaaaaagctaacagtgacattgaa
gcagctaaaaatgacctaataccgattgccaaagaaactgagcaggctcagaaaaaagca
aatgaaactaaagatgaagtagagggattacggttaagactttccgatttacagaaaaac
atattgaagatagaaagtgatgctgatcaagtgaaacaagaagcgaatgatgttgtaaac
agagctgaaggtgcggaacaaaaagctaggcaattgagattggatttcaaacaaacaaat
atgtcccttgctcagcgtgctgaccagacgtccaattcgagagagcgagcacaattgctt
ctcaatcgagctacaaagcttgctagtgatacacaaatgcagttaaaacttcttgcaaat
atggaagaactatacaatgaccataatgaacaattaaacattttggaaaaagaaatatcc
gaacttaatgcattaatgaattattatctcactgaaattacgaaacgatctgattattac
agggcctgtacaacataa

DBGET integrated database retrieval system