Acinetobacter sp. TTH0-4: AMQ28_08790
Help
Entry
AMQ28_08790 CDS
T04075
Name
(GenBank) choline transporter
KO
K02168
choline/glycine/proline betaine transport protein
Organism
att
Acinetobacter sp. TTH0-4
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
att00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
att02000
]
AMQ28_08790
Transporters [BR:
att02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
AMQ28_08790
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
BCCT
DUF5510
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALD02445
LinkDB
All DBs
Position
1868247..1870217
Genome browser
AA seq
656 aa
AA seq
DB search
MPSKNPSWFANVNPNVFLSTVVIIGLFLAVVVLAPNSFDLITKQLNQWVTDSFSWFYVLS
VAIFLILLIYIALSDMGKIKLGPDHSQPTYSNGSWFAMLFTAGMGIGLMFFGVAEPVMHY
VSPPTGEGETIQAAQTAMQVTFFHWGLHAWAIYTVVGLSLAYFAYRHNLPLKIRSALYPI
IGRKIYGPIGDAVDTFATIGTVFGVATTLGFGVTQINSGLNYLFGIEQAPSTQVILIIVV
SAMASMSVFLGLDKGIKRLSELNLILALTLLLFVFFASSSIYLLQTTIQNAGQYISNLFT
MTFNLYAYQPNGWIGGWTIMYWAWWISWSPFVGMFIARVSKGRSIREFIVGVLLIPTGFT
LIWMGFMGNAALYSILHESNQALVLAVQRDSSVALFEFLHSLPFSSVMSLLATFLVMLFF
VTSADSGALVTDYLTAKSENSPIWQRLFWTVLMAVLAIVLLLVGGLSALQSATMMSALPF
TFIMLFICWGLLKALRLDVTKMNALQEARITPRAIQNPRSWQQRLGLIMHYPHNQQEVRD
YIDTQVSVAFNQVKKEFKRRQLEVSIQNIQYGMELRVDHQNESNFVYQVVARETVPPSFM
AEMTSDEITYYQAEVFLREGGQNYDVMDWTLDDLLQDIIDQYERHLHFLSLIRTSE
NT seq
1971 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccttcgaaaaatccatcttggtttgccaacgtcaatccaaatgtttttttaagcacg
gttgttattattgggctgtttctggctgttgtcgttttagcaccgaattcatttgatttg
atcaccaaacagctgaaccaatgggtcactgactcatttagctggttttatgttttatct
gttgccatatttctgattttattgatttatatcgctttatccgatatgggaaaaatcaag
ttaggtccagatcatagccaacctacgtatagtaacggctcttggtttgccatgttattt
actgcaggcatgggcattggactcatgttctttggggtggctgaacccgtaatgcactat
gtttctcctcctacaggggagggtgaaaccatccaagctgcacaaacggcaatgcaagtg
accttttttcattggggcttacatgcatgggcaatttatactgtcgtgggtttgtccttg
gcctattttgcttatcggcataacctgcctttaaaaatacgctctgccttgtatccgatt
atcggacgaaaaatctatggtccaatcggtgatgcagtcgatacctttgccaccatcggt
actgtttttggtgtcgcgaccactcttggatttggagtgacacaaatcaactctggtttg
aattacctgtttggcattgagcaagcacccagtactcaagtgattttgattattgtcgtg
agtgctatggcatcaatgtccgtgtttttaggtttagacaaaggcattaaacggctgtct
gaactgaatttaattcttgctctcacccttttactgtttgtgttttttgccagttcatcg
atttatttgctgcaaaccaccatccaaaatgcagggcagtacatttcaaatttatttacc
atgacatttaatttatatgcctatcaacccaatggctggattgggggatggaccattatg
tattgggcatggtggatttcatggtcaccctttgttggcatgtttatcgcccgcgtatcc
aaaggtcgcagtattcgcgagtttattgtcggggtattgcttattccaacaggctttact
ttaatttggatgggttttatgggaaatgctgcgttatacagcattttgcatgagagtaat
caggctttggttttggccgtacaacgcgattcgtcagtggcattgtttgagtttttacac
agtttacctttttcatctgtcatgagcttactggcgacctttttggtgatgctctttttt
gtcacttcggccgattcaggtgcattagtcaccgattatttgaccgcaaaatccgaaaat
tctccaatatggcaaagacttttttggacagtattgatggctgttttagccatcgtatta
cttctggtcggtggtttaagtgccttacaatccgccacgatgatgagtgcgctaccattt
acgttcattatgttgtttatttgctggggattattgaaagcattgcgtttggatgtgacc
aaaatgaatgccttacaagaggcaagaattaccccgcgtgctattcaaaatccacgcagt
tggcagcagcgtttgggtttgattatgcattatccgcataaccaacaagaggttcgagac
tatattgatacacaggtttcggtggcttttaatcaggtgaagaaagagtttaaacgtcgg
cagcttgaagtctccattcaaaatattcagtatggtatggaacttagggttgatcatcag
aatgaaagtaactttgtttatcaagtggttgcccgagaaaccgttccaccgagttttatg
gcagaaatgacttcggatgaaataacgtattatcaagctgaagtttttctcagagaaggt
ggacaaaattatgatgttatggactggactttagatgatttattacaagatattatcgac
cagtacgaacgtcatttacattttttaagtttgatccgaacttctgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
