Amaranthus tricolor (tampala): 130812959
Help
Entry
130812959 CDS
T09367
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
atri
Amaranthus tricolor (tampala)
Pathway
atri03015
mRNA surveillance pathway
atri03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
atri00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
130812959
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
130812959
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
atri03041
]
130812959
Spliceosome [BR:
atri03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
130812959
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
130812959
NCBI-ProteinID:
XP_057534601
LinkDB
All DBs
Position
5:19411393..19416957
Genome browser
AA seq
486 aa
AA seq
DB search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NT seq
1461 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacggcggtggcggcgaatccaatcaacctctttccagtggaggttatggtggaggc
ggatatggcggagatggaggtggttatggtggtggtcgtggtggtgacggaggcggctat
ggaggtgacggaggcggtggatatggaggtggtcgtggaggcggtagagggggaggatat
ggaggtcgtggtggttctggaggaggctatggcggtggaggtggtggtggttatggcggt
aatcctgataatcgaggtggtggatatcaaggagatcgaggaggtcgtggtggaggaaga
ggaggcagaggtggcggtgctggtcatggaggaagtggcagagatggagactggtcctgt
cccaatccaggttgtgggaacctgaactttgctagaagaactgcttgtaacaagtgtggg
gctcctgctcctgctggcgctggcagcggcggtggaggtggtggagactatagaggtgga
ggtggtggttacaatagaggaggaagtggaggttatggaggtgatagaggagataggggt
agtagggataacaattatgaaggtgggagaggtggtggtagcaggggtgggtcggatggt
gggtatggtcaaggtagaagtgatggtgggtacggccaaggaagaaatgacggtggatac
ggacagagtagaaatgacgggggacatggccaagctcccccacctgcaccttcttatggc
ggggctggcggcgcttaccctccttcacagaacccttatggagcgaaccctgcatatggc
aatgattctgctgttcctcccctggcaagctatactggtggccctggatcatatccatca
tatggtgcacaaccaagtggatatggggctgatgcttctggagattataggggtggtggt
cgaggtggtccacctagtggtggctatggtggtggtcagagacattcaggtggtggttat
ggtggagaagctccagcatctgctgatgcacctgcaaaagtgaagcaatgtgatgaaaat
tgcggagattcctgtgataacgcaaggatttacatctcaaatttgccaccggatgttact
atagatgaacttagagaactttttggcagcattggaacagttgcaagaatcaagcaaaag
agaggctacaaagatcagtggccttggagcataaagttatacactgatgatagtggaaag
aacaagggtgatggtgttttgtcatatgaagacccatcagctgctcattccgccggtggt
ttttttaacggtcatgacataagaggatataaaattagtgttgcaatggcagagaagtct
gctccaagggctcctcagtcttttggccatggaggcggtggtagaggtggttatggaggt
ggagatcgccgaagagattatagagatggaggtggccctgacaggcattcccatggcggg
aatcgatcacgtccatactga
DBGET
integrated database retrieval system
