Acinetobacter vivianii: LF296_02895
Help
Entry
LF296_02895 CDS
T09059
Name
(GenBank) ESPR-type extended signal peptide-containing protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
aviv
Acinetobacter vivianii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aviv00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
aviv02000
]
LF296_02895
Transporters [BR:
aviv02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
LF296_02895
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
YadA_head
ESPR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WDZ51762
UniProt:
A0AAJ6NKA4
LinkDB
All DBs
Position
603783..608348
Genome browser
AA seq
1521 aa
AA seq
DB search
MNKIYRLVWNKSLSLWTVVSENARGVTKKRNVNTIQTVNTFSSTSLEHNNKLLKLKPSLI
ALTISSIFFSTGAFAGANMGGGTSNQGSSTAISPTNDQCGNPGQATVNGMPNSVAIGCGS
RVNQTNNQVQGIAQRRGGGSNEPYPDGTANHLPNAVAIGNKNVTGAGGGVAIGNANESSA
TFANVAIGQGNRAVGGGFGTALGIGNLTDGSSNVAIGVANRARGNTVIALGRQTYAEADF
AIAQGNTATVAQGATGGIAMGNAATTKGVRGIAIGSGTGGANYDATTAANADGADSVAIG
TGAKGTGAGSTAVGRRTVASGDSSTAMGDEATAEGNGDVAIGRNAYAKGSNNASATAVGR
GARAEGEESLALGNTAKATANFASAVGNFAEATGNQSTASGNRANASADFSSAYGTWTKA
SGTRSSAFGNIAEASGGQSTAIGNATKASGLRSSAFGNFAEASGEDSTASGNGAKATSDF
SSAYGNLAEASGIQSTAIGNATKASGLRSSAFGHGAVAEGAESLAMGRTARSTGESSVAV
GDSAQARGDHDIAIGYDAATSEGTKDNIAIGHGVTTGDTGQNVAMGSGTTTANAASSEGG
AVAIGRDQVARGDGAVAIGDPNNANGNGAVALGRNNTAAGNDDASEAADGAVAIGNENKA
IGQGSVALGNASTAAEAGSIALGDSANAQAARGIALGSNAVATNADDVALGAGSVTSTAT
GDSFLTGIAAPASVVSVGSAGNERRIQHLSDGAEDTDAVNVRQLKHVKDVVDEQGESTAN
ALGGGSTYDPETGAVSNPTYNINGNDMNNVGDALAELDKGWTLQTNGENAAAVKAGDTVD
IGTVDGEENLQVEKEGNNIKYSLNRDLKVDSVTAGDTVMNTDGMTIAGGPSVTKSGIDAG
GNKITNVAEGTEGTDAVNKDQLDSATATAKTEVEAGKNMTVESETGADGQTIYTVATADD
VEFDSVKVGDVSIDGATGKITGVTAGDVNPDSTDAINGSQLAGTAQSVSDALGGGSTVNP
DGTVTAPNYSVNGTDVNNVGDAIAELDKGWTLQTNGENAAAVKAGDTVDIGTAEGEENLQ
VSKEGNDIKYSLNRDLKVDSVTAGDTVMNTDGLTIAGGPSVTKDGIDAAGNKITNVANGE
VAAGSKDAVNGGQLNDSVGSVGDMLGGGVTNEGGKLNGPFTVNDNGYANVADAIEGETAA
AKTEVEAGKNMTVESETGANGQTIYTVATADDVEFDSVKVGDVSIDGATGKITGVTAGDV
NPDSTDAINGSQLAGTAQSVSDALGGGSTVNPDGTVTAPNYSVNGTDVNNVGDAIAELDK
GWTLQSNGENAAAVKAGDTVDIGTAEGEENLQVSKEGNDIKYSLNRDLKVDSVTAGDTVM
NTDGLTIAGGPSVTKDGIDAAGNKITNVADGEVAAGSKDAVNGGQLNDSVGSVGDMLGGG
VTNEGGKLNGPFTVNDNGYANVADAIEGETAAAKTEVEAGKNMTVESETGANGQTIYTVA
TTLQVAVITMLVMPWVQLMTV
NT seq
4566 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaatataccgtttagtctggaataaaagtctaagtttatggactgttgtttct
gaaaatgcacgaggcgtcacaaaaaaacgtaatgtgaatacaattcaaacagttaatacg
ttttcgtccacttccttagagcataataataaactcttaaagcttaaaccaagcttaatt
gcacttacgattagctcaattttctttagtacaggtgcctttgctggggcgaacatggga
ggggggacctccaaccaaggctcaagtacagcaatctcaccgaccaatgaccagtgtggt
aatcctggacaggccacagtcaatggcatgcccaacagcgtcgcgattggttgtggttct
cgcgtgaatcaaaccaataatcaggtacagggtattgcccaacgtcgtggtggtggcagt
aatgagccatatcctgatggcacggcgaatcatcttccaaatgcagtggcaatcggcaat
aaaaacgtgacaggcgctggtggtggtgttgctattggtaatgccaatgagtcgagcgca
acttttgccaatgttgcaattggacaaggtaaccgggcggttggcggtggttttggtaca
gcactcggtattggtaacttaacagatggaagctcgaatgttgcgattggtgtcgctaac
cgcgcgcgtggcaatactgtaattgcgttggggcgtcagacgtatgctgaggcagacttt
gcaattgcgcagggtaatactgccacggtagctcaaggtgcgacgggtggtattgcgatg
ggtaatgctgcaacgaccaaaggtgtacgtggtatcgcgattggtagcggtactggtggt
gcaaactacgatgcaaccacggcagccaatgcagatggtgccgattcggttgcgattggt
acgggtgcaaaaggtactggagctggttcaacggctgttgggcgtagaacggttgcttct
ggtgatagctcaactgcaatgggagatgaagctacagcggaaggaaatggtgatgttgca
attggccgaaatgcatatgcaaaaggttctaataatgcgtctgcgacagcggtaggtcga
ggagctcgtgcagaaggtgaagagtcacttgcattagggaatacggcaaaagcaacagct
aattttgcaagcgcagtgggtaactttgctgaagcgacagggaatcagtcaactgcaagt
ggtaatcgtgccaatgcatcagctgacttttctagcgcatatggtacttggaccaaagca
tcaggaacgcgttcaagtgcctttggtaatatagcggaagcttctggagggcaatctaca
gcaattggtaatgcaaccaaagcatctggattgcgttcaagtgcctttggtaattttgct
gaggcttcgggggaagactctactgcaagtggtaatggtgctaaagcaacttcagatttt
tcaagtgcttatggtaatttggctgaagcttcaggtattcaatctacagcaattggtaat
gcaaccaaagcatctggattgcgctcaagtgcctttggtcatggtgcggtagcagaaggc
gcagaatcccttgcaatgggacgtacagcaagatcgactggtgagtcctctgtagcggta
ggtgatagtgctcaagcacgtggtgatcatgatattgcgattggttatgatgctgcaact
tcggaaggtaccaaagataacatcgcgattggtcatggtgtgactacaggagacacaggc
caaaatgtggcaatgggttcaggcacaaccacagcgaatgcagcttcttcagagggtggt
gcagtggcgattggtcgtgatcaggtggctcgtggtgatggtgcggttgcaattggtgac
ccaaataatgccaatggtaatggtgcagttgcgctaggccgaaataataccgcggcgggc
aatgatgatgcttcagaagctgcagatggcgcagtggcgattggtaatgaaaacaaggcg
attggtcaaggttcagttgcattgggtaacgcatctacagcagcagaagctggttcgatc
gcattaggtgactcagccaatgcacaagcagcacgaggcattgctttaggttcaaatgct
gtagcgaccaatgctgatgatgttgctttaggtgcaggcagtgttacttctacagcaaca
ggtgacagtttcttaactggaatagcagcacctgcttcggtagtttctgttggatctgca
ggcaatgaacgtcgtattcaacacctttctgatggtgcagaagacactgatgctgtgaat
gtgcgtcaattaaaacacgttaaagatgttgttgatgaacaaggcgaaagcacagccaat
gccttaggtggcggttctacttatgacccagaaactggggctgtttcaaatccaacttat
aatattaatggcaacgacatgaataatgtcggtgatgctttagctgaactcgacaaaggc
tggacactacaaaccaatggtgaaaatgcggctgcagtgaaagctggcgatactgttgat
atcggtacagtagatggcgaagaaaacttacaggttgagaaagaaggcaacaacattaag
tacagcctgaaccgtgacctgaaagtggatagtgtgactgctggcgataccgtaatgaac
acagacggtatgaccattgcaggtggtccaagtgtgaccaagtctggtattgatgcgggc
ggtaacaaaatcaccaatgttgcagaaggaacagaaggcacagatgcagttaacaaagac
cagttagacagtgcaacagcaacagcaaaaactgaagttgaagctggcaagaacatgact
gttgaaagcgaaacaggtgcagatggacaaaccatttataccgttgcgacagctgatgat
gttgagttcgattcagtcaaagtcggcgacgtgagcattgatggtgcaacaggcaaaatc
acaggtgtgaccgcgggtgatgtgaatcctgattcaaccgatgcgatcaacggtagtcaa
ttggcaggtacggcacaaagcgtatcagatgccttgggtggcggttcaactgtaaaccca
gacggtaccgtgactgcaccgaactatagtgtaaatggcactgacgtgaacaatgttggt
gatgcgattgccgagttggacaaaggctggacattacaaactaatggtgaaaacgcagct
gcagtaaaagcaggtgacaccgttgatattggtacagcagaaggcgaagaaaacctacag
gtcagcaaagaaggcaatgacatcaagtacagcctgaaccgtgatctaaaagtggatagc
gtgactgctggcgatactgtgatgaacacagatggactaaccattgcgggtggcccaagt
gtcactaaagatggtatcgatgcagcaggtaacaagattaccaatgttgctaatggcgaa
gtcgctgcgggttctaaagatgcagtcaatggtggtcaactcaatgatagcgtgggttca
gtcggtgacatgcttggtggaggtgtaaccaatgaaggtggcaagctaaacggtccattc
acagtgaatgacaatggctatgccaacgttgcagatgcgattgaaggtgaaacagcagca
gcaaaaaccgaggttgaagctggcaagaacatgactgttgaaagcgaaacaggtgcaaat
ggacaaaccatttataccgttgcaacagcggatgatgtcgagttcgattcggtcaaagtt
ggtgacgtgagcattgatggtgcaacaggcaaaatcacaggtgtgacagcaggtgatgta
aatcctgattcaactgatgcgatcaacggtagccaattggcaggtacagcacaaagcgta
tcggatgccttgggtggtggttcaactgtaaatcctgatggcacagtgactgcaccaaat
tatagtgtaaatggcactgacgtgaacaatgttggtgatgcgattgccgagttggacaaa
ggctggacattacaaagtaatggtgaaaatgcagctgcagtaaaagcaggtgacaccgtt
gatattggtacagcagaaggcgaagaaaacctacaggtcagcaaagaaggcaatgacatc
aagtatagcctgaaccgtgacctgaaagtggatagcgtgactgctggcgatactgtgatg
aacacagatggactaaccattgcgggtggcccaagtgtcactaaagatggtatcgatgca
gcaggtaacaagattaccaatgttgctgatggcgaagtcgctgcgggttctaaagatgca
gtcaatggtggtcaactcaatgacagtgtgggttcagtcggtgacatgcttggtggaggt
gtaaccaatgaaggtggcaagctaaacggtccattcacagtgaatgacaatggctatgcc
aacgttgcagatgcgattgaaggtgaaacagcagcagcaaaaaccgaggttgaagctggc
aaaaacatgaccgttgaaagtgaaacaggtgcaaatggacaaaccatttataccgtagct
acaacgttgcaggtggcagttataacaatgttggtgatgccttgggtgcaattgatgacc
gtgtga
DBGET
integrated database retrieval system
