Amaranthus tricolor (tampala): 130810418
Help
Entry
130810418 CDS
T09367
Name
(RefSeq) glutamate receptor 3.3
KO
K05387
glutamate receptor, ionotropic, plant
Organism
atri
Amaranthus tricolor (tampala)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
atri00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
atri04040
]
130810418
Ion channels [BR:
atri04040
]
Ligand-gated channels
Glutamate (ionotropic)
130810418
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ANF_receptor
Lig_chan
Peripla_BP_6
SBP_bac_3
Lig_chan-Glu_bd
Peripla_BP_5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
130810418
NCBI-ProteinID:
XP_057532453
LinkDB
All DBs
Position
4:32857782..32863348
Genome browser
AA seq
933 aa
AA seq
DB search
MKVNWLLVLLISLMFVLSVGATNNVSTPAVINIGALFSFNSTIGEVVKIAIQEAVNDVNS
NSSILHGSTLNLTMRNSDCSGFMGFIQAMQLMETQVVAIIGPQSSTVSHMVSLVATELQI
PLLSFAATDPTLTYLSSPFFVRTIYCDQYQMTAISEIVEYYGWREVVAVYNDDDYGRNGV
AALDDALADKRGRISYKAAIAPDTSVTRGDIMDIFVKIAMLECRVIILHTNPHSGRLIFN
VSNYLGMTGNGYVWISTDWLSSLIDSNSPLPSGIMSAIQGFLVLRPHTPDSTRKRAFVSR
WKKATGGSLGLNAYAFYAYDSVWMLAHAIDAFLKQDGNISFSSDSKLLSLNITETYLQQM
RIFDGGQALLSNILQSDLIGLTGPLKFDSDRSLAHPAYDIINVLGTGYRQVGYWSNYSGL
SVVSPETLYTKPANRSSANQRLYPVFWPDGSTTVPRGWVFPNTGVQLRTGVPLRVSFKEF
VSRVPGSNDMFKGLCIDVFQAAVNLLQYPVPYEFVAFGDGHQNPNYTDLVNGITTGIFDA
VVGDVAITTSRTKIVDFTQPFVSSGLVVVAPFKKLNSGAWAFLRPFSALMWAVIVLSFIT
VGVVVWILEHRVNDEFRGSPTRQCITILWFSFSTLTFSHKENTHSCLGRMVVIIWLFVVL
ILTSSYTASLTSILTVQQLSSPIKGIDSLVVGHTRIGYQVGSFAERYLSGELNISQSRLV
ELKTPEDYADALRSGRIDALVDELPYVELFLARQCDFRIVGPEFTRSGWGFAFPRDSPLA
PDMSTAILKLSENGDLQRIHDKWLTTSSCSQDNTEIESSQLHLKSFLGLFLISGIACIIS
LCIYFSRICYRCHRASRTEVVSDLPGNASSLKRIRTLITLIDEKKDTSKKRKKRRETEGL
SFDDERDEECGRGGKRKQFLIPGDGDRNSNLSN
NT seq
2802 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagtcaattggcttcttgttctattaatcagcttgatgtttgtgctttcggttggg
gctactaataatgtgtcaacacctgctgtcatcaatatcggggcgctttttagcttcaac
tctactatcggagaagttgtcaagattgcaattcaggaagctgttaatgatgtcaactct
aattccagcatcctacatggctccacactgaatttaacaatgcgaaattccgattgcagc
gggtttatgggctttattcaagcaatgcagctcatggagacacaagtggtggcaattata
ggtccacaatcatctaccgtttctcatatggtttctttggtggccactgaactccaaatc
ccacttttatcatttgctgcaactgaccctacccttacatatttgagctccccctttttt
gtaagaacaatatattgtgatcagtatcaaatgactgcaatttctgaaattgttgaatat
tatgggtggagagaggtggttgctgtttacaatgatgatgattatggaaggaacggtgtt
gcagctcttgatgatgctcttgcagacaaacgtggcagaatctcatataaagctgcgatt
gcaccggatacaagtgtgacacggggtgatataatggatatctttgttaagattgctatg
ttggagtgtcgggtcattatcctgcacacaaatcctcattcagggcgtttaattttcaat
gtgtccaattatttgggaatgacaggtaacgggtatgtttggatatctacggactggctt
tcgtctctcattgattcgaattctcctcttccttccggaataatgagtgcaatacaaggg
ttccttgtcctgcgtccccatactccggattctactagaaaaagagcttttgtctcaaga
tggaaaaaagcaactggtggttcactcggattgaatgcttatgcattttatgcttatgat
tccgtttggatgcttgcacatgcaattgatgcatttttaaaacaagatggaaacatctct
ttttctagtgattctaaattgttgtctttgaatatcactgaaacttaccttcagcaaatg
cgcatttttgatggaggacaagcattgttgagcaatatactgcagagtgacctaataggt
ttaacaggtccgctgaagtttgattcggataggtccttggctcaccctgcatatgatata
attaatgttcttggaactggatatcgacaggttggttactggtctaattattcaggttta
tcagttgtttcaccagagactctctacaccaaaccagctaatcgttcaagtgcaaaccaa
cgcctatacccggttttttggccagatgggtctaccacagtacctcgtgggtgggtcttc
ccaaataccggagtacaattgagaacaggggttcctctccgggttagtttcaaggagttt
gtttctcgggtacccggaagcaatgatatgttcaagggactttgcattgatgtgtttcaa
gctgctgtcaacttgctgcagtaccccgttccatatgagtttgttgcctttggagatggt
catcaaaacccaaactacacagaccttgttaatgggataacaactggtatatttgatgct
gtagttggtgatgttgctattaccacaagcaggacaaaaattgttgattttacccaacca
tttgtttcatctggccttgtggtggtggcaccatttaaaaaattaaattcaggagcctgg
gcttttctccgaccattttcagcactcatgtgggctgtcattgttctgtcgttcattact
gttggtgtggtcgtgtggatattagagcacagggtaaatgatgagttcagaggctcccct
acaaggcagtgtataaccattctatggttcagcttctcaacattgactttttcccataag
gagaacactcatagctgccttggtcggatggtagtaattatatggctctttgtggttttg
attctgacatcaagctatactgcaagcttgacttcaattcttacggtgcaacaattgtca
tcgcctatcaaggggattgactctttggtagtgggtcacacacggattggataccaggtt
ggctcctttgctgaacggtacttgtctggagaactgaatatatcccaatctagacttgtt
gaactcaaaacgcctgaagattatgctgatgctctacgatctggtcgtattgatgccttg
gttgatgaacttccatatgtagagctcttcctagctcgccagtgtgactttagaattgtg
ggtccagagttcacaagaagtggctggggctttgcatttccacgagactctccgctggct
ccagacatgtcgactgcaattctgaaactatcagaaaacggggatttacagcgaatacat
gacaagtggttgacaacaagcagttgcagtcaggataatactgagattgaatccagccaa
ctgcaccttaaaagttttctgggtctgtttctaataagtggaatagcatgtattatttct
ctttgtatatacttcagtcggatatgttatcgctgtcatagggcctctagaaccgaagtt
gtttcagatcttcctggtaatgcatccagcttgaaaagaattcggacacttataaccttg
atcgatgagaaaaaagacacatcgaagaaaaggaaaaagaggagagaaacagaaggtttg
tcatttgatgatgagagagatgaagaatgtgggaggggtggaaaaaggaaacaatttcta
attcccggagacggtgatagaaactcaaacttgtcaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system