Trichormus variabilis: Ava_0505
Help
Entry
Ava_0505 CDS
T00277
Name
(GenBank) CheA Signal Transduction Histidine Kinases (STHK)
Organism
ava
Trichormus variabilis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Response_reg
Hpt
CheW
HATPase_c
H-kinase_dim
HATPase_c_3
DUF948
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABA20129
UniProt:
Q3MFV7
LinkDB
All DBs
Position
complement(629243..636220)
Genome browser
AA seq
2325 aa
AA seq
DB search
MLPEQQQRILGYFIEEARDHLNTIEQGLLNLESTLNDPEMINEVFRAAHSIKGGAAMLGL
TSIQHTSHRLEDCFKILKDNPVQVDQKLESLFLGVSDTLKALLEQLSGPFGLSEEVANTL
MSETEPVFQWLHEHLEQLVQKGGTAEIGDHAVSKPNTADSVGTLTEIFFRQDVATPAEAT
PKTSPVLPTYSPIVATDSDQWSEFQAQVLQTLREMLQLFKQPATPASRQNLQDCCNQLVK
LGKTWNLPNWCNLCKAAANAIANQENTYLTLAKIVITEIKQAQELVLRSRESEITISHRL
EALWGFPEMPLLEVAQNLLGDVPTAVSQSFITPITPTSEPTITNNEISAPLIESPTDSVT
SFTEISDQLSPQSAIAESIANTDIAFDHEDQTTYTTNKIHTHGPEVGLAELNTLADLFEG
ETPELDETWQQEEIIDINNASNLGVDVSESTDEAIDSDLADFLSLEEDKEESEKTINNTE
DLSLLFGENFLEKNNLESLDLFKAPVTAGEIIQEARDNANQLPDSDDVIDDLLALKIDDE
IQNSNELEQTNTSSDFDDLFSDTETNLPTNSELQLIALPEDLSLNNIFNDSEENKQLLTE
KSEISDLLDLPPVDNLGNLWNSATEVEPEQILESVIEEDIAQALEESLFEAAASGDIFVE
NRQFTSHLNESLDPDDLNITFLQDEQQLDLLFASDTSDDLFGELTINTHDTHRIDVISDD
IQFLREISQVSPPEIHDFSQQPEVLDFTPEFTTQIQELSAIDDLSSLTSDLTDITFTETN
DSSSLETVAETSELSLDDDLSALNSDLTDITFTETNDSSSLETVAETNELDLDDDLSALN
SDLTDITFAETHDSSSLETVAETNELDLDDDLSALNSDLADITFAETHDSSSLETVAGTN
ELDLDDDLSALTSDLADITFTETNDSSSLETVAETSELSLDDDLSALTSDLADITFTETN
DSSSLETVAETSELSLDDDLSALTSDLADITFTETNDSSSLETVAETSELSLDDDLSALT
SDLADITFTETNDSSSLETVAETSELSLDDDLSALTSDLTDITFTETNDSSSLETVAETN
ELDLDDDLSALNSDLADITFAETHDSSSLETVAGTNELDLDDDLSALTSDLADITFTETN
DSSSLETVAETSELSLDDDLSALTSDLADITFTETNDSSSLETVAETSELSLDDDLSALT
SDLADITFTETNDSSSLETVAETSELSLDDDLSALTSDLADITFTETNDSSSLETVAETS
ELSLDDDLSALTSDLTDITFTETNDSSSLETVSETSELSLDDDLSALTSDLTDITFTETN
DSSSLETVSETSELSLDDDLSALTSDLTDITFAETHDSSSLETVAETSELSLDDDLSALN
SDLTDITFAETNDSSSLETVAETSELSLDDDLSALTSDLADITFTETNDSSSLETVAETS
QLSLDDDLSALNSDLTDITFAETNDSSSLETVVETNELDLADDLSALTLDELITENHNFI
SIAVDDNTLSTSEFSELGLSLTNDENPEDIADSSGLLIDINPATEDVAGVEVENVVSTSI
DIPESVKSDTYIQDDFADLEALLEIEEPTFSADNDSIAGDDFAALEALLGEDNPETALDE
PPALAKIIKTTPTVSVTPAPLADEFSDLEKLLAEADQTISHSSPVKPTVGKTPRTSNRRT
ARFEETMKVPVKQLDEMSNLVGELVVNRNTLEQDHERLRQSLDNLLVQVQQLSDVGARMQ
ELYERSLLEASLLASRKTREPVYEVPDANSDRGFSELEMDRFTPFHTLSQEMIELIVRVR
ESASDIDFVTEETERVARQFRQVTTQLQEGLTRARMVPFSQTIDRLRRGVRDNAIKFGKQ
VELVIEGGDTLIDKMILDHLNDPLTHMLNNAIAHGIETPEIREASGKPPVGTITIRAFHQ
GNQTVISVGDDGAGIDPERIKAKAVKLGIMTPEQARTISRLEIYDLLFQSGFSTKDEADE
IAGRGVGMDVVRSEISEIRGAVNTDSTVGKGTTFTIRLPLTLSICKALCCVSDKARIAFS
MDGVEDTLDIPSKNVQHNADGQSFISWRDTVLPFRPLKELLTFNRQLGRGNVYGGTRDDD
MISVVVVRSGNTLIALQIDQVLSEQEIVIKQFEGPAPKPIGVAGATVLGDGRIMPIADVL
EIIDIFQGRMSKHAGGAPWQQTPPIAIEIPSVKIDPTVLIVDDSITVRELLSLTFNKAGY
RVEQARDGQEAWDKLRSGLPCDIVFCDIEMPRCDGLELLSRIQKDSTLNHLPIAMLTSRG
ADKHRQMAIQLGASGYFTKPYLEEALLEAAVRMLKGEKLVSQINA
NT seq
6978 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctgccggaacaacaacagaggattttaggttactttattgaagaggcgagagaccac
ctgaatacaatcgaacaggggttgctcaatcttgagagtaccttaaacgacccggaaatg
atcaacgaagttttccgggcggctcactccattaaaggaggagcagcaatgcttggttta
actagcattcagcacacttcccatcgtttagaagattgtttcaaaattcttaaagacaat
ccggttcaggttgaccaaaaactagagtccttatttcttggggtttctgataccctaaag
gcgctattagaacagttaagcgggccgttcggtttatcggaagaagttgctaatactttg
atgtcggaaactgagccagtttttcaatggctacatgagcatttggaacaactggtacaa
aaaggtggcactgctgaaattggtgatcatgcagtaagtaagccaaacacagcagatagt
gtgggtacactcacagaaatattctttcgccaagatgttgcaactccagcagaagcaacc
cccaaaacttctccagttttaccaacctattctcccattgttgctacagatagcgatcag
tggagcgagtttcaagcccaggttttacaaactctcagggagatgttgcaactatttaag
caaccagcaacaccagcatctcggcaaaatttacaagactgctgcaatcagttagtcaaa
ctcggaaaaacatggaatttgcctaactggtgtaatctatgcaaagctgcagctaatgcg
atcgctaatcaagaaaatacctatctgactttagctaaaattgtcattacagaaattaaa
caagctcaagaattagttctgcgaagtagggaatctgagattacaattagtcaccgactg
gaagcactctggggttttccagaaatgcccttgttagaagtagcacaaaatttactgggt
gatgttcccactgctgttagtcaatcattcataacaccaataacccccacatctgaaccg
acaattactaataacgaaattagtgcgcctttaattgaatcaccaacagacagtgtaact
agtttcactgaaatatctgaccaactttctcctcaaagtgccatagcagaaagcattgcg
aacacggatattgcatttgatcatgaagaccaaacaacctatactactaataaaattcat
acccacgggccagaagtaggattagctgagttaaatactcttgctgacttgtttgaaggt
gagacaccagaactcgatgaaacatggcaacaagaagaaattattgatattaataatgct
agtaatttaggtgtggatgtcagcgaaagtactgatgaagcaattgatagtgatcttgct
gattttctatcactggaagaagataaagaagagtccgagaaaactataaataatacagaa
gatttaagcttactttttggagaaaacttcttagagaaaaataatttagaatcacttgat
ttatttaaagctcctgttactgcgggtgaaataatacaagaagctagagataatgctaat
cagttgccagattctgatgatgtcatagatgatttgttggcattaaaaatcgatgatgaa
atccagaatagcaatgaattagagcagacaaacacctcaagcgattttgatgatttattt
tcagatacagaaactaatctacccactaattccgagttacagctaatagcactaccagaa
gacttatcgctaaataacatatttaatgattcagaggaaaataagcaattattaactgaa
aaatcagaaattagtgatttattggatttaccaccagtagataatttagggaatctatgg
aactcggcaactgaagtagaaccggagcaaatattagagtctgtaatagaagaagatata
gcccaagctttagaggaaagtttgtttgaagctgcggcttctggagacattttcgttgaa
aatcgacaatttacatcacatttaaatgaaagtttagatccagatgatctaaatatcact
ttcttacaggatgaacagcagttagatttgctattcgcatcagatacaagtgatgattta
tttggggaattaactataaatacgcatgatactcataggattgatgttattagtgatgat
atccaattcttaagagaaattagtcaagtttctccacctgagattcatgatttttcacag
caaccagaagttttagattttacccctgaatttactacgcaaattcaagaactatctgct
attgatgatttatcatcattaacgagcgatttaacagatatcacttttacagaaacgaat
gattcttccagtttagaaacagttgcagaaactagtgaactaagtttagatgatgattta
tcagcattaaatagtgatttaacagatatcacttttacagaaacgaatgattcttccagt
ttagaaacagttgcagaaactaacgaactagatttggatgatgacttatcagcattaaat
agtgatttaacagatatcacttttgcagaaacacatgattcttccagtttagaaacagtt
gcggaaactaacgaactagatttagatgatgacttatcagcattaaatagtgatttagcg
gatatcacttttgcagaaacacatgattcttccagtttagaaacagttgcgggaactaac
gaactagatttagatgatgatttatcagcattaactagtgatttagcggatatcactttt
acagaaacgaatgattcttccagtttagaaacagttgcagaaactagtgaactaagttta
gacgatgatttatcagcattaactagtgatttagcggatatcacttttacagaaacgaat
gattcttccagtttagaaacagttgcagaaactagtgaactaagtttagacgatgattta
tcagcattaactagtgatttagcggatatcacttttacagaaacgaatgattcttccagt
ttagaaacagttgcagaaactagtgaactaagtttagacgatgatttatcagcattaact
agtgatttagcggatatcacttttacagaaacgaatgattcttccagtttagaaacagtt
gcagaaactagtgaactaagtttagacgatgatttatcagcattaactagtgatttaaca
gatatcacttttacagaaacgaatgattcttccagtttagaaacagttgcggaaactaac
gaactagatttagatgatgacttatcagcattaaatagtgatttagcggatatcactttt
gcagaaacacatgattcttccagtttagaaacagttgcgggaactaacgaactagattta
gatgatgatttatcagcattaactagtgatttagcggatatcacttttacagaaacgaat
gattcttccagtttagaaacagttgcagaaactagtgaactaagtttagacgatgattta
tcagcattaactagtgatttagcggatatcacttttacagaaacgaatgattcttccagt
ttagaaacagttgcagaaactagtgaactaagtttagacgatgatttatcagcattaact
agtgatttagcggatatcacttttacagaaacgaatgattcttccagtttagaaacagtt
gcagaaactagtgaactaagtttagacgatgatttatcagcattaactagtgatttagcg
gatatcacttttacagaaacgaatgattcttccagtttagaaacagttgcagaaactagt
gaactaagtttagacgatgatttatcagcattaactagtgatttaacagatatcactttt
acagaaacgaatgattcttccagtttagaaacagtttcagaaactagtgaactaagttta
gacgatgatttatcagcattaacgagtgatttaacagatatcacttttacagaaacgaat
gattcttccagtttagaaacagtttcagaaactagtgaactaagtttagacgatgattta
tcagcattaacgagtgatttaacagatatcacttttgcagaaacacatgattcttccagt
ttagaaacagttgcagaaactagtgaactaagtttagatgatgatttatcagcattaaat
agtgatttaacagatatcacttttgcagaaacgaatgattcttccagtttagaaacagtt
gcagaaactagtgaactaagtttagacgatgatttatcagcattaactagtgatttagcg
gatatcacttttacagaaacgaatgattcttccagtttagaaacagttgcagaaactagt
caactaagtttagatgatgatttatcagcattaaatagtgatttaacagatatcactttt
gcagaaacgaatgattcttccagtttagaaacagttgtcgaaactaacgaactagatttg
gctgatgatttatcggctttaaccttagatgagttaatcacggaaaatcacaactttata
agtattgcggttgatgacaataccttatctacctcagaatttagcgaattggggttatct
ctgacaaatgatgaaaatccagaagatattgcagattcatcagggcttttaatagatata
aatccagccacggaagatgtagccggggttgaagtagagaatgtggtttctacttcaata
gatatcccagaatcagtcaagtcagatacttatattcaagatgattttgctgatttagaa
gcattgttagaaatagaagaacctacattcagtgctgataatgactccatagcaggagat
gattttgctgctttagaagcacttctgggtgaagacaatccggaaacagcactggatgag
ccacctgctttagctaaaatcatcaaaactactcctactgtttccgtaacaccagcgccg
ttggcagatgaatttagtgatctggagaaacttttagcagaagcagaccaaaccatctcc
cattcatcaccagtcaaaccaacggtaggaaaaactccacgtacttctaatcgacggact
gcgagatttgaagaaacgatgaaagtgccggtcaagcagttggatgaaatgagcaatttg
gtcggtgaactagtagtcaaccgcaacaccttagagcaggatcatgaacgactgcgacaa
tcattagataacttgctagttcaggtgcaacaactctcagacgtgggtgcaaggatgcag
gaattatatgagcgatcgctcttagaagcttctttattagctagtcgcaaaactagagag
cctgtctacgaagtaccggatgcgaatagcgatcgcggttttagcgaattagaaatggat
cgctttactcccttccacacactgtctcaggaaatgattgaattgattgtcagggtgcgg
gagtcagcgagtgacattgatttcgtcactgaagaaaccgaacgagtagccagacaattc
cgtcaagtgaccactcaactgcaagaaggtctgacacgcgcccgcatggtgccattttcc
cagacaattgaccgcttgcggcggggagtgcgcgacaacgccatcaagtttggtaaacag
gtggaattagtgattgaaggtggcgataccctcattgacaagatgattttagatcatctc
aatgacccactaacccatatgctcaacaatgcgatcgctcacggtattgaaaccccagaa
attagggaagcatctggcaaaccacccgtgggaaccattactatccgcgcctttcaccag
gggaatcaaactgtaatttctgtaggagatgacggtgcaggaattgatcccgaacgcatc
aaagccaaagcagtgaagctggggattatgacaccagaacaggctagaactatttctcgc
ctggaaatttatgacctactattccagtctggttttagtaccaaagatgaagccgatgaa
attgctggtcgtggtgtgggaatggatgtggtgcgttccgaaattagtgaaattcgcggg
gcggtaaatacagattctactgttggcaagggaaccaccttcacgattcgtctaccatta
accttgagtatttgtaaggctctgtgctgtgtttctgataaagcacggattgccttttca
atggatggtgtggaagataccctagatatacccagcaaaaacgtccaacataacgctgat
ggacaatcattcatctcttggcgggatacggttttacctttccgaccattgaaagaactg
ttaaccttcaatcgtcaactcggtcgcggtaatgtctacggtggtactagagatgatgat
atgatttccgtcgtcgttgtgcgatcgggtaatactttaatcgctctccagattgaccaa
gtattgagtgagcaagaaattgttattaaacaatttgaaggcccagcacctaaaccaata
ggtgtagcaggggctacggtcttgggcgatggtcgcattatgcccattgctgatgtacta
gaaattatcgacatcttccaaggacggatgtccaaacacgctggtggcgcaccttggcaa
caaacaccaccaattgcgatcgaaatcccatctgtgaagattgacccaactgtgctgatt
gtagatgactcgatcacagtccgagagttgttgtccctcacctttaataaagcgggttat
cgcgttgaacaagctcgtgatggtcaagaggcttgggacaaactccgttccggtctgcct
tgtgatatcgtcttctgcgatattgaaatgccccgttgcgacggactagagttactctca
cgtattcagaaagactccacccttaaccatttacccattgctatgctcacctcaagaggt
gcagataaacacagacagatggcaattcaactcggtgctagtggatactttactaagcct
tacctagaagaggctttactagaagccgcagtgcggatgttgaaaggtgagaagttagtc
agtcaaataaacgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
