Amaranthus tricolor (tampala): 130819932
Help
Entry
130819932 CDS
T09367
Name
(RefSeq) probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56130
Organism
atri
Amaranthus tricolor (tampala)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
Malectin
LRR_1
LRR_8
LRR_4
ABC1
TMEM154
SKG6
DUF515
DUF6203
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
130819932
NCBI-ProteinID:
XP_057541337
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(41126805..41152816)
Genome browser
AA seq
1044 aa
AA seq
DB search
MLSSRRNSFSIQRPPLMSIIGSYLCRRRLIVVVVVVMFFSGASYCVQAQKSATRATGGAT
TAPSEARALNAILAQWKKPANTEQWNTTGDPCSGAALVDSITMENPAYNPFIKCDCTYNG
NTTCHITALKVYAIDAIGVLPDELWNLVYLTNLKLGQNYLSGPISSGIGNLTRLQYLDFG
INALSGPLPREFGKLTSLISLGLGGNNFSGPLPSELGNIKTLEQLYIDSSGVSGAIPPSF
ANLENLKIIWASDVEFTGQMPDFIGNWSQLETLRLEGNSFVGPIPSSLSKLTSLTELRII
GLSNGSSSLDFITNLTSLKILVLKNNNITSPIPSGIGELQILTQLDLSFNKITGKIPDSV
FNLNSLSNLFLGNNRLTGALPGKKSPSLTNIDVSYNQLSGSLPSWVSQPNLQLNFVANNF
SVTNLNSRSLPSGLNCLENGFPCNSGLGRYSDFAIKCGGSQIRASNQVVYESENEPLGPA
TYFVASSDKWAVSNVGLFTNKNNVSYVANSLSQFVSLDSELFQTARVSAGSLRYYGLGLQ
NGNYSVLLQFAEIEINNGKTWKSLGRRVFDILIQGIPVERDFDIRKAAGGQSFRPVQKNY
TVQVTANYLEIHLFWNGKGTCCIPFQGTYGPSISAVSVVPLFQARPSNLRSNSQKTAIIV
GVVVPVVVISLLSFGLCWFIQRRKRARAAENELLGIDVKAYTFSYAELRTATGDFSPSNK
LGEGGFGSVYKGTLSDGRVVAVKQLSIASKQGKSQFLAEIATISAVQHRNLVTLYGCCID
GQKHLLVYEYLVNKSLDKVLFGDSKVELNWAQRFDVCLGVARGLTYLHQESRLRIVHRDV
KSSNILLDADLNPKISDFGLAKLYDNKMTHMSTGVAGTVGYLAPEYAMRGHLTEKVDVFA
FGVVALELVSGRSNCDASLGREQMYLVDWAWHLFENGRELQLADKRLKDFNQDEVKRVIA
VAFLCTQTSSAQRPIMSRVLAMLSGDVEVGSIPSKPTYLADFGFDDSSFMTSEASEYSKV
GYSSTSNYTSQGLNTPTDASFLHQ
NT seq
3135 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttagcagccgtagaaacagcttctctattcagcggccgccattaatgagtattatc
ggaagctatttgtgccgccgccgcttaattgtggtggtggtagtggtaatgtttttttcg
ggcgcatcatattgtgttcaagctcaaaaaagtgctacgcgcgctactggcggcgcaacc
actgctccatcggaagcgcgagcgttaaatgcaattctagcacaatggaagaagcctgca
aacacagaacaatggaatacaacaggagatccatgctctggagcagcccttgttgattct
ataacaatggaaaatcctgcttataatcccttcatcaaatgtgattgtacctataatggc
aacactacctgccatatcaccgctctgaaggtctatgcaatcgatgcgataggcgtgcta
ccagatgagctatggaatttggtttacctgactaatttgaaactgggacaaaattacttg
tcaggccctatatcttcaggcattggaaacctaactcgtcttcaatacctggattttggt
attaatgcattatctgggccactcccgcgagaattcggtaaactaacaagtctgatctca
ctgggacttggtggcaacaatttctctggccccctaccatcagagcttggcaacataaaa
actttagagcaactgtacattgacagctcgggagttagtggcgcaatccctccatcattt
gctaatttggaaaacctaaagatcatttgggcatcagatgtggaattcacgggtcagatg
cctgattttatagggaattggagccagcttgagacgctgaggcttgaagggaactcattt
gtgggaccgataccatcatcactttccaaactaacctctttgaccgaattgaggataatt
ggcttgtcaaatggcagctcttcgctagattttattactaatcttacctccttaaaaatc
ttggttctgaagaataacaacatcaccagtcccatacccagtggtataggagaattgcaa
attttaactcagctggaccttagtttcaacaagataacaggaaaaatcccagactcagtc
tttaatctcaattctctttctaatttgtttcttggaaataataggcttacgggtgctctt
ccaggaaaaaaaagcccatctctgactaatatagatgtatcgtataatcagttatctggg
agcctcccgtcttgggtcagccaaccgaatctacagcttaactttgtagcaaacaatttc
tctgtaacaaatttaaacagcagatctttgccgtcagggttgaactgtttggagaatgga
tttccttgcaactctggtctaggacgttattctgactttgcaattaagtgcggtggttcg
cagatcagagcatctaatcaagtcgtttatgaaagtgaaaatgaaccccttggtccggcc
acttattttgtggctagtagtgataagtgggctgttagcaatgttggattgttcaccaat
aaaaacaatgtgtcttacgtagctaactcgctaagccagtttgtaagtctggactctgaa
ctgttccaaaccgcaagagtgtcagctggatcccttcggtactatgggcttgggcttcag
aatggtaattacagtgtgctgctacaatttgctgagattgaaattaataatggtaaaacc
tggaaaagtcttggaaggcgtgtgtttgatatattaatccagggtattccggtggaaaga
gattttgacataagaaaggcagcaggtggtcagtcatttagacctgtccagaaaaactat
actgttcaggtgactgcaaactatctcgaaatacaccttttttggaatggaaaaggaact
tgctgcataccattccagggaacatatggaccttctatatcagctgtcagcgtcgtccca
ttatttcaagcaaggccttcaaatctacgatcaaactctcaaaagacagctataattgtc
ggagtagttgtacctgttgtggtcatttcccttctttctttcggtttatgttggtttatt
caaagaaggaagcgagcacgtgcagcagaaaatgagctcttaggcattgatgtgaaagcc
tacactttcagttatgctgaattgagaacagctactggagatttcagcccgtcgaataag
cttggtgaaggtggctttggaagtgtctataagggaaccctaagtgatggcagagttgtt
gcggtcaaacaactttcaatagcatctaaacaagggaagagtcaatttttagcggaaata
gctactatatctgcagtacagcatcgaaaccttgtaacactatatggatgctgcattgat
gggcaaaaacatctgcttgtttatgagtatttagtgaacaagagtcttgataaagtcttg
tttggagacagtaaagtagaacttaattgggctcaacgctttgacgtgtgcttgggagtg
gcgagaggcttgacatatctccatcaagaatcacgccttaggattgtgcatagagatgtt
aaatccagcaatattctgctggatgctgatcttaaccccaaaatttcagattttggtctt
gccaaattatatgataacaaaatgactcacatgagcactggtgttgctgggacagttgga
tacctagcgccggagtatgccatgcgtggccatcttacggagaaggtcgatgtgtttgcg
tttggagttgttgctctagaacttgttagtggaagatccaattgtgacgcttccttgggg
agggaacaaatgtatcttgttgattgggcatggcatctatttgagaatggtcgagaactg
caacttgcggataaaagactaaaagatttcaaccaggacgaggtgaaaagagtgattgca
gtagcatttttatgcacacaaacatcatcagcccaacgtcctataatgtcacgagtgcta
gccatgttatccggggatgttgaagtgggaagcataccatcaaagcctacatacttggcc
gactttggatttgacgactccagttttatgaccagtgaagcttccgagtattcgaaagtc
ggttattcctctacaagtaattacacttctcaaggactaaatacacccactgatgccagc
ttcttgcatcaatga
DBGET
integrated database retrieval system