Trichormus variabilis: Ava_1351
Help
Entry
Ava_1351 CDS
T00277
Name
(GenBank) Heat shock protein DnaJ-like protein
Organism
ava
Trichormus variabilis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Dynamin_N
DnaJ
MMR_HSR1
CHP04376
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABA20975
UniProt:
Q3MDG1
LinkDB
All DBs
Position
1665202..1667427
Genome browser
AA seq
741 aa
AA seq
DB search
MEQYAGYGSLVEVLKSASGLLELERTSRLHQDVVSICGYLENPNFRIAVFGPFNHGKSTL
LNAVLGSRALPIDLIPTTGAAITVKYGSSVRSRIMLVDGTEVYRSGTEVLQQFAILDGNR
QMRRDVASVEVFCPHPFLETGVEFVDLPGTNDREEQDNLVKEQLLSADLVVQLLDARKLM
TLGERENLRDWLLDRGIKTVIFVANFLNLLEPEEQQQVQNRLRFVAESFRAELPPGFSNL
YRVDALPALRARLKGDVGAASSSGLAAFETALQNVVGILQQNRGSVRLPRVEAIASQIQL
SLKNKIDPIAHEFKTFDDKQNAKFAIKQKAQDLIGRGFTASITELGDWLALPNLLAKYQA
DAAVALAENNFKSWQINNLKKDLNELQISVVKWLYQAYEFFQEERPEDLSIPLPSEPIIT
LPPKSDSGDTWSEPGSIAVGGGIGWLLGGPVGAAVVGSVSYLLNKNVQKQDDQIANESYH
QQVAKLCIAATEEYFTHLSHQGLSILAEYERQGEKVICFKVNQEPQEITQKRAELQRLQQ
GFNQLLSELEKVKISSNYQPYIETPRVTQTQQKSWQKQERIYTRPPQATPNPPRQENTAK
TPEKKVEPPKQQVSSPPPKTTPSPNPAELEAKFTNWEMDEEIARMKAKMGSPGFQNSQPP
NQNTQAPKSPQSQTEKDKIAHAYKVLGLPQDATFADVKQAYKTLVKKWHPDLFVNQPQMQ
KQAQEKMRLFNEAYTVLSQQK
NT seq
2226 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagcagtatgctggttatgggagtttggttgaggtgttgaagtctgcgtctggtttg
ttggagttggaacggacttctcggttacatcaagatgtggtgtctatctgtggttatttg
gagaatcctaattttcggattgcggtttttggcccttttaatcatggtaagtctactttg
ttaaatgcggttttgggtagtcgtgctttaccaattgatttgattcccactacgggggcg
gctattacggttaagtatggttctagtgtgcgatcgcgtattatgttggtagacggtaca
gaagtctatcgcagtggtacggaagttttacagcagtttgctattcttgatggtaataga
cagatgcgccgggatgtggcatctgttgaggttttttgtccccatccgtttttagaaact
ggtgttgagtttgtggatttaccagggactaatgatagggaggagcaagataatttagtt
aaggaacaattattgagtgcagatttagttgtgcaattactagatgcgcgcaagttgatg
actctgggtgaacgggaaaatttgcgcgattggttattggatagggggattaaaacagtt
atttttgtggctaattttcttaatttactggaaccggaggaacaacagcaggtacaaaat
cggctcaggtttgttgcagaaagtttccgggctgagttaccgccaggattcagtaattta
tatcgggttgatgctttacctgctttacgcgccaggttaaagggtgatgtaggggcggct
agtagtagcggtttagcggcgtttgaaacagctttgcaaaatgttgtgggtatcttacaa
caaaatcggggtagtgtgaggttgccgagagtggaggcgattgcatcccaaattcaatta
tcattaaaaaataaaattgaccctattgctcatgagtttaagacttttgatgataaacaa
aatgccaaatttgcaattaaacaaaaagcgcaagatttaattggacgaggctttactgct
agtattactgagttaggtgattggctggctttacctaatttacttgccaaataccaagct
gatgctgctgttgctttggcagaaaataactttaaatcttggcaaataaacaatctcaaa
aaagacttgaatgagttacaaatatctgtagtgaagtggctctatcaagcatacgagttt
ttccaagaagaacgaccagaagatttatcaattcctttacctagcgaaccaatcattacc
ctaccgcctaaatctgacagtggtgatacttggagtgaacccggttcaattgctgtcggt
ggtggtataggttggttattaggcgggcctgtcggtgcggctgtggttggtagtgtttcc
tatttactcaacaaaaatgtacaaaagcaagatgaccaaatagctaatgaatcctatcat
caacaggttgccaaactttgtatagctgcaacggaagagtactttactcatcttagtcat
caaggtttatcaatcttagctgaatatgaacgccaaggggaaaaggtaatttgctttaaa
gttaatcaagaaccacaagaaattactcaaaaacgtgcagagttacagcgattgcaacag
ggttttaatcaattactgagtgaattagaaaaagtcaaaatttcttctaactatcaacct
tatatagaaacgccaagagttactcaaactcaacaaaaatcttggcaaaaacaagaacgc
atatatactcgcccaccccaagctacacctaacccaccacgacaagaaaatacagctaaa
actcctgagaaaaaagttgaaccgccaaagcagcaagtttcttcaccaccaccaaaaact
accccttcacccaatcccgcagagttagaagcaaagtttaccaactgggaaatggatgag
gaaatagcacgaatgaaagccaaaatgggttctcctggttttcaaaatagtcagccacca
aatcaaaatacacaagcacctaaatcaccccaaagccaaacagaaaaagataaaattgct
cacgcttataaggttttaggattgccacaagatgctacttttgctgatgttaaacaagct
tataaaactttagttaaaaaatggcatccagatttatttgtgaatcaaccccagatgcag
aaacaagcgcaagaaaaaatgcgtttgtttaatgaagcttatacagtattgtctcaacaa
aagtag
DBGET
integrated database retrieval system
