Acinetobacter variabilis: RYU24_01190
Help
Entry
RYU24_01190 CDS
T07586
Name
(GenBank) nuclease
KO
K07004
uncharacterized protein
Organism
avb
Acinetobacter variabilis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
avb00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99997 Function unknown
RYU24_01190
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LTD
DUF5689
Exo_endo_phos
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCT87714
LinkDB
All DBs
Position
141747..144164
Genome browser
AA seq
805 aa
AA seq
DB search
MGCSFSAHAQLMFSQYIDGTSNKKGLEIYNPDSLTVNLADYEIQQFTNGSTTKSATFQLE
GSLASKAKYIIGRTELQAVIGNKVNQVAGLAFNGDDTLVLFYKGTPIDRFGRVGEDPGTG
WGVGFSSYQNSLSRTKTSNNVTSIDPATAFELESEWSKWSDRNEFSQYLDTSAPITSPVT
PISCNTADTAIADLQSAAENQPYVVRGVITADYRYDNGFSGFYIQTPDSKAKSNLSNAIF
VYLPASSKITGGKVGEEVILKGRLTSYQNQLQIDQLDQNIQTCHTQASNTVTAQALNLPF
TSLTEIAGNVPKRYQGMLVKIPQTLTISENYNYGRYGELSLSLGRLYIPTNLYPAKSAEA
VALAQQNLLSKIILDDGYNNQNRTPLLPQNFNAINTLRTGSELKNVEGILEYRFNAWRIQ
PIQGKVQPEIIKDTNLRPSTVIPKDVKQIRAAAFNVLNYDNGSEKGFPTERGASSETEFK
KQHQKIVSALKTIDADVYGLMEIANNGFDDKSAVAYLSQALGADWKYVIPTQMTKLGTDA
IAVAIIYNSKRVKPVGEPAVYDDQTEKNRVTMAQSFQSVNGGKIFTIVPNHLKSKGSCPT
DKTLADADQGDGQGCWNATRLTAVQELMQWIAKNPTQVAKPNYLLVGDMNSYAKEDPILA
LEKANYKVLLNDEKIGQGKTAYSYVFGVASDANGNGGAGNLDHAIADADLYPMVKRAFAW
HINADEPTALDYNEEYKTDEQIAAFYSDDAFRSSDHDPVIVDMDLNENISSNPDTGKISG
GSMGIWSMLTLTGLVLVSMIRRRKF
NT seq
2418 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggtgctcgttttctgcacatgcacaattaatgtttagtcagtatatagatggtaca
tctaataaaaagggtttggaaatctataaccctgacagtttaacagtgaacttagctgat
tatgagattcaacaatttactaatggttcaaccacgaaatctgcgacttttcaattagaa
ggttcattggcaagtaaagcaaaatacattattggtcgaacagagttgcaggcagtaatt
ggtaataaagtcaatcaagtggcaggacttgcatttaatggagatgataccttggtcctg
ttttataaaggtactccaatagaccgttttggtcgtgtgggagaggatccaggtactggt
tggggagtgggttttagtagttatcaaaatagtttgtcacgtactaaaacttcaaataat
gtaacttcaattgatcctgcaacagcatttgagttagaaagcgaatggtctaaatggtct
gatcgaaatgagttttcccagtatttagatacaagcgcgcctataacctcccccgttact
cctatcagttgtaatacagcagatacggcgattgcggacctacaatctgccgcagaaaat
caaccatatgttgttcgtggtgttattaccgcagactaccgttatgacaatggtttttct
ggtttttatatacaaacgcccgatagtaaagccaaatccaatttaagtaatgctattttt
gtctatcttcctgcaagtagtaaaatcactggaggaaaagtaggtgaagaggttatttta
aaaggtcgtttaacctcatatcaaaaccaactccaaatagatcaacttgatcaaaatatt
caaacctgtcatacacaagcatccaatacagtcacggcacaggcacttaatttaccgttt
accagtttgacggagatagcaggaaatgtacctaaacgctatcaagggatgctggttaaa
atcccacaaactttaacgataagtgaaaattacaattacggtcgttatggtgagctatct
ttaagtttaggtcgcttgtatattccaactaatctatatcctgcaaaatctgctgaagca
gttgcattagcccagcaaaatctgctttctaaaattatcttggatgatggctataataat
caaaatagaacaccattacttccgcaaaacttcaatgccataaatacattaagaacaggt
tctgaactgaaaaatgttgaggggattttagaatatcgttttaatgcatggcgaattcaa
ccgatacaggggaaggtacaacctgaaattatcaaggatactaatttacgtccttcaacg
gtgattccaaaagatgttaaacaaattcgcgctgcggcttttaatgtcttaaattatgat
aatggttcagaaaaaggtttcccaacagaacgtggtgcaagctcagaaactgagtttaag
aagcaacatcaaaaaattgtcagtgctttaaaaacaattgatgccgatgtgtatgggtta
atggaaatcgcaaataatggttttgatgataaaagtgcagtggcatacttatcgcaagcc
ttaggtgcagactggaaatatgtcattccaacccaaatgacaaaattaggtacagatgca
attgcagttgcgattatctataacagtaagcgcgtaaaacctgtaggtgagcctgcagtt
tatgatgatcagactgaaaagaaccgtgtcaccatggcgcaaagtttccaatctgtaaat
ggtggaaaaatatttacgatagtacccaatcacttaaagtcgaaaggcagttgtcctacc
gataaaactctggccgatgctgatcagggtgatggtcaaggttgctggaatgcaacacgt
ttaactgcagtacaagaacttatgcagtggattgcaaaaaatccaacacaagtggctaaa
ccaaattatttgctggtcggtgatatgaatagttatgctaaagaagatccgattttagca
ttagaaaaagccaattataaagtcttgctcaatgacgaaaaaattggacaaggtaaaaca
gcctatagttatgtatttggtgttgcaagtgatgccaatggcaatgggggcgcaggaaac
ctagaccatgcaattgctgatgcagacttatatccaatggtgaaacgcgcttttgcttgg
cacatcaatgctgatgagccgacggccttagactataacgaagaatataaaacagatgag
caaattgcagcattctatagcgatgatgcattccgttcttccgatcatgatcctgtaatt
gttgatatggatttaaacgaaaatatatcgagtaatcctgatacaggaaaaataagcggt
ggcagcatggggatctggtcaatgttaaccttaacgggcctcgttttagtttccatgata
cgcagacgtaaattttga
DBGET
integrated database retrieval system