Arcobacter venerupis: AVENP_0552
Help
Entry
AVENP_0552 CDS
T06858
Name
(GenBank) multi-sensor domain-containing diguanylate cyclase/phosphodiesterase
Organism
avp
Arcobacter venerupis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_9
CBS
PAS
PAS_8
PAS_3
Cas10-Cmr2_palm2
Diguanyl_cycl_sensor
PAS_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKF66126
UniProt:
A0AAE7B7Q0
LinkDB
All DBs
Position
complement(556123..559263)
Genome browser
AA seq
1046 aa
AA seq
DB search
MSLIKLISPLEDSTNFDLTLQEVLDLMIKNRTKHFILLKQKKAIGIITERDILFLYAKHI
DLNQKAINYANKKLITSKQNREINYVLGLMLNHNIRRVLILDKEDNYLGSIIQEKIIFEF
EQDLFKTNIKVKELIKNNSKAFFVQKESNIQTVINLMSERNIGSILIFDKENPIGILTES
DVINLAQKHIDTTLNIQQFMHKNIISFEKEELLFDVVNKMKQEDIRRAVIFDKTNLEYFM
ITSKDILNNIKGNYNLFLESKLKDVKNTFNSLNEAVIELFDDDEEQIIYWFNQKAAKLFD
IKIDNDITTIIPALKWEEIYRKIKFNDFKENEIIEINNNLFQLTILNTVLLDNSIIKLLF
TNISEISNKNKQIENKFKFLYEEAPYPYQSLNEKGIICNVNKKWLEVTGYEKDEVIGQKF
INFTQEPYEYLKEKFQIILSGTHIEHERIKMKKKNNDIFIASFTGNISNINDEIRTHCIF
KDITEEEKIEKKLKLSDIVFENTTEGIIITDENNEIISVNGAFTNITGYTFEEIKNKSPK
ILKSGRHDSEFYSKLWFELQTNGSWKGEIWNRKKSGEIYPEWLNLSIVKDSNGKILNYVA
LFSDISKIKKSNEKIEYLAHHDPLTNLPNRLLLKARLDKSIDKSIDLKQKLAILFIDIDN
FKLINDSYGHSIGDKIINLVAQRLQKNIRKNDTISRIGGDEFIIVIEDIIEQKNIEKIAK
SILHDFMEPLKLEQYLFDTTISIGISLFPDNGLNVEELIKQADTAMYSAKNAGKNQYHFY
KKKMTSEIFEKILMKQQISEALRNNEFEVYYQPQIDIKTNKIIAAEALLRWNHKSLGIIS
PSEFIPHAEETKLIIPLGDFVLKTATTFMKKLQEENLLIDGIIAVNISTIQLKHSDIFKT
VLNNLEISQLDAKFLEVELTETFIMENVEESKKILKNLKKLGIKLSIDDFGTGYSSLSYL
KQFPIDKLKIDKSFIDEIPNSSKDIAITRTIITLAKQLGIKVIAEGVEKIEQKDFLELEN
CDEIQGWIYSKALKEEEFIKFIQNFK
NT seq
3141 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcttaattaagttaatttcaccactagaagattctacaaattttgatctaacactg
caagaagttttagacttaatgattaaaaatcgaaccaaacattttattttgttaaaacaa
aaaaaagcgattggaattattacagaaagagacattctatttttgtatgcaaaacacata
gatttaaatcaaaaagcaattaattatgctaataaaaaattaattacatctaaacaaaat
agagagataaattatgttttgggattaatgctaaatcacaatattagaagagttcttatt
ttagataaagaagataattatttgggttcaatcattcaagaaaaaattatttttgaattt
gagcaggatttatttaagacaaatattaaagttaaagagttaataaaaaataattcaaaa
gccttttttgtacaaaaagaatcaaatattcaaactgtaataaatttaatgagtgaaagg
aatatcggttctatattgatatttgataaagaaaatcctattggaattttaacagaaagt
gatgttataaatcttgcgcaaaagcacattgatacaacgttaaatattcaacaattcatg
cataaaaatatcataagttttgaaaaagaagagttgttatttgatgtagtaaataaaatg
aaacaagaagatataagaagagctgttatttttgataaaacaaatcttgaatattttatg
attacttcaaaagatattctaaataatataaaagggaattacaatttatttttagaatca
aaacttaaagatgtaaaaaatacttttaattctctaaatgaagcagttattgagcttttt
gatgatgatgaagaacaaataatttattggttcaaccaaaaagctgcaaaattatttgat
attaaaattgataatgatatcacaactattattcctgctttaaaatgggaagaaatttat
agaaaaatcaaatttaatgattttaaagaaaatgaaataattgaaattaacaataattta
tttcaattgacaattttaaatactgttttattggacaattcaatcattaaacttctattt
acaaatatctctgaaatttcaaataaaaataaacaaattgaaaataaattcaaattttta
tatgaagaagcaccttatccttatcaatcattaaatgaaaaaggaattatttgtaatgta
aataaaaaatggcttgaagttacaggttatgaaaaagatgaagtaataggccaaaaattt
ataaattttacgcaagagccttatgaatatttaaaagaaaaatttcaaataattttaagt
ggtacacatatagaacacgaacgcataaaaatgaaaaaaaagaataatgatatttttatt
gcaagttttacaggaaatatatctaatattaatgatgaaataagaactcactgcattttt
aaagatattacagaagaagaaaaaatagaaaaaaaattaaaattatctgatattgtattt
gaaaataccactgaaggaatcataataacagatgaaaataatgaaattatttctgtaaat
ggagcctttacaaatattacaggttatacttttgaagagattaaaaataaaagcccgaaa
atattaaaatctggaagacatgatagtgaattttatagtaaattatggtttgaattacaa
acaaatggttcttggaaaggtgaaatctggaatcgtaaaaaaagtggagaaatttatcca
gaatggctaaatctgagcattgtaaaagattctaatggaaaaatattaaattatgtagca
ttattttcggatatttcaaaaatcaaaaaatcaaatgaaaaaatagaatatttagcacat
catgatccacttacaaatctgccaaatagattattgttaaaagcaagattagataaatct
attgataaaagtattgatttaaaacaaaaattagcaattttgtttattgatattgataac
tttaaacttataaatgactcttatggacactctattggagataaaattatcaatttagtt
gctcaaagattacaaaaaaatataagaaaaaatgacactatttcaagaattggtggtgat
gaatttatcattgtaattgaagacataattgaacaaaaaaatattgagaaaatagccaaa
agtattttacatgattttatggagccattaaaattagaacaatatctatttgatacaaca
attagtattggaatttctttgtttccagataatggattaaatgttgaagagttaatcaaa
caagcagataccgcaatgtacagtgcaaaaaatgcaggaaaaaatcaatatcatttttac
aagaaaaagatgaccagtgaaatttttgaaaaaattttaatgaaacaacaaataagtgaa
gctttgaggaataatgaatttgaagtttattatcaaccacaaatagatataaaaacaaac
aaaataattgcggctgaagcacttttaagatggaatcataaaagtttaggaatcatatct
ccaagtgagtttatcccacatgcagaagaaactaaattaattattcctttaggtgatttt
gtattaaaaactgctacaacctttatgaaaaaactacaagaagagaatttattaatagat
ggaattattgctgtaaatatttcaactattcaattaaaacatagtgatatttttaaaacc
gtacttaataatttggaaatttcacaactagatgctaaatttttagaagtagaattaaca
gaaacttttattatggaaaatgttgaagaatctaaaaaaattttaaaaaatctaaaaaaa
ttaggtattaaattgtcaattgatgactttggaacgggatattcatctttgagttatcta
aaacaatttccaattgataagttaaaaattgataaatcatttatagatgagataccaaat
agttcaaaagacatagcaataactagaactattattactttagccaaacaattaggaata
aaagttatagcagaaggtgttgaaaaaattgaacaaaaggattttctagaattagaaaat
tgtgatgagattcaaggttggatttattctaaagccttaaaagaggaagaatttattaaa
tttatccaaaactttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system