Acinetobacter variabilis: RYU24_03750
Help
Entry
RYU24_03750 CDS
T07586
Symbol
comC
Name
(GenBank) pilus assembly protein PilY
KO
K02674
type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
avb
Acinetobacter variabilis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
avb00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
avb02044
]
RYU24_03750 (comC)
02035 Bacterial motility proteins [BR:
avb02035
]
RYU24_03750 (comC)
Secretion system [BR:
avb02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
RYU24_03750 (comC)
Bacterial motility proteins [BR:
avb02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
RYU24_03750 (comC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
T4P_PilY1
PQQ_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCT87970
LinkDB
All DBs
Position
419450..423139
Genome browser
AA seq
1229 aa
AA seq
DB search
MNKMKKNALHKAYIRTLLATSISAVVTGTTLSGIAQASDIDIYQTARSGDITLMFLLDLS
GSMDRKAGGGGGACDLPKGVSAGTIRSATETYIAGAPSYIRQWCQNGSSNSAHRYYDRIT
RVKDGMFDLLYGNAEKNIERLDDTKVIGLSTFQGNTGRVRIPARPLGELVGSKTQRQLLL
ETIASSDFQATGRTPTANAYAEAAAYLLGTTTGKTEGGILGRLPTGYPSRFYKCLLPTTT
GGCGGYSSTYTSTPDFDYYITSGGYYYLYKEKIADSAYSGFSSSDPLTNNGSNYLQPNSL
RQTEEMRQCSGQGIYVLTDGEPNQSSVSIASSLMGRALDNTNFNCDGSLLSEVNNPTYGT
DGAWSCIGKFSQSLLDATSNPSSLTIKTAVVGFGSAFNSVSSYDKSLSQDQNLQNVNNAN
LSGNSLANDIKNAARWGIIGEGGWYSGNESQDVVNSVNDFISSLSTEIPSVTTGSPTIPA
DALNPSVLQNNAYFPQFQPTPEKPTQLWLGNLKKYLVHSSGKLVGKSGASIFDDRGAIKK
DVSDYWTSDATSSGGVLAQLKLRSNTTAPDIASRKLLTNRTFNTTTSAFESGTNLQRVNL
DYLTQAGTKDDPYRGYLMSLLGYKLSESQLNNPSTISNLGAVEELRQLGAVMHSSPVLLT
TEGEIKFIDNKLDTTQRKDFVLFGTTQGLLHVVDAKTGDEKFAFVPNEMLESQKEAFSIP
ELSNGGLSKLYYGVDGPWTAYTEYAVNSTGKLVVGKGAYSQEGKLNVYGGLRMGGRSYYA
LDLQDMNNPKLKFHINPDAATSGPLSYMGQSWSKPRLAWVNWKGKRTQVMFVGGGYDAGG
VDGNAKDAAGLKGIYTGYENDEYVQNNKRGAGVYMFDADDGELLWWASANAGSSSSASTD
SGVIRTHHDDLKYSVVSEIRTVDRDSDGLTDHLYFGDLGGQVFRIDLDNKTKTLGAFAKS
PVRLLDLTVTGGKKTRFYDMPAFSLYKSKTGDTFAVVSIGSGNRSSPLAEYTNGSGYSED
AIFNIYDKDVANRDLYKTGYSYTTRNIRKNDLGLITESDRKNDSDLKAPYTSSNGWYYPF
QSFKVQSEKVYGTPVAMKSVLHVSTFDGSKPGISGDCGAGVKGESFVTRFCLPYGQCEPS
KFGNDWFSKDNQGPGIHTIAVIGGGTGGGGTGGGTGGGTGGGTGGGSEKNYCLNADSVRV
YNQSGGNEGEPTQVCLIPQRWYEKISSIR
NT seq
3690 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaatgaagaaaaatgctttgcacaaagcttatattcggactctacttgccacc
agtattagcgccgtggtgacgggtacaactttaagtggtattgcacaggcaagtgatatt
gatatttatcagactgcaaggtctggtgatattacattaatgtttttgctggacttatca
ggaagtatggacagaaaagcaggaggtggagggggggcatgtgacctgccaaaaggggtg
agtgctggcacaataaggtctgcgacagaaacatacattgctggtgcaccaagttatatt
cggcaatggtgccagaatggcagttcaaacagtgcacaccgctattatgatcgtattacg
cgtgtaaaagatgggatgtttgatttgttatatgggaatgcagaaaaaaatattgagcga
ttggatgatacaaaagttattggattaagtacctttcaaggaaatacaggacgggtgcgt
attccagcaagaccattaggtgagctagttgggtcgaaaacccaaagacaattgcttctt
gagacgatagcgtcttctgacttccaggccacagggcgaactccgacagcaaatgcatat
gcagaagctgctgcatatctattgggtacaactacaggtaaaacagaaggtggtatactt
ggtagattgccaacagggtatccttcaagattttacaagtgtctattgcctacaactaca
ggagggtgtggtggatattcaagtacgtacacttctactcctgatttcgattattatatt
acttctggtggttattattatctttataaagaaaaaattgcagattcagcttatagcggt
ttttcatcatcagatcctttgactaacaatggaagtaattatcttcaacctaactccttg
agacagactgaagagatgaggcagtgtagtggtcaaggtatatatgtattaactgatggt
gaacccaaccaaagttcagtgagtattgcgagtagtttaatggggcgtgcacttgataat
acaaattttaattgtgatgggagcttattatcagaagttaacaacccaacttatggaact
gatggggcatggagctgtattggcaagttctcacaatctttattagacgctacgtctaac
ccaagttcgttgaccattaaaacagctgttgttggttttgggtcggcattcaactcagta
agttcttacgataaaagtttatctcaagatcaaaatttacaaaacgttaataatgcgaat
ttgtcagggaatagtttggcaaatgatattaagaatgctgcacgttggggaattattgga
gaaggcggttggtattcaggtaatgagtcacaagatgtcgtaaatagcgtaaatgatttt
attagcagcttaagtacagaaatcccttcggttaccacaggttcacctacaattcctgcg
gatgcgctgaatccgtccgtattgcaaaacaatgcttatttcccacaatttcaacctaca
ccagaaaaaccaactcaattatggttggggaatttgaaaaaatacttggtacatagctca
gggaaattggtgggtaaaagtggagcaagtatttttgatgatcgtggagcgattaaaaaa
gatgtaagtgattattggacttctgatgcaacctcctcagggggggtgcttgcacaactt
aaattacgtagcaatacgacagcaccagatatagcttctcgtaaactactcacaaaccgt
acttttaatacaacaacttctgcgtttgaaagcggtacgaatctacaacgtgtcaattta
gattatttaactcaggcaggcacaaaagatgatccatatagagggtatttaatgtctctc
ttaggatataagctgtctgaaagtcaactcaataatccaagcacgataagtaatttgggc
gccgtggaagagcttcgacagttaggtgctgtaatgcattcatctcctgttttattaaca
acagagggtgaaattaagtttatagataacaagcttgatacaacccaacgtaaagacttt
gtcttatttggtacaacgcaaggtttattacatgttgtagatgccaaaacaggtgatgaa
aaatttgcttttgtaccaaatgaaatgcttgagagtcaaaaagaagctttttcaatacca
gagttatctaatggtggtttgagcaagctctattatggggttgatggtccttggacggct
tatactgaatatgctgtcaattcaacaggtaaattggttgtaggaaaaggtgcatatagc
caagaaggtaaattgaatgtatatggcggcttacgcatgggtgggcgtagctattatgca
ctcgatttgcaagatatgaataatcctaaactcaagtttcatattaatcctgatgctgca
acctcagggcctttaagctatatggggcaaagttggtctaaaccacgtttggcgtgggta
aattggaaaggaaaacgaacacaagtgatgttcgttggtggcggctatgatgctggcgga
gtggatggtaatgctaaagatgccgccggtctgaaaggcatctatactggttatgaaaat
gatgaatatgtgcagaacaataaacgcggtgctggtgtttatatgtttgatgctgacgat
ggagaactcttgtggtgggcgagtgctaatgcaggatccagtagcagtgcttcaacagat
tcgggcgtgataagaacacatcatgatgatttaaaatatagtgtagtcagtgaaattaga
acggtcgaccgtgacagtgatggtttaactgatcatttatattttggtgatctgggtggg
caggtattccgtattgatttggacaataaaacgaagactttaggtgcttttgcaaagagt
cctgtgcgtctgttggatttaacagtcacaggtgggaagaaaacacgtttttatgatatg
cctgctttttccttatataagtcaaagactggggatacttttgcagtggtatccataggt
agtggtaatagaagctcacctttagctgaatataccaatggctcaggctatagcgaagac
gcaatatttaatatttatgataaagatgttgctaatcgagatctatataagacaggatat
agttataccacacgaaatatacgtaaaaatgacttgggtttaattactgaaagtgaccgt
aaaaatgattcggatttaaaagcaccatatacgagtagcaacggttggtattatccattc
caatcttttaaagtacaaagtgaaaaagtatatggtacgccagtggcgatgaagtcggtg
ttgcatgtttctacttttgatggatctaagccaggtatttcgggcgactgtggggcaggt
gtgaaaggagaaagttttgtaactcgtttttgcttaccttacgggcaatgtgaaccaagt
aaatttggcaatgattggtttagtaaagataatcagggccctggtattcatactattgca
gtaattggtggtggtactggtggtggtggcactggtggcggtactggtggtggtactggt
ggtggtactggtggtggaagtgagaaaaattattgcttgaatgcagattcagtcagagtt
tataaccagtctggaggtaatgaaggggagccaactcaagtttgtttaattcctcaacgc
tggtatgaaaaaattagttcgattaggtag
DBGET
integrated database retrieval system
