Acinetobacter vivianii: LF296_10145
Help
Entry
LF296_10145 CDS
T09059
Name
(GenBank) translocation/assembly module TamB domain-containing protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
aviv
Acinetobacter vivianii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aviv00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
aviv02000
]
LF296_10145
Transporters [BR:
aviv02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
LF296_10145
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WDZ49701
UniProt:
A0AAJ6P3V4
LinkDB
All DBs
Position
complement(2154840..2159345)
Genome browser
AA seq
1501 aa
AA seq
DB search
MTEVEQQLTPPAGPRKNRHIVRNIVLIVLIILLLLVSSLVVMMSTDKGSRFLLDRVLQSQ
KIIKYEYEGGNLLSGIILKNILVQLQAVDVSLDRADVSLGWRAILSKEVHLSHADVRNLK
IINKKPPSDEPFGFDPIKLPFVLRINEASLDHLEIQTATSKVDFNDVYLKDALWSETKLE
FEDSRMDMGYLAVQNASGQMDFSGKYPLNANADLIIPSLKSLDIETIKVAARGSLDTLRV
GVATTTPDLLTGRATLHPVREHVPMQGELFLKNYHLPLLKDQKLFAKDGVVRFNGDIQKL
ALNLDTDLKGEQIPEGKYTALMDTDLTHQLNIRDFNGQLMKGAVSLNGMVNWHEHVSWDV
KGRLDHLDPENTTVPQIAQDFLPPKLDANISSSGSLEKGLALTAQVAFDKYETWALKLDQ
AEEKNNKAQPMLLDISWKGIDRAMPYIGWLSSEEGHTNVALKEGQQDIYVATTVRPHEQA
LLPTGKYEARLDLKDNLLNVENFLYQAEKGSLSGLAKVKLPTEKQQLSWQAQLKAQDFNP
QTVAAAAPVNLLNGDIKASGFAKPNQQVIQLEQIDLKGQLAQVNQQETIALKGKSTAALI
FHDEKAGGGFKSFAVDYNGSLNALNQGDGLLKINVAGTPDYIKINELKHDGVAGKVFATG
AVNLKDKLGWDIDASLVRFKPQYFVSSVKGEVSGHVKTQGVWSDKLKRIDIRQLNAAGFL
NNKPIRGRGNLSLLLDSNQEGFLPQQFEANDLFLAYAQNQLQASGNAQSLRIKLNAPALY
ELYPGLRGRAYGSLNVQSQPRLRATANMAVDDFGFNDLVSIKSLRVQGELPTSETTPTQL
TATLTQLRNGNREIQNATVNLAGTRKAHVLKVESKNRQSNFYVQLAGGFNPNNDWLGLVQ
KGNFTSRNISLVQNQNAPIIYTAAKQELYVGQHCWQSANSQLCLDQPARISKAKGNFSLI
TKNLDLKDFTAFMPEGLAVTGQLNGYAKASWANGSHPKLDARLVTRKGEIGLAADDPQDP
ATTVTYDELSLIAKSISEGMLFRVDMKTPDIGTGYANVIIDPFQNNMPMRGEVAFDDVQL
KVFKPFIKDVRSMAGTLSLAGKVNGTLTQPQITGEMRLKNGAISMISLPVNLSNIQLYSS
IRQDYATIDGAFNSGRGVGRLKGNFDWKNDPHLNLTLKGDNLLIRQAPMITAIVEPDLTL
DVYPFNQRLSLKGKIDVPRARISMPESSATVVNLSPDVRVVQQGQDLLATLKAAKPWDIR
ADMTVTLGNQVIFQGFESTIPLVGRLHLSQRGLETAMRANGAIGVSQKVKIEAYGQSLDL
NRAIARFNGPLANPTLDIDANKPVQGSMVGVRVTGTATVPNIQVYNDAGLSEQEALNALL
TGRINEGNSGLSNTEGFKSDVNNTIAAAGISMGLGGTRALTNQIGRTFGLSGLALDAQGT
GDDTQVSLTGYITPDLFIRYGIGVFTPVNKLTLRYQMNRRLYLEASQSLERAIDIFYNWR
F
NT seq
4506 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacggaagtagaacagcaactgacacctccagctggaccaagaaaaaatcggcacatt
gttcgaaatattgtgctgatcgtgctgatcattcttttattattggtcagctctttagtt
gtaatgatgtctacggataaaggcagccgttttctattagatcgcgtgctgcaaagccag
aaaatcattaaatacgaatatgaaggcggtaatctgctatcgggcattatcctgaaaaat
attctggtgcagttacaggctgttgatgtttctttagatcgggcagatgtctctttaggt
tggagagcgattctaagtaaagaagtacatttgagtcatgctgatgttcgtaacctgaaa
attattaataaaaaaccaccatcagatgaaccgtttggatttgatccgatcaagctgcca
tttgtcttgcgtatcaatgaagccagtctggatcatttggaaatccagaccgcaacctca
aaggttgattttaatgatgtttatttaaaagatgcgttgtggtctgagaccaagctggaa
tttgaagattcgcgtatggatatgggctatttagccgtccagaatgcttcaggtcagatg
gattttagtggtaaatatcctttaaatgccaatgctgatttaattattccgtcgttaaaa
agtctggatattgaaacgattaaggttgcagcacgtggttctttagataccttgagagta
ggcgttgcaacaaccacacctgatttgctcacaggtcgggcaacgcttcatcctgtgcgt
gaacatgtgcccatgcaaggtgagttatttttaaaaaattatcatttgccattactaaaa
gaccagaaactctttgctaaagatggcgtggtcagatttaacggtgatatacaaaaactg
gccttaaatctcgatacggatttaaaaggtgagcaaattcctgaagggaaatataccgca
ctgatggatacagatttaacccatcagttaaatatccgtgattttaatggtcagttaatg
aaaggtgctgttagcctgaatggtatggttaactggcatgagcatgtctcttgggatgtt
aaaggtcgtcttgaccatctggatcctgaaaacaccacagtaccgcagatcgcacaagac
tttttaccaccaaaacttgatgcaaatatcagttcttctggttcattggaaaaaggtttg
gcgctgactgctcaagtggcctttgataaatatgagacttgggcgctcaaacttgatcag
gctgaagaaaaaaataataaagctcagcctatgctgctggatatttcatggaaaggtatt
gatcgtgccatgccttatattggctggttgagtagtgaggaaggtcataccaatgtggca
ctcaaagagggacaacaggatatttatgttgcaaccactgtgcgcccgcatgaacaggct
ttactaccaacgggtaaatatgaagcgcgactcgatttaaaagacaatctgttaaatgtc
gaaaatttcctttaccaagctgaaaaaggcagtttgtctggtctggcaaaagttaaattg
ccaactgaaaagcagcaactgtcatggcaagctcagcttaaagctcaagattttaatccg
caaactgttgctgcggctgcacctgttaatttgttaaatggtgatattaaagcaagcggt
tttgccaagccaaatcagcaagtaattcagcttgaacaaattgatctgaaaggccagctt
gcccaagtcaatcaacaggaaaccattgccttaaaaggaaaaagtacagcagctttaatt
ttccatgacgaaaaagcgggtggcggattcaagagttttgctgtggactataacggctct
ttaaatgccttgaatcagggtgatggtctattaaaaatcaatgttgcaggaacacctgat
tacatcaagattaatgaacttaagcatgatggcgttgcgggtaaggtctttgcgacgggt
gccgtgaatcttaaagataagctcggttgggatattgatgcttcactggtacgttttaaa
ccacaatattttgtttccagtgtcaaaggtgaagtgtcggggcatgttaaaacacaaggt
gtctggtcagataaactgaaacggattgatattcgtcagctcaatgcagcaggcttcttg
aacaataaaccgattcgtggccgtggtaatctcagcttattgcttgattcaaatcaggaa
ggttttttaccgcaacaatttgaggctaatgacctgttccttgcctatgcacagaaccag
ttgcaagcctcaggcaatgcacaaagtttaagaatcaaactgaatgcacctgcgttgtac
gagttatatcccggtttgcgtgggcgggcgtatggtagcttaaacgttcagtcacagccg
cgtttaagagcaacggcaaacatggcggtcgatgactttggatttaatgatctggtcagt
atcaagtcattacgcgtacaaggtgaattaccgacatctgagactacaccaacacaatta
acggcgacgttgactcagctccgcaatggtaatcgcgaaatccagaatgccactgtcaat
ctggcaggaacacgtaaagcacatgtcttgaaagtagaaagtaaaaaccgtcagtctaat
ttctatgtgcaactggcaggtggctttaatccaaataatgactggttaggactggtgcag
aaaggtaactttacttcacgcaatatcagcctagtgcaaaaccaaaatgcaccgattatc
tataccgctgcgaaacaggaactctatgttggacagcattgctggcagagtgcaaatagt
cagttatgtctggatcagcctgcacgcatcagtaaggcaaaaggtaacttctcactaatt
accaagaatctggacttaaaagactttactgcatttatgccagaaggtttggcggtgaca
ggtcagctcaatggttatgctaaagcctcatgggcgaatggcagtcatccaaaactggat
gcccgtttagtgacacgtaaaggtgaaatcggtctggcagcagatgatccgcaagatcca
gctacaactgtgacctacgatgaattgagcctgattgccaaaagtatcagtgagggaatg
ttattccgtgtggatatgaagacccctgatatcgggacgggctatgccaatgtcattatt
gatccattccagaataatatgccaatgcgcggcgaagtagcctttgatgatgtgcagtta
aaagtcttcaaaccatttatcaaagatgtgcgttcaatggctggaacattgtcattggct
ggaaaagtaaatggcaccttaacgcaaccgcagattacgggtgaaatgcgtttaaaaaat
ggcgcaatcagcatgatttcgctgccagtcaatttaagcaatatccagctttattcatct
attcgccaagactatgccacgattgatggggcattcaacagcggacgaggtgtagggcgt
ttaaaaggtaactttgactggaagaatgatccacatttaaacctgacattaaaaggcgat
aacctactgattcgtcaggcgccaatgattacggcaattgtagaacctgacctgacgctg
gatgtttatccatttaatcagcgtctcagtttaaaaggtaagattgatgttccgcgtgcg
cgtatttcgatgccagaaagctctgctacggttgtgaatctgtcaccagatgtacgcgtt
gtacagcaaggccaagatttacttgcgaccttaaaagcagctaaaccgtgggatattcgt
gccgatatgaccgtgacactgggtaatcaggtcatcttccaaggcttcgagagtaccatt
ccactggtcggacgtttacatctatctcaacgtggtctagaaacagcaatgcgggccaat
ggtgcaattggtgtgagccagaaagtgaagattgaagcctatggtcaaagtcttgacctg
aaccgtgcgattgcgcgttttaacgggccgctggcaaacccgacactggatattgatgcc
aataaaccggttcagggcagtatggttggtgtacgggtaacaggtacagcaaccgtgccg
aatattcaggtttataatgatgctggcttatctgaacaggaagcactcaatgccttactg
acggggcgtattaatgaaggtaacagtggtttaagtaatacagaaggctttaagtctgat
gtcaataacaccattgctgccgcagggatcagtatgggcttaggcggtacacgtgccttg
accaatcaaattggccgaacctttggtttaagtggcttagcactcgatgcacaaggtacg
ggtgacgatacgcaggtgagcctgacaggctatatcacgccagacctgttcattcgttac
ggtattggggtatttacaccagtgaacaagttaaccttgcgttatcaaatgaaccgccgt
ttatatctggaggcaagtcagtctttagaacgagccatcgacattttctacaactggcgt
ttctag
DBGET
integrated database retrieval system