KEGG   Trichormus variabilis: Ava_2710
Entry
Ava_2710          CDS       T00277                                 
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)
Organism
ava  Trichormus variabilis
SSDB
Motif
Pfam: EAL GGDEF PAS_3 PAS PAS_4 PAS_9 PAS_8 PAS_11
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABA22323
UniProt: Q3M9L3
LinkDB
Position
complement(3346090..3347847)
AA seq 585 aa
MTSISEDITDGNQAEAALRESEAKFRSLIQNSSDIIGIFEPDGTIRYESPSVERILGYKP
EELVGKNAFDFIHPDDIAGSSESFNYLIQNLGATVLVESRFRRKDGSWCFLESTGSNLLA
EPSVKGIVINSRDITDRKLAEERLVHDALHDVLTGLPNRVLFIDRLRRAVEYAKRYSDHL
FAVLFLDLDRFKFINDSLGHTIGDQLLVIIAQRLIECLRPTDIAARFGGDEFIILLEGIQ
DISDTVRVVERIQEKLLVPVDLSGHEIFTTASIGISLSATGYEQPEDLLRNADIAMYRAK
ARGKACYEIFNSDMHVQIVERLQLENDLRKAIERHEFLVYYQPIVSLASGRIIGFEALVR
WLHPEQGIVFPEEFMPIAQETGLIIPIDAWVLREACRQTRQWQEQIPSQSVNLHQQPLSI
SINLCSSRFSQKKLLEDINQVLQDTGLDAQSLKLEITESVIMENGENATTMLYQLRNLGI
ELAIDDFGTGYSSLGRLHNFPINGLKIDQSFVSGRGVEAGNLHIVETIVTLSSKLGVDVT
AEGVETPAQLQRLRELKCEYGQGYFFSEPLDSDSAKALIMSNPQW
NT seq 1758 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgacaagcatcagcgaagatattactgacggcaatcaagctgaagcggcactgcgtgaa
agtgaagctaaatttcgttcgctgattcaaaatagctccgacatcattggtatttttgaa
ccagatggaactattcgctacgaaagtccatctgttgaaagaattctaggatataaacca
gaagaactagtcggtaaaaacgcttttgattttattcatcccgatgatattgctggtagt
tctgaaagctttaattacttaatccaaaatttaggcgcgactgtactagtagagtcgcgt
tttcgacgcaaagatggttcgtggtgttttctcgaatcaacaggtagtaatcttctagca
gagccatctgtgaagggcatagttattaattctcgtgatattaccgatcgcaagctagca
gaagagcgattagttcatgatgccctacatgatgtattaacagggttgccaaatagagtc
ttattcatagaccgcttaagacgtgcggttgagtatgcaaaacgatattcggatcatctg
tttgcggtgctgttcctcgatttggatcgcttcaagtttatcaacgacagcctgggacac
acaattggcgaccaattactggtgattattgctcaaaggctgatagagtgtctgcgacct
acagatatagctgcacgctttggcggagatgagttcatcattctgctagaaggtattcaa
gacattagtgacacagtgcgtgtcgttgagcgaatacaggagaaattgttagttccggtg
gatttaagtggccatgaaatttttaccacagctagtatcggtattagtttgagcgccaca
ggttatgagcaaccagaagaccttttacgtaacgccgacattgcgatgtaccgagctaag
gcgcggggtaaggcgtgttacgaaatatttaatagtgatatgcacgttcagatagtggaa
cgtttgcagctagaaaacgacttacgcaaagcaattgaacgtcatgagttcctagtttat
tatcagcctattgtgtcactggcaagcgggagaattattggttttgaagcgcttgtacgt
tggctacatccagagcagggaattgtgttcccggaggagtttatgccaatcgcccaagaa
accggactaattatcccgattgatgcctgggtgttgcgtgaggcgtgtcgccagacaagg
cagtggcaggaacagattccctctcaatcagtaaatttacatcagcagcctttgagcatc
agtattaatctttgtagttcccgattcagccaaaaaaagctgctggaggatattaatcaa
gtactacaagacactggtttagatgcacagagtttgaaattggaaattacagaaagcgta
attatggaaaatggggaaaatgctactactatgctctatcaattgagaaacttaggcatc
gaattagcaattgatgatttcggtacaggatattcttcattaggtcgtctccataatttt
ccgattaatgggctaaagattgatcaatcctttgttagtgggagaggtgtagaagcaggc
aatttacacattgtggagactatagttaccctttctagcaaactgggtgtggatgtaaca
gccgagggggtggaaacaccagcgcaactacaaaggcttagagagttgaaatgtgaatat
ggtcagggatactttttctcggaaccattggatagcgattcggcaaaggcgttaattatg
agcaatccccaatggtag

DBGET integrated database retrieval system